• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Hea-0360
MIM

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Structural maintenance of chromosomes protein 6
Gene Name: MIM, HannXRQ_Chr01g0028141
Ensembl Gene: HannXRQ_Chr01g0028141
Ensembl Protein: OTG38292
Organism: Helianthus annuus
Taxa ID: 4232
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblOTG38292OTG38292
UniProtA0A251VT92, A0A251VT92_HELAN
GeneBankCM007890OTG38292.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MAEARVSNRT  PLRAGIITKI  RVENFMCHSH  MEIDMGDRVN  FITGQNGSGK  SAILTALCIG  60
61    FGCRAKSTDR  ATTMKEFIKT  GCSYALVHLE  IKNQGEDAFK  HDLYGDMIIL  ERRITESSST  120
121   SVLKDHQGKK  VAGRREDIRE  LVEHFNIDVE  NPCVVMTQDK  SREFLHSGND  KDKFKFFFKA  180
181   TLLSQVDDLL  KSVKDNLDKA  NGEVVGLEKS  IAPIEKELND  LQGKIRSMEH  VEEIAQQVQL  240
241   LTKKCAWSVV  YDIDKQIQVE  VARIKKLEER  IPRCQARIDQ  QIAKVAEIQD  LLDKKKAQSA  300
301   ILMETTSKAR  QRKNELEQKL  SKATKEKLEL  EQEYYRRSNN  IGKMVKRIKL  LEQQINDVNE  360
361   QQIKDTQAEE  SEMEKKLKEL  QDEINAAELE  SQRLKNIEDQ  VSESLVTARD  ELRTLTSEIE  420
421   DCEKRVNESQ  RRIRDLRLNQ  THKVTAFGGY  KVTNLLQVIE  RNHRRFKKPP  IGPIGSHVAL  480
481   IQGDKWAVAV  ENAIGKLLNA  FIVTDHKDSL  VLRSCAREAN  YPYLQIIIYD  FSIPRLQIPH  540
541   HMLPQTNHPT  TISVIQSDSP  TVVNVLVDMG  GAERQVLVTD  YDMGTRVAFD  QRIPNLKEVY  600
601   TLEGHRMFSR  GSAQTILPPN  KSARTGRLCS  SYDDQIKKHE  REALHMQEQA  QQIRGKKRSF  660
661   EERVQNLQNE  LSNAKRQRTG  AEKRVMSKKL  SLEDLKKSYA  AEAMTSSVSN  VDELHHEISK  720
721   VQSDKSESEV  LLEKIQERLN  EADAKVNEFK  VLFAELGELA  KADINALDKA  TRELTQIEED  780
781   LSAADADKRH  FDGLMQQQVH  KRIETSKQQL  KEKENERKIN  SEKASIICPE  SEIEALGGCG  840
841   GDTSEQLQAN  LKRLKLRLQQ  ESQRHVESID  ELRMQYNKNE  RKIKKQRETY  KAFRDKLSAI  900
901   HTALDKRWSK  FQRNATLLKR  QLTWQFNGHL  GKKGISGHIK  VSYEEQKLSI  EVKMPQDAST  960
961   SNVRDTRGLS  GGERSFSTLC  FALALHEMTE  APFRAMDEFD  VFMDAVSRKI  SLDTVVDFAL  1020
1021  TQGSQWIFIT  PHDISMVKHD  ERIKKQQMAA  PRS  1053
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGCGGAAG  CTAGGGTTTC  TAACAGAACG  CCTCTGCGAG  CAGGGATAAT  AACCAAAATT  60
61    AGAGTCGAAA  ACTTCATGTG  TCATAGTCAT  ATGGAGATTG  ATATGGGAGA  TCGGGTTAAT  120
121   TTCATCACCG  GACAAAACGG  AAGTGGAAAG  AGTGCGATAC  TTACGGCGTT  GTGTATAGGG  180
