• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Thc-1795
TCM_035065

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: DIS3-like exonuclease 2
Gene Name: TCM_035065
Ensembl Gene: TCM_035065
Ensembl Protein: EOY16222
Organism: Theobroma cacao
Taxa ID: 3641
LLPS Type: Client


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Stress granulePredicted from orthologs(View)

▼ FUNCTION


3'-5'-exoribonuclease that specifically recognizes RNAs polyuridylated at their 3' end and mediates their degradation. Component of an exosome-independent RNA degradation pathway that mediates degradation of cytoplasmic mRNAs that have been deadenylated and subsequently uridylated at their 3'.

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblEOY16222EOY16222
UniProtA0A061FHS8, A0A061FHS8_THECC
GeneBankCM001886EOY16222.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MRGGSGVAEQ  SMIVERVEDA  DKEKKKKRRS  NRRSKHNSVN  EARVESSDSL  KNGDKTKSLT  60
61    QSMSCSSSSK  QQGLETALNE  QTPGRASDFA  FSSMPTMHIN  EQVGSGCGDA  DDDVGGRTFS  120
121   KSCPEPISLA  GSSKVCIDGF  FPFHQVEGFA  RKELFAPYWP  IEAVNKALEK  GEAFKALFRV  180
181   NAHNRLEAYC  KIDGVPTDVL  ISGVSSQNRA  VEGDIVVIKV  DPLGLWTKMK  GSTGSSNNSA  240
241   QVEEYNLVQE  VDGLAGNSYK  GKGKVDADCE  YAHCKSGVLL  EKGVYDEAGM  TRTAAFNNVN  300
301   GHYQSSSDSS  HMGFFPGQNE  GMNSVDRLAA  MTSQFSLKRP  TGRVVAIVEK  SPRRDAIVGF  360
361   LNVKQWFSYR  ELYRKDAKKN  SAIFDREYVT  LTPTDPRFPK  MIVYVRDLPD  RIKKRLEDGD  420
421   ETIEMELVAA  QIEDWSAESP  FPQARVSHSF  GRGGELEPQI  NAILYQNAIL  CTDFPPLVLS  480
481   CLPNIPWEIP  MEEFQSRKDL  KDLCVFTIDP  STASDLDDAL  SVERLSNGSF  RIGVHIADVS  540
541   YFVLPNTALD  KEAQIRSTSV  YMLHRKIQML  PSLLSEKLCS  LNPGVDRLAF  SIFWDLNSMG  600
601   DVLDRWIGRT  VIRSCCKLSY  QHAQDIIEGT  IDVEKFNTLE  GYPQLYGQFE  WTDVVRSVKC  660
661   LHEISKTLMG  KRFNDGALQL  ESSKVVYLFD  ECGVPYDCRL  SERMDSNFLI  EEFMLLANMT  720
721   AAEVISRAFP  ASALLRRHPE  PNMRKLKEFE  AFCHKNGLAL  DTSSSGQFHQ  SLEKIREKLK  780
781   DDSVLFDILI  SYASKPMQLA  TYFCSGELKD  NLNDWGHYAL  AVPLYTHFTS  PLRRYPDIVV  840
841   HRTLAAVIEA  EELYLKHRGL  LKVNNGEEVL  RRCFTGIYFD  KEAAASPQGK  EALSIAALNH  900
901   GIPSPELLAD  VAAYSNERKL  ASRHAEDACE  KLSMWVLLKK  KEIFLSDARV  LGLGPRFMSV  960
961   YIQKLAIERR  IYYDEVEGLN  VEWLESTSTL  VLNLSGHRRV  FKRGGLQHYM  ALGNVAWVVN  1020
