DrLLPS - Data resource of LLPS

LLPS-Viv-0009
VIT_11s0037g00080

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status:	Unreviewed
Protein Name:	40S ribosomal protein S12
Gene Name:	VIT_11s0037g00080
Ensembl Gene:	VIT_11s0037g00080
Ensembl Protein:	VIT_11s0037g00080.t01
Organism:	Vitis vinifera
Taxa ID:	29760
LLPS Type:	Others

▼ PROPERTY

——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:

Condensate	Evidence	Orthologs
Nucleolus, Stress granule	Predicted from orthologs	(View)

Organism	DrLLPS ID	UniProt ID	LLPS type	Condensate	Identity	E-value	Score
Arabidopsis thaliana	LLPS-Art-0233	Q9SKZ3	Client	Nucleolus	75.00	7e-63	196
Saccharomyces cerevisiae	LLPS-Sac-0046	P48589	Client	Stress granule	51.75	2e-23	94.7

▼ CROSS REFERENCE

Database	Nucleotide ID	Protein ID
Ensembl	VIT_11s0037g00080.t01	VIT_11s0037g00080.t01
UniProt		F6HYI6, F6HYI6_VITVI
GeneBank	FN596499	CCB59750.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1 MGDEAVVVEA AAAPPLGETL DLMTALQLVL RKSLAHGGLV RGLHEGAKVI EKHAAQLCVL 60 61 AEDCNQPDYI KLVKALCADH NVSLISVPSA KTLGEWAGLC KIDSEGKARK VVGCSCVVVK 120 121 DYGEETPGLH IVQEHVKSN 139

