• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Xet-1524
itgb1

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: Integrin beta
Gene Name: itgb1
Ensembl Gene: ENSXETG00000026716.2
Ensembl Protein: ENSXETP00000048743.3
Organism: Xenopus tropicalis
Taxa ID: 8364
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Stress granulePredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MARYSVLTFG  LLTCLALCIN  AQQGGTECLK  ANAKSCGECI  QAGPNCGWCT  KVNFLQEGEP  60
61    TSARCDDLAA  LKNKGCPEED  IQNPRGRKQK  LKDIPITNKG  KGERMDPANI  TQIRPQQLVF  120
121   ELRSGEPQTF  NLTFRRAEDY  PIDLYYLMDL  SFSMKDDLEN  VKSLGTALMT  EMEKITSDFR  180
181   IGFGSFVEKT  VMPYISTTPA  KLINPCTSDQ  NCTSPFSYKN  VLNLTSDGKL  FNDLVGKQQI  240
241   SGNLDSPEGG  FDAIMQVAVC  GEQIGWRNVT  RLLVFSTDAG  FHFAGDGKLG  GIVLPNDGKC  300
301   HLHGNMYTMS  HYYDYPSIAH  LVQKLSENNI  QTIFAVTEDF  QPVYQELKNL  IPKSAVGTLS  360
361   SNSSNVIQLI  IDSYNSLSSE  LILENSKLPE  GVTISYKSFC  KNGVKGTGED  GRKCSNISIG  420
421   DQVEFEISVT  AHKCPKKGQA  ESIKIKPLGF  TEEVEIVLQF  ICECDCQEKG  TPNSPECHHG  480
481   NGTFECGACR  CNEGRIGKEC  ECSTDEVNSE  DMDAYCRREN  SSEICSNNGD  CICGQCVCKK  540
541   RDNPNEVYSG  KYCECDNFNC  DRSNGLICGG  KGVCKCRVCE  CFPNYSGSAC  DCSEDTSTCM  600
601   AKNGQICNGR  GICDCGRCKC  TDPKFQGPTC  ELCQTCVGVC  TEHKECVQCR  AFQKGEKQEV  660
661   CLEQCMHFNI  SLVESREDLP  QPGQAEALTH  CKEKDAEDCW  FYFTYSVDSK  NEVLVHVVKE  720
721   PECPSGPDII  PIVAGVVAGI  VLIGLALLLI  WKLLMIIHDR  REFAKFEKEK  MNAKWDTGEN  780
781   PIYKSAVTTV  VNPKYEGK  798
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGCCCGTT  ATTCAGTATT  GACGTTTGGA  TTACTTACTT  GTTTGGCTTT  GTGCATAAAT  60
61    GCCCAGCAAG  GTGGGACAGA  ATGTCTAAAA  GCAAATGCCA  AATCATGTGG  AGAATGTATT  120
121   CAAGCCGGGC  CCAACTGCGG  CTGGTGCACT  AAAGTGAACT  TCTTACAAGA  AGGAGAGCCC  180
181   ACGTCAGCAC  GTTGTGACGA  TTTGGCTGCT  TTGAAAAACA  AAGGCTGCCC  TGAAGAAGAC  240
241   ATCCAAAACC  CCAGGGGACG  TAAACAAAAG  CTAAAAGATA  TCCCAATAAC  AAACAAAGGG  300
301   AAAGGAGAAC  GTATGGACCC  TGCAAACATC  ACCCAAATCC  GACCTCAACA  ACTGGTATTC  360
361   GAACTGCGAT  CAGGTGAACC  CCAGACATTT  AATTTGACAT  TCAGAAGAGC  AGAAGACTAT  420
421   CCAATTGACC  TGTACTATCT  TATGGACCTC  TCATTTTCTA  TGAAAGATGA  CTTGGAGAAC  480
481   GTTAAAAGCC  TTGGAACAGC  ACTAATGACA  GAAATGGAGA  AAATTACTTC  AGATTTCCGG  540
541   ATAGGTTTTG  GCTCTTTTGT  GGAAAAAACA  GTCATGCCCT  ACATAAGCAC  CACTCCTGCC  600
601   AAGCTTATTA  ACCCATGCAC  AAGTGATCAG  AATTGCACCA  GCCCATTCAG  CTATAAAAAT  660
661   GTCCTCAACC  TCACTAGCGA  CGGAAAGTTG  TTTAACGACC  TGGTAGGCAA  GCAGCAGATC  720
721   TCCGGTAACT  TGGATTCTCC  CGAGGGAGGC  TTTGATGCAA  TTATGCAGGT  TGCGGTCTGT  780