1021  PYDLSVETGS  VDDCDATCMG  NNGVAFPDSE  PISKSWVDPG  TFPLTVRLLS  TIPVALYAIG  1080
1081  GDDGPLEIGV  RLYMSSYLK  1099
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGAGGGGTG  GAAGCGGCGT  TGCGGAGCAA  TCTATGATTG  TTGAGAGGGT  GGAGGATGCT  60
61    GATAAGGAGA  AGAAGAAGAA  ACGCCGATCT  AATCGTCGAT  CCAAACATAA  CTCAGTGAAT  120
121   GAAGCACGTG  TGGAATCATC  GGATAGCTTG  AAAAATGGAG  ACAAAACAAA  AAGTTTGACA  180
181   CAATCTATGA  GTTGTTCTTC  TTCATCGAAA  CAACAAGGAT  TGGAGACTGC  TTTGAATGAG  240
241   CAGACTCCTG  GTAGAGCATC  CGATTTTGCT  TTTAGTTCCA  TGCCTACGAT  GCATATAAAT  300
301   GAACAAGTTG  GCTCTGGTTG  TGGTGATGCT  GATGATGATG  TTGGTGGAAG  AACTTTTTCA  360
361   AAGTCGTGTC  CTGAACCAAT  TTCCTTGGCA  GGATCATCTA  AAGTGTGCAT  AGATGGTTTT  420
421   TTTCCTTTCC  ACCAGGTTGA  GGGTTTTGCT  CGAAAGGAAT  TGTTCGCTCC  ATATTGGCCT  480
481   ATAGAGGCTG  TAAACAAGGC  ATTAGAGAAA  GGGGAAGCTT  TTAAAGCATT  GTTTCGTGTG  540
541   AATGCTCACA  ATCGACTTGA  GGCATATTGC  AAAATTGACG  GGGTACCTAC  AGATGTTCTC  600
601   ATCAGTGGAG  TTTCTTCACA  GAATAGAGCT  GTTGAGGGAG  ATATTGTGGT  TATTAAGGTT  660
661   GATCCTTTGG  GATTGTGGAC  AAAGATGAAA  GGGTCAACTG  GGTCCTCAAA  CAATTCTGCA  720
721   CAGGTAGAAG  AGTATAATTT  AGTCCAAGAA  GTCGATGGAC  TGGCTGGTAA  TAGCTACAAG  780
781   GGTAAAGGTA  AGGTAGATGC  AGATTGTGAG  TATGCTCATT  GTAAAAGTGG  AGTACTCCTT  840
841   GAGAAAGGTG  TTTATGATGA  GGCAGGAATG  ACTAGAACGG  CAGCATTCAA  TAATGTTAAT  900
901   GGGCATTACC  AATCTAGTTC  AGATTCATCG  CATATGGGTT  TTTTTCCTGG  GCAGAATGAA  960
961   GGCATGAATT  CAGTGGATAG  GTTGGCTGCC  ATGACTAGTC  AATTTTCCCT  GAAACGACCA  1020
1021  ACTGGGAGGG  TTGTAGCAAT  TGTTGAAAAG  TCTCCTCGAC  GAGATGCTAT  TGTTGGTTTT  1080
1081  CTTAATGTTA  AGCAGTGGTT  TTCTTATCGA  GAACTTTATA  GAAAAGATGC  AAAGAAAAAT  1140
1141  TCGGCAATTT  TTGACCGTGA  GTATGTTACA  TTGACCCCAA  CTGATCCAAG  ATTTCCCAAA  1200
1201  ATGATTGTTT  ATGTGAGAGA  CTTACCAGAC  CGCATAAAGA  AAAGGTTGGA  AGATGGTGAT  1260
1261  GAAACAATTG  AGATGGAGTT  GGTAGCTGCT  CAAATTGAAG  ATTGGAGTGC  AGAAAGTCCT  1320
1321  TTTCCACAAG  CTCGTGTCTC  TCATTCTTTT  GGACGGGGTG  GTGAGTTGGA  ACCACAGATC  1380
1381  AATGCGATTC  TATATCAAAA  TGCAATCCTG  TGTACTGATT  TTCCTCCTCT  AGTGCTTTCT  1440
1441  TGTCTTCCGA  ATATTCCTTG  GGAAATCCCA  ATGGAGGAAT  TTCAAAGTAG  AAAAGACCTT  1500
