Tursiops truncatus      Regulator


※ Regulator introduction

    The LLPS of scaffold proteins and the stability of MLOs can be modulated by PTMs and other proteins (1-4). For example, arginine methylation of FUS by PRMT1 or PRMT8 reduces the LLPS of FUS, and both PRMTs were classified as PTM regulators. Also, Buchan et al. conducted a microscopy-based genetic screen of >4000 gene deletions in Saccharomyces cerevisiae, and identified 125 genes to be involved in regulating the stability and formation of P-bodies and/or stress granules (5). None of these proteins have been characterized to undergo LLPS, and here we classified all the 125 proteins as MLO regulators.

References
1. Vernon, R.M. and Forman-Kay, J.D. (2019) First-generation predictors of biological protein phase separation. Current opinion in structural biology 58, 88-96. PMID: 31252218
2. Wang, Z. and Zhang, H. (2019) Phase Separation, Transition, and Autophagic Degradation of Proteins in Development and Pathogenesis. Trends in cell biology, 29, 417-427. PMID: 30826216
3. Alberti, S., Gladfelter, A. and Mittag, T. (2019) Considerations and challenges in studying liquid-liquid phase separation and biomolecular condensates. Cell, 176, 419-434. PMID: 30682370
4. Bergeron-Sandoval, L.P., Safaee, N. and Michnick, S.W. (2016) Mechanisms and Consequences of Macromolecular Phase Separation. Cell, 165, 1067-1079. PMID: 27203111
5. Buchan, J.R., Kolaitis, R.M., Taylor, J.P. and Parker, R. (2013) Eukaryotic stress granules are cleared by autophagy and Cdc48/VCP function. Cell, 176, 419-434. PMID: 23791177


There are 353 genes.  Reviewed (0 or Unreviewed (353

No.StatusDrLLPS IDEnsemble Gene IDUniProt AccessionGene Name
1
LLPS-Tut-0167
ENSTTRG00000000987.1
2
LLPS-Tut-0343
ENSTTRG00000005537.2
3
LLPS-Tut-0412
ENSTTRG00000011346.1
4
LLPS-Tut-0433
ENSTTRG00000008207.1
5
LLPS-Tut-0578
ENSTTRG00000006661.1
6
LLPS-Tut-0595
ENSTTRG00000000163.1
7
LLPS-Tut-0674
ENSTTRG00000000385.1
8
LLPS-Tut-0682
ENSTTRG00000012069.1
9
LLPS-Tut-0872
ENSTTRG00000011952.1
10
LLPS-Tut-1108
ENSTTRG00000009213.1
11
LLPS-Tut-1151
ENSTTRG00000011417.1
12
LLPS-Tut-1188
ENSTTRG00000003558.1
13
LLPS-Tut-1410
ENSTTRG00000008191.1
14
LLPS-Tut-1445
ENSTTRG00000006413.1
15
LLPS-Tut-1764
ENSTTRG00000010623.1
16
LLPS-Tut-0039
ENSTTRG00000002176.1
A0A2U3V2M6
ABT1
17
LLPS-Tut-1753
ENSTTRG00000017109.1
A0A2U4CBP7
ABTB1
18
LLPS-Tut-2457
ENSTTRG00000014633.1
A0A2U3V779
ADAMTS1
19
LLPS-Tut-1202
ENSTTRG00000006247.1
A0A2U4BED5
ADK
20
LLPS-Tut-1935
ENSTTRG00000008381.1
A0A2U3V401
ADRB2
21
LLPS-Tut-1527
ENSTTRG00000014095.1
A0A2U3UYZ1
AIF1
22
LLPS-Tut-2305
ENSTTRG00000014947.1
A0A2U4APD7
AKT1S1
23