181   TTTGGTTGTC  GTGCGAAAAG  TACAGATAGG  GCTACTACAA  TGAAGGAGTT  TATAAAGACT  240
241   GGTTGCAGCT  ACGCCCTTGT  TCACTTGGAA  ATTAAAAATC  AGGGGGAAGA  TGCTTTTAAG  300
301   CACGACCTTT  ATGGAGATAT  GATAATTTTA  GAGCGTAGAA  TCACCGAATC  ATCAAGTACT  360
361   AGCGTTCTTA  AAGATCATCA  AGGGAAAAAA  GTGGCTGGCC  GAAGAGAAGA  CATCCGTGAG  420
421   CTTGTGGAAC  ACTTTAATAT  TGATGTTGAG  AATCCTTGTG  TAGTAATGAC  TCAGGACAAG  480
481   AGTAGAGAAT  TTTTGCATTC  GGGAAATGAC  AAAGATAAAT  TTAAGTTCTT  TTTCAAGGCT  540
541   ACACTTCTAA  GTCAAGTGGA  TGATTTGTTA  AAAAGCGTTA  AGGATAACCT  TGATAAGGCG  600
601   AATGGTGAGG  TTGTTGGGTT  GGAAAAATCA  ATAGCACCTA  TAGAGAAAGA  GTTAAATGAC  660
661   TTGCAAGGGA  AAATTAGAAG  CATGGAGCAT  GTTGAAGAAA  TTGCTCAGCA  GGTGCAGTTA  720
721   TTAACGAAGA  AATGTGCATG  GTCAGTGGTA  TATGACATAG  ACAAACAAAT  CCAGGTAGAG  780
781   GTTGCAAGGA  TTAAAAAACT  CGAAGAACGG  ATACCTCGTT  GTCAAGCTCG  AATTGATCAG  840
841   CAAATTGCGA  AAGTAGCAGA  AATACAGGAC  TTACTTGACA  AAAAGAAAGC  TCAAAGCGCC  900
901   ATTTTGATGG  AAACTACCTC  AAAAGCAAGG  CAAAGGAAGA  ATGAATTGGA  GCAGAAACTT  960
961   TCTAAGGCTA  CAAAGGAGAA  GCTTGAGTTG  GAGCAAGAAT  ATTATCGCAG  AAGTAACAAC  1020
1021  ATTGGTAAGA  TGGTCAAAAG  GATTAAGTTG  CTTGAGCAGC  AAATCAATGA  TGTAAACGAG  1080
1081  CAACAAATTA  AGGACACACA  GGCTGAAGAG  TCTGAGATGG  AGAAAAAACT  GAAGGAGCTT  1140
1141  CAAGATGAGA  TAAATGCTGC  TGAATTAGAG  TCTCAAAGAT  TGAAGAATAT  TGAGGATCAA  1200
1201  GTATCTGAAA  GTTTAGTTAC  TGCAAGGGAT  GAACTTAGAA  CACTCACTTC  TGAGATCGAA  1260
1261  GATTGTGAGA  AGAGGGTTAA  CGAGAGTCAG  CGTCGCATTC  GTGACCTGCG  ACTTAATCAA  1320
1321  ACACACAAGG  TGACAGCATT  TGGAGGCTAT  AAAGTTACCA  ATCTTCTACA  GGTTATTGAG  1380
1381  AGGAATCACC  GCAGATTTAA  AAAGCCCCCT  ATTGGTCCTA  TAGGCTCTCA  TGTGGCATTA  1440
1441  ATTCAAGGTG  ATAAATGGGC  CGTTGCTGTA  GAAAATGCAA  TTGGCAAATT  ACTTAATGCT  1500
1501  TTTATAGTGA  CAGATCATAA  AGATTCTCTC  GTATTGAGAT  CGTGTGCTAG  AGAAGCCAAC  1560
1561  TACCCCTACC  TTCAGATCAT  TATATATGAT  TTTTCTATAC  CGAGGTTGCA  AATTCCACAT  1620
1621  CATATGCTTC  CTCAAACAAA  TCACCCAACT  ACTATTTCAG  TAATACAATC  TGACAGTCCA  1680
1681  ACAGTAGTGA  ATGTTTTAGT  TGATATGGGC  GGGGCTGAGA  GACAAGTGCT  TGTAACAGAC  1740
1741  TATGATATGG  GAACTAGGGT  TGCGTTTGAC  CAAAGGATTC  CAAATCTGAA  GGAGGTTTAC  1800
