• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Sol-1409

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Ensembl Gene: Solyc06g008310.3
Ensembl Protein: Solyc06g008310.3.1
Organism: Solanum lycopersicum
Taxa ID: 4081
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Stress granulePredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblSolyc06g008310.3.1Solyc06g008310.3.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MQNMEVERVF  IGAGCNRVVN  NVSWGASGLV  SFGAQNAVAI  FCPKTAQILT  TLAGHKASVN  60
61    CTLWLPNSKF  AFKAKQLEQH  LLLSGDAEGV  IILWEYSLVD  AKWRYVLQVP  QVHKKGVTCI  120
121   TAIMVSQQEA  VFASASSDGT  VNVCEVVFPS  TRGGDCKLSC  SDSLFVGQKP  MVALSLAELP  180
181   GNSKQLVLAM  GGLDNKIHLY  CGERNGKFLR  ACELKAHTDW  IRSLDLSLPV  YVNGESSLLL  240
241   VSSSQDKGIR  IWKMTLQDSS  ASNKKQQTSL  ASYIKGPVLV  AGSSSYQISM  ESLLIGHEDW  300
301   VYSVEWQPPS  TSSVEGIECF  QPQSILSASM  DKTMLIWQPE  KTTGIWMNVV  TVGELSHCAL  360
361   GFYGGHWSPN  ADFILAHGYG  GSFHLWKNVG  IEYDDWKPQK  VPSGHFAAVS  DIAWARCGEY  420
421   MMSVSHDQTT  RVFAPWLNNT  SVQNEESWHE  IARPQVHGHD  INCVTVIKGK  GNHRFVGGAD  480
481   EKVARVFESP  LSFLKTLSHV  TSDNSSFSAD  IQADVQILGA  NMSALGLSQK  PIYVQASTPI  540
541   DRSNTEGFDT  LETVPEAVPV  VLTEPPIEEQ  LAWHTLWPES  HKLYGHGNEL  FSLCCDHDGK  600
601   LVASSCKAQS  APVAEIWLWQ  VGSWKSVGRL  RSHSLTVTQM  EFSHDNKYLL  AVSRDRHFSV  660
661   FQINHKGTDE  IDYQLVAKQE  AHKRIIWSCS  WNPFGHEFAT  GSRDKTVKIW  AVGTETSVKL  720
721   LLTLPPFKSS  VTALSWLSLD  NHSNHGLLAV  GMENGLIELW  NLDSRGGDGH  LSVQNASPAV  780
781   KFDPFLCHVS  TVQRLSWRNP  QKSEDSETVQ  LASCGADHCV  RIFRVNVT  828
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGCAAAATA  TGGAAGTAGA  GAGAGTTTTT  ATAGGAGCAG  GATGCAACAG  AGTAGTGAAT  60
61    AACGTTTCAT  GGGGTGCTTC  TGGTTTAGTT  TCTTTTGGTG  CCCAAAATGC  TGTTGCCATT  120
121   TTCTGTCCAA  AGACAGCTCA  AATCTTGACT  ACACTGGCTG  GTCATAAAGC  TTCTGTGAAT  180
181   TGTACCCTTT  GGCTTCCCAA  TAGCAAGTTT  GCATTCAAAG  CTAAGCAGCT  GGAGCAACAT  240
241   CTTTTGCTTT  CTGGAGATGC  GGAAGGTGTA  ATAATTTTGT  GGGAGTATTC  TCTTGTGGAT  300
301   GCGAAGTGGA  GATATGTCTT  ACAAGTGCCA  CAAGTCCACA  AAAAAGGTGT  TACCTGCATC  360
361   ACGGCGATCA  TGGTGTCTCA  GCAAGAAGCT  GTTTTTGCAT  CTGCATCCTC  TGATGGCACT  420
421   GTGAATGTAT  GCGAAGTAGT  ATTTCCATCT  ACTCGTGGAG  GTGATTGCAA  ATTGTCGTGC  480
481   TCGGATTCTC  TTTTTGTTGG  TCAGAAACCT  ATGGTTGCTC  TTTCACTAGC  AGAGCTCCCA  540
541   GGGAATAGCA  AGCAGCTGGT  TCTGGCCATG  GGAGGATTGG  ACAACAAAAT  TCATCTATAT  600
601   TGTGGTGAGA  GAAATGGAAA  ATTTCTTCGT  GCTTGTGAGT  TAAAGGCTCA  TACAGACTGG  660
