• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Nia-0972
GCP4

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Gamma-tubulin complex component 4
Gene Name: GCP4, A4A49_05818
Ensembl Gene: A4A49_05818
Ensembl Protein: OIT08099
Organism: Nicotiana attenuata
Taxa ID: 49451
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Centrosome/Spindle pole bodyPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblOIT08099OIT08099
UniProtA0A1J6JB89, A0A1J6JB89_NICAT
GeneBankMJEQ01037183OIT08099.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MLHEILVALL  GYTGDLIIDA  REHQDSIPLS  PDAPISQEPT  FKLAPDLSFV  QPSERDVIER  60
61    IITLGFYYRE  LERFAAKSRN  LSWIRSANET  PLSRTSQLLK  GKTVKQSVYR  RAIANGIVEV  120
121   LSVYRSAVLH  IEQKLLSDSP  PILATLTQGL  NKFFVLLPPL  FELILEIERD  NIYGGKLLNL  180
181   LHKRCHCGVP  ELQTCIQRLL  WHGHQVMYNQ  LASWVVYGIL  HDPYQEFYIS  SQDDKDSEQE  240
241   SAPHLLEKLT  RLSIADSSLS  DWHLGFHISL  MVSLPDYIEL  LQYKACKQTS  SVIASVVQTD  300
301   SSVTCVSQSS  TSESWVIDSG  ASDHISGKKS  LFTSISYSQS  LPTVTMANGS  QTMATAIVYE  360
361   LSWGYSSNIF  SSCSSTTYSS  SCSSTTYSSS  CSSTTYSSSS  TPYSPVPPPS  PVLPSAAPPL  420
421   LTYHRPSPAS  GPGDSRPASD  SAPFVDLSPL  SQPIALRKGV  RSTLNPNPHF  VSLSYHRLSS  480
481   PHYAFISSLS  TVSIRKSTGE  ALSHPGWRQA  MIEEMSALHA  SGTWELVPLP  SASVRLFLSM  540
541   AAVRHWPLYQ  LDIKNAFLHG  DLEEEVYMEQ  PPGFVAQGES  SGLHFQTKDL  GRLKYFLGIE  600
601   VAQSSSGIVI  SQRKCALDIL  EEIGMMGCRP  VDTPMDPNAK  LLPGQGEPLR  DPMRYRRLVG  660
661   KLNYLTDMLP  EYITMHVAES  ILFAGKAVRV  LRNPSPSFQF  KDGSSHQQIQ  RGSQRTQGYT  720
721   TTISFQNNSL  DNKLIGEDLL  PQAEADKIES  LIQHLKESSE  FHKRSFKNAI  DTIKAVAASH  780
781   LWQLVVVRAD  LNGHLKALKD  YFLLEKGDFF  QSFLEESRQL  MRLPPRQSTA  EADLVVPFQL  840
841   AALKTIGEED  KYFSRVSLRM  PSFGIALKPS  PVDLPKVKVN  KDGDSVGQPD  ASLEVALDGW  900
901   DGISLEYSIN  WPLQLFVTPE  VLSKYQRIFQ  YLLRLKRTQM  ELEKSWAFAM  HQDHFDFAKL  960
961   RNDSRKSFVS  QHRRQRLRPM  WHVREHMAFL  IRNLQFYIQV  DVIESQWNVL  QSHIQNSHDF  1020
1021  TELVGFHQDY  LAALISQSFL  DIGSVSRILD  GIMKLCLQFC  WKIESDESNR  STKELEHIAE  1080
1081  EFNKKSNSLY  TILRSSRLAG  SQRAPFLRQF  LLRLNFNSFF  EAKAKGVLNI  VRPRPPASVL  1140
1141  Q  1141
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGCTGCACG  AAATCTTAGT  GGCGCTGTTG  GGTTACACCG  GAGATCTCAT  CATCGACGCA  60
61    AGAGAACACC  AAGACAGTAT  TCCCTTGTCC  CCAGATGCAC  CCATCTCTCA  GGAACCCACC  120
121   TTTAAGCTTG  CCCCTGATCT  CTCCTTCGTT  CAACCCAGTG  AAAGGGATGT  CATTGAGAGG  180
181   ATTATCACTC  TAGGATTTTA  CTATAGGGAG  CTAGAGCGCT  TTGCAGCCAA  GTCTCGTAAT  240
