• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Tru-1879
TRIUR3_20031

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1 homolog
Gene Name: TRIUR3_20031
Ensembl Gene: TRIUR3_20031
Ensembl Protein: TRIUR3_20031-P1
Organism: Triticum urartu
Taxa ID: 4572
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Centrosome/Spindle pole bodyPredicted from orthologs(View)

▼ FUNCTION

May participate in a complex which severs microtubules in an ATP-dependent manner. Microtubule severing may promote rapid reorganization of cellular microtubule arrays.

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblTRIUR3_20031-T1TRIUR3_20031-P1
UniProtM8A586, M8A586_TRIUA
GeneBankKD022071EMS67191.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MTTNTKRAYK  LRILDSVQIF  FLPRGSFSNC  LFGEEEFVAH  ASNVNCLKIG  RKTSRVLVTG  60
61    GEDHKVNLWA  IGKPNSISSL  PGHTSAVESV  AFDSTEVFVA  AGAASGTVKL  WDLEEAKIVR  120
121   TLTGHRSNCM  SVDFHPFGEF  FASGSLDTNL  KIWDIRRKGC  IHTYKGHTRG  VNAIRFTPDG  180
181   RWVVSGGEDS  AVKIWDLTAG  KLLHEFKSHE  GQIQCIDFHP  HEFLLATGSA  DKTVKFWDLE  240
241   TFELIGSTGP  EMTGVRSMTF  NPDGRSLLCG  LHESLKVALL  FPHVTVTADF  SFPCLSESCV  300
301   GIWVVDLTLT  DNQTINWQRL  EPHATSTSAL  LNGRSELKTS  SGGTMPLQND  SGSRANIGRS  360
361   SALQNSENNL  KASTGRLSVS  QNSDSAPKEI  KPTALFETQH  MSNLYFVCSC  YDNEASGLVP  420
421   STPQRVGTGS  STRTAGNSTY  ASGGTTLKRS  SLKSNSTSNL  HNFSKTDVVP  AAVIIPRTSS  480
481   GAELGTGSRS  YAADVAPVLS  KASRRAEPAT  DPRTESADVA  PAVVPRTSSR  MEMASDSAPD  540
541   AVSRVGRRLE  SAADSRKESA  DAAPVVPRAT  SRMEMASDSV  PVLPKAGRRF  ESATDSRKES  600
601   TDEAPVVVPR  ATSRMEMASD  SRREPSAGRV  SPFRIQSRYA  EPRKSTNVKV  DMDKVDVGSK  660
661   DTESDDLTCQ  IFLPRRNGAV  QTVIPEETRE  DVKHGSVYRS  GFSDVPRMRK  PRDNCYIEVS  720
721   RAVFLGRTRS  IVSNWEGRDQ  SPSHEEPTTS  NSALGAPRGR  IYSSRGSSQA  AETNIVTSEE  780
781   DVLSVLIEEH  DLFLSSTRSR  LTKLQILHQM  WQRNDIRGVF  SALEKMSDHA  VSTLQPLFPV  840
841   LHGITVALLI  HNYKISANSR  HVAVSLELVV  KLVRTFGPVI  HSTVSVGPSS  VGVDLEAEQR  900
901   RERCNLCFIE  LEKVKNKLPS  LMSMIYITGH  RLLAVPPTVG  IGVLDQHYSE  LNS  953