661   ATTAGGAGTT  TAGATCTCTC  ATTGCCTGTG  TATGTGAATG  GTGAATCTAG  TCTTCTACTT  720
721   GTAAGTTCAT  CCCAAGACAA  AGGCATTCGC  ATATGGAAGA  TGACCTTACA  GGATTCTTCA  780
781   GCTAGTAACA  AGAAGCAGCA  AACAAGTTTG  GCTTCTTACA  TTAAAGGTCC  TGTTCTTGTA  840
841   GCTGGCTCAT  CCTCTTATCA  GATCTCTATG  GAATCTCTCC  TCATTGGGCA  TGAAGATTGG  900
901   GTATACTCAG  TGGAATGGCA  GCCGCCATCG  ACTTCTTCTG  TTGAGGGAAT  TGAGTGTTTT  960
961   CAGCCTCAAA  GCATTTTATC  TGCATCCATG  GATAAGACAA  TGTTGATCTG  GCAACCTGAA  1020
1021  AAGACAACTG  GTATTTGGAT  GAATGTAGTC  ACCGTTGGGG  AATTAAGTCA  CTGTGCTTTG  1080
1081  GGATTTTATG  GTGGTCACTG  GAGTCCAAAT  GCAGATTTTA  TTTTAGCTCA  TGGATATGGT  1140
1141  GGATCTTTTC  ACCTCTGGAA  AAATGTTGGT  ATTGAGTATG  ATGACTGGAA  GCCACAAAAA  1200
1201  GTTCCATCTG  GACACTTTGC  TGCAGTGTCA  GACATCGCCT  GGGCTAGATG  TGGGGAATAT  1260
1261  ATGATGTCTG  TCAGTCATGA  TCAGACAACT  AGAGTATTTG  CTCCTTGGCT  CAACAATACA  1320
1321  AGCGTACAGA  ATGAGGAATC  CTGGCATGAA  ATTGCTCGCC  CTCAAGTTCA  TGGTCATGAC  1380
1381  ATAAATTGTG  TCACAGTAAT  CAAAGGAAAA  GGAAATCATC  GTTTTGTTGG  CGGTGCAGAC  1440
1441  GAGAAAGTTG  CAAGAGTTTT  TGAATCTCCT  CTATCCTTTC  TGAAGACGCT  GAGCCATGTA  1500
1501  ACATCAGACA  ACTCTAGTTT  TTCTGCCGAC  ATTCAAGCTG  ATGTGCAGAT  ATTAGGGGCA  1560
1561  AATATGTCTG  CTTTAGGTCT  ATCACAGAAA  CCTATTTATG  TTCAGGCATC  GACACCAATA  1620
1621  GACAGAAGCA  ATACGGAAGG  TTTTGATACT  CTAGAAACTG  TTCCTGAAGC  AGTTCCAGTT  1680
1681  GTCTTGACAG  AGCCACCTAT  TGAAGAGCAA  TTGGCATGGC  ATACTCTATG  GCCTGAATCA  1740
1741  CACAAACTTT  ATGGTCATGG  GAATGAGCTT  TTTTCTCTAT  GTTGTGATCA  TGATGGAAAG  1800
1801  CTTGTAGCTT  CATCCTGCAA  GGCACAATCA  GCACCGGTTG  CTGAAATATG  GCTTTGGCAA  1860
1861  GTTGGTTCTT  GGAAATCCGT  TGGTCGTTTA  CGGTCTCACA  GTTTAACAGT  GACCCAAATG  1920
1921  GAGTTCTCTC  ATGATAACAA  GTATCTCTTG  GCTGTTTCAA  GAGATCGCCA  CTTCTCTGTT  1980
1981  TTTCAAATTA  ATCATAAAGG  AACTGATGAG  ATCGATTACC  AGCTCGTAGC  TAAGCAAGAA  2040
2041  GCACATAAAA  GAATAATATG  GTCATGTTCT  TGGAACCCAT  TTGGTCATGA  ATTTGCTACT  2100
2101  GGTTCAAGGG  ACAAAACTGT  CAAAATATGG  GCCGTGGGAA  CTGAAACCTC  GGTGAAGCTA  2160
2161  CTGTTGACAC  TTCCACCTTT  CAAAAGCAGC  GTCACTGCCC  TGTCTTGGTT  AAGTCTCGAT  2220
2221  AACCATAGCA  ATCATGGGCT  TCTTGCAGTG  GGAATGGAAA  ATGGCTTGAT  TGAACTATGG  2280
2281  AATCTGGATA  GCAGAGGAGG  AGATGGGCAT  TTATCAGTCC  AAAATGCTTC  TCCCGCTGTC  2340
2341  AAGTTTGATC  CATTTCTATG  CCACGTCTCT  ACTGTTCAAC  GACTATCTTG  GAGAAATCCT  2400
2401  CAGAAGAGCG  AAGATTCTGA  GACCGTGCAG  CTTGCCTCCT  GTGGAGCTGA  TCATTGTGTG  2460
