• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Meg-0079
SMC6

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Structural maintenance of chromosomes protein 6
Gene Name: SMC6
Ensembl Gene: ENSMGAG00000014028.2
Ensembl Protein: ENSMGAP00000014838.2
Organism: Meleagris gallopavo
Taxa ID: 9103
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MGKRKEESVS  KPPFHKRQRQ  EHIDEHSDES  SDEENTRFSA  DNSFSLTSTV  GEAGIIERIQ  60
61    LKNFMCHSML  GPFQFGSNLN  FIIGNNGSGK  SSVLTALIVG  LGGKATATNR  GSSLKLFVKS  120
121   GESSADISVT  LQNQGRDAFK  PELYGDSIIV  NTHINLEGSR  TYRLKSKSGT  VISSKKEELL  180
181   GMLDHFNIQV  ENPVSVLTQE  MSKLFLQSKN  EGDKYKFFMK  ATQLEQMKED  YSYIMKTKEN  240
241   TRLQIEQGVE  RLKELKRIYC  EEKERYESIE  CVNEMQKHLE  ELKHKMAWAV  VAEMEREIQP  300
301   IREGIKAEEG  NTEKFDQKLE  ECQIKVNEAE  EKCKAIQEKL  ITVNGEAEAL  HTQCMSSKAE  360
361   VQTRRKAVNE  AELLHNRVRT  ELKRLAKDDE  QLRNRIEEMK  KSAYQASESE  RLEKERKITQ  420
421   LKEKLKALRD  EEIMIGQQMD  QFQQAIYKHK  EEFAKLKRED  SDVRQDLDAK  QKHLRELRDS  480
481   KTNAFKRFGQ  HMPSLLEEVE  IAYRQGQFKH  KPVGPLGAFI  HPKDPELSLA  IEACLKTLVQ  540
541   AFCCDNHSDE  RVLQQLMSKY  YPHGARPSII  VNKFHDKIYD  VRHSGVHHPE  FPSVLTALEI  600
601   DGAAVANCLI  NVRGIEKVLL  IKSSCKAREV  MQSNNPPKNC  REAFTAEGDQ  VFNRRYYSSD  660
661   YLRPKYLSKD  VEAEISLLEN  EIASRKAQLA  ASQKRLSSTE  HEIKQNESYL  HHHRQHQKEL  720
721   QIKTRRTAAE  IADLENVDEI  QYMDIRALED  VAEENKNKME  SVRQEMQEES  RKMEELNEIL  780
781   RAAEKRYEEI  KEKMNQVEDI  TNPIKDELDK  ADSEVENRRR  CLQYYEDKKK  EHLTCIKKHK  840
841   ELLAAKEKEL  EEKTAQARQI  YSERIEVTRT  VKSLDAEMNR  LRERIKTEKS  HRGNTEEIIQ  900
901   RFLDAKERYE  DANSKVNNLK  KFIRLLEEIM  TQRFNIYRRF  LRLLSLRCKL  YFDHLLRIRG  960
961   CSGRILFDHK  NETLSITVQP  GEEDRAAPNN  VRSLSGGERS  FSTVCFILSL  WSITESPFRC  1020
1021  LDEFDVYMDM  LNRRIAMDMI  LKVADSQCHR  QFILLTPQSM  SFLPVSSRIR  ILRMQDPERG  1080
1081  QRTLTFRNRN  EEEEDDSAH  1099
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGGTAAGA  GAAAGGAAGA  AAGTGTTTCA  AAGCCTCCAT  TCCACAAAAG  ACAGAGACAA  60
61    GAACACATAG  ATGAACATAG  TGATGAGTCC  AGTGATGAAG  AAAACACACG  GTTTTCAGCT  120
121   GATAATAGTT  TCTCTTTAAC  ATCGACTGTA  GGGGAAGCTG  GGATAATTGA  AAGGATCCAG  180
181   CTGAAGAACT  TCATGTGCCA  TTCGATGTTG  GGGCCTTTTC  AGTTTGGATC  AAATCTCAAT  240
241   TTTATTATTG  GAAACAATGG  AAGTGGAAAA  AGTTCTGTTT  TAACTGCGCT  GATTGTTGGA  300