1801  ACGTTAGAGG  GCCATAGAAT  GTTCTCACGT  GGTTCGGCAC  AGACAATTCT  ACCTCCTAAT  1860
1861  AAGAGCGCAA  GGACTGGGCG  TCTCTGTAGT  TCATACGATG  ATCAAATTAA  AAAGCATGAA  1920
1921  CGAGAGGCAC  TACATATGCA  AGAACAAGCA  CAGCAAATTC  GAGGGAAGAA  AAGAAGCTTT  1980
1981  GAGGAACGGG  TTCAGAATCT  TCAGAATGAA  CTAAGCAATG  CAAAAAGACA  ACGCACTGGT  2040
2041  GCAGAGAAGC  GGGTAATGTC  TAAAAAGTTA  AGTCTAGAGG  ATCTGAAGAA  ATCTTATGCT  2100
2101  GCAGAAGCCA  TGACTTCATC  TGTTTCGAAC  GTTGATGAGC  TCCATCACGA  GATTTCAAAA  2160
2161  GTACAAAGCG  ATAAAAGTGA  AAGCGAAGTT  TTGCTTGAGA  AGATTCAGGA  GAGATTGAAT  2220
2221  GAAGCCGATG  CTAAAGTGAA  TGAATTTAAA  GTCTTGTTTG  CCGAGCTAGG  TGAACTGGCA  2280
2281  AAAGCAGACA  TCAATGCTTT  AGACAAAGCA  ACTCGTGAGT  TGACTCAGAT  CGAAGAGGAT  2340
2341  CTAAGTGCTG  CAGATGCGGA  TAAACGCCAT  TTTGACGGAC  TCATGCAGCA  GCAGGTTCAT  2400
2401  AAGAGGATTG  AAACCTCAAA  ACAACAACTT  AAGGAAAAAG  AAAATGAGCG  AAAGATAAAT  2460
2461  TCTGAAAAGG  CGTCTATTAT  ATGTCCCGAG  AGTGAGATTG  AAGCCTTAGG  AGGATGCGGC  2520
2521  GGGGATACTT  CTGAGCAACT  TCAAGCCAAC  CTTAAAAGGC  TAAAACTTAG  ACTTCAGCAA  2580
2581  GAGAGCCAGA  GGCATGTGGA  ATCTATTGAT  GAACTTCGGA  TGCAGTATAA  TAAGAATGAG  2640
2641  CGTAAGATCA  AAAAACAACG  CGAAACCTAC  AAAGCATTTA  GAGATAAACT  TTCTGCAATT  2700
2701  CATACGGCTC  TTGACAAACG  ATGGAGTAAG  TTTCAGAGGA  ATGCAACTCT  TTTAAAGAGG  2760
2761  CAGCTGACGT  GGCAATTCAA  TGGTCATCTT  GGAAAAAAAG  GGATCAGTGG  TCACATTAAA  2820
2821  GTTAGTTACG  AGGAGCAGAA  GCTTTCAATA  GAGGTTAAGA  TGCCACAAGA  TGCATCTACT  2880
2881  AGCAATGTTC  GTGACACTAG  AGGGCTTTCA  GGAGGGGAGC  GATCATTCTC  AACTCTCTGT  2940
2941  TTTGCGCTAG  CTCTTCACGA  GATGACAGAA  GCCCCATTTC  GAGCTATGGA  TGAGTTTGAT  3000
3001  GTGTTTATGG  ATGCTGTCAG  CCGGAAAATC  AGCTTGGATA  CAGTTGTAGA  TTTTGCTCTC  3060
3061  ACACAAGGTT  CCCAGTGGAT  ATTTATCACG  CCTCACGATA  TAAGCATGGT  AAAACATGAT  3120
3121  GAGAGAATAA  AGAAGCAACA  AATGGCTGCT  CCTCGGTCAT  GA  3162

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Via-0557Vigna angularis87.81e-40 160
LLPS-Ors-0061Oryza sativa67.523e-48 173
LLPS-Viv-0639Vitis vinifera65.860.01335
LLPS-Nia-0490Nicotiana attenuata64.280.01263
LLPS-Sot-0799Solanum tuberosum63.240.0 648
LLPS-Sol-0726Solanum lycopersicum62.930.01281
LLPS-Prp-0608Prunus persica62.790.01271
LLPS-Cus-0856Cucumis sativus62.750.01278