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS ID	Organism	Identity	E-value	Score
LLPS-Nia-0217	Nicotiana attenuata	88.89	2e-67	207
LLPS-Dac-1175	Daucus carota	88.71	5e-75	226
LLPS-Sot-1031	Solanum tuberosum	88.71	4e-67	206
LLPS-Hea-0914	Helianthus annuus	88.1	1e-75	228
LLPS-Sol-0607	Solanum lycopersicum	88.1	1e-66	205
LLPS-Prp-1419	Prunus persica	87.9	3e-73	223
LLPS-Pot-2236	Populus trichocarpa	87.3	1e-77	233
LLPS-Mua-1513	Musa acuminata	86.67	2e-71	217
LLPS-Mae-0483	Manihot esculenta	86.4	8e-74	223
LLPS-Cus-0863	Cucumis sativus	84.68	3e-71	217
LLPS-Tru-0730	Triticum urartu	83.06	2e-69	212
LLPS-Glm-2463	Glycine max	82.93	3e-69	212
LLPS-Amt-1538	Amborella trichopoda	82.64	3e-68	223
LLPS-Tra-0131	Triticum aestivum	82.54	5e-70	214
LLPS-Sei-1796	Setaria italica	82.54	1e-70	215
LLPS-Sob-1571	Sorghum bicolor	82.54	7e-70	213
LLPS-Via-1166	Vigna angularis	82.11	2e-69	213
LLPS-Orni-0304	Oryza nivara	81.97	5e-68	209
LLPS-Ori-0125	Oryza indica	81.75	9e-70	213
LLPS-Orb-1031	Oryza barthii	81.75	9e-70	213
LLPS-Hov-1410	Hordeum vulgare	81.75	7e-70	215
LLPS-Orgl-0273	Oryza glumaepatula	81.75	9e-70	213
LLPS-Orbr-1529	Oryza brachyantha	81.75	7e-70	213
LLPS-Orp-0756	Oryza punctata	81.75	9e-70	213
LLPS-Ors-0156	Oryza sativa	81.75	9e-70	213
LLPS-Zem-0634	Zea mays	81.75	6e-70	213
LLPS-Org-0801	Oryza glaberrima	81.75	9e-70	213
LLPS-Orr-0256	Oryza rufipogon	81.75	9e-70	213
LLPS-Vir-0529	Vigna radiata	81.67	7e-68	207
LLPS-Phv-1116	Phaseolus vulgaris	81.3	2e-68	210
LLPS-Brd-2151	Brachypodium distachyon	80.95	7e-69	211
LLPS-Orm-1781	Oryza meridionalis	80.95	3e-69	212
LLPS-Php-2532	Physcomitrella patens	80.65	8e-68	208
LLPS-Sem-1721	Selaginella moellendorffii	80.16	3e-69	212
LLPS-Lep-0457	Leersia perrieri	80.16	4e-68	209
LLPS-Met-0557	Medicago truncatula	79.67	1e-66	205
LLPS-Brr-0758	Brassica rapa	79.17	5e-67	206
LLPS-Brn-0750	Brassica napus	78.69	2e-67	207
LLPS-Bro-0521	Brassica oleracea	78.69	2e-67	207
LLPS-Arl-0321	Arabidopsis lyrata	78.33	2e-65	202
LLPS-Thc-1154	Theobroma cacao	76.67	7e-64	198
LLPS-Gor-0645	Gossypium raimondii	76.67	6e-62	193
LLPS-Art-1807	Arabidopsis thaliana	76.23	3e-62	194
LLPS-Coc-0001	Corchorus capsularis	73.11	9e-60	187
LLPS-Chr-0324	Chlamydomonas reinhardtii	67.48	4e-57	181
LLPS-Osl-0315	Ostreococcus lucimarinus	62.18	4e-47	155
LLPS-Xet-2774	Xenopus tropicalis	61.68	3e-40	137
LLPS-Bot-1605	Bos taurus	61.54	9e-38	134
LLPS-Orn-2117	Oreochromis niloticus	60.92	1e-32	117
LLPS-Scm-1320	Scophthalmus maximus	60.58	1e-36	130
LLPS-Sah-3286	Sarcophilus harrisii	60.0	2e-34	123
LLPS-Paa-0685	Papio anubis	59.29	7e-42	142
LLPS-Icp-0711	Ictalurus punctatus	59.22	6e-36	127
LLPS-Ere-0004	Erinaceus europaeus	58.68	2e-45	150
LLPS-Dio-1620	Dipodomys ordii	58.68	9e-46	152
LLPS-Anc-1063	Anolis carolinensis	58.68	4e-45	150
LLPS-Chs-0674	Chlorocebus sabaeus	58.47	9e-45	149
LLPS-Fia-0660	Ficedula albicollis	58.47	4e-45	150
LLPS-Mum-3519	Mus musculus	57.98	1e-44	149
LLPS-Fud-0436	Fukomys damarensis	57.85	5e-45	150
LLPS-Gog-1036	Gorilla gorilla	57.85	6e-45	149
LLPS-Sus-0371	Sus scrofa	57.85	5e-45	150
LLPS-Cea-0663	Cercocebus atys	57.85	5e-45	150
LLPS-Aon-0044	Aotus nancymaae	57.85	5e-45	150
LLPS-Ora-0068	Ornithorhynchus anatinus	57.85	5e-45	150
LLPS-Maf-1383	Macaca fascicularis	57.85	5e-45	150
LLPS-Mea-0235	Mesocricetus auratus	57.85	5e-45	150
LLPS-Ova-0221	Ovis aries	57.85	5e-45	150
LLPS-Myl-0096	Myotis lucifugus	57.85	5e-45	150
LLPS-Mup-2835	Mustela putorius furo	57.85	5e-45	150
LLPS-Aim-0075	Ailuropoda melanoleuca	57.85	5e-45	150
LLPS-Mal-0844	Mandrillus leucophaeus	57.85	2e-44	148
LLPS-Ran-1571	Rattus norvegicus	57.85	5e-45	150
LLPS-Tut-0008	Tursiops truncatus	57.85	5e-45	150
LLPS-Rhb-1040	Rhinopithecus bieti	57.85	5e-45	150
LLPS-Orc-0309	Oryctolagus cuniculus	57.85	5e-45	150
LLPS-Pes-0299	Pelodiscus sinensis	57.85	4e-45	150
LLPS-Otg-1498	Otolemur garnettii	57.85	5e-45	150
LLPS-Loa-0689	Loxodonta africana	57.85	5e-45	150
LLPS-Anp-0542	Anas platyrhynchos	57.85	5e-45	150
LLPS-Man-0448	Macaca nemestrina	57.85	5e-45	150
LLPS-Fec-0346	Felis catus	57.85	5e-45	150
LLPS-Mod-1271	Monodelphis domestica	57.85	5e-45	150
