LLPS-Ran-0023

▼ OVERVIEW

Status: Reviewed
Ensembl Gene: ENSRNOG00000000204.7
Ensembl Protein: ENSRNOP00000048433.4
Organism: Rattus norvegicus
Taxa ID: 10116
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateDescriptionTissue/CellPMIDs
Neuronal granule
N/A
N/A11719208
Nuclear speckle, Nucleolus, P-body, Stress granule, Postsynaptic densityPredicted from orthologsN/A(View)

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MATEHVNGNG  TEEPMDTTSA  VIHSENFQTL  LDAGLPQKVA  EKLDEIYVAG  LVAHSDLDER  60
61    AIEALKEFNE  DGALAVLQQF  KDSDLSHVQN  KSAFLCGVMK  TYRQREKQGT  KVADSSKGPD  120
121   EAKIKALLER  TGYTLDVTTG  QRKYGGPPPD  SVYSGQQPSV  GTEIFVGKIP  RDLFEDELVP  180
181   LFEKAGPIWD  LRLMMDPLTG  LNRGYAFVTF  CTKEAAQEAV  KLYNNHEIRS  GKHIGVCISV  240
241   ANNRLFVGSI  PKSKTKEQIL  EEFSKVTEGL  TDVILYHQPD  DKKKNRGFCF  LEYEDHKTAA  300
301   QARRRLMSGK  VKVWGNVGTV  EWADPIEDPD  PEVMAKVKVL  FVRNLANTVT  EEILEKSFSQ  360
361   FGKLERVKKL  KDYAFIHFDE  RDGAVKAMEE  MNGKDLEGEN  IEIVFAKPPD  QKRKERKAQR  420
421   QAAKNQMYDD  YYYYGPPHMP  PPTRGRGRGG  RGGYGYPPDY  YGYEDYYDYY  GYDYHNYRGG  480
481   YEDPYYGYED  FQVGARGRGG  RGARGAAPSR  GRGAAPPRGR  AGYSQRGGPG  SARGVRGARG  540
541   GAQQQRGRGQ  GKGVEAGPDL  LQ  562
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGCTACAG  AACATGTTAA  TGGAAATGGT  ACTGAAGAGC  CCATGGATAC  TACTTCAGCA  60
61    GTTATCCATT  CAGAAAATTT  TCAGACATTG  CTTGATGCTG  GTTTACCACA  GAAAGTTGCT  120
121   GAAAAACTAG  ATGAAATTTA  CGTTGCAGGG  CTAGTTGCAC  ATAGTGATTT  AGATGAGAGA  180
181   GCTATCGAAG  CTTTAAAAGA  GTTCAATGAA  GACGGCGCAT  TGGCAGTGCT  TCAACAGTTC  240
241   AAAGACAGTG  ATCTCTCTCA  TGTTCAGAAC  AAAAGTGCCT  TTTTATGTGG  AGTCATGAAG  300
301   ACTTACAGGC  AGAGAGAGAA  ACAAGGGACC  AAAGTAGCAG  ACTCTAGTAA  AGGACCAGAT  360
361   GAGGCGAAGA  TTAAGGCACT  TTTGGAAAGA  ACAGGCTACA  CTCTTGATGT  GACTACAGGT  420