1501  AAAGACTTGT  GTGTATTTAC  TATTGACCCA  TCCACTGCAT  CTGATCTTGA  TGATGCTTTA  1560
1561  TCTGTTGAAA  GGTTATCAAA  TGGCTCTTTT  AGAATTGGTG  TACACATTGC  AGATGTGTCA  1620
1621  TACTTTGTGC  TGCCAAACAC  TGCCTTAGAC  AAAGAAGCTC  AGATTCGATC  AACCAGTGTG  1680
1681  TACATGTTGC  ATAGGAAGAT  ACAGATGTTG  CCATCATTGC  TTTCAGAAAA  GCTTTGTTCG  1740
1741  CTTAATCCTG  GAGTAGATAG  GCTTGCATTT  TCTATATTCT  GGGACTTAAA  CAGCATGGGG  1800
1801  GATGTTTTGG  ACCGTTGGAT  TGGCCGTACA  GTTATAAGGT  CTTGTTGTAA  GCTTTCATAT  1860
1861  CAGCATGCTC  AAGACATAAT  CGAAGGGACA  ATTGATGTGG  AGAAATTTAA  TACTTTAGAA  1920
1921  GGTTATCCGC  AGTTGTATGG  CCAATTTGAA  TGGACTGATG  TTGTTAGATC  TGTTAAATGT  1980
1981  CTTCATGAAA  TTTCAAAAAC  TTTGATGGGG  AAAAGATTTA  ATGATGGTGC  TCTACAGCTT  2040
2041  GAAAGCTCCA  AAGTTGTTTA  CTTATTTGAT  GAATGTGGAG  TTCCATATGA  TTGCAGGCTA  2100
2101  AGTGAGAGGA  TGGATTCAAA  TTTTCTCATT  GAAGAGTTCA  TGCTTTTGGC  AAATATGACA  2160
2161  GCTGCAGAAG  TAATATCGAG  AGCTTTTCCA  GCTAGTGCAT  TATTGCGGAG  GCATCCTGAA  2220
2221  CCTAATATGA  GAAAGCTCAA  AGAGTTTGAA  GCTTTTTGTC  ACAAAAATGG  TCTAGCATTA  2280
2281  GATACTTCCT  CTTCTGGCCA  GTTTCATCAA  TCCTTGGAGA  AAATAAGGGA  AAAACTCAAG  2340
2341  GATGATTCTG  TTCTTTTCGA  TATTCTCATC  TCATATGCTT  CAAAACCGAT  GCAATTGGCT  2400
2401  ACTTACTTCT  GCAGTGGTGA  GTTAAAAGAT  AATTTGAATG  ATTGGGGTCA  CTATGCATTG  2460
2461  GCTGTTCCTC  TCTATACACA  TTTTACTTCA  CCACTACGTC  GGTATCCAGA  CATTGTGGTA  2520
2521  CATCGGACAT  TGGCTGCTGT  AATTGAAGCT  GAGGAGTTGT  ATCTAAAGCA  TAGAGGGTTG  2580
2581  CTTAAAGTCA  ACAATGGTGA  GGAAGTGCTA  AGAAGGTGTT  TCACTGGAAT  TTATTTTGAC  2640
2641  AAGGAAGCTG  CAGCCTCTCC  ACAAGGGAAA  GAAGCATTAT  CAATTGCTGC  ATTGAATCAT  2700
2701  GGAATTCCTT  CCCCTGAACT  CCTTGCTGAT  GTTGCTGCAT  ATAGCAATGA  AAGAAAGCTG  2760
2761  GCCAGTAGGC  ATGCTGAGGA  TGCCTGTGAG  AAACTCTCTA  TGTGGGTTTT  GCTAAAGAAA  2820
2821  AAAGAGATTT  TTTTGTCTGA  TGCTAGAGTA  TTGGGACTGG  GGCCAAGATT  TATGTCTGTT  2880
2881  TACATCCAGA  AGCTGGCTAT  TGAGCGAAGA  ATATACTATG  ATGAAGTTGA  AGGGTTAAAT  2940
2941  GTAGAATGGC  TTGAGTCTAC  CTCAACGTTG  GTGCTTAATT  TATCTGGCCA  CAGACGAGTG  3000
3001  TTCAAGAGAG  GTGGCCTACA  GCATTACATG  GCTTTAGGAA  ATGTTGCATG  GGTTGTGAAT  3060
3061  CCTTATGATC  TAAGTGTGGA  AACAGGTAGT  GTTGATGACT  GTGATGCAAC  ATGCATGGGG  3120
3121  AATAACGGGG  TGGCATTCCC  AGATTCAGAG  CCAATTTCAA  AATCTTGGGT  TGATCCTGGA  3180