LLPS-Tut-0653
ENSTTRG00000010036.1
A0A2U3V4H0
ANKZF1
24
LLPS-Tut-1541
ENSTTRG00000008712.1
P0DMM1
APOE
25
LLPS-Tut-1571
ENSTTRG00000004308.1
A0A2U3V1M9
ARCN1
26
LLPS-Tut-0264
ENSTTRG00000017202.1
A0A2U3V6C2
ARL1
27
LLPS-Tut-0969
ENSTTRG00000013969.1
A0A2U4AW68
ASF1A
28
LLPS-Tut-1914
ENSTTRG00000014692.1
A0A2U4AZA2
ASF1B
29
LLPS-Tut-1244
ENSTTRG00000004353.1
A0A2U4AAC9
ATG3
30
LLPS-Tut-1316
ENSTTRG00000016560.1
A0A2U4C3U2
ATG7
31
LLPS-Tut-2275
ENSTTRG00000012682.1
A0A2U4BFN2
ATP12A
32
LLPS-Tut-1236
ENSTTRG00000002920.1
A0A2U4BA48
ATP2C1
33
LLPS-Tut-2104
ENSTTRG00000004768.1
A0A2U3V8E6
ATP5O
34
LLPS-Tut-1721
ENSTTRG00000007171.1
A0A2U4BNS9
ATP6V0A1
35
LLPS-Tut-1399
ENSTTRG00000008231.1
A0A2U4AMP2
ATP6V0C
36
LLPS-Tut-1099
ENSTTRG00000010626.1
A0A2U4C809
ATP6V0E1
37
LLPS-Tut-0145
ENSTTRG00000012236.1
A0A2U4BXX9
ATP6V1B1
38
LLPS-Tut-0937
ENSTTRG00000011890.1
A0A2U4BYJ2
ATP6V1E2
39
LLPS-Tut-1870
ENSTTRG00000001489.1
A0A2U4BKB1
BICD1
40
LLPS-Tut-0406
ENSTTRG00000011743.1
A0A2U4BPI0
BRCA1
41
LLPS-Tut-0554
ENSTTRG00000003262.1
A0A2U3V6G9
BRIX1
42
LLPS-Tut-1360
ENSTTRG00000007290.1
A0A2U3V6K6
BTF3
43
LLPS-Tut-1656
ENSTTRG00000003221.1
A0A2U3V018
CALM1
44
LLPS-Tut-1674
ENSTTRG00000009777.1
A0A2U4C453
CAMK1
45
LLPS-Tut-0783
ENSTTRG00000017316.1
A0A2U4ATJ9
CAMP
46
LLPS-Tut-1695
ENSTTRG00000010424.1
A0A2U4C0N6
CCNB3
47
LLPS-Tut-1771
ENSTTRG00000009463.1
A0A2U4CL56
CDC25B
48
LLPS-Tut-1782
ENSTTRG00000009299.1
A0A2U4A548
CDC73
49
LLPS-Tut-1473
ENSTTRG00000001085.1
A0A2U4BDY1
CDK1
50
LLPS-Tut-1122
ENSTTRG00000002877.1
A0A2U4AXF6
CDK7
51
LLPS-Tut-0171
ENSTTRG00000006523.1
A0A2U3V084
CENPU
52
LLPS-Tut-0218
ENSTTRG00000007831.1
A0A2U4A249
CHIA
53
LLPS-Tut-0043
ENSTTRG00000016175.1
A0A2U4BF60
CKS2
54
LLPS-Tut-0685
ENSTTRG00000009363.1
A0A2U4BIV3
CNOT6
55
LLPS-Tut-0865
ENSTTRG00000015951.1
A0A2U4AH97
CNOT8
56
LLPS-Tut-1351
ENSTTRG00000010506.1
A0A2U3V740
CRYAB
57
LLPS-Tut-0212
ENSTTRG00000015583.1
A0A2U4A114
CSDE1
58
LLPS-Tut-0115
ENSTTRG00000009184.1
A0A2U4BDE5
CTCF
59
LLPS-Tut-1027
ENSTTRG00000015672.1
A0A2U4C2C6
CTCFL
60
LLPS-Tut-2449
ENSTTRG00000010567.1
A0A2U4BKG3
CTPS1
61
LLPS-Tut-0206
ENSTTRG00000008583.1
A0A2U4CFR5
CTSC
62
LLPS-Tut-0247
ENSTTRG00000004020.1
A0A2U3V6J3
DBR1
63
LLPS-Tut-0753
ENSTTRG00000015218.1
A0A2U4B2L2
DDX18
64
LLPS-Tut-1177
ENSTTRG00000007931.1
A0A2U4B8U1
DDX39A
65
LLPS-Tut-0044
ENSTTRG00000001906.1
A0A2U4C0L2
DDX3X
66
LLPS-Tut-0194
ENSTTRG00000004248.1
A0A2U3V794
DIS3
67
LLPS-Tut-1457
ENSTTRG00000010513.1
A0A2U4BWD3
DLAT
68
LLPS-Tut-0163
ENSTTRG00000015868.1
A0A2U4CKK8
DNAJA4
69
LLPS-Tut-0152
ENSTTRG00000000097.1
A0A2U4A1H0
DNAJB4
70
LLPS-Tut-1200
ENSTTRG00000004204.1
A0A2U4A2M9
DNTTIP2
71
LLPS-Tut-1879