781   GGTGAGCAAA  TTGGTTGGAG  AAATGTCACA  CGCTTGCTGG  TCTTCTCAAC  TGACGCAGGA  840
841   TTCCATTTTG  CCGGAGATGG  AAAATTAGGC  GGCATTGTAT  TGCCAAATGA  TGGCAAATGT  900
901   CATTTGCATG  GGAACATGTA  CACAATGAGC  CACTATTATG  ACTATCCCTC  AATTGCTCAC  960
961   CTAGTTCAGA  AACTTAGTGA  AAACAACATT  CAGACCATTT  TTGCTGTTAC  AGAGGATTTC  1020
1021  CAGCCAGTCT  ACCAGGAGCT  GAAAAATCTG  ATACCAAAAT  CAGCTGTGGG  AACCTTGTCG  1080
1081  TCAAATTCCA  GCAATGTGAT  TCAACTGATT  ATTGACTCCT  ATAATTCTCT  TTCCTCTGAA  1140
1141  CTTATTTTGG  AAAACAGCAA  ATTGCCAGAG  GGTGTAACAA  TCAGCTATAA  ATCATTCTGT  1200
1201  AAGAATGGAG  TCAAGGGAAC  TGGGGAGGAT  GGAAGGAAAT  GTTCAAACAT  TTCTATTGGA  1260
1261  GATCAGGTGG  AATTTGAAAT  TAGTGTGACA  GCTCACAAGT  GCCCCAAAAA  AGGACAAGCG  1320
1321  GAATCCATAA  AAATCAAACC  ACTTGGATTT  ACCGAAGAAG  TAGAGATTGT  TCTCCAGTTC  1380
1381  ATCTGTGAAT  GTGATTGCCA  GGAAAAAGGG  ACGCCCAACA  GCCCTGAATG  TCATCATGGA  1440
1441  AATGGAACAT  TCGAATGTGG  TGCCTGCAGA  TGTAATGAGG  GGCGCATTGG  GAAGGAGTGT  1500
1501  GAATGCAGCA  CCGATGAAGT  AAACAGCGAA  GATATGGACG  CTTATTGTCG  AAGAGAAAAT  1560
1561  AGCTCTGAAA  TCTGCAGTAA  CAACGGGGAC  TGTATATGCG  GCCAGTGTGT  GTGCAAAAAA  1620
1621  CGGGACAATC  CCAATGAAGT  TTACTCCGGC  AAGTACTGTG  AATGCGACAA  CTTCAACTGT  1680
1681  GACAGATCCA  ATGGGCTGAT  TTGTGGAGGT  AAAGGCGTGT  GCAAGTGTCG  AGTATGTGAA  1740
1741  TGTTTCCCCA  ATTACTCCGG  CAGTGCTTGT  GACTGCTCAG  AGGATACCTC  CACTTGTATG  1800
1801  GCAAAAAATG  GCCAGATATG  TAACGGGAGA  GGAATATGTG  ACTGTGGAAG  GTGTAAATGT  1860
1861  ACAGATCCTA  AATTCCAAGG  ACCAACCTGT  GAACTGTGTC  AGACCTGCGT  TGGTGTTTGT  1920
1921  ACGGAGCACA  AAGAATGTGT  CCAGTGCCGA  GCTTTCCAGA  AAGGAGAGAA  GCAAGAAGTA  1980
1981  TGCCTGGAGC  AGTGCATGCA  CTTTAACATC  TCTTTAGTGG  AAAGTCGGGA  AGACTTGCCC  2040
2041  CAGCCAGGCC  AGGCAGAAGC  CCTCACACAC  TGTAAGGAAA  AGGATGCAGA  AGACTGCTGG  2100
2101  TTTTACTTCA  CGTATTCAGT  CGATTCAAAG  AATGAAGTTC  TGGTGCATGT  GGTGAAGGAG  2160
2161  CCAGAGTGTC  CCAGCGGTCC  TGACATCATT  CCTATTGTCG  CCGGTGTGGT  TGCTGGCATT  2220
2221  GTGCTCATCG  GACTGGCACT  GTTGCTCATA  TGGAAACTGC  TTATGATCAT  TCACGACAGA  2280
2281  AGGGAGTTTG  CCAAGTTCGA  GAAGGAGAAA  ATGAACGCTA  AATGGGACAC  TGGCGAAAAT  2340
2341  CCCATCTACA  AGAGCGCCGT  GACAACCGTG  GTGAATCCTA  AATATGAGGG  AAAATGA  2397

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Fia-1331Ficedula albicollis86.940.01052
LLPS-Tag-2959Taeniopygia guttata84.070.01255
LLPS-Meg-3107Meleagris gallopavo83.690.01262
LLPS-Anp-2821Anas platyrhynchos83.350.01250
LLPS-Ora-1844Ornithorhynchus anatinus82.870.01248