301   CTTGGAGGAA  AAGCCACTGC  TACTAATAGA  GGTTCCTCGT  TAAAATTGTT  TGTAAAAAGT  360
361   GGAGAGAGCT  CTGCAGATAT  CTCAGTAACA  CTGCAAAACC  AAGGCAGAGA  TGCATTTAAA  420
421   CCGGAACTGT  ATGGTGATTC  TATTATTGTG  AATACACACA  TTAATCTGGA  AGGGAGCAGA  480
481   ACTTACAGAC  TGAAAAGCAA  ATCTGGTACT  GTCATTTCTT  CAAAAAAGGA  GGAACTCTTA  540
541   GGAATGCTTG  ATCACTTTAA  TATACAGGTA  GAAAATCCTG  TGTCTGTTTT  AACCCAAGAG  600
601   ATGAGTAAGC  TCTTCTTACA  GTCTAAAAAT  GAGGGTGACA  AGTATAAGTT  TTTTATGAAG  660
661   GCAACTCAGC  TGGAACAAAT  GAAAGAAGAT  TATTCATATA  TCATGAAAAC  TAAAGAAAAT  720
721   ACACGTCTTC  AGATAGAACA  AGGAGTGGAG  CGTCTAAAAG  AGCTTAAGCG  AATTTACTGT  780
781   GAAGAAAAGG  AGCGCTATGA  AAGCATCGAG  TGTGTGAATG  AAATGCAAAA  ACATCTTGAA  840
841   GAGCTGAAGC  ATAAGATGGC  TTGGGCAGTG  GTGGCTGAAA  TGGAGAGAGA  AATACAGCCG  900
901   ATCAGAGAAG  GCATCAAAGC  TGAAGAAGGA  AATACAGAGA  AGTTTGATCA  GAAGCTGGAG  960
961   GAATGTCAGA  TAAAAGTAAA  TGAAGCGGAA  GAAAAATGCA  AAGCAATACA  AGAGAAGTTG  1020
1021  ATAACAGTAA  ATGGTGAAGC  TGAAGCCCTG  CATACTCAGT  GTATGTCTTC  AAAAGCTGAA  1080
1081  GTTCAGACAA  GAAGAAAAGC  AGTCAATGAA  GCTGAGTTGC  TTCATAATCG  TGTCAGAACT  1140
1141  GAGCTGAAAC  GTCTGGCAAA  AGATGATGAA  CAGCTACGTA  ACCGAATTGA  GGAAATGAAA  1200
1201  AAGAGTGCTT  ATCAGGCTTC  AGAGTCTGAA  AGGCTGGAAA  AAGAAAGGAA  AATCACACAG  1260
1261  TTAAAGGAGA  AGTTGAAGGC  ACTTCGTGAT  GAAGAAATAA  TGATTGGCCA  ACAGATGGAT  1320
1321  CAGTTTCAGC  AAGCTATTTA  TAAGCACAAA  GAAGAATTTG  CTAAACTTAA  GAGAGAAGAC  1380
1381  TCTGATGTGA  GACAAGACTT  GGATGCTAAA  CAGAAGCATC  TGAGAGAGCT  GAGAGATAGT  1440
1441  AAAACAAATG  CCTTTAAAAG  ATTTGGACAA  CATATGCCAT  CATTGCTTGA  AGAAGTTGAA  1500
1501  ATAGCCTACA  GGCAAGGGCA  ATTTAAACAC  AAACCTGTTG  GACCTTTAGG  TGCTTTCATT  1560
1561  CATCCAAAAG  ATCCTGAACT  ATCTCTGGCT  ATTGAAGCTT  GTTTAAAGAC  CTTAGTTCAG  1620
1621  GCATTTTGCT  GCGATAATCA  TAGTGATGAA  AGAGTTCTTC  AGCAACTGAT  GTCAAAATAT  1680
1681  TATCCACATG  GAGCTAGACC  TTCAATAATT  GTAAATAAAT  TTCATGATAA  GATTTATGAT  1740
1741  GTTAGACACA  GTGGAGTTCA  TCATCCAGAG  TTCCCATCAG  TTCTCACAGC  GTTGGAAATA  1800
1801  GATGGTGCAG  CAGTTGCTAA  CTGTTTGATC  AATGTGAGGG  GTATAGAAAA  AGTCCTGCTA  1860
1861  ATTAAAAGTA  GCTGTAAAGC  TCGTGAAGTA  ATGCAGTCTA  ACAATCCTCC  AAAAAATTGT  1920
1921  AGAGAAGCTT  TCACTGCTGA  AGGTGATCAA  GTATTTAACA  GACGATATTA  TTCTTCTGAT  1980
1981  TACCTCAGAC  CCAAGTATCT  AAGCAAAGAT  GTTGAAGCAG  AAATAAGTCT  CTTGGAGAAT  2040