3181  ACTTTTCCTC  TAACGGTGCG  TCTGCTTTCA  ACAATTCCTG  TGGCATTATA  TGCAATTGGT  3240
3241  GGTGATGATG  GACCCCTTGA  GATTGGAGTG  CGCTTATACA  TGAGTTCATA  TTTGAAGTAA  3300

▼ KEYWORD


ID
Family
Complete proteome
Cytoplasm
Exonuclease
Hydrolase
Magnesium
Manganese
Metal-binding
Nuclease
Reference proteome
RNA-binding

▼ GENE ONTOLOGY


ID
Classification
Description
Cellular Component
P-body
Molecular Function
3'-5'-exoribonuclease activity
Molecular Function
Metal ion binding
Molecular Function
RNA binding
Biological Process
Nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5'
Biological Process
Polyuridylation-dependent mRNA catabolic process

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Coc-1232Corchorus capsularis83.530.01787
LLPS-Gor-1182Gossypium raimondii78.150.01712
LLPS-Pot-0410Populus trichocarpa64.730.01328
LLPS-Mae-0163Manihot esculenta63.980.01317
LLPS-Prp-2024Prunus persica63.960.01310
LLPS-Viv-1225Vitis vinifera60.440.01263
LLPS-Via-0811Vigna angularis59.240.01229
LLPS-Glm-0896Glycine max58.90.01222
LLPS-Nia-0758Nicotiana attenuata58.590.0 987
LLPS-Orp-0891Oryza punctata58.360.0 679
LLPS-Vir-2122Vigna radiata58.210.01201
LLPS-Cus-0158Cucumis sativus58.040.01149
LLPS-Phv-1191Phaseolus vulgaris57.560.01188
LLPS-Arl-2334Arabidopsis lyrata57.480.01110
LLPS-Art-3016Arabidopsis thaliana57.060.01094
LLPS-Sol-0690Solanum lycopersicum56.660.01134
LLPS-Met-1269Medicago truncatula56.460.01112
LLPS-Bro-1203Brassica oleracea56.020.01059
LLPS-Brr-0817Brassica rapa55.680.01049
LLPS-Mua-1382Musa acuminata55.670.0 741
LLPS-Brn-1605Brassica napus55.340.01053
LLPS-Sei-1770Setaria italica55.070.0 578
LLPS-Dac-0857Daucus carota54.730.01061
LLPS-Hea-1109Helianthus annuus54.140.01018
LLPS-Amt-1799Amborella trichopoda51.80.01037
LLPS-Orb-1470Oryza barthii50.980.0 939
LLPS-Tru-1713Triticum urartu50.950.0 930
LLPS-Tra-1034Triticum aestivum50.620.0 959
LLPS-Ors-2185Oryza sativa49.710.0 962
LLPS-Org-0058Oryza glaberrima49.710.0 962
LLPS-Orm-2063Oryza meridionalis49.270.0 942
LLPS-Brd-0329Brachypodium distachyon49.070.0 956
LLPS-Orni-0108Oryza nivara49.030.0 942
LLPS-Orgl-1562Oryza glumaepatula49.030.0 939
LLPS-Orr-1910Oryza rufipogon49.030.0 941
LLPS-Anc-0115Anolis carolinensis48.914e-135 429