241   TTAAGTTGGA  TTAGGTCCGC  CAATGAGACA  CCTCTGTCGA  GGACATCCCA  ACTATTGAAA  300
301   GGGAAGACAG  TGAAGCAAAG  TGTGTACAGG  AGGGCCATTG  CGAATGGTAT  TGTTGAGGTG  360
361   TTATCAGTTT  ATAGGTCTGC  TGTTCTACAT  ATTGAGCAAA  AGTTACTGTC  TGATTCACCA  420
421   CCTATCTTGG  CAACGCTTAC  TCAAGGCCTC  AATAAGTTCT  TTGTTCTTTT  GCCTCCTCTT  480
481   TTTGAGCTGA  TTCTAGAGAT  TGAACGTGAT  AACATTTATG  GAGGAAAACT  TCTCAACCTT  540
541   TTACACAAAC  GCTGCCACTG  TGGGGTTCCG  GAACTACAGA  CATGCATTCA  GAGGCTCCTC  600
601   TGGCATGGGC  ATCAGGTCAT  GTATAATCAG  CTTGCTTCTT  GGGTGGTTTA  TGGAATTCTT  660
661   CATGATCCAT  ATCAAGAATT  CTACATCAGC  AGTCAGGACG  ACAAAGACTC  TGAACAGGAA  720
721   TCAGCTCCAC  ATTTGCTTGA  GAAACTGACA  CGCTTGTCAA  TCGCTGATTC  ATCTTTAAGT  780
781   GATTGGCACT  TGGGCTTCCA  TATTTCTTTG  ATGGTTTCTT  TACCGGATTA  TATTGAGTTA  840
841   CTTCAGTACA  AAGCATGTAA  ACAGACATCT  TCAGTGATAG  CTTCCGTTGT  TCAAACAGAT  900
901   AGTAGCGTGA  CTTGTGTCTC  CCAATCTTCA  ACCTCTGAGT  CTTGGGTCAT  TGATTCAGGT  960
961   GCATCTGATC  ATATTTCTGG  TAAAAAATCT  CTTTTCACTA  GTATTTCGTA  TTCTCAATCT  1020
1021  CTTCCAACAG  TCACAATGGC  CAATGGGTCT  CAAACCATGG  CAACTGCAAT  AGTTTATGAA  1080
1081  CTCTCATGGG  GTTATTCATC  AAACATCTTC  TCCAGTTGCA  GCTCCACCAC  CTACAGCTCC  1140
1141  AGTTGCAGCT  CCACCACCTA  CAGCTCTAGT  TGCAGCTCTA  CTACCTATAG  CTCCAGTTCC  1200
1201  ACCCCTTATA  GCCCAGTTCC  ACCACCTAGT  CCAGTTCTAC  CTTCTGCAGC  TCCACCACTC  1260
1261  TTGACTTACC  ATCGTCCAAG  TCCAGCATCG  GGCCCAGGTG  ATTCACGTCC  TGCATCAGAT  1320
1321  TCTGCACCTT  TTGTGGACTT  GTCTCCTCTC  AGTCAACCAA  TTGCACTCCG  CAAAGGTGTA  1380
1381  CGATCCACAC  TTAATCCTAA  TCCCCATTTT  GTCAGTTTAA  GTTATCATCG  TCTGTCATCA  1440
1441  CCTCATTATG  CTTTTATATC  ATCTTTGTCC  ACTGTTTCTA  TCCGTAAGTC  TACAGGTGAG  1500
1501  GCACTGTCTC  ATCCAGGATG  GCGACAAGCT  ATGATTGAGG  AGATGTCTGC  TTTACATGCG  1560
1561  AGTGGCACTT  GGGAGCTTGT  TCCTCTTCCT  TCAGCATCTG  TTCGTCTCTT  TTTGTCCATG  1620
1621  GCTGCTGTAC  GTCATTGGCC  TCTTTATCAG  TTAGACATTA  AGAATGCTTT  TCTCCACGGT  1680
1681  GATCTTGAGG  AAGAAGTTTA  TATGGAGCAA  CCACCTGGTT  TTGTTGCTCA  GGGGGAGTCT  1740
1741  AGTGGTCTTC  ACTTCCAGAC  TAAGGATCTG  GGCAGATTGA  AGTATTTTCT  AGGTATTGAG  1800
1801  GTCGCTCAGT  CTAGCTCAGG  CATTGTTATT  TCACAGCGGA  AGTGTGCCTT  AGACATTCTT  1860
1861  GAGGAGATTG  GAATGATGGG  CTGCAGACCT  GTTGACACTC  CTATGGATCC  GAATGCTAAG  1920
1921  CTTCTGCCTG  GACAGGGGGA  GCCTCTTAGA  GATCCTATGA  GATATAGGAG  GTTGGTTGGC  1980
1981  AAATTGAATT  ACCTCACAGA  TATGCTGCCA  GAGTATATTA  CCATGCATGT  TGCAGAATCA  2040
2041  ATTCTTTTTG  CAGGAAAAGC  TGTTAGGGTT  CTTCGCAATC  CAAGTCCCAG  TTTCCAATTT  2100