LLPS-Pot-0067Populus trichocarpa62.180.01275
LLPS-Dac-1372Daucus carota61.920.01019
LLPS-Mae-1219Manihot esculenta60.30.01218
LLPS-Brn-2830Brassica napus59.230.01168
LLPS-Bro-0854Brassica oleracea59.230.01168
LLPS-Arl-0453Arabidopsis lyrata59.130.01177
LLPS-Amt-0639Amborella trichopoda59.060.01171
LLPS-Art-0982Arabidopsis thaliana58.940.01179
LLPS-Thc-0549Theobroma cacao58.890.01140
LLPS-Brr-2206Brassica rapa58.850.01155
LLPS-Mua-0176Musa acuminata58.550.01194
LLPS-Gor-0041Gossypium raimondii57.210.01122
LLPS-Phv-1811Phaseolus vulgaris56.052e-143 445
LLPS-Met-0110Medicago truncatula55.570.01100
LLPS-Glm-1523Glycine max55.430.01099
LLPS-Coc-0620Corchorus capsularis54.890.01050
LLPS-Sei-0169Setaria italica53.840.01041
LLPS-Zem-0081Zea mays53.310.01046
LLPS-Sob-1122Sorghum bicolor52.910.01050
LLPS-Cae-0800Caenorhabditis elegans52.72e-1585.5
LLPS-Hov-0214Hordeum vulgare52.650.01026
LLPS-Brd-0939Brachypodium distachyon52.370.01052
LLPS-Tra-3027Triticum aestivum52.070.01013
LLPS-Orbr-0478Oryza brachyantha51.870.01026
LLPS-Ori-1081Oryza indica51.680.01035
LLPS-Orp-0673Oryza punctata51.010.01011
LLPS-Lep-1459Leersia perrieri50.240.01001
LLPS-Tru-0474Triticum urartu48.40.0 914
LLPS-Vir-0016Vigna radiata47.840.0 921
LLPS-Sem-0543Selaginella moellendorffii45.050.0 837
LLPS-Php-0142Physcomitrella patens44.90.0 850
LLPS-Orgl-0057Oryza glumaepatula44.660.0 848
LLPS-Orni-0418Oryza nivara44.660.0 849
LLPS-Orr-0873Oryza rufipogon44.660.0 848
LLPS-Orb-0609Oryza barthii44.570.0 847
LLPS-Orm-0615Oryza meridionalis43.970.0 832
LLPS-Org-0410Oryza glaberrima42.090.0 565
LLPS-Zyt-0433Zymoseptoria tritici31.412e-36 153
LLPS-Ora-3106Ornithorhynchus anatinus31.013e-27 119
LLPS-Put-0859Puccinia triticina30.252e-27 124
LLPS-Mod-0610Monodelphis domestica29.951e-1689.7
LLPS-Tum-0035Tuber melanosporum29.912e-20 102
LLPS-Chr-0598Chlamydomonas reinhardtii29.583e-1998.2
LLPS-Gaa-2382Gasterosteus aculeatus29.496e-56 215
LLPS-Asm-0269Astyanax mexicanus29.323e-105 361
LLPS-Osl-0896Ostreococcus lucimarinus29.177e-113 381
LLPS-Ran-0412Rattus norvegicus28.652e-99 345
LLPS-Abg-0628Absidia glauca28.412e-49 195
LLPS-Mum-2021Mus musculus28.058e-98 340
LLPS-Sah-1473Sarcophilus harrisii28.021e-97 340
LLPS-Orl-0072Oryzias latipes27.911e-99 346
