• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Nia-1772
PAB8_3

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Polyadenylate-binding protein 8
Gene Name: PAB8_3, A4A49_34832
Ensembl Gene: A4A49_34832
Ensembl Protein: OIT07790
Organism: Nicotiana attenuata
Taxa ID: 49451
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MPPRAVKRTP  TGSGTKRGGR  TNRGTHKSKE  KQPVVMADEP  VKVEVSAAEE  EKKLELKQEL  60
61    KAEQPVAEEK  SELEKPVKAE  PEVKPVEKTD  DVKDSDEYEK  GERLDLDDND  PEYEPEEYGA  120
121   VDYDERGIEH  EDVQEEGYEI  EEDPQEGDDG  EEEEEGDMVE  DDVEDMHEEI  EGEEDGEHAE  180
181   GEEHAEMVDA  AEDEEHHEVV  KERLKRKEFE  VFVGGLDKDA  TEDDLRKVFS  QVGEVTEVRL  240
241   LMNPQTKKNK  GFAFLRFATV  EQAKRACIEL  KNPVVNGKKC  GVSPSQDSDT  LFLGNICKSW  300
301   TKEALKEKLK  HYGVNNVEDL  TLVEDTNNEG  MNRGFAFLEF  SSRSEAMDAF  KRLQKRDIVF  360
361   GVDRPAKVSF  ADSFIDPGDE  IMAQVKTVFI  DGLSASWDED  RVRDLLKEYG  NIEKIELARN  420
421   MPSAKRKDFG  FVSFDTHEAA  VVCAKSINNE  ELGEGDKKVK  VRARLSRPLQ  RGRGRYGARD  480
481   LRPRHGLMRG  PRAPWGRPVP  HRLPVRGSRV  STRVPPLADR  SFKRPAAMRD  RRPVMAVAPR  540
541   GRPVAPLSSR  SYDRRPPVHS  YPKSKREYAR  HEEIPPPRSR  AAVDYPSRFP  SDRRSSYRDD  600
601   YSSRSSGYPD  FPRGTARTST  RRAYVDDGYE  ERYERPPPAY  REGRGREYDS  ISGSKRSYSS  660
661   LDEVPPRYAE  AGVRTSRSRL  DYELGGASGT  QYGDYSDSRL  GRSNLGYSGS  RSSLSGQDSH  720
721   GMYSSRQGGY  GGGSYGGSDV  SGMYSSGYGG  DYVSRGSDVG  GSSYSSAYSS  RGMGGSGYMG  780
781   SGGSGSYY  788
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGCCTCCGA  GAGCTGTAAA  GAGGACGCCG  ACAGGATCCG  GAACGAAACG  GGGCGGCCGG  60
61    ACAAACCGAG  GGACACATAA  ATCAAAGGAA  AAACAACCGG  TAGTGATGGC  GGATGAACCG  120
121   GTAAAAGTTG  AGGTTTCTGC  AGCGGAGGAG  GAGAAGAAGC  TGGAGCTGAA  ACAAGAATTG  180
181   AAGGCGGAGC  AACCGGTGGC  CGAGGAGAAA  TCCGAGCTTG  AAAAGCCGGT  CAAAGCGGAG  240
241   CCGGAGGTGA  AACCTGTGGA  GAAGACGGAC  GATGTGAAAG  ATTCAGATGA  ATATGAAAAA  300
301   GGCGAACGCT  TAGATTTGGA  TGATAATGAT  CCTGAATATG  AACCCGAAGA  GTATGGCGCT  360
361   GTAGATTATG  ACGAGAGAGG  AATTGAACAT  GAGGATGTTC  AGGAAGAGGG  TTATGAAATA  420
421   GAGGAAGATC  CCCAAGAGGG  AGATGATGGT  GAGGAGGAGG  AGGAAGGTGA  CATGGTTGAA  480
481   GATGATGTTG  AAGATATGCA  CGAGGAAATT  GAGGGTGAGG  AAGATGGCGA  GCATGCAGAA  540
541   GGAGAGGAGC  ATGCAGAGAT  GGTTGATGCA  GCTGAGGATG  AAGAACATCA  TGAAGTTGTT  600
601   AAAGAAAGAC  TTAAGAGGAA  GGAATTTGAA  GTTTTTGTTG  GTGGCTTGGA  CAAGGATGCT  660