2101  AAGGATGGTT  CATCTCATCA  GCAAATACAA  AGAGGATCTC  AAAGGACCCA  AGGATATACA  2160
2161  ACGACGATAT  CTTTCCAGAA  TAACTCCTTG  GATAATAAGT  TAATTGGAGA  AGATTTACTC  2220
2221  CCACAGGCAG  AGGCTGACAA  GATTGAATCT  CTGATTCAAC  ACTTAAAGGA  GTCGTCTGAA  2280
2281  TTCCACAAAA  GATCATTCAA  GAATGCCATT  GATACAATAA  AAGCAGTAGC  AGCTAGTCAT  2340
2341  CTGTGGCAGC  TTGTTGTTGT  GCGTGCCGAC  TTAAATGGGC  ACTTGAAGGC  TCTTAAAGAC  2400
2401  TATTTTCTTT  TAGAAAAAGG  TGATTTCTTC  CAGAGTTTCC  TCGAGGAGAG  TCGCCAGCTG  2460
2461  ATGCGTTTAC  CACCTCGCCA  ATCTACTGCA  GAAGCGGATC  TTGTGGTCCC  ATTTCAACTA  2520
2521  GCTGCTTTAA  AGACTATTGG  TGAAGAGGAC  AAGTACTTTT  CAAGGGTGTC  TTTGCGGATG  2580
2581  CCATCATTTG  GAATTGCTTT  AAAACCCTCA  CCAGTTGATC  TGCCCAAGGT  AAAAGTGAAT  2640
2641  AAAGATGGAG  ACTCAGTAGG  GCAACCAGAT  GCATCTTTGG  AGGTGGCCCT  TGATGGATGG  2700
2701  GATGGCATTT  CCCTTGAATA  TTCTATTAAC  TGGCCATTGC  AGCTGTTTGT  TACGCCGGAA  2760
2761  GTGCTATCCA  AGTATCAAAG  GATATTCCAG  TATCTGCTCC  GTCTTAAGAG  GACGCAAATG  2820
2821  GAGTTGGAAA  AATCATGGGC  TTTTGCTATG  CATCAAGATC  ATTTTGACTT  TGCTAAACTT  2880
2881  CGAAATGACT  CTAGAAAGTC  ATTTGTCTCT  CAGCATCGAA  GGCAACGCCT  TAGACCAATG  2940
2941  TGGCATGTTA  GAGAGCACAT  GGCCTTCTTG  ATCAGAAATC  TTCAATTCTA  TATTCAGGTG  3000
3001  GATGTGATAG  AATCTCAATG  GAACGTTTTG  CAATCTCATA  TTCAGAATTC  TCATGATTTC  3060
3061  ACGGAACTTG  TGGGCTTCCA  TCAAGATTAC  TTGGCTGCAC  TGATTTCACA  ATCTTTCTTG  3120
3121  GACATCGGTT  CTGTCTCAAG  AATTCTGGAT  GGAATAATGA  AACTATGCTT  GCAGTTCTGT  3180
3181  TGGAAGATCG  AAAGCGACGA  AAGCAATAGA  AGTACTAAGG  AGCTGGAGCA  CATAGCTGAG  3240
3241  GAGTTCAACA  AGAAATCAAA  CTCCCTATAC  ACAATACTAC  GTAGTAGCAG  GCTTGCTGGG  3300
3301  AGCCAGAGAG  CCCCGTTCCT  TAGGCAATTT  CTTTTACGAC  TCAATTTCAA  TTCCTTCTTT  3360
3361  GAGGCAAAAG  CAAAAGGGGT  GCTCAATATT  GTCCGACCTC  GGCCACCCGC  ATCTGTTCTG  3420
3421  CAGTGA  3426

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Sot-0612Solanum tuberosum93.770.0 590
LLPS-Sol-0606Solanum lycopersicum93.260.0 880
LLPS-Thc-0963Theobroma cacao78.150.0 720
LLPS-Mae-1591Manihot esculenta77.10.0 719
LLPS-Pot-1980Populus trichocarpa77.050.0 716
LLPS-Viv-2162Vitis vinifera76.910.0 711
LLPS-Prp-1929Prunus persica76.470.0 707
LLPS-Coc-0992Corchorus capsularis76.420.0 698
LLPS-Dac-1055Daucus carota75.930.0 709
LLPS-Glm-0439Glycine max75.790.0 692
LLPS-Via-1384Vigna angularis75.00.0 629
LLPS-Gor-2487Gossypium raimondii74.950.0 689
LLPS-Phv-0676Phaseolus vulgaris74.210.0 677
LLPS-Met-1250Medicago truncatula73.360.0 657
LLPS-Cus-1486Cucumis sativus72.210.0 629