421   CAGAGGAAGT  ATGGGGGGCC  ACCTCCAGAT  TCTGTTTATT  CAGGTCAGCA  GCCTTCTGTT  480
481   GGCACTGAGA  TATTTGTGGG  GAAGATCCCC  AGAGATCTGT  TTGAAGATGA  GCTTGTTCCA  540
541   TTGTTTGAGA  AAGCTGGACC  TATATGGGAT  CTTCGTTTAA  TGATGGATCC  ACTTACTGGT  600
601   CTCAACAGAG  GTTATGCCTT  TGTCACTTTT  TGTACAAAAG  AAGCAGCACA  AGAGGCTGTT  660
661   AAACTGTATA  ATAATCATGA  AATTCGTTCC  GGGAAACATA  TTGGTGTCTG  CATCTCAGTT  720
721   GCCAACAATA  GGCTTTTTGT  GGGCTCTATT  CCTAAGAGTA  AAACCAAGGA  ACAGATTCTT  780
781   GAAGAATTTA  GTAAAGTGAC  AGAGGGTCTC  ACAGATGTCA  TTTTATACCA  CCAACCTGAT  840
841   GACAAGAAAA  AAAACAGAGG  CTTTTGCTTT  CTTGAATATG  AAGATCATAA  AACAGCTGCC  900
901   CAGGCAAGGC  GTAGGCTAAT  GAGTGGTAAA  GTTAAAGTCT  GGGGAAATGT  TGGAACTGTT  960
961   GAATGGGCTG  ATCCTATTGA  AGATCCTGAT  CCTGAAGTTA  TGGCAAAGGT  AAAAGTGCTG  1020
1021  TTTGTACGCA  ACCTTGCCAA  CACTGTAACA  GAAGAAATTT  TAGAAAAGTC  GTTTAGTCAG  1080
1081  TTTGGGAAAC  TGGAACGAGT  GAAGAAGCTA  AAAGATTATG  CTTTCATTCA  TTTTGATGAG  1140
1141  AGAGATGGTG  CTGTCAAGGC  TATGGAAGAA  ATGAATGGTA  AAGACTTGGA  GGGAGAAAAC  1200
1201  ATTGAAATTG  TTTTTGCTAA  GCCACCAGAT  CAGAAGAGGA  AAGAAAGAAA  AGCTCAGAGG  1260
1261  CAAGCAGCAA  AGAATCAAAT  GTATGATGAT  TACTACTATT  ATGGTCCACC  TCATATGCCC  1320
1321  CCTCCAACAA  GAGGTCGAGG  GCGTGGAGGT  AGAGGTGGCT  ATGGATATCC  TCCAGATTAT  1380
1381  TATGGATACG  AAGATTATTA  TGATTATTAT  GGTTATGATT  ACCATAACTA  TCGTGGTGGA  1440
1441  TATGAAGATC  CATATTATGG  TTATGAAGAT  TTTCAAGTTG  GAGCTAGAGG  AAGGGGTGGT  1500
1501  AGAGGAGCAA  GGGGTGCTGC  TCCATCCAGA  GGTCGCGGGG  CTGCTCCTCC  CCGTGGTAGA  1560
1561  GCCGGTTATT  CACAGAGAGG  AGGCCCTGGA  TCAGCAAGAG  GCGTTCGTGG  TGCGAGAGGA  1620
1621  GGTGCCCAAC  AACAAAGAGG  CCGCGGGCAG  GGAAAAGGGG  TCGAGGCCGG  TCCTGACCTG  1680
1681  TTACAATGA  1689