2041  GAAATTGCAA  GCCGGAAAGC  ACAGTTGGCA  GCATCTCAGA  AACGTTTGTC  TTCCACTGAA  2100
2101  CATGAAATTA  AGCAGAATGA  AAGTTATCTT  CATCATCATC  GACAACATCA  AAAAGAACTA  2160
2161  CAGATAAAAA  CACGAAGAAC  AGCTGCAGAA  ATAGCAGATC  TTGAGAATGT  TGATGAAATC  2220
2221  CAGTACATGG  ACATCCGTGC  ATTAAAGGGC  AAATACCAAC  TTAAAGAAGA  ATCATACCAC  2280
2281  TATGTAGGCT  GTCTTTCTGT  GTGTGCATGT  GTGAGTAAAA  ATTTCAAAGC  ATACTCAACA  2340
2341  AGTGAAGAAT  CATTAGTCAA  GTCCTGTAGG  TGTAGGAAAT  GCATGTTCAT  CCTTTTAGTT  2400
2401  CAAGATGAAT  TGGACAAAGC  GGACTCAGAA  GTGGAAAACA  GAAGACGTTG  TTTGCAGTAC  2460
2461  TATGAAGACA  AAAAGAAAGA  ACATTTGACT  TGCATAAAAA  AACATAAAGA  ATTACTAGCT  2520
2521  GCCAAAGAGA  AAGAATTGGA  GGAAAAAACT  GCACAGGCTA  GGCAAATCTA  CTCAGAGCGC  2580
2581  ATAGAAGTCA  CCCGTACTGT  GAAGAGTCTT  GATGCAGAGA  TGAATCGCTT  GAGAGAGAGG  2640
2641  ATAAAGACAG  AAAAAAGTCA  CCGTGGAAAC  ACAGAAGAAA  TAATACAGCG  ATTTCTTGAT  2700
2701  GCAAAGGAAA  GATATGAGGA  TGCAAACAGT  AAAGTAAATA  ACCTAAAGAA  ATTTATTAGG  2760
2761  CTGCTGGAAG  AAATAATGAC  ACAGAGATTC  AACATATATC  GTCGGTTCTT  AAGGCTCCTT  2820
2821  TCTTTGCGGT  GCAAACTGTA  CTTTGACCAC  TTATTACGCA  TTCGAGGTTG  CAGTGGAAGA  2880
2881  ATACTTTTTG  ATCACAAAAA  TGAGACACTT  TCGATAACAG  TTCAGCCTGG  AGAGGAGGAC  2940
2941  AGAGCTGCCC  CGAACAATGT  GAGATCTTTA  TCAGGAGGCG  AACGTTCCTT  CTCAACAGTT  3000
3001  TGTTTCATTC  TTTCTCTATG  GTCCATTACT  GAATCTCCTT  TCAGATGCCT  GGATGAATTT  3060
3061  GACGTCTACA  TGGATATGCT  CAACAGAAGA  ATTGCAATGG  ATATGATTCT  GAAGGTAGCT  3120
3121  GACTCTCAGT  GTCATCGGCA  GTTCATTTTG  CTCACCCCAC  AAAGCATGAG  TTTTCTGCCT  3180
3181  GTAAGTTCCC  GTATTCGTAT  CCTCCGAATG  CAAGACCCTG  AAAGAGGCCA  AAGAACACTG  3240
3241  ACATTCCGTA  ATAGGAACGA  AGAAGAGGAA  GATGATTAA  3279

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Gaga-1799Gallus gallus95.890.02070
LLPS-Anp-1694Anas platyrhynchos81.660.01784
LLPS-Fia-0203Ficedula albicollis69.770.01494
LLPS-Tag-1153Taeniopygia guttata69.530.01499
LLPS-Pes-0385Pelodiscus sinensis67.520.01480
LLPS-Aim-0324Ailuropoda melanoleuca60.420.01208
LLPS-Sus-2277Sus scrofa60.260.01296
LLPS-Caf-2979Canis familiaris60.260.01296
LLPS-Ova-1690Ovis aries60.180.01295
LLPS-Bot-0110Bos taurus60.160.01305
LLPS-Fec-3353Felis catus60.160.01293
LLPS-Maf-1742Macaca fascicularis60.050.01303
LLPS-Caj-2062Callithrix jacchus60.050.01299
