• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Meg-1264
SYNCRIP

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein
Gene Name: SYNCRIP
Ensembl Gene: ENSMGAG00000013690.2
Ensembl Protein: ENSMGAP00000014474.2
Organism: Meleagris gallopavo
Taxa ID: 9103
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Nuclear speckle, Nucleolus, Neuronal granule, P-body, Stress granule, Postsynaptic densityPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     QISGNMATEH  VNGNGTEEPM  DTSAAVTHSE  HFQTLLDAGL  PQKVAEKLDE  IYVAGLVAHS  60
61    DLDERAIEAL  KEFNEEGALA  VLQQFKDSDL  SHVQNKSAFL  CGVMKTYRQR  EKQGTKVADS  120
121   SKGPDEAKIK  ALLERTGYTL  DVTTGQRKYG  GPPPESVYSG  QQPSVGTEIF  VGKIPRDLFE  180
181   DELVPLFEKA  GPIWDLRLMM  DPLTGLNRGY  AFVTFCTKEA  AQEAVKLYNN  HEIRSGKHIG  240
241   VCISVANNRL  FVGSIPKSKT  KEQIVEEFSK  VTEGLTDVIL  YHQPDDKKKN  RGFCFLEYED  300
301   HKTAAQARRR  LMSGKVKVWG  NVVTVEWADP  IEDPDPEVMA  KVKVLFVRNL  ANTVTEEILE  360
361   KAFSQFGKLE  RVKKLKDYAF  IHFDERDGAV  KAMEEMNGKD  LEGENIEIVF  AKPPDQKRKE  420
421   RKAQRQAAKN  QMYDDYYYYG  PPHMPPPTRG  RGRGGRGGYG  YPPDYYGYED  YYDYYGYDYH  480
481   NYRGGYEDPY  YGYEDFQVGA  RGRGGRGARG  AAPSRGRGAA  PPRGRAGYAQ  RGGPGSARGV  540
541   RGARGGAQQQ  RGRGVRGARG  GRGGNVGGKR  KADGYNQPDS  KRRQTNNQNW  GSQPIAQQPL  600
601   QGGDHSGNYG  YKSENQEFYQ  DSFGQQWK  628
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGCTACTG  AACATGTGAA  TGGGAACGGT  ACTGAAGAGC  CAATGGACAC  TTCTGCTGCG  60
61    GTTACCCATT  CTGAGCACTT  CCAGACGTTG  CTTGATGCTG  GTTTACCACA  GAAAGTTGCT  120
121   GAAAAACTAG  ATGAAATTTA  TGTGGCAGGG  CTAGTTGCAC  ATAGTGATCT  AGATGAAAGA  180
181   GCTATTGAAG  CTTTAAAGGA  ATTTAATGAA  GAAGGTGCAT  TGGCAGTGCT  TCAGCAGTTT  240
241   AAAGACAGTG  ATCTCTCACA  TGTTCAGAAC  AAAAGTGCCT  TTTTATGTGG  AGTCATGAAG  300
301   ACATACAGGC  AGAGGGAAAA  ACAGGGGACC  AAGGTGGCAG  ATTCTAGCAA  AGGACCAGAT  360
361   GAGGCAAAAA  TTAAGGCACT  CTTGGAAAGA  ACCGGCTACA  CTCTTGATGT  GACTACAGGA  420
421   CAGAGAAAGT  ACGGTGGGCC  TCCTCCAGAG  TCTGTATATT  CAGGACAGCA  GCCTTCTGTT  480
481   GGAACAGAGA  TATTTGTGGG  TAAGATTCCA  AGAGATTTGT  TTGAAGATGA  ACTCGTTCCG  540
541   TTATTTGAGA  AAGCTGGACC  TATCTGGGAT  CTCCGCTTAA  TGATGGATCC  ATTAACCGGT  600
601   CTAAATAGAG  GATATGCTTT  TGTCACATTT  TGTACTAAAG  AAGCAGCTCA  GGAGGCTGTT  660
661   AAGCTGGTAA  AAGTTCTGTT  TGTCCGCAAT  CTTGCCAACA  CTGTAACAGA  GGAGATACTA  720
721   GAAAAGGCCT  TCAGTCAGTT  TGGAAAGCTA  GAGCGAGTGA  AGAAGCTAAA  AGACTATGCT  780
781   TTCATTCATT  TTGATGAACG  GGATGGTGCT  GTAAAGGCAA  TGGAAGAAAT  GAATGGCAAA  840
841   GATTTAGAGG  GAGAAAACAT  TGAAATTGTT  TTTGCTAAGC  CACCAGATCA  AAAAAGGAAA  900
901   GAACGGAAAG  CTCAGAGACA  AGCGGCTAAA  AATCAGATGT  ATGATGATTA  CTACTATTAC  960
961   GGTCCACCTC  ATATGCCCCC  TCCAACAAGA  GGTCGAGGCC  GAGGAGGCAG  AGGTGGTTAT  1020
1021  GGATATCCCC  CTGACTATTA  CGGATATGAA  GATTATTACG  ATTATTATGG  CTATGACTAC  1080
1081  CATAACTATC  GTGGCGGATA  TGAAGATCCT  TATTATGGTT  ATGAAGATTT  TCAAGTTGGA  1140
1141  GCTAGAGGAA  GGGGTGGTAG  AGGAGCAAGG  GGTGCTGCTC  CATCCAGAGG  TCGCGGGGCT  1200
1201  GCTCCTCCCC  GTGGCAGAGC  CGGTTATGCA  CAGAGAGGTG  GTCCTGGATC  AGCAAGAGGC  1260