2461  AGAATATTCA  GGGTAAATGT  TACCTAA  2487

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Sot-0045Solanum tuberosum96.850.01650
LLPS-Nia-2222Nicotiana attenuata91.910.01574
LLPS-Pot-0014Populus trichocarpa75.480.01297
LLPS-Prp-0265Prunus persica75.450.01286
LLPS-Mae-1821Manihot esculenta74.940.01318
LLPS-Viv-1089Vitis vinifera74.550.01281
LLPS-Dac-0573Daucus carota73.880.01265
LLPS-Glm-1926Glycine max73.240.01251
LLPS-Thc-2425Theobroma cacao72.920.01263
LLPS-Gor-1967Gossypium raimondii72.770.01275
LLPS-Phv-2331Phaseolus vulgaris72.750.01244
LLPS-Via-2152Vigna angularis72.270.01233
LLPS-Met-2570Medicago truncatula72.130.01220
LLPS-Hea-2532Helianthus annuus71.510.01230
LLPS-Cus-1197Cucumis sativus71.020.01201
LLPS-Mua-2370Musa acuminata66.750.01137
LLPS-Brr-2655Brassica rapa66.590.01119
LLPS-Bro-1409Brassica oleracea66.470.01116
LLPS-Arl-1086Arabidopsis lyrata66.470.01132
LLPS-Brn-3169Brassica napus66.180.01117
LLPS-Art-2055Arabidopsis thaliana65.990.01119
LLPS-Vir-1752Vigna radiata65.910.01070
LLPS-Amt-0442Amborella trichopoda63.430.01094
LLPS-Sob-0658Sorghum bicolor63.020.01092
LLPS-Sei-1044Setaria italica62.750.01096
LLPS-Tru-0843Triticum urartu62.550.01080
LLPS-Zem-1443Zea mays62.450.01078
LLPS-Orbr-2364Oryza brachyantha62.30.01070
LLPS-Brd-0832Brachypodium distachyon62.280.01058
LLPS-Org-1539Oryza glaberrima62.180.01073
LLPS-Tra-2680Triticum aestivum62.160.01073
LLPS-Orgl-1030Oryza glumaepatula62.140.01069
LLPS-Orb-0795Oryza barthii62.140.01073
LLPS-Orr-1355Oryza rufipogon62.010.01067
LLPS-Ors-0431Oryza sativa62.010.01067
LLPS-Ori-2396Oryza indica62.010.01067
LLPS-Orni-0897Oryza nivara61.650.01062
LLPS-Lep-0970Leersia perrieri61.270.01048
LLPS-Orp-0887Oryza punctata61.180.01048
LLPS-Hov-1902Hordeum vulgare60.970.01070
LLPS-Orm-1012Oryza meridionalis59.450.01012
LLPS-Sem-0613Selaginella moellendorffii52.00.0 837
LLPS-Fia-3007Ficedula albicollis40.546e-140 441
LLPS-Pes-1190Pelodiscus sinensis39.595e-141 439
LLPS-Lac-3046Latimeria chalumnae39.23e-139 442
LLPS-Chr-1692Chlamydomonas reinhardtii39.182e-1068.9
LLPS-Cap-4496Cavia porcellus38.313e-138 434
LLPS-Gaga-3458Gallus gallus38.295e-164 507
LLPS-Mam-2209Macaca mulatta38.023e-128 412
LLPS-Mal-3948Mandrillus leucophaeus37.656e-127 409
LLPS-Paa-2110Papio anubis37.562e-127 411
LLPS-Tag-1672Taeniopygia guttata37.532e-156 485
LLPS-Cas-4065Carlito syrichta37.59e-129 414
LLPS-Hos-0374Homo sapiens37.399e-127 409
LLPS-Gog-2733Gorilla gorilla37.392e-127 410
