• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Pug-0732
PGTG_19860

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Structural maintenance of chromosomes protein 6
Gene Name: PGTG_19860
Ensembl Gene: PGTG_19860
Ensembl Protein: EFP93825
Organism: Puccinia graminis
Taxa ID: 418459
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblEFP93825EFP93825
UniProtE3LBA0, E3LBA0_PUCGT
GeneBankDS178411EFP93825.1
RefSeqXM_003338196.2XP_003338244.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MGSKHSPPEM  EDYPAKKRTR  INEDSARQSP  VPTDDGSSES  SYWDDPEGDA  CAERDAVEQV  60
61    TIPRPPGPPR  QAGTISKVIL  VQFMCHRYQV  VELGPQINFV  IGHNGSGKSA  VLTAITLLLG  120
121   AKASSTNRGN  SLKTFIREGQ  KKAEVTLHLT  NRGEEAFQPE  IYGDEIIIQR  NISKDGSSGF  180
181   KIKSSRDHRV  FFIRGTQLKQ  LTDEYEEIDA  NLKISEVLLT  KKQEDLPELL  QRVKSAEKNM  240
241   REVQIASQAQ  EMIIQLEKEI  FWIYVAEAEA  ERDLALQQLQ  NEERALPKYD  TKLQETENKI  300
301   SELDDRIKTL  EAAKAARNDD  ETHIRQADVD  LKEKDEEISQ  QSRDIAEENA  KLLGNTDSSR  360
361   KQSIERMGQL  DTEITEIECR  ITQIQQDISG  ADAAVKTNSS  QANQCDQNVK  KLGADMESNK  420
421   RAIHEYGSIR  KDRLLVFGQR  SDQLKNAIER  NTSWSEKPIG  PLGYYIKVKD  KSWQPVLETV  480
481   LAGSLKSYMV  VDKRDEQLLQ  RLMSDCKCVS  PIIRTRRDLF  DYSSGEPGPQ  FVTILRALHF  540
541   EDEFVKRALI  NDMRIEKTIL  VEHRTEGDPI  MSHPPPNIVS  CYTRDGFKVG  GVDGGRGVRA  600
601   LTMYNGPPRL  SNDDGSFIAE  LNQRAAELGS  QIEETKRQAA  AANSRYRQSA  EQLKRLRTEE  660
661   GQLKGRLRKA  RDMKASIQDD  LDRSASSNIT  TLEDLKSESE  SARRTLYDQS  QELLRQRDAL  720
721   NSDLAPIKVE  LEKLQHMIEN  RDQEEDKINV  ELTTKITDKA  VANDALRHFR  DSRTKQAAKV  780
781   AEAKKKYDAA  EAALPKAIDE  AKKVSGSDEP  MQTNRSRQDA  MADLESFKKI  VRATETRHRK  840
841   SLEDIEIEYH  QANASYKVAE  KQIEEQAASL  KVLSNALAIR  KYRWIEFRNH  IAARAKMNFV  900
901   KYLDHRRYTG  KLSFNHNSQR  LQVQVNPRED  GTTQVYSSGL  LSLVINGNPL  DVHFY  955
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGGCAGCA  AACATTCACC  TCCGGAGATG  GAGGATTATC  CTGCCAAAAA  ACGTACTCGG  60
61    ATTAACGAGG  ACAGTGCCCG  TCAATCTCCA  GTCCCGACCG  ATGACGGTAG  CTCTGAATCG  120
121   TCCTACTGGG  ATGACCCCGA  AGGAGATGCA  TGCGCCGAAC  GGGATGCAGT  GGAGCAAGTT  180
181   ACCATCCCTC  GCCCGCCTGG  GCCACCGAGA  CAGGCAGGCA  CGATTTCCAA  AGTCATCCTG  240
241   GTCCAATTCA  TGTGTCATCG  ATATCAGGTT  GTTGAACTTG  GTCCGCAGAT  CAACTTCGTA  300
301   ATAGGCCATA  ACGGAAGTGG  CAAGAGTGCC  GTCTTAACCG  CCATCACGCT  TTTGCTTGGG  360
361   GCCAAAGCTA  GTTCTACTAA  CCGCGGTAAC  TCCTTAAAAA  CATTCATTCG  CGAAGGTCAA  420
421   AAGAAAGCCG  AAGTGACGCT  ACACCTAACC  AATCGTGGTG  AAGAAGCTTT  TCAACCAGAA  480
481   ATTTATGGGG  ATGAGATTAT  AATCCAGCGC  AACATCTCAA  AGGATGGTAG  TTCGGGATTT  540