LLPS-Art-1056Arabidopsis thaliana71.910.0 669
LLPS-Arl-1202Arabidopsis lyrata71.70.0 668
LLPS-Mua-0902Musa acuminata71.490.0 670
LLPS-Brn-0492Brassica napus71.490.0 675
LLPS-Brr-0619Brassica rapa71.490.0 673
LLPS-Bro-1151Brassica oleracea71.060.0 671
LLPS-Vir-1083Vigna radiata70.852e-102 346
LLPS-Hea-1240Helianthus annuus70.740.0 624
LLPS-Amt-1264Amborella trichopoda70.080.0 639
LLPS-Brd-0133Brachypodium distachyon69.390.0 629
LLPS-Ori-0020Oryza indica69.120.0 625
LLPS-Tra-2516Triticum aestivum68.970.0 631
LLPS-Hov-1220Hordeum vulgare68.970.0 631
LLPS-Sei-1038Setaria italica68.970.0 628
LLPS-Zem-0633Zea mays68.920.0 624
LLPS-Org-0632Oryza glaberrima68.890.0 625
LLPS-Orbr-0755Oryza brachyantha68.880.0 637
LLPS-Ors-0104Oryza sativa68.680.0 623
LLPS-Sob-0065Sorghum bicolor68.050.0 627
LLPS-Lep-1252Leersia perrieri64.080.0 565
LLPS-Orp-0582Oryza punctata63.494e-178 547
LLPS-Orgl-1364Oryza glumaepatula63.260.0 556
LLPS-Orni-0262Oryza nivara63.260.0 556
LLPS-Orb-0608Oryza barthii63.260.0 557
LLPS-Orr-0157Oryza rufipogon63.260.0 556
LLPS-Orm-1440Oryza meridionalis62.841e-179 553
LLPS-Php-1286Physcomitrella patens62.02e-169 525
LLPS-Sem-1241Selaginella moellendorffii59.585e-161 503
LLPS-Anc-2077Anolis carolinensis34.154e-1378.2
LLPS-Pes-0359Pelodiscus sinensis32.527e-1273.9
LLPS-Anp-0626Anas platyrhynchos32.521e-1173.2
LLPS-Leo-2388Lepisosteus oculatus31.812e-56 213
LLPS-Scm-1978Scophthalmus maximus31.722e-55 210
LLPS-Orn-0012Oreochromis niloticus31.496e-55 208
LLPS-Dar-0541Danio rerio31.353e-55 209
LLPS-Scf-3663Scleropages formosus31.262e-55 210
LLPS-Tar-2584Takifugu rubripes31.263e-55 209
LLPS-Fia-0934Ficedula albicollis31.216e-53 202
LLPS-Meg-0738Meleagris gallopavo31.214e-53 203
LLPS-Pof-2013Poecilia formosa31.193e-54 206
LLPS-Icp-0646Ictalurus punctatus31.126e-54 205
LLPS-Ten-1157Tetraodon nigroviridis31.117e-54 205
LLPS-Asm-0648Astyanax mexicanus31.075e-54 205
LLPS-Otg-0156Otolemur garnettii31.031e-52 202
LLPS-Tag-0450Taeniopygia guttata30.982e-53 204
LLPS-Gaga-0793Gallus gallus30.985e-53 202
LLPS-Ran-1235Rattus norvegicus30.824e-52 200
LLPS-Paa-3256Papio anubis30.82e-52 201
LLPS-Mal-1936Mandrillus leucophaeus30.82e-52 201
LLPS-Caj-0684Callithrix jacchus30.82e-52 201
LLPS-Gog-0849Gorilla gorilla30.84e-52 200
LLPS-Sus-1487Sus scrofa30.86e-52 199
LLPS-Aon-3297Aotus nancymaae30.85e-52 200
LLPS-Cea-3254Cercocebus atys30.82e-52 201
LLPS-Maf-0543Macaca fascicularis30.82e-52 201
LLPS-Mea-3102Mesocricetus auratus30.85e-52 200
LLPS-Nol-2176Nomascus leucogenys30.83e-52 201
LLPS-Mam-3674Macaca mulatta30.82e-52 201