ENSTTRG00000002645.1
A0A2U4AXU0
DPP6
72
LLPS-Tut-1479
ENSTTRG00000000181.1
A0A2U3V2W7
DRD3
73
LLPS-Tut-1614
ENSTTRG00000012138.1
A0A2U3V9Z1
DUSP12
74
LLPS-Tut-0179
ENSTTRG00000005101.1
A0A2U4BP69
DUSP3
75
LLPS-Tut-0998
ENSTTRG00000013207.1
A0A2U4AQM6
DYNC1I1
76
LLPS-Tut-0362
ENSTTRG00000006809.1
A0A2U4C6I4
DYNLL2
77
LLPS-Tut-0276
ENSTTRG00000000077.1
A0A2U3V819
DYRK2
78
LLPS-Tut-1307
ENSTTRG00000012102.1
A0A2U3UZK9
DYRK3
79
LLPS-Tut-1127
ENSTTRG00000004659.1
A0A2U4ARM7
EGF
80
LLPS-Tut-2074
ENSTTRG00000006882.1
A0A2U4BZL3
EIF2AK2
81
LLPS-Tut-2332
ENSTTRG00000000035.1
A0A2U4BC90
EIF2AK4
82
LLPS-Tut-1411
ENSTTRG00000001921.1
A0A2U4A6E8
EIF2B2
83
LLPS-Tut-2382
ENSTTRG00000006637.1
A0A2U3ZZS8
EIF3D
84
LLPS-Tut-1262
ENSTTRG00000011025.1
A0A2U3V6P9
EIF3E
85
LLPS-Tut-0516
ENSTTRG00000016586.1
A0A2U3V4R9
EIF3F
86
LLPS-Tut-1981
ENSTTRG00000004549.1
A0A2U4B5W5
EIF3G
87
LLPS-Tut-0319
ENSTTRG00000008032.1
A0A2U4CBG9
EIF4B
88
LLPS-Tut-0392
ENSTTRG00000004206.1
A0A2U4AM14
EIF4E
89
LLPS-Tut-1605
ENSTTRG00000004474.1
A0A2U3UYV8
EIF4EBP2
90
LLPS-Tut-2293
ENSTTRG00000010284.1
A0A2U4CJL3
EIF4ENIF1
91
LLPS-Tut-0111
ENSTTRG00000002384.1
A0A2U3V6L5
EIF5
92
LLPS-Tut-1153
ENSTTRG00000017011.1
A0A2U4CLF4
EIF6
93
LLPS-Tut-0402
ENSTTRG00000011534.1
A0A2U4AJ06
ELOC
94
LLPS-Tut-0691
ENSTTRG00000016992.1
A0A2U4C281
EP300
95
LLPS-Tut-0780
ENSTTRG00000013963.1
A0A2U3V022
ERH
96
LLPS-Tut-1178
ENSTTRG00000016922.1
A0A2U3UYX4
ERP44
97
LLPS-Tut-0341
ENSTTRG00000005507.1
A0A2U4AGG3
ETF1
98
LLPS-Tut-0097
ENSTTRG00000010241.1
A0A2U4BCX3
EXOC3L1
99
LLPS-Tut-0420
ENSTTRG00000011779.1
A0A2U3V2J6
EXOSC3
100
LLPS-Tut-0726
ENSTTRG00000007189.1
A0A2U3V1Z4
EXOSC7
101
LLPS-Tut-0575
ENSTTRG00000001556.1
A0A2U4BVI8
FAM118B
102
LLPS-Tut-2038
ENSTTRG00000008010.1
A0A2U3V906
FAM98A
103
LLPS-Tut-1907
ENSTTRG00000017246.1
A0A2U3V7D8
FAU
104
LLPS-Tut-2380
ENSTTRG00000012176.1
A0A2U4C7L0
FBXW11
105
LLPS-Tut-1960
ENSTTRG00000002440.1
A0A2U3V4B1
FCF1
106
LLPS-Tut-1192
ENSTTRG00000011237.1
A0A2U3UZS9
FEN1
107
LLPS-Tut-1847
ENSTTRG00000004425.1
A0A2U4AEL3
FERMT2
108
LLPS-Tut-0314
ENSTTRG00000005594.1
A0A2U4BVN0
FLI1
109
LLPS-Tut-1062
ENSTTRG00000010231.1
A0A2U4C2N6
FXR2
110
LLPS-Tut-0091
ENSTTRG00000008758.1
A0A2U4BTS5
FZR1
111
LLPS-Tut-1340
ENSTTRG00000013795.1
A0A2U3V687
G3BP2
112
LLPS-Tut-1757
ENSTTRG00000007027.1
A0A2U3V3X8
G6PD
113
LLPS-Tut-1514
ENSTTRG00000009099.1
A0A2U3V6T7
GABARAPL1
114
LLPS-Tut-0309
ENSTTRG00000000334.1
A0A2U4AKT0
GARS
115
LLPS-Tut-0409
ENSTTRG00000005538.1
A0A2U3UZV0
GDPD1
116
LLPS-Tut-2254
ENSTTRG00000003065.1
A0A2U3V747
GEMIN4
117
LLPS-Tut-0476
ENSTTRG00000014326.1
A0A2U3V5Q9
GEMIN6
118
LLPS-Tut-0105
ENSTTRG00000009266.1
A0A2U4AJJ9