541   AAGATCAAAA  GCAGCCGCGA  TCACCGAGTC  TTTTTTATTC  GAGGGACTCA  GCTTAAACAG  600
601   CTAACGGATG  AGTACGAGGA  GATCGATGCC  AACCTGAAGA  TTTCCGAAGT  CCTTCTAACC  660
661   AAGAAGCAGG  AAGACTTACC  TGAACTGTTG  CAGCGTGTCA  AATCGGCCGA  GAAAAACATG  720
721   CGAGAAGTAC  AAATAGCTTC  TCAGGCTCAA  GAAATGATCA  TCCAACTCGA  AAAGGAAATT  780
781   TTCTGGATCT  ATGTTGCGGA  AGCTGAAGCT  GAACGTGACT  TGGCCCTCCA  GCAGCTGCAG  840
841   AATGAGGAGC  GTGCCTTACC  GAAATACGAT  ACCAAGCTTC  AAGAAACGGA  AAACAAAATA  900
901   TCTGAGCTAG  ATGATCGGAT  CAAAACCCTC  GAAGCCGCAA  AGGCAGCGCG  GAACGACGAC  960
961   GAAACCCACA  TTCGACAGGC  AGATGTAGAT  CTTAAAGAGA  AGGACGAAGA  AATTTCCCAA  1020
1021  CAATCAAGAG  ATATCGCAGA  GGAAAATGCC  AAGTTACTGG  GAAACACCGA  CTCTTCACGA  1080
1081  AAACAATCCA  TCGAGCGAAT  GGGACAACTT  GACACCGAAA  TCACAGAGAT  CGAGTGCCGC  1140
1141  ATCACTCAAA  TACAACAAGA  TATCTCCGGC  GCAGATGCAG  CGGTCAAAAC  CAACAGTTCC  1200
1201  CAGGCGAACC  AATGTGACCA  GAATGTGAAG  AAACTGGGGG  CCGATATGGA  AAGTAATAAG  1260
1261  CGTGCCATCC  ATGAGTATGG  ATCCATCCGC  AAGGACAGGC  TCCTCGTATT  TGGCCAAAGG  1320
1321  TCGGACCAGC  TCAAGAATGC  TATTGAAAGA  AACACCTCTT  GGTCGGAAAA  GCCCATTGGC  1380
1381  CCATTGGGCT  ACTACATAAA  GGTGAAAGAT  AAATCTTGGC  AACCTGTCCT  AGAAACGGTT  1440
1441  CTCGCAGGTT  CTTTGAAATC  TTATATGGTA  GTTGATAAGA  GGGATGAGCA  ACTCCTACAA  1500
1501  CGGTTAATGT  CGGATTGTAA  ATGTGTATCT  CCAATCATTC  GAACGCGCCG  AGACTTGTTT  1560
1561  GATTACTCAA  GCGGGGAACC  CGGGCCGCAA  TTCGTCACAA  TCTTACGAGC  TCTTCATTTT  1620
1621  GAGGACGAAT  TTGTCAAACG  AGCCTTAATC  AATGATATGC  GGATCGAAAA  AACCATCCTA  1680
1681  GTCGAACATC  GAACAGAAGG  AGATCCCATA  ATGTCGCATC  CCCCTCCTAA  CATTGTATCC  1740
1741  TGTTACACAC  GTGATGGGTT  CAAAGTTGGT  GGAGTTGATG  GAGGACGCGG  GGTCAGAGCA  1800
1801  CTCACCATGT  ACAACGGTCC  ACCCCGGTTA  TCAAACGACG  ATGGTTCCTT  CATTGCAGAA  1860
1861  CTCAATCAAA  GAGCCGCTGA  ACTCGGCTCC  CAAATTGAAG  AGACTAAGCG  CCAGGCTGCT  1920
1921  GCTGCAAATT  CGCGGTATCG  TCAATCGGCC  GAACAGCTTA  AAAGACTGAG  GACCGAGGAG  1980
1981  GGACAGCTGA  AGGGGCGACT  CCGTAAGGCT  CGGGATATGA  AGGCCTCTAT  ACAAGATGAT  2040
2041  TTGGATCGGA  GTGCATCATC  TAACATCACG  ACTTTGGAAG  ACTTGAAAAG  CGAATCAGAG  2100
2101  TCTGCCAGAC  GGACGTTGTA  TGATCAAAGC  CAGGAGCTTT  TACGCCAAAG  GGATGCCCTC  2160
2161  AACAGCGACT  TAGCCCCTAT  TAAAGTCGAG  CTAGAGAAGC  TGCAGCATAT  GATTGAGAAT  2220
2221  CGAGACCAAG  AAGAGGATAA  GATTAATGTT  GAGCTAACTA  CGAAAATTAC  CGATAAGGCT  2280
2281  GTTGCGAACG  ATGCATTAAG  ACATTTCCGT  GACTCTCGGA  CTAAGCAAGC  TGCCAAGGTA  2340
2341  GCAGAGGCAA  AAAAGAAATA  CGACGCCGCC  GAAGCTGCGC  TACCAAAAGC  CATCGACGAA  2400