LLPS-Rhb-0833Rhinopithecus bieti30.82e-52 201
LLPS-Man-2354Macaca nemestrina30.82e-52 201
LLPS-Hos-0470Homo sapiens30.82e-52 201
LLPS-Pap-2134Pan paniscus30.82e-52 201
LLPS-Xim-0494Xiphophorus maculatus30.733e-53 203
LLPS-Aim-3361Ailuropoda melanoleuca30.575e-52 199
LLPS-Bot-1242Bos taurus30.576e-52 199
LLPS-Dio-0561Dipodomys ordii30.572e-52 201
LLPS-Sah-2607Sarcophilus harrisii30.572e-52 201
LLPS-Chs-0699Chlorocebus sabaeus30.576e-52 199
LLPS-Cas-0021Carlito syrichta30.575e-52 200
LLPS-Eqc-1307Equus caballus30.577e-52 199
LLPS-Mod-1575Monodelphis domestica30.576e-52 199
LLPS-Fec-0948Felis catus30.575e-52 200
LLPS-Orl-0742Oryzias latipes30.548e-53 202
LLPS-Myl-1949Myotis lucifugus30.523e-52 201
LLPS-Poa-1679Pongo abelii30.522e-52 201
LLPS-Mup-1865Mustela putorius furo30.341e-51 199
LLPS-Ova-2292Ovis aries30.348e-51 196
LLPS-Gaa-3005Gasterosteus aculeatus30.341e-52 201
LLPS-Mum-2551Mus musculus30.346e-52 199
LLPS-Ict-0457Ictidomys tridecemlineatus30.342e-52 201
LLPS-Xet-1395Xenopus tropicalis30.343e-53 203
LLPS-Loa-1847Loxodonta africana30.342e-51 197
LLPS-Pat-1056Pan troglodytes30.344e-52 200
LLPS-Caf-0709Canis familiaris30.321e-53 204
LLPS-Orc-1716Oryctolagus cuniculus30.111e-52 202
LLPS-Chr-0197Chlamydomonas reinhardtii30.086e-24 113
LLPS-Cap-1185Cavia porcellus30.074e-53 203
LLPS-Fud-0287Fukomys damarensis29.845e-53 202
LLPS-Lac-2295Latimeria chalumnae29.841e-48 189
LLPS-Ora-0944Ornithorhynchus anatinus29.269e-1686.7
LLPS-Tut-0069Tursiops truncatus29.29e-46 180
LLPS-Cii-0374Ciona intestinalis28.829e-41 165
LLPS-Cis-1008Ciona savignyi28.549e-40 161
LLPS-Osl-0644Ostreococcus lucimarinus27.938e-45 177
LLPS-Gas-0384Galdieria sulphuraria27.718e-1686.7
LLPS-Mel-0513Melampsora laricipopulina27.562e-1791.7
LLPS-Usm-0595Ustilago maydis26.385e-1687.8
LLPS-Spr-0537Sporisorium reilianum25.894e-1791.7
LLPS-Abg-0604Absidia glauca25.826e-1894.0
LLPS-Asc-0474Aspergillus clavatus25.428e-1790.5
LLPS-Scc-0651Schizosaccharomyces cryophilus25.173e-1791.7
LLPS-Pyt-0612Pyrenophora teres24.751e-1793.2
LLPS-Cog-0675Colletotrichum gloeosporioides24.487e-1687.4
LLPS-Coo-0381Colletotrichum orbiculare24.112e-1689.4
LLPS-Urm-0061Ursus maritimus24.063e-1688.6
LLPS-Drm-0393Drosophila melanogaster24.047e-21 102
LLPS-Lem-0041Leptosphaeria maculans23.567e-1790.5
LLPS-Pytr-0034Pyrenophora triticirepentis23.431e-1689.7
LLPS-Zyt-0134Zymoseptoria tritici23.48e-1893.6
LLPS-Dos-0529Dothistroma septosporum23.233e-1791.7
LLPS-Tum-0397Tuber melanosporum22.83e-1894.7
LLPS-Blg-0418Blumeria graminis22.783e-1791.7