661   ACTGAGGATG  ATCTCAGGAA  AGTTTTCAGT  CAAGTTGGTG  AGGTCACTGA  AGTGAGACTC  720
721   TTAATGAATC  CTCAGACAAA  GAAGAATAAA  GGATTTGCAT  TCCTGCGTTT  TGCAACAGTG  780
781   GAACAAGCAA  AACGAGCTTG  TATTGAGCTG  AAAAATCCAG  TGGTGAATGG  GAAAAAATGT  840
841   GGTGTTTCCC  CAAGTCAGGA  CAGTGATACC  CTATTTTTGG  GTAACATATG  CAAATCTTGG  900
901   ACAAAAGAAG  CCTTAAAAGA  GAAGTTGAAG  CATTATGGCG  TTAATAATGT  TGAGGATTTG  960
961   ACATTGGTTG  AAGACACTAA  TAATGAGGGT  ATGAATCGAG  GCTTTGCTTT  TCTGGAGTTC  1020
1021  TCTTCACGCT  CAGAGGCCAT  GGATGCATTT  AAACGTCTAC  AGAAGAGAGA  TATTGTGTTT  1080
1081  GGAGTTGATA  GGCCTGCCAA  GGTTTCTTTT  GCAGATTCAT  TCATTGACCC  TGGAGATGAA  1140
1141  ATTATGGCAC  AGGTTAAAAC  AGTTTTTATT  GATGGTCTTT  CTGCATCTTG  GGATGAGGAT  1200
1201  CGTGTGAGGG  ATCTTCTTAA  AGAATATGGC  AATATTGAAA  AAATTGAGCT  AGCCCGTAAT  1260
1261  ATGCCTTCAG  CCAAGAGAAA  GGATTTTGGA  TTTGTCAGTT  TTGACACTCA  TGAAGCTGCA  1320
1321  GTTGTTTGTG  CCAAAAGCAT  TAATAATGAA  GAGTTGGGTG  AAGGAGATAA  GAAGGTTAAA  1380
1381  GTTAGGGCCA  GATTATCAAG  GCCACTTCAG  AGAGGAAGAG  GGAGATATGG  TGCACGTGAT  1440
1441  CTGCGACCTC  GACATGGGTT  GATGCGTGGT  CCTCGTGCTC  CATGGGGTCG  TCCAGTCCCA  1500
1501  CATAGACTCC  CTGTTCGTGG  ATCTAGAGTT  AGTACACGTG  TCCCTCCCCT  TGCTGATCGT  1560
1561  AGTTTCAAAC  GACCTGCCGC  AATGAGGGAT  AGGCGACCGG  TTATGGCTGT  GGCTCCAAGG  1620
1621  GGCAGACCTG  TGGCTCCATT  ATCGAGCAGG  TCTTATGACC  GGAGACCACC  TGTTCACTCG  1680
1681  TACCCAAAGA  GTAAGAGGGA  GTATGCACGG  CATGAGGAAA  TTCCTCCTCC  TAGAAGCAGA  1740
1741  GCCGCAGTGG  ACTATCCTTC  TAGGTTTCCT  TCCGATAGAC  GCAGCTCGTA  CAGGGATGAC  1800
1801  TATTCTTCTC  GTAGCTCGGG  TTACCCTGAT  TTTCCAAGAG  GTACTGCTCG  CACATCAACA  1860
1861  AGGAGAGCTT  ATGTTGATGA  TGGATATGAA  GAACGGTATG  AAAGGCCTCC  TCCTGCTTAT  1920
1921  CGCGAGGGGC  GAGGTAGGGA  ATATGATTCC  ATATCTGGCT  CCAAACGTTC  ATACAGTTCA  1980
1981  CTGGATGAGG  TCCCTCCCCG  CTATGCTGAA  GCAGGAGTCC  GCACTTCTCG  TTCTCGTTTG  2040
2041  GATTATGAAC  TTGGTGGTGC  GAGTGGCACA  CAGTACGGGG  ATTATAGTGA  CAGTAGGTTA  2100
2101  GGGAGATCAA  ATCTTGGATA  TAGTGGCAGC  CGGAGTTCCC  TTTCTGGGCA  AGATTCTCAT  2160
2161  GGAATGTATA  GCAGTCGTCA  GGGAGGCTAT  GGCGGAGGCT  CTTATGGGGG  CAGTGATGTC  2220
2221  AGTGGAATGT  ATTCATCTGG  CTATGGTGGC  GATTACGTGT  CTCGTGGCAG  TGATGTTGGT  2280
2281  GGTAGCTCTT  ATTCATCAGC  CTATTCCAGT  CGTGGCATGG  GTGGTAGTGG  TTATATGGGT  2340
2341  AGTGGTGGTT  CTGGATCTTA  TTACTAA  2367

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Sot-1804Solanum tuberosum80.040.0 762