2401  GCCAAAAAGG  TATCCGGATC  CGATGAACCC  ATGCAGACCA  ACCGTTCGCG  TCAGGACGCC  2460
2461  ATGGCCGATC  TGGAAAGCTT  CAAGAAAATT  GTGAGAGCCA  CCGAAACCCG  TCATCGTAAA  2520
2521  TCGCTTGAAG  ACATTGAAAT  TGAGTATCAC  CAAGCAAATG  CTAGCTATAA  GGTAGCAGAG  2580
2581  AAGCAAATCG  AAGAGCAGGC  CGCATCCCTC  AAAGTCTTAT  CAAACGCACT  GGCAATACGG  2640
2641  AAATACCGCT  GGATTGAATT  CCGTAACCAC  ATCGCTGCTC  GCGCCAAAAT  GAATTTTGTT  2700
2701  AAATATCTGG  ATCATCGTAG  ATACACCGGA  AAGTTGAGCT  TTAATCACAA  TTCGCAAAGG  2760
2761  CTTCAAGTCC  AGGTCAACCC  TCGTGAGGAT  GGAACTACCC  AGGTATATAG  TTCAGGCTTG  2820
2821  CTCTCTTTGG  TCATCAATGG  AAATCCACTT  GATGTTCATT  TTTACTGA  2868

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Put-0859Puccinia triticina54.130.0 976
LLPS-Orr-0873Oryza rufipogon48.623e-26 120
LLPS-Orgl-0057Oryza glumaepatula48.623e-26 120
LLPS-Ori-1081Oryza indica48.623e-26 120
LLPS-Orb-0609Oryza barthii48.623e-26 120
LLPS-Orni-0418Oryza nivara48.623e-26 120
LLPS-Ors-0061Oryza sativa47.714e-27 113
LLPS-Orbr-0478Oryza brachyantha45.793e-23 110
LLPS-Orm-0615Oryza meridionalis41.942e-23 111
LLPS-Phn-0153Phaeosphaeria nodorum39.524e-36 152
LLPS-Pytr-0170Pyrenophora triticirepentis37.265e-37 155
LLPS-Pyt-0080Pyrenophora teres36.712e-35 150
LLPS-Lem-0065Leptosphaeria maculans36.414e-37 155
LLPS-Cae-0800Caenorhabditis elegans36.294e-1481.3
LLPS-Mel-0160Melampsora laricipopulina34.657e-174 543
LLPS-Sem-2273Selaginella moellendorffii32.452e-1998.2
LLPS-Yal-1011Yarrowia lipolytica31.866e-0861.2
LLPS-Thc-0549Theobroma cacao31.195e-25 116
LLPS-Cogr-0243Colletotrichum graminicola29.267e-67 248
LLPS-Ast-0041Aspergillus terreus28.991e-58 216
LLPS-Asfu-1072Aspergillus fumigatus28.331e-70 259
LLPS-Miv-0172Microbotryum violaceum27.888e-84 299
LLPS-Nef-0089Neosartorya fischeri27.632e-86 306
LLPS-Usm-0429Ustilago maydis27.581e-93 328
LLPS-Spr-0619Sporisorium reilianum27.552e-95 332
LLPS-Asc-0008Aspergillus clavatus27.411e-82 295
LLPS-Scj-1173Schizosaccharomyces japonicus27.221e-81 292
LLPS-Asg-0182Ashbya gossypii26.962e-44 179
LLPS-Tum-0035Tuber melanosporum26.893e-59 224
LLPS-Pot-0067Populus trichocarpa26.637e-36 151
LLPS-Asn-0027Aspergillus nidulans26.554e-86 305
LLPS-Gaa-2213Gasterosteus aculeatus26.472e-51 201
LLPS-Xet-0485Xenopus tropicalis26.389e-58 220
LLPS-Blg-0620Blumeria graminis26.264e-65 243
LLPS-Gog-1643Gorilla gorilla26.063e-66 245
LLPS-Mal-0398Mandrillus leucophaeus26.015e-49 192
LLPS-Coo-1467Colletotrichum orbiculare25.94e-65 243
LLPS-Crn-0468Cryptococcus neoformans25.722e-69 255
LLPS-Sah-1473Sarcophilus harrisii25.612e-48 191
LLPS-Rhb-3033Rhinopithecus bieti25.42e-57 218
LLPS-Aon-0058Aotus nancymaae25.391e-64 240