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGACGACCA  ACACCAAGCG  CGCGTACAAG  CTCCGTATCC  TCGATTCCGT  CCAGATTTTT  60
61    TTTCTTCCGC  GGGGCTCTTT  TTCAAATTGT  TTGTTCGGGG  AAGAGGAGTT  TGTGGCGCAC  120
121   GCCTCCAATG  TCAACTGCCT  CAAGATTGGG  AGGAAGACAT  CGCGAGTCCT  TGTCACTGGA  180
181   GGAGAGGATC  ATAAGGTTAA  TCTTTGGGCT  ATCGGGAAGC  CCAATTCGAT  ATCGAGTTTA  240
241   CCAGGGCATA  CAAGTGCTGT  GGAGTCAGTT  GCTTTTGATT  CCACAGAAGT  ATTTGTGGCT  300
301   GCAGGAGCAG  CCAGTGGCAC  AGTAAAATTA  TGGGATCTAG  AGGAGGCGAA  GATTGTCCGC  360
361   ACGCTTACTG  GACATAGATC  AAACTGTATG  TCAGTTGATT  TCCATCCTTT  TGGGGAATTC  420
421   TTTGCCTCTG  GGTCTTTGGA  CACTAATCTG  AAGATATGGG  ATATAAGAAG  GAAGGGCTGT  480
481   ATCCACACAT  ACAAAGGCCA  CACCAGAGGG  GTGAATGCTA  TTAGATTCAC  ACCTGATGGC  540
541   CGTTGGGTTG  TGTCTGGCGG  TGAAGATAGT  GCAGTGAAGA  TCTGGGATTT  GACAGCTGGA  600
601   AAGTTACTGC  ATGAGTTCAA  ATCTCATGAG  GGTCAAATTC  AGTGCATTGA  TTTCCATCCC  660
661   CATGAGTTCC  TTCTGGCAAC  AGGTTCAGCT  GATAAAACTG  TCAAGTTCTG  GGATTTGGAG  720
721   ACCTTTGAGT  TGATTGGATC  TACTGGACCT  GAGATGACAG  GTGTACGATC  CATGACATTC  780
781   AATCCCGACG  GAAGATCTCT  GTTATGTGGG  CTGCACGAGA  GCTTAAAGGT  AGCATTGCTG  840
841   TTTCCTCATG  TGACTGTTAC  TGCAGACTTT  TCGTTTCCAT  GTCTTTCAGA  GAGTTGTGTT  900
901   GGAATATGGG  TTGTTGATCT  AACGTTGACT  GATAACCAAA  CAATCAATTG  GCAGCGCCTT  960
961   GAGCCACATG  CAACTAGTAC  TTCAGCATTA  CTTAATGGCC  GTTCTGAATT  GAAGACTTCA  1020
1021  TCAGGTGGCA  CTATGCCATT  ACAAAACGAC  AGTGGTTCAA  GGGCTAACAT  AGGGCGATCA  1080
1081  TCAGCTCTAC  AAAATTCAGA  GAATAACTTA  AAAGCTTCTA  CAGGAAGGCT  CTCAGTTTCT  1140
1141  CAAAATTCAG  ATTCTGCACC  CAAAGAGATT  AAGCCGACAG  CTCTGTTTGA  AACGCAGCAT  1200
1201  ATGTCTAATC  TGTACTTTGT  CTGTTCTTGT  TATGATAATG  AAGCAAGTGG  CTTGGTCCCA  1260
1261  AGCACTCCTC  AAAGGGTCGG  AACTGGCTCC  AGTACTAGAA  CAGCTGGAAA  TTCAACTTAT  1320
1321  GCATCTGGTG  GCACCACATT  AAAGAGAAGT  TCACTGAAGA  GTAACAGCAC  TTCTAATCTT  1380
1381  CATAATTTCA  GTAAAACTGA  CGTGGTGCCT  GCTGCTGTTA  TCATCCCAAG  AACTAGCTCA  1440