LLPS-Php-2293Physcomitrella patens48.670.0 772
LLPS-Sob-0198Sorghum bicolor48.280.0 898
LLPS-Lep-1146Leersia perrieri48.230.0 943
LLPS-Zem-0484Zea mays46.890.0 845
LLPS-Ori-0385Oryza indica46.120.0 865
LLPS-Sem-2073Selaginella moellendorffii45.510.0 799
LLPS-Cas-0684Carlito syrichta42.131e-105 348
LLPS-Scj-0973Schizosaccharomyces japonicus40.943e-116 387
LLPS-Drm-0729Drosophila melanogaster40.532e-83 298
LLPS-Cii-0167Ciona intestinalis40.378e-112 371
LLPS-Crn-0602Cryptococcus neoformans40.01e-0863.9
LLPS-Miv-0250Microbotryum violaceum39.443e-0862.4
LLPS-Abg-1284Absidia glauca39.272e-95 334
LLPS-Osl-1169Ostreococcus lucimarinus39.119e-123 394
LLPS-Xim-0752Xiphophorus maculatus38.947e-127 418
LLPS-Caj-4631Callithrix jacchus38.372e-123 403
LLPS-Orl-3310Oryzias latipes38.051e-134 441
LLPS-Fud-0309Fukomys damarensis37.823e-115 384
LLPS-Gas-0361Galdieria sulphuraria37.724e-84 300
LLPS-Usm-1068Ustilago maydis37.187e-0861.2
LLPS-Spr-0238Sporisorium reilianum37.187e-0861.2
LLPS-Lac-3886Latimeria chalumnae36.951e-123 402
LLPS-Orc-2408Oryctolagus cuniculus36.952e-90 308
LLPS-Eqc-4329Equus caballus36.871e-153 488
LLPS-Dos-0045Dothistroma septosporum36.811e-81 292
LLPS-Otg-4566Otolemur garnettii36.721e-149 477
LLPS-Maf-2637Macaca fascicularis36.689e-83 285
LLPS-Zyt-0092Zymoseptoria tritici36.671e-81 293
LLPS-Aon-0664Aotus nancymaae36.632e-149 476
LLPS-Caf-4143Canis familiaris36.591e-149 477
LLPS-Mup-2606Mustela putorius furo36.483e-147 470
LLPS-Phn-0059Phaeosphaeria nodorum36.433e-81 291
LLPS-Fia-3321Ficedula albicollis36.392e-144 462
LLPS-Icp-3156Ictalurus punctatus36.285e-114 384
LLPS-Hos-1985Homo sapiens36.272e-150 479
LLPS-Cap-2822Cavia porcellus36.272e-148 473
LLPS-Fec-3509Felis catus36.243e-149 476
LLPS-Sus-1529Sus scrofa36.234e-149 475
LLPS-Aim-3477Ailuropoda melanoleuca36.233e-147 470
LLPS-Rhb-3487Rhinopithecus bieti36.224e-118 392
LLPS-Pes-2611Pelodiscus sinensis36.24e-144 462
LLPS-Chs-0791Chlorocebus sabaeus36.141e-148 475
LLPS-Paa-4767Papio anubis36.141e-148 475
LLPS-Mal-4448Mandrillus leucophaeus36.142e-148 474
LLPS-Ict-4332Ictidomys tridecemlineatus36.126e-152 483
LLPS-Poa-2118Pongo abelii36.094e-93 322
LLPS-Pyt-0157Pyrenophora teres36.053e-80 288
LLPS-Pap-1418Pan paniscus36.011e-150 479
LLPS-Pat-4801Pan troglodytes36.011e-150 479