LLPS-Pat-1337Pan troglodytes25.341e-62 235
LLPS-Hos-1075Homo sapiens25.342e-62 234
LLPS-Loa-3728Loxodonta africana25.293e-62 233
LLPS-Myl-1319Myotis lucifugus25.247e-63 235
LLPS-Poa-2718Pongo abelii25.238e-62 232
LLPS-Pap-2315Pan paniscus25.234e-62 233
LLPS-Nol-2833Nomascus leucogenys25.136e-62 232
LLPS-Aso-0416Aspergillus oryzae25.089e-63 236
LLPS-Kop-0712Komagataella pastoris25.072e-45 182
LLPS-Chr-0598Chlamydomonas reinhardtii25.07e-33 142
LLPS-Fud-2727Fukomys damarensis25.04e-62 233
LLPS-Tru-0474Triticum urartu24.893e-31 136
LLPS-Man-1204Macaca nemestrina24.824e-58 220
LLPS-Mam-2810Macaca mulatta24.793e-60 228
LLPS-Pes-0385Pelodiscus sinensis24.794e-66 245
LLPS-Paa-2237Papio anubis24.793e-60 228
LLPS-Cea-0574Cercocebus atys24.793e-60 228
LLPS-Chs-0469Chlorocebus sabaeus24.793e-60 227
LLPS-Maf-1742Macaca fascicularis24.793e-60 227
LLPS-Ova-1690Ovis aries24.777e-62 232
LLPS-Orc-1512Oryctolagus cuniculus24.712e-55 213
LLPS-Sus-2277Sus scrofa24.718e-62 232
LLPS-Caj-2062Callithrix jacchus24.719e-63 235
LLPS-Dio-0704Dipodomys ordii24.663e-60 227
LLPS-Cym-0058Cyanidioschyzon merolae24.621e-32 141
LLPS-Php-0142Physcomitrella patens24.629e-35 147
LLPS-Meg-0079Meleagris gallopavo24.64e-60 227
LLPS-Gaga-1799Gallus gallus24.422e-60 228
LLPS-Orn-0327Oreochromis niloticus24.351e-68 252
LLPS-Anp-1694Anas platyrhynchos24.326e-63 235
LLPS-Brd-0939Brachypodium distachyon24.292e-36 153
LLPS-Gas-0751Galdieria sulphuraria24.231e-37 157
LLPS-Pof-0193Poecilia formosa24.145e-66 244
LLPS-Cus-0856Cucumis sativus24.132e-32 140
LLPS-Scm-0955Scophthalmus maximus24.017e-67 247
LLPS-Mup-1051Mustela putorius furo23.953e-55 212
LLPS-Lac-0105Latimeria chalumnae23.945e-62 233
LLPS-Xim-0508Xiphophorus maculatus23.832e-65 243
LLPS-Urm-2210Ursus maritimus23.82e-55 213
LLPS-Mae-1219Manihot esculenta23.744e-37 155
LLPS-Coc-0620Corchorus capsularis23.711e-33 145
LLPS-Anc-0826Anolis carolinensis23.581e-59 226
LLPS-Sot-0799Solanum tuberosum23.374e-27 121
LLPS-Brn-0861Brassica napus23.281e-28 128
LLPS-Mua-0176Musa acuminata23.191e-31 138
LLPS-Brr-2206Brassica rapa23.187e-35 148
LLPS-Vir-0016Vigna radiata23.083e-28 127
LLPS-Prp-0608Prunus persica23.061e-33 144
LLPS-Bro-0854Brassica oleracea23.061e-34 147
LLPS-Icp-1310Ictalurus punctatus22.911e-48 192
LLPS-Cii-1340Ciona intestinalis22.821e-50 197
LLPS-Drm-0821Drosophila melanogaster22.794e-29 129
LLPS-Viv-0639Vitis vinifera22.598e-33 141
LLPS-Amt-0639Amborella trichopoda22.541e-33 144
LLPS-Leo-1205Lepisosteus oculatus22.52e-24 114
LLPS-Mod-0610Monodelphis domestica22.054e-32 139
LLPS-Hea-0360Helianthus annuus21.469e-34 144