LLPS-Mup-1051Mustela putorius furo59.980.01291
LLPS-Paa-2237Papio anubis59.960.01303
LLPS-Cea-0574Cercocebus atys59.960.01303
LLPS-Mam-2810Macaca mulatta59.960.01303
LLPS-Eqc-0656Equus caballus59.890.01302
LLPS-Urm-2210Ursus maritimus59.80.01291
LLPS-Aon-0058Aotus nancymaae59.780.01294
LLPS-Otg-1083Otolemur garnettii59.780.01288
LLPS-Ora-3106Ornithorhynchus anatinus59.763e-119 377
LLPS-Cas-0606Carlito syrichta59.710.01295
LLPS-Hos-1075Homo sapiens59.710.01292
LLPS-Mea-0761Mesocricetus auratus59.690.01292
LLPS-Fud-2727Fukomys damarensis59.620.01291
LLPS-Pat-1337Pan troglodytes59.620.01290
LLPS-Poa-2718Pongo abelii59.60.01293
LLPS-Cap-1724Cavia porcellus59.560.01283
LLPS-Rhb-3033Rhinopithecus bieti59.540.01256
LLPS-Ran-0412Rattus norvegicus59.510.01288
LLPS-Mum-2021Mus musculus59.510.01290
LLPS-Loa-3728Loxodonta africana59.490.01277
LLPS-Dio-0704Dipodomys ordii59.420.01296
LLPS-Myl-1319Myotis lucifugus59.420.01298
LLPS-Nol-2833Nomascus leucogenys59.420.01287
LLPS-Ict-0175Ictidomys tridecemlineatus59.250.01286
LLPS-Orc-1512Oryctolagus cuniculus58.980.01266
LLPS-Pap-2315Pan paniscus58.890.01264
LLPS-Chs-0469Chlorocebus sabaeus58.690.01200
LLPS-Sah-1473Sarcophilus harrisii58.00.01225
LLPS-Man-1204Macaca nemestrina57.580.01100
LLPS-Xet-0485Xenopus tropicalis57.360.01205
LLPS-Gog-1643Gorilla gorilla57.230.01226
LLPS-Lac-0105Latimeria chalumnae56.930.01231
LLPS-Anc-0826Anolis carolinensis56.310.01219
LLPS-Mal-0398Mandrillus leucophaeus55.530.01142
LLPS-Scf-2433Scleropages formosus51.780.01102
LLPS-Ors-0061Oryza sativa50.438e-26 109
LLPS-Orl-0072Oryzias latipes50.150.01027
LLPS-Scm-0955Scophthalmus maximus50.150.01059
LLPS-Pof-0193Poecilia formosa49.950.01040
LLPS-Dar-1594Danio rerio49.910.01037
LLPS-Orn-0327Oreochromis niloticus49.170.01046
LLPS-Xim-0508Xiphophorus maculatus48.90.01017
LLPS-Tar-0856Takifugu rubripes47.790.0 957
LLPS-Ten-1550Tetraodon nigroviridis47.660.0 967
LLPS-Leo-1205Lepisosteus oculatus47.520.0 873
LLPS-Asm-0269Astyanax mexicanus47.250.0 917
LLPS-Mod-0610Monodelphis domestica47.190.0 879
LLPS-Icp-1310Ictalurus punctatus47.130.0 921
LLPS-Asfu-1072Aspergillus fumigatus46.792e-25 118
LLPS-Gaa-2382Gasterosteus aculeatus45.520.0 866
LLPS-Via-0557Vigna angularis44.441e-1687.0
LLPS-Phv-1811Phaseolus vulgaris40.995e-55 204
LLPS-Cii-1340Ciona intestinalis35.80.0 684
LLPS-Brn-2830Brassica napus32.871e-24 115