LLPS-Dar-3413Danio rerio37.31e-157 488
LLPS-Caj-3256Callithrix jacchus37.243e-126 407
LLPS-Xim-1082Xiphophorus maculatus37.012e-156 485
LLPS-Tar-1247Takifugu rubripes36.769e-160 494
LLPS-Asm-0078Astyanax mexicanus36.731e-142 448
LLPS-Leo-1188Lepisosteus oculatus36.647e-160 494
LLPS-Icp-3918Ictalurus punctatus36.428e-147 459
LLPS-Fud-3745Fukomys damarensis36.273e-150 469
LLPS-Scm-2947Scophthalmus maximus36.261e-153 478
LLPS-Mod-0953Monodelphis domestica36.225e-153 479
LLPS-Myl-0576Myotis lucifugus36.21e-149 467
LLPS-Gaa-3716Gasterosteus aculeatus36.21e-153 478
LLPS-Pof-4142Poecilia formosa36.159e-151 471
LLPS-Ova-3232Ovis aries36.142e-143 456
LLPS-Caf-1537Canis familiaris35.952e-146 464
LLPS-Orc-3114Oryctolagus cuniculus35.873e-147 461
LLPS-Loa-3786Loxodonta africana35.822e-146 459
LLPS-Eqc-4394Equus caballus35.799e-148 462
LLPS-Bot-3087Bos taurus35.666e-147 460
LLPS-Orl-2817Oryzias latipes35.633e-146 458
LLPS-Tut-2329Tursiops truncatus35.625e-148 463
LLPS-Otg-0776Otolemur garnettii35.613e-115 379
LLPS-Orn-0325Oreochromis niloticus35.613e-154 479
LLPS-Mum-3050Mus musculus35.616e-148 463
LLPS-Sus-1046Sus scrofa35.513e-147 461
LLPS-Urm-2787Ursus maritimus35.484e-149 466
LLPS-Mea-3127Mesocricetus auratus35.38e-143 449
LLPS-Mup-0633Mustela putorius furo35.289e-147 459
LLPS-Chs-3580Chlorocebus sabaeus35.254e-145 455
LLPS-Ran-1557Rattus norvegicus35.11e-147 462
LLPS-Scf-1712Scleropages formosus34.918e-144 452
LLPS-Pap-2092Pan paniscus34.898e-143 449
LLPS-Drm-0619Drosophila melanogaster34.846e-146 456
LLPS-Ora-2173Ornithorhynchus anatinus34.838e-137 434
LLPS-Ten-1411Tetraodon nigroviridis34.679e-47 183
LLPS-Poa-2330Pongo abelii34.664e-142 447
LLPS-Aim-3889Ailuropoda melanoleuca34.233e-125 401
LLPS-Fec-4017Felis catus33.965e-137 435
LLPS-Abg-1992Absidia glauca33.922e-144 454
LLPS-Zyt-0758Zymoseptoria tritici33.762e-120 390
LLPS-Anc-1577Anolis carolinensis33.557e-125 404
LLPS-Coo-1458Colletotrichum orbiculare33.452e-123 399
LLPS-Cea-3869Cercocebus atys33.376e-135 430
LLPS-Aon-4543Aotus nancymaae33.331e-133 427
LLPS-Xet-1198Xenopus tropicalis33.38e-140 443
LLPS-Rhb-0884Rhinopithecus bieti33.33e-135 431
LLPS-Cii-1977Ciona intestinalis33.212e-117 381
LLPS-Man-3999Macaca nemestrina33.196e-134 427
LLPS-Maf-1032Macaca fascicularis33.197e-134 427
LLPS-Cis-1869Ciona savignyi33.134e-123 395
LLPS-Pat-3560Pan troglodytes32.822e-133 426
LLPS-Nol-1162Nomascus leucogenys32.82e-128 413
LLPS-Osl-1286Ostreococcus lucimarinus32.632e-105 346