1261  GTTCGTGGTG  CGAGAGGAGG  TGCCCAGCAA  CAAAGAGGCC  GCGGGCAGGG  AAAAGGGGTC  1320
1321  GAGGCCGGTC  CTGACCTGTT  ACAATGA  1347

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Tag-0235Taeniopygia guttata100.02e-139 423
LLPS-Xet-1698Xenopus tropicalis100.01e-30 131
LLPS-Gaga-1705Gallus gallus100.00.0 881
LLPS-Fia-0410Ficedula albicollis100.00.0 891
LLPS-Anp-2038Anas platyrhynchos100.00.0 880
LLPS-Lac-3539Latimeria chalumnae100.01e-30 131
LLPS-Sah-0469Sarcophilus harrisii100.01e-30 131
LLPS-Ora-0343Ornithorhynchus anatinus100.01e-30 131
LLPS-Pes-1541Pelodiscus sinensis99.530.0 879
LLPS-Anc-1865Anolis carolinensis98.610.0 880
LLPS-Mod-2033Monodelphis domestica98.590.0 870
LLPS-Nol-0782Nomascus leucogenys98.283e-30 130
LLPS-Mam-0933Macaca mulatta98.282e-30 130
LLPS-Orc-0281Oryctolagus cuniculus98.283e-30 130
LLPS-Otg-0790Otolemur garnettii98.283e-30 130
LLPS-Loa-0312Loxodonta africana98.283e-30 130
LLPS-Fec-2285Felis catus98.283e-30 130
LLPS-Hos-2095Homo sapiens98.283e-30 130
LLPS-Aim-0673Ailuropoda melanoleuca98.283e-30 130
LLPS-Ova-1186Ovis aries98.283e-30 130
LLPS-Myl-0557Myotis lucifugus98.283e-30 130
LLPS-Mal-2303Mandrillus leucophaeus98.283e-30 130
LLPS-Paa-2523Papio anubis98.283e-30 130
LLPS-Bot-0701Bos taurus98.283e-30 130
LLPS-Caj-1018Callithrix jacchus98.283e-30 130
LLPS-Aon-1175Aotus nancymaae98.283e-30 130
LLPS-Mea-0457Mesocricetus auratus98.282e-30 129
LLPS-Ict-0599Ictidomys tridecemlineatus98.130.0 867
LLPS-Cas-1901Carlito syrichta98.130.0 867
LLPS-Cap-0599Cavia porcellus98.130.0 867
LLPS-Poa-2384Pongo abelii98.130.0 867
LLPS-Caf-0757Canis familiaris98.130.0 867
LLPS-Rhb-1777Rhinopithecus bieti98.130.0 867
LLPS-Man-2149Macaca nemestrina98.130.0 867
LLPS-Pat-2184Pan troglodytes98.130.0 867
LLPS-Pap-1852Pan paniscus98.130.0 867
LLPS-Urm-1469Ursus maritimus98.130.0 867
LLPS-Mup-1555Mustela putorius furo98.130.0 867
LLPS-Dio-1086Dipodomys ordii98.130.0 867
LLPS-Fud-2086Fukomys damarensis98.130.0 867
LLPS-Cea-2913Cercocebus atys98.130.0 867
LLPS-Sus-0705Sus scrofa98.130.0 867
LLPS-Chs-1206Chlorocebus sabaeus98.130.0 867
LLPS-Maf-0952Macaca fascicularis98.130.0 867
LLPS-Ran-0023Rattus norvegicus97.890.0 866
LLPS-Gog-0118Gorilla gorilla97.890.0 866
LLPS-Mum-2050Mus musculus97.890.0 866
LLPS-Leo-1171Lepisosteus oculatus93.310.0 638
LLPS-Asm-1790Astyanax mexicanus92.970.0 828
LLPS-Scm-2169Scophthalmus maximus92.510.0 825
LLPS-Icp-3298Ictalurus punctatus92.510.0 824
LLPS-Tar-3471Takifugu rubripes92.58e-1685.1
LLPS-Scf-1424Scleropages formosus92.040.0 830
LLPS-Gaa-1477Gasterosteus aculeatus91.670.0 829
LLPS-Orl-0961Oryzias latipes91.570.0 821
LLPS-Orn-0502Oreochromis niloticus91.330.0 811
LLPS-Ten-2719Tetraodon nigroviridis91.180.0 823
LLPS-Eqc-3680Equus caballus91.090.0 849
LLPS-Xim-0112Xiphophorus maculatus90.870.0 816
LLPS-Pof-0542Poecilia formosa90.720.0 822
LLPS-Dar-0732Danio rerio90.420.0 807
LLPS-Ere-0182Erinaceus europaeus81.350.0 710
LLPS-Drm-0002Drosophila melanogaster60.543e-172 516
LLPS-Cis-1358Ciona savignyi54.752e-163 485
LLPS-Tut-0384Tursiops truncatus54.051e-101 328
LLPS-Cii-2001Ciona intestinalis53.85e-109 346
LLPS-Cae-1383Caenorhabditis elegans47.514e-123 385