1441  GGAGCAGAGC  TTGGTACTGG  TTCAAGAAGT  TATGCTGCTG  ATGTGGCCCC  TGTTCTTTCA  1500
1501  AAGGCAAGCA  GAAGGGCAGA  GCCGGCTACT  GATCCTAGGA  CAGAAAGTGC  TGATGTGGCA  1560
1561  CCTGCTGTTG  TTCCCAGAAC  AAGTTCAAGA  ATGGAAATGG  CCTCTGATTC  AGCACCTGAT  1620
1621  GCTGTTTCTA  GGGTAGGCAG  AAGGTTGGAA  TCTGCTGCTG  ATTCTAGGAA  AGAAAGTGCT  1680
1681  GATGCAGCAC  CGGTCGTTCC  CAGGGCTACT  TCAAGAATGG  AAATGGCCTC  TGATTCTGTA  1740
1741  CCTGTTCTTC  CGAAGGCAGG  CAGAAGGTTC  GAGTCTGCTA  CTGATTCAAG  AAAAGAAAGC  1800
1801  ACTGATGAAG  CACCTGTTGT  TGTTCCTAGA  GCAACTTCAA  GAATGGAAAT  GGCCTCTGAT  1860
1861  TCTAGGAGAG  AACCTTCTGC  AGGAAGAGTA  TCACCATTTA  GGATCCAATC  AAGGTATGCT  1920
1921  GAACCAAGGA  AATCAACCAA  TGTGAAAGTT  GATATGGACA  AAGTTGATGT  GGGAAGCAAA  1980
1981  GATACTGAAA  GTGACGACCT  TACTTGTCAA  ATATTTCTTC  CTCGGAGGAA  TGGTGCTGTT  2040
2041  CAAACAGTGA  TTCCCGAAGA  AACTCGTGAA  GATGTAAAAC  ATGGTTCAGT  TTACAGGTCG  2100
2101  GGATTTTCAG  ATGTTCCTAG  AATGCGTAAG  CCAAGAGATA  ACTGCTACAT  TGAAGTTTCA  2160
2161  AGAGCAGTAT  TTCTAGGAAG  AACAAGATCA  ATTGTTTCTA  ATTGGGAAGG  CAGGGATCAG  2220
2221  TCCCCAAGTC  ACGAAGAACC  AACAACAAGC  AATTCAGCGT  TGGGGGCTCC  TAGAGGCCGA  2280
2281  ATATATTCAT  CTAGAGGAAG  CAGTCAAGCA  GCTGAAACTA  ATATCGTAAC  TAGCGAGGAA  2340
2341  GATGTTTTAT  CTGTTCTAAT  CGAAGAGCAT  GATCTATTTT  TGAGTTCAAC  ACGGTCACGG  2400
2401  CTGACAAAAT  TGCAGATTCT  GCACCAAATG  TGGCAAAGAA  ATGACATCAG  GGGTGTTTTC  2460
2461  TCAGCGCTGG  AGAAGATGTC  CGATCATGCT  GTCAGTACTC  TGCAACCTCT  TTTTCCTGTT  2520
2521  CTGCATGGAA  TAACCGTTGC  ATTGTTGATT  CATAATTATA  AGATTTCTGC  TAACTCCAGG  2580
2581  CATGTAGCCG  TATCACTGGA  ACTGGTAGTG  AAGCTTGTCA  GGACTTTTGG  GCCTGTAATA  2640
2641  CATTCAACAG  TGTCGGTTGG  TCCATCTTCT  GTTGGTGTAG  ATCTTGAAGC  AGAGCAAAGG  2700
2701  CGGGAGAGGT  GCAACTTATG  CTTCATAGAA  CTGGAGAAAG  TTAAAAATAA  GCTTCCTTCC  2760
2761  CTTATGAGTA  TGATATACAT  TACTGGACAT  CGTCTTCTAG  CTGTACCACC  AACCGTTGGT  2820
2821  ATTGGAGTTT  TGGACCAGCA  CTATTCTGAA  CTGAACTCGT  AA  2862