LLPS-Anp-1879Anas platyrhynchos35.986e-145 464
LLPS-Meg-0871Meleagris gallopavo35.891e-143 461
LLPS-Pytr-0631Pyrenophora triticirepentis35.861e-79 286
LLPS-Mam-2791Macaca mulatta35.763e-143 460
LLPS-Ten-0123Tetraodon nigroviridis35.73e-82 293
LLPS-Bot-1608Bos taurus35.531e-147 471
LLPS-Man-3526Macaca nemestrina35.497e-141 454
LLPS-Mum-1658Mus musculus35.433e-84 300
LLPS-Cea-2141Cercocebus atys35.423e-140 452
LLPS-Ova-1200Ovis aries35.411e-146 469
LLPS-Tag-0667Taeniopygia guttata35.46e-84 299
LLPS-Gog-1060Gorilla gorilla35.394e-137 441
LLPS-Orn-1293Oreochromis niloticus35.385e-81 290
LLPS-Myl-2135Myotis lucifugus35.362e-137 444
LLPS-Lem-0228Leptosphaeria maculans35.344e-79 286
LLPS-Pof-0165Poecilia formosa35.338e-84 298
LLPS-Gaga-3692Gallus gallus35.327e-142 463
LLPS-Gaa-3398Gasterosteus aculeatus35.292e-82 295
LLPS-Ran-3223Rattus norvegicus35.244e-83 298
LLPS-Nol-1343Nomascus leucogenys35.244e-80 289
LLPS-Xet-1007Xenopus tropicalis35.216e-138 442
LLPS-Mod-0294Monodelphis domestica35.149e-84 298
LLPS-Leo-2703Lepisosteus oculatus35.15e-143 463
LLPS-Scm-0177Scophthalmus maximus35.01e-81 292
LLPS-Mea-1429Mesocricetus auratus34.997e-85 301
LLPS-Nec-0048Neurospora crassa34.983e-79 285
LLPS-Fus-0949Fusarium solani34.957e-79 284
LLPS-Loa-2876Loxodonta africana34.932e-80 290
LLPS-Asm-0879Astyanax mexicanus34.914e-82 292
LLPS-Orbr-0000Oryza brachyantha34.878e-82 292
LLPS-Dio-4231Dipodomys ordii34.861e-78 283
LLPS-Dar-1013Danio rerio34.782e-84 300
LLPS-Scf-1214Scleropages formosus34.775e-82 293
LLPS-Sah-1411Sarcophilus harrisii34.752e-82 295
LLPS-Hov-0455Hordeum vulgare34.741e-82 295
LLPS-Scc-0791Schizosaccharomyces cryophilus34.52e-79 286
LLPS-Asc-0144Aspergillus clavatus34.433e-78 283
LLPS-Tar-0518Takifugu rubripes34.42e-82 295
LLPS-Tut-0194Tursiops truncatus34.232e-83 297
LLPS-Urm-0337Ursus maritimus34.183e-80 288
LLPS-Cae-1566Caenorhabditis elegans34.12e-97 335
LLPS-Ast-0158Aspergillus terreus33.881e-78 284
LLPS-Nef-0107Neosartorya fischeri33.882e-78 284
LLPS-Asfu-0412Aspergillus fumigatus33.883e-78 283
LLPS-Mel-0485Melampsora laricipopulina31.815e-118 393
LLPS-Trv-0077Trichoderma virens30.341e-80 289
LLPS-Put-0086Puccinia triticina30.112e-105 367
LLPS-Blg-0036Blumeria graminis30.085e-84 300
LLPS-Pug-0682Puccinia graminis30.09e-105 365