LLPS-Brr-2206Brassica rapa32.871e-24 115
LLPS-Cis-0006Ciona savignyi32.846e-25 110
LLPS-Cae-0524Caenorhabditis elegans32.046e-22 107
LLPS-Ast-0041Aspergillus terreus31.115e-73 259
LLPS-Cym-0058Cyanidioschyzon merolae30.544e-23 110
LLPS-Gas-0751Galdieria sulphuraria30.453e-22 107
LLPS-Tum-0035Tuber melanosporum30.313e-122 409
LLPS-Pytr-0170Pyrenophora triticirepentis30.164e-117 396
LLPS-Lem-0065Leptosphaeria maculans29.876e-112 382
LLPS-Sot-0799Solanum tuberosum29.552e-49 190
LLPS-Put-0859Puccinia triticina29.497e-35 149
LLPS-Blg-0620Blumeria graminis29.342e-116 395
LLPS-Pyt-0080Pyrenophora teres29.096e-115 390
LLPS-Asn-0027Aspergillus nidulans28.83e-116 394
LLPS-Nef-0089Neosartorya fischeri28.571e-115 392
LLPS-Amt-0639Amborella trichopoda28.576e-105 360
LLPS-Fuv-0793Fusarium verticillioides28.472e-115 392
LLPS-Scc-0071Schizosaccharomyces cryophilus28.459e-109 373
LLPS-Miv-0172Microbotryum violaceum28.373e-118 399
LLPS-Trr-0575Trichoderma reesei28.363e-114 389
LLPS-Crn-0468Cryptococcus neoformans28.352e-105 364
LLPS-Art-2727Arabidopsis thaliana28.325e-101 349
LLPS-Scp-0023Schizosaccharomyces pombe28.071e-123 414
LLPS-Fus-0282Fusarium solani27.985e-115 390
LLPS-Lep-1459Leersia perrieri27.975e-93 326
LLPS-Asni-0771Aspergillus niger27.893e-104 360
LLPS-Asc-0008Aspergillus clavatus27.884e-112 382
LLPS-Arl-0493Arabidopsis lyrata27.866e-95 332
LLPS-Beb-0184Beauveria bassiana27.796e-115 390
LLPS-Orb-0609Oryza barthii27.742e-55 214
LLPS-Scs-0267Sclerotinia sclerotiorum27.659e-111 379
LLPS-Aso-0416Aspergillus oryzae27.64e-103 357
LLPS-Tru-0474Triticum urartu27.52e-88 313
LLPS-Abg-0628Absidia glauca27.433e-120 404
LLPS-Sol-0726Solanum lycopersicum27.432e-84 302
LLPS-Scj-1173Schizosaccharomyces japonicus27.336e-121 406
LLPS-Mel-0160Melampsora laricipopulina27.323e-112 382
LLPS-Orni-0418Oryza nivara27.316e-56 215
LLPS-Orr-0873Oryza rufipogon27.318e-56 215
LLPS-Dos-0886Dothistroma septosporum27.088e-118 399
LLPS-Fuo-0715Fusarium oxysporum26.984e-61 227
LLPS-Mua-0176Musa acuminata26.959e-94 328
LLPS-Ori-1081Oryza indica26.943e-90 318
LLPS-Osl-0896Ostreococcus lucimarinus26.932e-88 314
LLPS-Sac-1065Saccharomyces cerevisiae26.165e-88 313
LLPS-Chr-0598Chlamydomonas reinhardtii25.873e-80 291
LLPS-Dac-1372Daucus carota25.297e-46 183
LLPS-Chc-0444Chondrus crispus24.373e-66 248
LLPS-Yal-1011Yarrowia lipolytica22.971e-35 151