LLPS-Dar-0085
nup50

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Nucleoporin 50
Gene Name: nup50
Ensembl Gene: ENSDARG00000017454.11
Ensembl Protein: ENSDARP00000137742.1
Organism: Danio rerio
Taxa ID: 7955
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Nuclear pore complex, Nucleolus, Stress granulePredicted from orthologs(View)

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MAKRIAEKEL  TDRNWDQEDD  GEEAGTFSIA  SDDVMKNRAI  KKAKRRNVAE  GESGGAFKAF  60
61    KGFSLAPATA  TASFSGFGNG  AGFKPMASLT  NGSVASVAPS  FTGFNVPASA  KTNSGPLTFS  120
121   SSTPSKPTDG  EVTSNGSAPS  SKEYNRQLTA  LNCSVRDWIT  KHVNDNPLCD  LNPIFRDYER  180
181   HLASIERKYG  SGAADETPGK  PLASCAAAPQ  TVSLKNKDDK  PPAEKPAAPP  GVSFNFGKKV  240
241   DSSVLGALSS  GGAPSFSFSS  SSSSSAVFGS  AVSSVSSPVV  NSDSNSQTAD  ENGEDSEEPP  300
301   VPVVKEIKEK  DAFYSKKCKL  FYKKDGEFKE  KGVGTLHLKM  TTESKLQLLV  RADTNLGNIL  360
361   LNIMVPSSMP  CSRTGKNNVM  VVCVPNPPVD  DKNPSVPVPV  LIRVKTAEDA  DQLHRVLQEK  420
421   KA  422
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGCCAAGC  GGATTGCGGA  AAAAGAGTTG  ACCGACAGGA  ACTGGGATCA  GGAGGATGAT  60
61    GGAGAAGAGG  CAGGAACGTT  TTCGATTGCG  AGTGATGATG  TGATGAAAAA  CCGCGCCATC  120
121   AAGAAAGCCA  AGCGGCGTAA  CGTTGCAGAG  GGAGAGAGTG  GAGGGGCTTT  CAAAGCGTTT  180
181   AAGGGGTTTT  CTCTGGCTCC  AGCCACAGCG  ACGGCTTCGT  TCTCTGGCTT  CGGCAATGGT  240
241   GCTGGCTTCA  AACCCATGGC  CAGCCTGACC  AATGGCAGCG  TGGCATCAGT  GGCTCCGTCA  300
301   TTCACAGGTT  TCAACGTTCC  TGCATCTGCT  AAAACTAACA  GTGGTCCTTT  AACATTCAGC  360
361   AGCTCCACCC  CCTCCAAGCC  CACAGACGGT  GAGGTCACCT  CCAACGGCTC  CGCCCCCAGC  420
421   AGTAAAGAGT  ACAACCGGCA  GCTCACAGCG  CTGAACTGCT  CGGTGCGCGA  CTGGATCACC  480
481   AAACACGTCA  ACGACAACCC  GCTGTGCGAC  CTCAACCCCA  TCTTCCGGGA  CTACGAGCGT  540
541   CACCTGGCCA  GCATCGAGAG  GAAATACGGC  AGCGGGGCGG  CAGACGAAAC  ACCAGGGAAG  600
601   CCGCTGGCAT  CCTGTGCTGC  GGCTCCGCAG  ACCGTCTCCC  TCAAAAACAA  GGACGACAAG  660
661   CCTCCAGCAG  AAAAGCCAGC  AGCTCCTCCG  GGAGTCTCCT  TTAATTTCGG  AAAGAAGGTG  720
721   GACAGCTCGG  TGCTCGGGGC  GCTGTCGTCA  GGTGGAGCGC  CGTCGTTTTC  CTTCTCCTCT  780
781   TCGTCTTCTT  CTTCTGCTGT  GTTTGGCTCA  GCCGTCAGTA  GCGTCAGTAG  TCCTGTGGTC  840
841   AACTCGGACA  GCAACAGCCA  GACTGCAGAT  GAGAACGGGG  AGGACTCTGA  GGAGCCGCCG  900
901   GTGCCTGTGG  TGAAGGAGAT  CAAGGAGAAA  GACGCTTTCT  ACTCCAAAAA  GTGTAAGCTG  960
961   TTCTACAAGA  AAGACGGCGA  GTTTAAGGAG  AAGGGCGTCG  GGACGCTGCA  TCTGAAGATG  1020
1021  ACCACCGAGA  GCAAACTCCA  GCTGCTAGTG  CGCGCAGACA  CCAACCTGGG  GAACATCCTG  1080
1081  CTGAACATCA  TGGTGCCCTC  CTCCATGCCC  TGCTCACGAA  CTGGCAAAAA  CAATGTGATG  1140
1141  GTGGTGTGTG  TGCCAAACCC  TCCCGTGGAC  GACAAGAACC  CCAGCGTGCC  CGTCCCAGTG  1200
1201  CTGATCCGCG  TCAAAACAGC  CGAGGACGCA  GACCAACTGC  ACCGAGTCCT  CCAGGAGAAG  1260
1261  AAAGCCTAA  1269

