• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Sol-1512

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Ensembl Gene: Solyc12g062290.2
Ensembl Protein: Solyc12g062290.2.1
Organism: Solanum lycopersicum
Taxa ID: 4081
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblSolyc12g062290.2.1Solyc12g062290.2.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MADLKRKRGR  KPKNVVDNST  DAPGISSKEA  LDDGVLSATP  VETAITNGDP  PTHRRGRGRP  60
61    KKGGKHDEEV  DRDIAASPER  RGHRFAEHNG  DITTVLSGDL  RHGADLAAVA  AAAKAAPSMD  120
121   AVVKVFCVHT  EPNFSLPWQR  KRQYSSSSSG  FIIGGRRVLT  NAHSVEHHTQ  VKLKKRGSDT  180
181   KYLATVLSIG  TECDIAMLTV  NDDEFWEGVS  PLEFGDLPAL  QDAVTVVGYP  IGGDTISVTS  240
241   GVVSRIEILS  YVHVSTELLG  LQIDAAINSG  NSGGPAFNDK  GKCVGIAFQS  LKHEDAENIG  300
301   YVIPTPVIMH  FIQDYEKNGA  YTGFPIIGIE  WQKMENPDLR  LSMGMAHNQK  GVRIRRVEPT  360
361   APESNVLKPS  DVILSFDGVD  IANDGTVPFR  HGERIGFSYL  VSQKYTGDDA  QVKVLRKSKT  420
421   LEFKIKLNAH  KRLIPAHIKG  KPPSYYIVGG  FVFSAVSVPY  LRSEYGKDYE  FDAPVKLLDK  480
481   LLHAMAQSMD  EQLVVVSQVL  VADINIGYEE  LVNTQVIAFN  GKPVKNLKSL  AKMVEACKEE  540
541   YMKFDLDYNQ  IVVLQTTNAK  AATSDILAMH  CIPSAMSDDL  KT  582
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGCAGACC  TCAAGAGAAA  AAGAGGCCGG  AAACCTAAAA  ATGTGGTGGA  CAACTCCACC  60
61    GACGCCCCTG  GTATTTCTTC  CAAAGAAGCC  CTCGATGACG  GCGTACTATC  TGCAACCCCT  120
121   GTCGAAACTG  CCATCACCAA  CGGTGACCCA  CCAACTCATC  GACGCGGCCG  TGGACGCCCT  180
181   AAGAAAGGTG  GAAAACATGA  TGAAGAAGTA  GACAGGGATA  TTGCGGCCTC  TCCAGAGAGA  240
241   CGAGGTCATA  GGTTCGCTGA  ACACAACGGC  GATATTACCA  CTGTATTGAG  TGGCGACTTG  300
301   AGGCATGGGG  CGGATTTGGC  TGCGGTAGCA  GCAGCAGCCA  AGGCGGCTCC  GTCTATGGAT  360
361   GCAGTGGTCA  AGGTGTTCTG  CGTCCATACA  GAGCCTAATT  TCTCGCTTCC  TTGGCAGAGG  420
421   AAGAGACAAT  ATAGCTCCAG  TAGTAGTGGG  TTTATCATTG  GTGGAAGGAG  GGTGCTCACG  480
481   AATGCCCACT  CCGTGGAGCA  CCATACTCAG  GTTAAGCTCA  AGAAACGTGG  TTCTGATACC  540
541   AAATACTTGG  CTACCGTACT  TTCCATTGGA  ACGGAATGCG  ATATTGCAAT  GTTAACTGTG  600
601   AATGATGATG  AGTTCTGGGA  AGGAGTGTCA  CCTCTTGAGT  TTGGGGATCT  GCCTGCACTG  660
661   CAAGATGCTG  TAACTGTTGT  TGGATACCCT  ATAGGAGGAG  ATACAATCTC  TGTGACTAGT  720
721   GGTGTTGTCT  CGCGTATCGA  GATACTATCT  TATGTTCATG  TGTCAACCGA  GCTCCTCGGA  780
