• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Sol-1083

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Ensembl Gene: Solyc04g081570.3
Ensembl Protein: Solyc04g081570.3.1
Organism: Solanum lycopersicum
Taxa ID: 4081
LLPS Type: Client


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblSolyc04g081570.3.1Solyc04g081570.3.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MRKWKIPFVL  FLLCLIYLVP  DQGRKIQANA  EADSDAPVDP  PKVEEKFGAV  PNGLSTDSDV  60
61    AKREAESMSR  KTLRASAEKF  EFQAEVSRLM  DILINSLYSN  KDIFLRELIS  NASDALDKIR  120
121   FLALTDKEVL  GEGDNTKLEI  QIKLDKEKKI  LSIRDRGVGM  TKEDLRKNLG  TIAKSGTSAF  180
181   VEKMQTSGDL  NLIGQFGVGF  YSVYLVADYV  EVISKHNDDK  QYVWESKADG  AFAISEDTWN  240
241   EPLGRGTEIR  LHLRDEAGEY  LDELKLKELV  KKYSEFINFP  INLWASKEVE  KEVPADEDES  300
301   VDEEETSEST  SSEEEGEEED  AEKAEDEKKP  KTKTVKETTY  EWELLNDMKA  IWLRSPKEVT  360
361   DEEYNKFYHS  LAKDFSEDKP  MAWSHFNAEG  DVEFKAVLFI  PPKAPHDLYE  SYYNTKQSNL  420
421   KLYVRRVFIS  DEFNELLPKY  LNFLMGLVDS  DTLPLNVSRE  MLQQHSSLKT  IKKKLIRKAL  480
481   DMIRKLAEED  PDETNDKEKR  DVEESSDENE  KKGQYAKFWN  EFGKSIKLGI  IEDATNRNRL  540
541   AKLLRFETTK  SDGKLTSLDQ  YISRMKSSQK  DIFYITGASK  EQLEKSPFLE  RLNKKDYEVI  600
601   FFTDPVDEYL  MQYLMDYEDK  KFQNVSKEGL  KLKDSKTKEL  KESFKGLTKW  WKNTLASDNV  660
661   EDVKISSRLA  DTPCVVVTSK  YGWSAYMEKI  MHSQTLSDAS  KQAYMRGKRV  LEINPRHPII  720
721   KALRERVVTD  PEDESVKLTA  KLIYQTALME  SGFDLSDPKD  FASHIYSSVK  SSLNISPDAT  780
781   VEEEEDEAEE  PETETKAEEE  SASDESELKD  EL  812
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGAGGAAGT  GGAAGATCCC  GTTCGTCCTG  TTTCTGTTAT  GCCTGATTTA  CCTTGTTCCA  60
61    GATCAAGGTC  GAAAGATACA  GGCAAATGCA  GAAGCTGATT  CTGATGCACC  AGTAGATCCA  120
121   CCAAAGGTTG  AGGAGAAGTT  TGGTGCTGTT  CCTAATGGTT  TATCGACTGA  TTCTGATGTG  180
181   GCTAAGAGGG  AAGCTGAGTC  TATGTCAAGG  AAAACTCTCC  GAGCTAGTGC  GGAGAAGTTT  240
241   GAGTTCCAGG  CTGAGGTCTC  TCGTCTTATG  GACATCCTTA  TCAACTCTCT  CTACAGTAAC  300
301   AAGGACATCT  TTTTGAGGGA  GCTGATTTCC  AATGCTTCTG  ATGCACTGGA  CAAGATTAGG  360
361   TTCCTTGCAC  TCACTGACAA  GGAGGTTCTT  GGTGAGGGTG  ATAATACTAA  GCTTGAGATT  420
421   CAGATTAAAC  TTGATAAAGA  AAAGAAAATT  CTTTCCATTC  GCGACAGAGG  TGTTGGAATG  480
481   ACCAAGGAGG  ATCTAAGAAA  GAATTTGGGA  ACCATAGCTA  AATCTGGAAC  TTCAGCTTTT  540
541   GTCGAGAAGA  TGCAGACAAG  TGGTGACCTT  AACCTGATTG  GACAATTTGG  TGTTGGGTTT  600