LLPS-Icp-1310Ictalurus punctatus27.894e-94 330
LLPS-Pes-0385Pelodiscus sinensis27.733e-98 341
LLPS-Orn-0327Oreochromis niloticus27.722e-97 340
LLPS-Scf-2433Scleropages formosus27.591e-105 364
LLPS-Urm-2210Ursus maritimus27.453e-99 344
LLPS-Caf-2979Canis familiaris27.362e-100 347
LLPS-Mup-1051Mustela putorius furo27.293e-99 344
LLPS-Pof-0193Poecilia formosa27.214e-94 330
LLPS-Myl-1319Myotis lucifugus27.092e-97 339
LLPS-Fud-2727Fukomys damarensis27.073e-100 347
LLPS-Cym-0058Cyanidioschyzon merolae26.952e-82 296
LLPS-Scm-0955Scophthalmus maximus26.943e-95 333
LLPS-Lem-0065Leptosphaeria maculans26.926e-76 276
LLPS-Mel-0160Melampsora laricipopulina26.926e-50 197
LLPS-Anp-1694Anas platyrhynchos26.888e-97 337
LLPS-Poa-2718Pongo abelii26.833e-98 341
LLPS-Cii-1340Ciona intestinalis26.713e-89 315
LLPS-Xim-0508Xiphophorus maculatus26.693e-94 330
LLPS-Cea-0574Cercocebus atys26.672e-98 342
LLPS-Maf-1742Macaca fascicularis26.672e-98 342
LLPS-Ova-1690Ovis aries26.652e-97 339
LLPS-Meg-0079Meleagris gallopavo26.629e-92 323
LLPS-Chc-0444Chondrus crispus26.613e-67 250
LLPS-Trr-0575Trichoderma reesei26.619e-72 264
LLPS-Ten-1550Tetraodon nigroviridis26.422e-88 313
LLPS-Pytr-0170Pyrenophora triticirepentis26.332e-75 275
LLPS-Asfu-1072Aspergillus fumigatus26.191e-70 259
LLPS-Pyt-0080Pyrenophora teres25.967e-68 252
LLPS-Fuv-0793Fusarium verticillioides25.963e-49 194
LLPS-Asg-0182Ashbya gossypii25.964e-52 203
LLPS-Dos-0886Dothistroma septosporum25.821e-72 266
LLPS-Blg-0620Blumeria graminis25.717e-70 258
LLPS-Leo-1205Lepisosteus oculatus25.541e-59 226
LLPS-Gas-0751Galdieria sulphuraria25.521e-61 233
LLPS-Lac-0105Latimeria chalumnae25.492e-94 331
LLPS-Anc-0826Anolis carolinensis25.466e-91 321
LLPS-Tar-0856Takifugu rubripes25.47e-89 315
LLPS-Miv-0172Microbotryum violaceum25.214e-69 256
LLPS-Usm-0429Ustilago maydis25.111e-74 272
LLPS-Kop-0712Komagataella pastoris25.024e-60 228
LLPS-Spr-0619Sporisorium reilianum25.09e-77 279
LLPS-Asn-0027Aspergillus nidulans24.771e-79 288
LLPS-Phn-0153Phaeosphaeria nodorum24.491e-52 204
LLPS-Drm-0821Drosophila melanogaster24.483e-59 225
LLPS-Crn-0468Cryptococcus neoformans24.424e-67 249
LLPS-Fus-0282Fusarium solani23.654e-73 268
LLPS-Yal-1011Yarrowia lipolytica21.66e-1584.3
LLPS-Pug-0732Puccinia graminis21.242e-32 140