LLPS-Sol-1480Solanum lycopersicum79.440.0 759
LLPS-Prp-2217Prunus persica74.760.0 705
LLPS-Pot-0774Populus trichocarpa74.610.0 712
LLPS-Mae-1029Manihot esculenta74.070.0 691
LLPS-Coc-0268Corchorus capsularis73.590.0 702
LLPS-Thc-1738Theobroma cacao72.820.0 695
LLPS-Cus-1912Cucumis sativus72.620.0 686
LLPS-Gor-2611Gossypium raimondii71.730.0 695
LLPS-Dac-2053Daucus carota71.020.0 688
LLPS-Viv-1801Vitis vinifera71.020.0 711
LLPS-Mua-1566Musa acuminata68.060.0 617
LLPS-Amt-1002Amborella trichopoda67.260.0 630
LLPS-Hea-0965Helianthus annuus66.290.0 616
LLPS-Met-1555Medicago truncatula65.840.0 656
LLPS-Phv-0833Phaseolus vulgaris65.840.0 676
LLPS-Sob-1913Sorghum bicolor65.690.0 591
LLPS-Vir-1987Vigna radiata65.170.0 667
LLPS-Via-1262Vigna angularis64.860.0 652
LLPS-Ors-2357Oryza sativa64.790.0 600
LLPS-Org-1943Oryza glaberrima64.590.0 601
LLPS-Zem-1615Zea mays63.210.0 575
LLPS-Orbr-0946Oryza brachyantha63.040.0 598
LLPS-Lep-2388Leersia perrieri62.840.0 605
LLPS-Orp-0751Oryza punctata62.620.0 584
LLPS-Tru-1519Triticum urartu62.262e-175 530
LLPS-Orgl-2010Oryza glumaepatula62.20.0 585
LLPS-Orr-1945Oryza rufipogon62.080.0 584
LLPS-Orb-1899Oryza barthii61.90.0 583
LLPS-Orni-1392Oryza nivara61.710.0 579
LLPS-Tra-0801Triticum aestivum61.630.0 572
LLPS-Art-1181Arabidopsis thaliana61.060.0 550
LLPS-Brd-2406Brachypodium distachyon60.990.0 568
LLPS-Ori-2414Oryza indica60.793e-147 451
LLPS-Arl-2266Arabidopsis lyrata60.750.0 554
LLPS-Glm-1386Glycine max59.750.0 591
LLPS-Sei-1324Setaria italica59.021e-158 486
LLPS-Hov-1925Hordeum vulgare58.319e-146 445
LLPS-Brn-1269Brassica napus57.822e-179 542
LLPS-Brr-0097Brassica rapa56.663e-177 536
LLPS-Bro-1317Brassica oleracea56.349e-180 543
LLPS-Php-2011Physcomitrella patens48.122e-86 304
LLPS-Orm-0507Oryza meridionalis43.216e-72 252
LLPS-Sem-0924Selaginella moellendorffii35.969e-38 152
LLPS-Tar-3471Takifugu rubripes33.474e-31 134
LLPS-Lac-3539Latimeria chalumnae33.473e-32 137
LLPS-Xet-3727Xenopus tropicalis33.462e-30 130
LLPS-Scf-2164Scleropages formosus33.079e-31 132
LLPS-Leo-1171Lepisosteus oculatus33.069e-33 137
LLPS-Anc-1865Anolis carolinensis33.063e-31 133
LLPS-Caf-1308Canis familiaris32.797e-26 117
LLPS-Otg-1819Otolemur garnettii32.791e-25 117
LLPS-Dar-1152Danio rerio32.662e-31 135
LLPS-Bot-0701Bos taurus32.655e-31 133
LLPS-Dio-1086Dipodomys ordii32.653e-31 133