LLPS-Gaga-1372Gallus gallus82.620.01241
LLPS-Poa-4109Pongo abelii81.80.01226
LLPS-Sah-3798Sarcophilus harrisii81.750.01217
LLPS-Myl-3058Myotis lucifugus81.640.01233
LLPS-Chs-2653Chlorocebus sabaeus81.130.01224
LLPS-Sus-4568Sus scrofa81.130.01226
LLPS-Rhb-1906Rhinopithecus bieti81.130.01228
LLPS-Aim-3330Ailuropoda melanoleuca81.010.01229
LLPS-Otg-3059Otolemur garnettii81.010.01196
LLPS-Urm-3846Ursus maritimus81.010.01228
LLPS-Ict-2309Ictidomys tridecemlineatus81.010.01223
LLPS-Caf-3944Canis familiaris81.010.01227
LLPS-Ova-4318Ovis aries81.00.01229
LLPS-Mup-1276Mustela putorius furo80.880.01225
LLPS-Orc-1714Oryctolagus cuniculus80.880.01216
LLPS-Loa-3509Loxodonta africana80.750.01223
LLPS-Mum-4498Mus musculus80.630.01216
LLPS-Tut-0291Tursiops truncatus80.620.01181
LLPS-Ran-4642Rattus norvegicus80.50.01212
LLPS-Mod-4118Monodelphis domestica80.430.01192
LLPS-Dio-1851Dipodomys ordii80.380.01210
LLPS-Fud-4125Fukomys damarensis80.330.01200
LLPS-Pes-1674Pelodiscus sinensis80.330.01179
LLPS-Caj-0193Callithrix jacchus80.30.01212
LLPS-Lac-3553Latimeria chalumnae80.250.01191
LLPS-Eqc-1247Equus caballus80.130.01207
LLPS-Maf-2664Macaca fascicularis80.050.01202
LLPS-Paa-4591Papio anubis80.050.01202
LLPS-Man-0394Macaca nemestrina80.050.01202
LLPS-Aon-4010Aotus nancymaae80.00.01207
LLPS-Bot-3526Bos taurus80.00.01204
LLPS-Fec-4276Felis catus80.00.01207
LLPS-Nol-4242Nomascus leucogenys80.00.01203
LLPS-Cas-1845Carlito syrichta79.80.01196
LLPS-Mam-1671Macaca mulatta79.750.01201
LLPS-Gog-2765Gorilla gorilla79.620.01203
LLPS-Pat-2744Pan troglodytes79.620.01204
LLPS-Pap-0262Pan paniscus79.620.01203
LLPS-Hos-2275Homo sapiens79.620.01203
LLPS-Cap-1600Cavia porcellus79.620.01201
LLPS-Anc-3926Anolis carolinensis78.990.01175
LLPS-Cea-4515Cercocebus atys78.160.01164
LLPS-Leo-2024Lepisosteus oculatus76.740.01139
LLPS-Scf-3688Scleropages formosus76.120.01111
LLPS-Orn-2216Oreochromis niloticus75.540.01101
LLPS-Scm-3707Scophthalmus maximus75.290.01103
LLPS-Asm-2261Astyanax mexicanus75.260.01112
LLPS-Dar-4162Danio rerio74.970.01127
LLPS-Icp-3840Ictalurus punctatus74.870.01100
LLPS-Gaa-3273Gasterosteus aculeatus74.650.01093
LLPS-Ten-2729Tetraodon nigroviridis73.210.01073
LLPS-Tar-1760Takifugu rubripes73.080.01080
LLPS-Orl-1840Oryzias latipes72.970.01088
LLPS-Mal-2254Mandrillus leucophaeus71.950.01072
LLPS-Xim-1230Xiphophorus maculatus70.40.01051
LLPS-Pof-2525Poecilia formosa69.210.01043
LLPS-Cae-1521Caenorhabditis elegans42.270.0 546
LLPS-Cii-0447Ciona intestinalis41.628e-148 457
LLPS-Drm-2251Drosophila melanogaster40.262e-168 515
LLPS-Cis-1494Ciona savignyi36.744e-138 435