GEMIN8
119
LLPS-Tut-1498
ENSTTRG00000011590.1
A0A2U4CHB9
GLE1
120
LLPS-Tut-0228
ENSTTRG00000011831.1
A0A2U4BBG6
GLTSCR2
121
LLPS-Tut-1269
ENSTTRG00000002755.1
A0A2U3V163
GMPPB
122
LLPS-Tut-0787
ENSTTRG00000008287.1
A0A2U4CHJ3
GNL1
123
LLPS-Tut-2284
ENSTTRG00000012531.1
A0A2U3V7U6
GPN1
124
LLPS-Tut-0443
ENSTTRG00000016652.1
A0A2U4AAG1
GSK3B
125
LLPS-Tut-0352
ENSTTRG00000014196.1
A0A2U4CLP3
GSS
126
LLPS-Tut-1296
ENSTTRG00000015855.1
A0A2U3V9Z0
HAX1
127
LLPS-Tut-1565
ENSTTRG00000002809.1
A0A2U3V031
HINFP
128
LLPS-Tut-1708
ENSTTRG00000009693.1
A0A2U4A1Z6
HMGCS2
129
LLPS-Tut-1028
ENSTTRG00000012262.1
A0A2U4AHU3
HOXB9
130
LLPS-Tut-1449
ENSTTRG00000000228.1
A0A2U3V392
HPGDS
131
LLPS-Tut-1066
ENSTTRG00000017399.1
A0A2U4CHC9
HSPA5
132
LLPS-Tut-0805
ENSTTRG00000000862.1
A0A2U3V846
HSPB3
133
LLPS-Tut-2493
ENSTTRG00000014608.1
A0A2U4CL04
HSPB8
134
LLPS-Tut-0274
ENSTTRG00000015862.1
A0A2U4CKP9
IDH3A
135
LLPS-Tut-0024
ENSTTRG00000006482.1
Q9TV67
IFNG
136
LLPS-Tut-1518
ENSTTRG00000010976.1
A0A2U4AIJ6
IFRD1
137
LLPS-Tut-2068
ENSTTRG00000014670.1
A0A2U4C6X6
IGF1R
138
LLPS-Tut-2016
ENSTTRG00000009341.1
A0A2U4C8X8
IKBKAP
139
LLPS-Tut-0879
ENSTTRG00000002756.1
A0A2U4B2D9
IP6K1
140
LLPS-Tut-0435
ENSTTRG00000006944.1
A0A2U3V6B6
IP6K3
141
LLPS-Tut-1109
ENSTTRG00000008626.1
A0A2U4AG73
IPO4
142
LLPS-Tut-1106
ENSTTRG00000001707.1
A0A2U4BMA4
JMJD6
143
LLPS-Tut-1266
ENSTTRG00000016927.1
A0A2U3V584
KAT7
144
LLPS-Tut-1176
ENSTTRG00000015552.1
A0A2U3V6K7
KAT8
145
LLPS-Tut-0834
ENSTTRG00000013488.1
A0A2U4CGI8
KIF23
146
LLPS-Tut-0545
ENSTTRG00000007001.1
A0A2U4CJ01
KLHDC3
147
LLPS-Tut-0962
ENSTTRG00000000079.1
A0A2U4C8N2
KPNA4
148
LLPS-Tut-0186
ENSTTRG00000012599.1
A0A2U4BFI5
KRAS
149
LLPS-Tut-0747
ENSTTRG00000015934.1
A0A2U4AH90
LARP1
150
LLPS-Tut-0699
ENSTTRG00000011657.1
A0A2U3V6Y1
LBR
151
LLPS-Tut-0643
ENSTTRG00000001531.1
A0A2U4CL95
LIF
152
LLPS-Tut-1040
ENSTTRG00000003979.1
A0A2U4APU3
LIM2
153
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LMNB1
154
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155
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NAPB
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NONO
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NSF
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NXT1
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NYX
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PAK1
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228
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230
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231
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PPRC1
232
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ENSTTRG00000004738.1