▼ ANNOTATION

Disorder
D2P2IUPred2A
Domain
SMARTCDD
Interaction
RAINMIST
Physicochemical
AAindex
Localization
COMPARTMENTS

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Mum-2050Mus musculus100.00.0 882
LLPS-Mup-1555Mustela putorius furo99.770.0 881
LLPS-Aim-0673Ailuropoda melanoleuca99.770.0 881
LLPS-Ova-1186Ovis aries99.770.0 880
LLPS-Mal-2303Mandrillus leucophaeus99.770.0 879
LLPS-Paa-2523Papio anubis99.770.0 880
LLPS-Bot-0701Bos taurus99.770.0 880
LLPS-Dio-1086Dipodomys ordii99.770.0 880
LLPS-Caj-1018Callithrix jacchus99.770.0 881
LLPS-Fud-2086Fukomys damarensis99.770.0 880
LLPS-Cea-2913Cercocebus atys99.770.0 880
LLPS-Aon-1175Aotus nancymaae99.770.0 881
LLPS-Sus-0705Sus scrofa99.770.0 881
LLPS-Chs-1206Chlorocebus sabaeus99.770.0 880
LLPS-Maf-0952Macaca fascicularis99.770.0 880
LLPS-Ict-0599Ictidomys tridecemlineatus99.770.0 880
LLPS-Nol-0782Nomascus leucogenys99.770.0 881
LLPS-Cas-1901Carlito syrichta99.770.0 880
LLPS-Cap-0599Cavia porcellus99.770.0 880
LLPS-Poa-2384Pongo abelii99.770.0 880
LLPS-Caf-0757Canis familiaris99.770.0 880
LLPS-Rhb-1777Rhinopithecus bieti99.770.0 880
LLPS-Orc-0281Oryctolagus cuniculus99.770.0 881
LLPS-Man-2149Macaca nemestrina99.770.0 880
LLPS-Fec-2285Felis catus99.770.0 881
LLPS-Pat-2184Pan troglodytes99.770.0 880
LLPS-Urm-1469Ursus maritimus99.770.0 880
LLPS-Pap-1852Pan paniscus99.770.0 880
LLPS-Hos-2095Homo sapiens99.770.0 881
LLPS-Myl-0557Myotis lucifugus99.530.0 879
LLPS-Gog-0118Gorilla gorilla99.530.0 879
LLPS-Otg-0790Otolemur garnettii99.530.0 880
LLPS-Mam-0933Macaca mulatta99.060.0 873
LLPS-Loa-0312Loxodonta africana99.060.0 869
LLPS-Mea-0457Mesocricetus auratus99.010.0 630
LLPS-Sah-0469Sarcophilus harrisii98.830.0 874
LLPS-Mod-2033Monodelphis domestica98.830.0 873
LLPS-Tag-0235Taeniopygia guttata98.542e-138 418
LLPS-Ora-0343Ornithorhynchus anatinus98.360.0 867
LLPS-Gaga-1705Gallus gallus97.890.0 867
LLPS-Fia-0410Ficedula albicollis97.890.0 866
LLPS-Pes-1541Pelodiscus sinensis97.890.0 867
LLPS-Anp-2038Anas platyrhynchos97.890.0 866
LLPS-Meg-1264Meleagris gallopavo97.890.0 867
LLPS-Anc-1865Anolis carolinensis96.490.0 856
LLPS-Xet-1698Xenopus tropicalis94.610.0 835
LLPS-Lac-3539Latimeria chalumnae94.610.0 840
LLPS-Eqc-3680Equus caballus92.610.0 863
LLPS-Leo-1171Lepisosteus oculatus92.40.0 633
LLPS-Scf-1424Scleropages formosus91.330.0 822
LLPS-Asm-1790Astyanax mexicanus91.10.0 814
LLPS-Icp-3298Ictalurus punctatus90.630.0 811
LLPS-Scm-2169Scophthalmus maximus90.630.0 811
LLPS-Tar-3471Takifugu rubripes90.140.0 800
LLPS-Gaa-1477Gasterosteus aculeatus89.930.0 806
LLPS-Orl-0961Oryzias latipes89.930.0 808
LLPS-Orn-0502Oreochromis niloticus89.930.0 800
LLPS-Ten-2719Tetraodon nigroviridis89.460.0 802
LLPS-Xim-0112Xiphophorus maculatus88.990.0 802
LLPS-Pof-0542Poecilia formosa88.990.0 803
LLPS-Dar-0732Danio rerio88.790.0 795
LLPS-Ere-0182Erinaceus europaeus81.120.0 706
LLPS-Drm-0002Drosophila melanogaster61.032e-173 517
LLPS-Tut-0384Tursiops truncatus54.694e-102 327
LLPS-Cis-1358Ciona savignyi54.36e-163 481
LLPS-Cii-2001Ciona intestinalis53.87e-109 344
LLPS-Cae-1383Caenorhabditis elegans48.512e-125 388