781   TTGCAGATAG  ATGCTGCCAT  CAATTCTGGA  AATTCTGGTG  GACCTGCATT  CAATGATAAG  840
841   GGGAAGTGTG  TAGGTATTGC  ATTTCAATCC  CTTAAACATG  AAGATGCCGA  GAACATTGGT  900
901   TATGTCATAC  CAACACCAGT  AATTATGCAT  TTCATTCAAG  ATTATGAGAA  GAATGGAGCA  960
961   TACACAGGAT  TTCCTATCAT  TGGGATTGAA  TGGCAAAAAA  TGGAAAATCC  TGACCTCCGC  1020
1021  TTGTCGATGG  GTATGGCACA  TAATCAGAAG  GGTGTTCGTA  TCCGAAGAGT  TGAGCCTACG  1080
1081  GCCCCAGAAT  CCAATGTTCT  AAAGCCTTCA  GATGTTATCC  TTAGCTTTGA  TGGGGTTGAT  1140
1141  ATAGCGAATG  ACGGAACAGT  ACCGTTCAGG  CATGGAGAGC  GTATTGGTTT  CAGCTATCTC  1200
1201  GTTTCTCAAA  AATATACTGG  AGATGATGCT  CAAGTGAAAG  TTCTCCGTAA  ATCTAAAACT  1260
1261  CTAGAATTCA  AAATAAAGCT  TAATGCACAT  AAACGATTGA  TTCCAGCTCA  TATCAAGGGA  1320
1321  AAACCTCCTT  CTTACTACAT  TGTTGGTGGT  TTTGTCTTCT  CTGCTGTTTC  TGTTCCATAT  1380
1381  TTACGTTCCG  AGTATGGAAA  AGACTATGAA  TTTGATGCTC  CGGTTAAGTT  GTTGGACAAA  1440
1441  CTTTTACACG  CAATGGCACA  GTCAATGGAT  GAACAACTGG  TTGTGGTTTC  TCAGGTGCTT  1500
1501  GTGGCTGACA  TCAATATTGG  TTATGAAGAA  CTGGTAAACA  CTCAGGTTAT  TGCTTTCAAC  1560
1561  GGCAAGCCGG  TAAAAAATCT  GAAGAGCTTG  GCTAAGATGG  TGGAGGCCTG  TAAAGAAGAG  1620
1621  TACATGAAGT  TTGATCTTGA  TTATAATCAG  ATTGTTGTAC  TGCAGACTAC  AAATGCAAAA  1680
1681  GCGGCAACGT  CTGATATCCT  TGCAATGCAT  TGTATACCTT  CAGCCATGTC  TGATGACCTG  1740
1741  AAGACATGA  1749

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Sot-1456Solanum tuberosum97.590.01080
LLPS-Viv-1554Vitis vinifera88.360.0 830
LLPS-Brd-0396Brachypodium distachyon87.770.0 826
LLPS-Orm-2083Oryza meridionalis87.340.0 822
LLPS-Bro-2012Brassica oleracea87.310.0 824
LLPS-Brr-0208Brassica rapa87.310.0 825
LLPS-Brn-2421Brassica napus87.310.0 824
LLPS-Orr-1995Oryza rufipogon87.230.0 815
LLPS-Orbr-0957Oryza brachyantha87.070.0 818
LLPS-Orb-1713Oryza barthii87.030.0 803
LLPS-Org-0733Oryza glaberrima86.910.0 822
LLPS-Ors-0067Oryza sativa86.910.0 821
LLPS-Orp-1770Oryza punctata86.910.0 822
LLPS-Orgl-0905Oryza glumaepatula86.910.0 819
LLPS-Lep-2237Leersia perrieri86.910.0 818
LLPS-Sei-0978Setaria italica86.70.0 818
LLPS-Sob-1610Sorghum bicolor86.270.0 816
LLPS-Met-0106Medicago truncatula85.840.0 845
LLPS-Vir-1199Vigna radiata85.410.0 821
LLPS-Pot-1476Populus trichocarpa85.380.0 837