LLPS-Sah-3579Sarcophilus harrisii32.59e-87 301
LLPS-Fus-1381Fusarium solani32.472e-115 376
LLPS-Blg-1526Blumeria graminis32.294e-108 357
LLPS-Cogr-1633Colletotrichum graminicola32.18e-120 389
LLPS-Yal-1587Yarrowia lipolytica32.031e-97 327
LLPS-Mao-1148Magnaporthe oryzae32.01e-124 402
LLPS-Gas-0733Galdieria sulphuraria31.938e-88 302
LLPS-Asf-1486Aspergillus flavus31.864e-1790.1
LLPS-Asc-0851Aspergillus clavatus31.751e-111 367
LLPS-Ved-1351Verticillium dahliae31.742e-110 363
LLPS-Tum-1612Tuber melanosporum31.742e-113 371
LLPS-Fuv-1078Fusarium verticillioides31.747e-117 381
LLPS-Scj-1027Schizosaccharomyces japonicus31.653e-98 328
LLPS-Beb-0766Beauveria bassiana31.521e-63 227
LLPS-Lem-1430Leptosphaeria maculans31.493e-105 349
LLPS-Scc-1417Schizosaccharomyces cryophilus31.453e-107 353
LLPS-Trr-1029Trichoderma reesei31.443e-109 359
LLPS-Cae-0708Caenorhabditis elegans31.317e-78 274
LLPS-Fuo-1313Fusarium oxysporum31.295e-116 379
LLPS-Aso-1107Aspergillus oryzae31.118e-108 356
LLPS-Chc-1144Chondrus crispus31.094e-73 258
LLPS-Dos-1414Dothistroma septosporum31.078e-101 338
LLPS-Trv-0204Trichoderma virens30.957e-107 353
LLPS-Pytr-0276Pyrenophora triticirepentis30.921e-102 343
LLPS-Nef-1469Neosartorya fischeri30.891e-104 348
LLPS-Asfu-0195Aspergillus fumigatus30.867e-105 348
LLPS-Cog-0993Colletotrichum gloeosporioides30.681e-103 343
LLPS-Crn-1022Cryptococcus neoformans30.657e-99 332
LLPS-Usm-0353Ustilago maydis30.563e-0758.5
LLPS-Ast-1403Aspergillus terreus30.561e-108 358
LLPS-Asg-0166Ashbya gossypii30.567e-98 329
LLPS-Nec-1034Neurospora crassa30.412e-95 325
LLPS-Kop-1502Komagataella pastoris30.394e-96 324
LLPS-Miv-0575Microbotryum violaceum30.345e-96 326
LLPS-Phn-1548Phaeosphaeria nodorum30.264e-78 273
LLPS-Pyt-1249Pyrenophora teres30.222e-102 342
LLPS-Scp-0379Schizosaccharomyces pombe30.071e-95 322
LLPS-Sac-1255Saccharomyces cerevisiae30.033e-94 319
LLPS-Spr-0469Sporisorium reilianum29.944e-30 132
LLPS-Put-1345Puccinia triticina29.872e-81 283
LLPS-Pug-1372Puccinia graminis29.762e-91 313
LLPS-Asn-1344Aspergillus nidulans29.692e-105 352
LLPS-Gag-1243Gaeumannomyces graminis29.691e-101 343
LLPS-Asni-1220Aspergillus niger29.472e-102 342
LLPS-Mel-1329Melampsora laricipopulina29.382e-86 300
LLPS-Map-0812Magnaporthe poae29.068e-101 339
LLPS-Ict-0985Ictidomys tridecemlineatus28.126e-0757.0
LLPS-Dio-3791Dipodomys ordii25.751e-0861.6
LLPS-Cym-0534Cyanidioschyzon merolae25.293e-46 182
LLPS-Php-2319Physcomitrella patens25.08e-0755.8
LLPS-Anp-1817Anas platyrhynchos24.656e-0757.8