▼ ANNOTATION

Disorder
D2P2IUPred2A
Interaction
RAINMIST
Physicochemical
AAindex

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Asm-0398Astyanax mexicanus86.331e-54 195
LLPS-Icp-0197Ictalurus punctatus85.513e-53 190
LLPS-Pof-2216Poecilia formosa82.352e-41 157
LLPS-Xim-1373Xiphophorus maculatus81.368e-40 153
LLPS-Mup-1332Mustela putorius furo79.371e-22 103
LLPS-Gaa-1341Gasterosteus aculeatus78.992e-30 125
LLPS-Ova-2994Ovis aries78.056e-41 156
LLPS-Anc-2542Anolis carolinensis77.277e-1786.7
LLPS-Scm-0894Scophthalmus maximus77.046e-46 170
LLPS-Lac-3413Latimeria chalumnae76.563e-40 154
LLPS-Cap-1688Cavia porcellus76.566e-46 170
LLPS-Dio-0164Dipodomys ordii76.568e-44 164
LLPS-Anp-2689Anas platyrhynchos76.472e-39 152
LLPS-Otg-3939Otolemur garnettii76.427e-42 159
LLPS-Fia-1775Ficedula albicollis76.422e-41 157
LLPS-Orl-2044Oryzias latipes76.126e-45 167
LLPS-Tar-1609Takifugu rubripes75.813e-41 156
LLPS-Fec-0725Felis catus75.05e-44 165
LLPS-Eqc-0022Equus caballus75.04e-43 162
LLPS-Fud-1259Fukomys damarensis75.02e-43 163
LLPS-Gaga-3117Gallus gallus74.88e-41 156
LLPS-Sah-1382Sarcophilus harrisii74.81e-42 160
LLPS-Orc-0026Oryctolagus cuniculus74.221e-44 167
LLPS-Scf-2765Scleropages formosus74.13e-48 177
LLPS-Gog-3119Gorilla gorilla74.044e-33 130
LLPS-Pes-0901Pelodiscus sinensis73.986e-40 154
LLPS-Ten-1252Tetraodon nigroviridis73.916e-35 139
LLPS-Urm-3068Ursus maritimus73.448e-42 159
LLPS-Poa-0750Pongo abelii73.441e-43 164
LLPS-Cas-0521Carlito syrichta73.444e-44 166
LLPS-Bot-1543Bos taurus73.443e-41 157
LLPS-Ere-0376Erinaceus europaeus73.441e-41 159
LLPS-Aim-0767Ailuropoda melanoleuca73.441e-42 161
LLPS-Mod-1881Monodelphis domestica73.174e-41 157
LLPS-Aon-2116Aotus nancymaae73.089e-44 164
LLPS-Orn-2584Oreochromis niloticus72.991e-39 153
LLPS-Pat-4197Pan troglodytes72.663e-43 163
LLPS-Pap-3258Pan paniscus72.663e-43 163
LLPS-Hos-0714Homo sapiens72.663e-43 163
LLPS-Man-3023Macaca nemestrina72.665e-43 162
LLPS-Rhb-0355Rhinopithecus bieti72.666e-43 162
LLPS-Caf-2288Canis familiaris72.665e-41 157
LLPS-Mam-2710Macaca mulatta72.664e-43 162
LLPS-Nol-1070Nomascus leucogenys72.663e-43 163
LLPS-Maf-0386Macaca fascicularis72.665e-43 162
LLPS-Ora-0775Ornithorhynchus anatinus72.664e-42 160
LLPS-Chs-1266Chlorocebus sabaeus72.665e-43 162
LLPS-Cea-3395Cercocebus atys72.665e-43 162
LLPS-Sus-2928Sus scrofa72.661e-43 164
LLPS-Caj-0833Callithrix jacchus72.661e-42 161
LLPS-Mal-0109Mandrillus leucophaeus72.665e-43 162
LLPS-Paa-0227Papio anubis72.664e-43 162
LLPS-Ran-0540Rattus norvegicus71.973e-43 163
LLPS-Mum-0590Mus musculus71.885e-42 159
LLPS-Loa-0030Loxodonta africana70.541e-42 161
LLPS-Meg-1995Meleagris gallopavo70.212e-41 158
LLPS-Myl-1336Myotis lucifugus65.625e-41 157
LLPS-Mea-1819Mesocricetus auratus63.648e-33 132
LLPS-Leo-1208Lepisosteus oculatus54.743e-99 311
LLPS-Cii-0484Ciona intestinalis54.269e-1992.0
LLPS-Tag-0661Taeniopygia guttata53.687e-95 300
LLPS-Cis-1105Ciona savignyi53.491e-1685.5
LLPS-Ict-0932Ictidomys tridecemlineatus51.291e-44 166
LLPS-Drm-1884Drosophila melanogaster45.973e-22 103