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PQBP1
233
LLPS-Tut-2194
ENSTTRG00000002153.1
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PRIM1
234
LLPS-Tut-1998
ENSTTRG00000014685.1
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PRKACB
235
LLPS-Tut-0450
ENSTTRG00000001501.1
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PRMT5
236
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ENSTTRG00000002069.1
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PRMT8
237
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ENSTTRG00000011117.1
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PRPF18
238
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ENSTTRG00000003634.1
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PSMA1
239
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PSMA5
240
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ENSTTRG00000011050.1
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PSMA7
241
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ENSTTRG00000007260.1
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PSMB2
242
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ENSTTRG00000006651.1
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PSMB3
243
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ENSTTRG00000001505.1
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PSMB5
244
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ENSTTRG00000000566.1
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PSMB6
245
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PSMB7
246
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PSMC2
247
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PSMD3
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PSPC1
252
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PTCRA
253
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PUM2
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RAB10
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RALB
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RAN
257
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SLC15A1
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SLC39A1
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SMPD3
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SNAP25
305
LLPS-Tut-1666
ENSTTRG00000007827.1
A0A2U3V576
SNRPC
306
LLPS-Tut-2013
ENSTTRG00000002654.1
A0A2U4AYR7
SNRPD1
307
LLPS-Tut-0382
ENSTTRG00000010966.1
A0A2U4C7M9
SNRPN
308
LLPS-Tut-1779
ENSTTRG00000008576.1
A0A2U3V1R5
SPCS1
309
LLPS-Tut-1465
ENSTTRG00000003853.1
A0A2U4BGG4
SPG20
310
LLPS-Tut-0381
ENSTTRG00000000036.1
A0A2U3V2Z8