LLPS-Zem-1236Zea mays85.350.0 807
LLPS-Orni-2299Oryza nivara85.190.0 794
LLPS-Nia-0001Nicotiana attenuata84.980.0 824
LLPS-Hov-1267Hordeum vulgare84.720.0 663
LLPS-Dac-1505Daucus carota83.230.0 815
LLPS-Gor-2096Gossypium raimondii81.620.0 852
LLPS-Coc-0917Corchorus capsularis81.040.0 836
LLPS-Mua-2215Musa acuminata79.690.0 831
LLPS-Tru-0270Triticum urartu79.170.0 789
LLPS-Php-2027Physcomitrella patens79.140.0 756
LLPS-Phv-1216Phaseolus vulgaris77.110.0 855
LLPS-Via-0223Vigna angularis76.990.0 865
LLPS-Hea-1688Helianthus annuus76.510.0 853
LLPS-Prp-1360Prunus persica75.770.0 857
LLPS-Ori-2174Oryza indica75.430.0 822
LLPS-Art-0090Arabidopsis thaliana75.130.0 843
LLPS-Cus-1715Cucumis sativus75.00.0 844
LLPS-Mae-0453Manihot esculenta74.870.0 842
LLPS-Sem-2019Selaginella moellendorffii74.680.0 755
LLPS-Arl-0966Arabidopsis lyrata74.440.0 843
LLPS-Thc-2501Theobroma cacao74.320.0 827
LLPS-Glm-1138Glycine max74.320.0 845
LLPS-Tra-0227Triticum aestivum73.230.0 810
LLPS-Amt-2015Amborella trichopoda69.870.0 806
LLPS-Chr-1693Chlamydomonas reinhardtii68.40.0 684
LLPS-Osl-1009Ostreococcus lucimarinus64.150.0 595
LLPS-Cym-0907Cyanidioschyzon merolae52.492e-172 509
LLPS-Gas-1218Galdieria sulphuraria52.118e-173 510
LLPS-Chc-0425Chondrus crispus40.343e-100 320
LLPS-Lac-2940Latimeria chalumnae29.682e-0861.2
LLPS-Meg-2452Meleagris gallopavo29.541e-1067.0
LLPS-Tag-1592Taeniopygia guttata29.53e-0963.9
LLPS-Fia-2910Ficedula albicollis29.53e-1066.6
LLPS-Anp-1913Anas platyrhynchos29.292e-1066.6
LLPS-Cis-1974Ciona savignyi28.932e-0860.8
LLPS-Drm-2089Drosophila melanogaster28.684e-0860.1
LLPS-Leo-3756Lepisosteus oculatus28.571e-0655.8
LLPS-Icp-1288Ictalurus punctatus28.461e-0758.5
LLPS-Cap-1026Cavia porcellus28.352e-0757.8
LLPS-Dio-3744Dipodomys ordii28.273e-0757.4
LLPS-Aon-2549Aotus nancymaae27.499e-0652.8
LLPS-Dar-1227Danio rerio27.314e-0756.6
LLPS-Scf-1516Scleropages formosus27.311e-0552.4
LLPS-Pes-0040Pelodiscus sinensis27.052e-0757.0
LLPS-Pof-1234Poecilia formosa26.691e-0758.9
LLPS-Caj-0778Callithrix jacchus26.695e-0653.5
LLPS-Scm-1970Scophthalmus maximus26.673e-0654.3
LLPS-Mod-0576Monodelphis domestica26.57e-0859.3
LLPS-Xim-2820Xiphophorus maculatus26.485e-0756.6
LLPS-Cii-1496Ciona intestinalis25.07e-0858.9
LLPS-Gaga-3711Gallus gallus24.647e-0652.8