▼ KEYWORD

ID
Family
Complete proteome
Cytoplasm
Cytoskeleton
Microtubule
Reference proteome
WD repeat

▼ GENE ONTOLOGY

ID
Classification
Description
Cellular Component
Katanin complex
Cellular Component
Microtubule
Molecular Function
Microtubule binding
Biological Process
Microtubule severing

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Tra-1813Triticum aestivum84.880.01553
LLPS-Brd-0887Brachypodium distachyon76.20.01387
LLPS-Sem-1919Selaginella moellendorffii73.092e-150 471
LLPS-Sei-1258Setaria italica71.120.01280
LLPS-Php-0095Physcomitrella patens70.352e-149 471
LLPS-Ori-1069Oryza indica70.150.01247
LLPS-Orbr-1197Oryza brachyantha69.710.01217
LLPS-Org-2180Oryza glaberrima69.640.01236
LLPS-Sob-2471Sorghum bicolor69.360.01253
LLPS-Mae-1255Manihot esculenta67.242e-132 429
LLPS-Mua-2209Musa acuminata67.05e-179 535
LLPS-Zem-1388Zea mays66.840.01200
LLPS-Amt-2118Amborella trichopoda62.724e-176 539
LLPS-Orm-1164Oryza meridionalis62.210.01027
LLPS-Prp-1268Prunus persica61.420.0 576
LLPS-Viv-1827Vitis vinifera61.050.0 564
LLPS-Sot-1681Solanum tuberosum60.680.0 559
LLPS-Orp-1927Oryza punctata60.50.01024
LLPS-Glm-2113Glycine max60.320.0 553
LLPS-Met-1770Medicago truncatula60.320.0 558
LLPS-Orb-1334Oryza barthii58.570.0 991
LLPS-Orni-0058Oryza nivara58.570.0 991
LLPS-Orr-1290Oryza rufipogon58.570.0 991
LLPS-Phv-0207Phaseolus vulgaris58.263e-127 408
LLPS-Nia-0167Nicotiana attenuata58.02e-177 542
LLPS-Sol-1379Solanum lycopersicum57.42e-180 550
LLPS-Dac-2237Daucus carota57.45e-170 523
LLPS-Orgl-1541Oryza glumaepatula57.01e-137 441
LLPS-Asm-2887Astyanax mexicanus56.792e-90 310
LLPS-Caf-2580Canis familiaris55.457e-85 290
LLPS-Hov-2118Hordeum vulgare55.269e-123 404
LLPS-Pot-2211Populus trichocarpa55.170.0 553
LLPS-Mup-1557Mustela putorius furo55.144e-93 315
LLPS-Chs-1788Chlorocebus sabaeus54.731e-92 314
LLPS-Mum-4719Mus musculus54.732e-92 313
LLPS-Mea-2262Mesocricetus auratus54.738e-93 315
LLPS-Aon-1785Aotus nancymaae54.739e-93 314
LLPS-Cea-4778Cercocebus atys54.739e-93 314
LLPS-Gog-4076Gorilla gorilla54.739e-93 314
LLPS-Caj-2397Callithrix jacchus54.731e-91 312
LLPS-Dio-0610Dipodomys ordii54.738e-93 315
LLPS-Ran-2956Rattus norvegicus54.731e-92 314
LLPS-Paa-2698Papio anubis54.738e-93 315
LLPS-Fec-4749Felis catus54.731e-92 314
LLPS-Hos-1971Homo sapiens54.739e-93 314
LLPS-Pap-3047Pan paniscus54.739e-93 314
LLPS-Pat-2849Pan troglodytes54.739e-93 314
LLPS-Loa-1995Loxodonta africana54.739e-93 315
LLPS-Otg-2770Otolemur garnettii54.732e-92 313
LLPS-Rhb-2382Rhinopithecus bieti54.738e-93 315
LLPS-Orc-1929Oryctolagus cuniculus54.737e-93 315
LLPS-Eqc-4324Equus caballus54.739e-93 314