SRP14
311
LLPS-Tut-1220
ENSTTRG00000010945.1
A0A2U3V8V0
SRP72
312
LLPS-Tut-1318
ENSTTRG00000010081.1
A0A2U4A4L2
SRP9
313
LLPS-Tut-1488
ENSTTRG00000013447.1
A0A2U3UZ23
SRSF3
314
LLPS-Tut-0766
ENSTTRG00000012670.1
A0A2U3V0F2
SST
315
LLPS-Tut-0533
ENSTTRG00000003466.1
A0A2U4BHF6
STRAP
316
LLPS-Tut-2473
ENSTTRG00000008403.1
A0A2U4A917
STX1B
317
LLPS-Tut-1373
ENSTTRG00000002483.1
A0A2U3V2L5
STX5
318
LLPS-Tut-2442
ENSTTRG00000003893.1
A0A2U3V2V6
STYX
319
LLPS-Tut-1047
ENSTTRG00000013769.1
A0A2U4A9N4
STYXL1
320
LLPS-Tut-0475
ENSTTRG00000000642.1
A0A2U4BND3
SUMO1
321
LLPS-Tut-2087
ENSTTRG00000004092.1
A0A2U4ANQ5
SUPT6H
322
LLPS-Tut-0743
ENSTTRG00000016207.1
A0A2U4C7V6
TARSL2
323
LLPS-Tut-1452
ENSTTRG00000017299.1
A0A2U4CA01
TDGF1
324
LLPS-Tut-0198
ENSTTRG00000000150.1
A0A2U4CGP9
TDRD7
325
LLPS-Tut-2105
ENSTTRG00000006405.1
A0A2U4AFH7
TDRD9
326
LLPS-Tut-0812
ENSTTRG00000003745.1
A0A2U4AID5
TERF1
327
LLPS-Tut-1305
ENSTTRG00000010015.1
A0A2U3V434
TERF2
328
LLPS-Tut-1712
ENSTTRG00000001222.1
A0A2U3VAP4
TERF2IP
329
LLPS-Tut-1561
ENSTTRG00000013665.1
A0A2U4CGK0
TGFBR1
330
LLPS-Tut-2019
ENSTTRG00000010122.1
A0A2U3V0S1
TMEM97
331
LLPS-Tut-0060
ENSTTRG00000012164.1
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TOPORS
332
LLPS-Tut-1891
ENSTTRG00000005073.1
A0A2U4CL82
TRIB3
333
LLPS-Tut-2390
ENSTTRG00000002415.1
A0A2U4C9F0
TRIM32
334
LLPS-Tut-1417
ENSTTRG00000001588.1
A0A2U4ARP3
TRPC3
335
LLPS-Tut-1682
ENSTTRG00000016275.1
A0A2U4AEH2
TRPC6
336
LLPS-Tut-1913
ENSTTRG00000001177.1
A0A2U3V0Q7
TSR1
337
LLPS-Tut-0954
ENSTTRG00000016404.1
A0A2U4BP52
TUBG1
338
LLPS-Tut-1204
ENSTTRG00000003816.1
A0A2U4BUI6
U2AF1L4
339
LLPS-Tut-1385
ENSTTRG00000021461.1
A0A2U3V125
UBA52
340
LLPS-Tut-2107
ENSTTRG00000009244.1
A0A2U4BCJ2
UBE2D1
341
LLPS-Tut-2205
ENSTTRG00000002001.1
A0A2U3V8Z2
UBE2F
342
LLPS-Tut-1299
ENSTTRG00000001715.1
A0A2U4CB75
UBXN6
343
LLPS-Tut-2229
ENSTTRG00000014941.1
A0A2U3V5M1
UFD1L
344
LLPS-Tut-1971
ENSTTRG00000016981.1
A0A2U4C0J4
USP27X
345
LLPS-Tut-0635
ENSTTRG00000013865.1
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UTP18
346
LLPS-Tut-0689
ENSTTRG00000006231.1
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VCP
347
LLPS-Tut-0606
ENSTTRG00000010265.1
A0A2U4B142
VEGFB
348
LLPS-Tut-0266
ENSTTRG00000005719.1
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VRK1
349
LLPS-Tut-0728
ENSTTRG00000003314.1
A0A2U4AEQ1
WDHD1
350
LLPS-Tut-0310
ENSTTRG00000010253.1
A0A2U4C2U5
WRAP53
351
LLPS-Tut-0509
ENSTTRG00000006347.1
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XPO5
352
LLPS-Tut-0737
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YIPF3
353
LLPS-Tut-1170
ENSTTRG00000010657.1
A0A2U4AIJ9
ZFHX4