LLPS-Ran-0023Rattus norvegicus32.655e-31 132
LLPS-Ova-1186Ovis aries32.655e-31 133
LLPS-Aim-0673Ailuropoda melanoleuca32.655e-31 133
LLPS-Mup-1555Mustela putorius furo32.653e-31 133
LLPS-Paa-2523Papio anubis32.655e-31 133
LLPS-Mal-2303Mandrillus leucophaeus32.653e-31 134
LLPS-Ora-0343Ornithorhynchus anatinus32.654e-31 133
LLPS-Chs-1206Chlorocebus sabaeus32.653e-31 133
LLPS-Mea-0457Mesocricetus auratus32.654e-31 132
LLPS-Mum-2050Mus musculus32.659e-31 132
LLPS-Maf-0952Macaca fascicularis32.653e-31 133
LLPS-Aon-1175Aotus nancymaae32.657e-31 133
LLPS-Cea-2913Cercocebus atys32.653e-31 133
LLPS-Sah-0469Sarcophilus harrisii32.655e-31 133
LLPS-Sus-0705Sus scrofa32.656e-31 133
LLPS-Gog-0118Gorilla gorilla32.653e-31 133
LLPS-Caj-1018Callithrix jacchus32.655e-31 133
LLPS-Fud-2086Fukomys damarensis32.653e-31 133
LLPS-Cap-0599Cavia porcellus32.653e-31 133
LLPS-Poa-2384Pongo abelii32.653e-31 133
LLPS-Mam-0933Macaca mulatta32.656e-31 133
LLPS-Cas-1901Carlito syrichta32.653e-31 133
LLPS-Gaga-1705Gallus gallus32.655e-31 133
LLPS-Ict-0599Ictidomys tridecemlineatus32.653e-31 133
LLPS-Nol-0782Nomascus leucogenys32.654e-31 134
LLPS-Fec-2285Felis catus32.657e-31 133
LLPS-Mod-2033Monodelphis domestica32.652e-31 134
LLPS-Pap-1852Pan paniscus32.653e-31 133
LLPS-Urm-1469Ursus maritimus32.653e-31 133
LLPS-Pat-2184Pan troglodytes32.653e-31 133
LLPS-Meg-1264Meleagris gallopavo32.656e-31 133
LLPS-Hos-2095Homo sapiens32.657e-31 133
LLPS-Loa-0312Loxodonta africana32.657e-31 133
LLPS-Anp-2038Anas platyrhynchos32.653e-31 133
LLPS-Man-2149Macaca nemestrina32.653e-31 133
LLPS-Pes-1541Pelodiscus sinensis32.654e-31 133
LLPS-Rhb-1777Rhinopithecus bieti32.653e-31 133
LLPS-Fia-0410Ficedula albicollis32.654e-31 133
LLPS-Orc-0281Oryctolagus cuniculus32.657e-31 133
LLPS-Icp-1165Ictalurus punctatus32.529e-32 135
LLPS-Eqc-3680Equus caballus32.393e-30 130
LLPS-Tag-1480Taeniopygia guttata32.398e-26 117
LLPS-Myl-0557Myotis lucifugus32.243e-30 131
LLPS-Ten-2719Tetraodon nigroviridis32.242e-30 130
LLPS-Orn-0502Oreochromis niloticus32.246e-31 132
LLPS-Asm-1198Astyanax mexicanus32.112e-31 134
LLPS-Xim-3128Xiphophorus maculatus31.855e-31 133
LLPS-Scm-2169Scophthalmus maximus31.842e-30 131
LLPS-Pof-0542Poecilia formosa31.849e-31 131
LLPS-Orl-2715Oryzias latipes31.713e-31 134
LLPS-Gaa-1477Gasterosteus aculeatus31.434e-30 130
LLPS-Drm-0002Drosophila melanogaster30.341e-29 130
LLPS-Cii-2001Ciona intestinalis30.078e-27 120