LLPS-Poa-1503Pongo abelii54.736e-93 313
LLPS-Mam-4089Macaca mulatta54.738e-93 315
LLPS-Cas-2604Carlito syrichta54.732e-92 314
LLPS-Fud-4157Fukomys damarensis54.322e-91 311
LLPS-Cap-2306Cavia porcellus54.323e-92 313
LLPS-Brn-3138Brassica napus54.132e-159 496
LLPS-Bro-1649Brassica oleracea54.131e-159 497
LLPS-Brr-2105Brassica rapa54.129e-166 514
LLPS-Arl-0829Arabidopsis lyrata53.865e-169 522
LLPS-Sus-3357Sus scrofa53.337e-74 263
LLPS-Scm-3993Scophthalmus maximus53.122e-67 243
LLPS-Gaa-3438Gasterosteus aculeatus52.672e-85 294
LLPS-Man-1777Macaca nemestrina52.651e-84 294
LLPS-Orn-2073Oreochromis niloticus51.854e-85 295
LLPS-Nol-0530Nomascus leucogenys51.858e-82 284
LLPS-Leo-3707Lepisosteus oculatus51.595e-94 318
LLPS-Dar-0985Danio rerio51.593e-92 314
LLPS-Scf-3191Scleropages formosus51.241e-91 313
LLPS-Art-2788Arabidopsis thaliana50.573e-169 522
LLPS-Mod-3752Monodelphis domestica50.522e-93 317
LLPS-Lac-3569Latimeria chalumnae50.523e-97 327
LLPS-Hea-1687Helianthus annuus50.213e-133 431
LLPS-Icp-2932Ictalurus punctatus50.186e-89 304
LLPS-Ora-1715Ornithorhynchus anatinus50.178e-94 316
LLPS-Cis-2065Ciona savignyi50.01e-81 273
LLPS-Ova-4000Ovis aries49.836e-93 315
LLPS-Myl-0300Myotis lucifugus49.836e-93 315
LLPS-Orl-3342Oryzias latipes49.793e-83 289
LLPS-Aim-3637Ailuropoda melanoleuca49.495e-92 313
LLPS-Xet-2036Xenopus tropicalis49.473e-91 311
LLPS-Tar-1911Takifugu rubripes49.385e-78 275
LLPS-Maf-2964Macaca fascicularis49.194e-94 318
LLPS-Pes-3769Pelodiscus sinensis49.123e-93 316
LLPS-Ten-0323Tetraodon nigroviridis48.777e-78 273
LLPS-Fia-3556Ficedula albicollis48.432e-91 311
LLPS-Tag-3269Taeniopygia guttata48.436e-92 312
LLPS-Anp-2415Anas platyrhynchos48.281e-91 312
LLPS-Bot-1252Bos taurus48.062e-74 265
LLPS-Via-0224Vigna angularis47.884e-129 417
LLPS-Gaga-0782Gallus gallus47.743e-90 307
LLPS-Urm-3332Ursus maritimus47.599e-50 191
LLPS-Cii-1915Ciona intestinalis47.582e-76 270
LLPS-Meg-1644Meleagris gallopavo47.396e-90 306
LLPS-Coc-2057Corchorus capsularis46.880.0 737
LLPS-Anc-3263Anolis carolinensis46.691e-86 298
LLPS-Lep-0914Leersia perrieri46.592e-140 442
LLPS-Thc-1930Theobroma cacao45.340.0 704
LLPS-Gor-1969Gossypium raimondii44.960.0 685
LLPS-Cus-2188Cucumis sativus44.770.0 665
LLPS-Pof-2725Poecilia formosa43.57e-85 293
LLPS-Ors-2384Oryza sativa36.97e-162 504
LLPS-Mal-4523Mandrillus leucophaeus35.89e-46 179
LLPS-Tut-2058Tursiops truncatus33.987e-0963.2
LLPS-Ict-3692Ictidomys tridecemlineatus33.987e-0963.2
LLPS-Sah-3483Sarcophilus harrisii32.715e-0963.9
LLPS-Xim-0089Xiphophorus maculatus31.223e-30 130
LLPS-Spr-0481Sporisorium reilianum30.72e-30 130
LLPS-Usm-0939Ustilago maydis29.322e-29 127