LLPS-Meg-0461	Meleagris gallopavo	57.85	7e-45	149
LLPS-Hos-0064	Homo sapiens	57.85	5e-45	150
LLPS-Pap-0623	Pan paniscus	57.85	5e-45	150
LLPS-Pat-0102	Pan troglodytes	57.85	5e-45	150
LLPS-Tag-0579	Taeniopygia guttata	57.85	2e-45	150
LLPS-Nol-0502	Nomascus leucogenys	57.85	5e-45	150
LLPS-Cas-0387	Carlito syrichta	57.85	5e-45	150
LLPS-Gaga-0845	Gallus gallus	57.85	5e-45	150
LLPS-Mam-0291	Macaca mulatta	57.85	5e-45	150
LLPS-Cap-0446	Cavia porcellus	57.85	5e-45	150
LLPS-Caf-3089	Canis familiaris	57.85	5e-45	150
LLPS-Poa-0773	Pongo abelii	57.85	5e-45	150
LLPS-Pof-0612	Poecilia formosa	57.38	2e-44	149
LLPS-Caj-1188	Callithrix jacchus	56.91	1e-43	146
LLPS-Spr-0283	Sporisorium reilianum	56.8	3e-45	150
LLPS-Usm-0146	Ustilago maydis	56.8	3e-45	150
LLPS-Miv-0022	Microbotryum violaceum	56.67	1e-42	144
LLPS-Asm-0935	Astyanax mexicanus	56.56	2e-44	148
LLPS-Leo-1180	Lepisosteus oculatus	56.56	9e-45	149
LLPS-Scf-0410	Scleropages formosus	56.56	3e-44	148
LLPS-Tar-2549	Takifugu rubripes	56.56	2e-43	148
LLPS-Dar-0040	Danio rerio	56.56	2e-44	148
LLPS-Ten-1343	Tetraodon nigroviridis	56.56	6e-44	147
LLPS-Drm-0752	Drosophila melanogaster	56.35	2e-44	148
LLPS-Lac-0820	Latimeria chalumnae	56.2	8e-43	144
LLPS-Orl-0457	Oryzias latipes	56.1	1e-43	146
LLPS-Cii-0343	Ciona intestinalis	55.93	3e-41	140
LLPS-Chc-0062	Chondrus crispus	55.83	4e-45	150
LLPS-Cis-0756	Ciona savignyi	55.66	2e-26	102
LLPS-Urm-1037	Ursus maritimus	55.56	1e-42	144
LLPS-Gaa-0634	Gasterosteus aculeatus	55.37	4e-43	145
LLPS-Cym-0361	Cyanidioschyzon merolae	55.2	7e-36	127
LLPS-Scs-0102	Sclerotinia sclerotiorum	55.14	5e-35	125
LLPS-Pyt-0077	Pyrenophora teres	55.14	5e-34	130
LLPS-Abg-1052	Absidia glauca	54.76	2e-43	146
LLPS-Scj-0765	Schizosaccharomyces japonicus	54.63	2e-36	128
LLPS-Put-0514	Puccinia triticina	53.85	1e-25	100
LLPS-Gas-0622	Galdieria sulphuraria	53.78	3e-40	137
LLPS-Scc-0865	Schizosaccharomyces cryophilus	53.77	5e-35	125
LLPS-Blg-0690	Blumeria graminis	52.68	8e-35	124
LLPS-Crn-0943	Cryptococcus neoformans	52.17	3e-37	130
LLPS-Zyt-0182	Zymoseptoria tritici	52.1	1e-36	128
LLPS-Sac-0046	Saccharomyces cerevisiae	51.75	2e-23	94.7
LLPS-Mel-0107	Melampsora laricipopulina	51.64	1e-30	113
LLPS-Aso-0291	Aspergillus oryzae	51.26	8e-37	128
LLPS-Ved-0013	Verticillium dahliae	51.26	5e-36	127
LLPS-Asni-0722	Aspergillus niger	50.82	6e-37	130
LLPS-Asc-0251	Aspergillus clavatus	50.82	5e-37	129
LLPS-Asf-0671	Aspergillus flavus	50.82	6e-37	130
LLPS-Ast-0092	Aspergillus terreus	50.82	5e-37	130
LLPS-Dos-0526	Dothistroma septosporum	50.82	7e-37	129
LLPS-Fuv-0064	Fusarium verticillioides	50.81	2e-37	130
LLPS-Fuo-1005	Fusarium oxysporum	50.81	2e-37	130
LLPS-Scp-0366	Schizosaccharomyces pombe	50.44	2e-34	123
LLPS-Coo-0566	Colletotrichum orbiculare	50.42	2e-35	126
LLPS-Lem-0319	Leptosphaeria maculans	50.42	1e-35	126
LLPS-Fus-0436	Fusarium solani	50.42	4e-37	129
LLPS-Cog-1036	Colletotrichum gloeosporioides	50.42	1e-35	126
LLPS-Phn-1015	Phaeosphaeria nodorum	50.42	2e-35	126
LLPS-Cogr-0288	Colletotrichum graminicola	50.42	2e-35	126
LLPS-Pytr-0014	Pyrenophora triticirepentis	50.42	1e-35	126
LLPS-Pug-0887	Puccinia graminis	50.4	5e-29	110
LLPS-Nef-0111	Neosartorya fischeri	50.0	2e-36	128
LLPS-Asfu-0427	Aspergillus fumigatus	50.0	2e-36	128
LLPS-Trr-0158	Trichoderma reesei	49.6	3e-36	128
LLPS-Trv-0018	Trichoderma virens	49.6	3e-36	128
LLPS-Cae-0119	Caenorhabditis elegans	49.58	9e-34	121
LLPS-Nec-1111	Neurospora crassa	49.19	6e-35	124
LLPS-Beb-0338	Beauveria bassiana	49.19	1e-35	126
LLPS-Map-0528	Magnaporthe poae	49.17	1e-35	126
LLPS-Mao-0091	Magnaporthe oryzae	49.17	6e-36	127
LLPS-Gag-0449	Gaeumannomyces graminis	49.17	5e-36	127
LLPS-Kop-0436	Komagataella pastoris	48.78	1e-32	118
LLPS-Asg-0019	Ashbya gossypii	48.39	8e-24	95.5
LLPS-Eqc-0387	Equus caballus	48.31	1e-33	120
LLPS-Ict-0394	Ictidomys tridecemlineatus	47.93	2e-26	102
LLPS-Yal-0474	Yarrowia lipolytica	45.9	3e-31	115
LLPS-Tum-0634	Tuber melanosporum	45.83	1e-33	120
LLPS-Asn-0429	Aspergillus nidulans	39.35	9e-30	112

LLPS-Viv-0009VIT_11s0037g00080

Protein Sequence

Nucleotide Sequence

LLPS-Viv-0009
VIT_11s0037g00080