601   TACTCTGTGT  ATCTTGTGGC  TGACTATGTT  GAAGTCATCA  GCAAGCACAA  TGACGACAAA  660
661   CAATATGTCT  GGGAATCAAA  GGCAGATGGG  GCATTTGCCA  TTTCTGAAGA  TACATGGAAT  720
721   GAACCTCTTG  GCCGTGGAAC  TGAAATTAGA  CTGCATCTAA  GAGATGAAGC  AGGGGAATAT  780
781   TTGGATGAGC  TCAAACTAAA  GGAATTGGTC  AAGAAATATT  CTGAATTCAT  CAACTTCCCT  840
841   ATAAATTTAT  GGGCAAGCAA  AGAGGTTGAG  AAGGAAGTTC  CTGCTGATGA  GGACGAGTCA  900
901   GTTGATGAAG  AGGAAACATC  TGAAAGCACT  TCCTCTGAGG  AAGAGGGAGA  AGAAGAAGAT  960
961   GCAGAGAAGG  CCGAAGATGA  GAAGAAGCCT  AAAACTAAGA  CAGTGAAGGA  AACCACATAT  1020
1021  GAGTGGGAGC  TTTTAAATGA  CATGAAAGCT  ATATGGCTTC  GAAGCCCAAA  GGAAGTTACA  1080
1081  GATGAAGAAT  ATAATAAGTT  CTATCACTCT  CTGGCAAAGG  ACTTCAGTGA  AGATAAACCC  1140
1141  ATGGCGTGGA  GTCACTTCAA  TGCTGAAGGT  GATGTAGAGT  TCAAGGCTGT  TCTATTCATC  1200
1201  CCTCCTAAAG  CCCCTCATGA  TTTGTATGAG  AGCTACTACA  ACACAAAGCA  ATCCAACTTG  1260
1261  AAGTTATATG  TCAGACGGGT  TTTCATCTCA  GATGAATTTA  ATGAATTGTT  GCCCAAGTAC  1320
1321  TTGAATTTCC  TAATGGGTCT  TGTTGATTCT  GACACCTTAC  CCCTCAATGT  CTCAAGAGAA  1380
1381  ATGCTTCAGC  AGCACAGCAG  TTTGAAGACA  ATTAAGAAAA  AACTCATCCG  TAAGGCCCTT  1440
1441  GACATGATCC  GCAAACTTGC  CGAAGAGGAT  CCAGATGAAA  CTAATGACAA  GGAGAAGAGA  1500
1501  GATGTTGAAG  AGTCCAGTGA  TGAAAATGAG  AAGAAAGGTC  AATATGCCAA  ATTCTGGAAT  1560
1561  GAATTTGGAA  AGTCGATTAA  GCTTGGTATT  ATAGAAGACG  CAACTAACAG  AAACCGCTTA  1620
1621  GCTAAACTTC  TTCGATTTGA  GACAACCAAA  TCAGATGGTA  AATTAACTTC  ACTTGACCAA  1680
1681  TACATCTCAA  GAATGAAATC  AAGTCAAAAG  GATATCTTCT  ACATCACCGG  TGCCAGCAAA  1740
1741  GAACAGTTGG  AGAAATCTCC  CTTCCTTGAA  AGACTTAATA  AGAAAGACTA  TGAGGTTATA  1800
1801  TTCTTCACCG  ATCCAGTAGA  TGAATACCTC  ATGCAATATC  TTATGGACTA  TGAAGACAAA  1860
1861  AAGTTCCAGA  ATGTGTCTAA  AGAGGGATTA  AAGCTTAAGG  ATTCGAAAAC  CAAAGAGCTC  1920
1921  AAGGAGTCAT  TCAAGGGGCT  AACTAAGTGG  TGGAAGAATA  CTCTTGCTAG  TGACAACGTT  1980
1981  GAAGATGTCA  AGATAAGCAG  CCGTTTGGCC  GACACCCCTT  GTGTTGTGGT  AACATCAAAA  2040
2041  TACGGATGGA  GTGCATATAT  GGAGAAAATA  ATGCATTCAC  AAACCCTGTC  AGATGCAAGC  2100
2101  AAGCAAGCAT  ACATGCGTGG  TAAAAGGGTG  CTTGAAATCA  ATCCTAGGCA  CCCAATTATC  2160
2161  AAGGCACTTC  GGGAGAGAGT  AGTAACAGAC  CCAGAGGACG  AGAGTGTGAA  GTTGACAGCA  2220
2221  AAACTTATAT  ACCAAACAGC  TTTAATGGAG  AGTGGCTTCG  ATCTGAGTGA  TCCAAAGGAT  2280
2281  TTTGCCTCCC  ACATCTACAG  CTCAGTAAAG  AGCAGTCTAA  ACATTAGCCC  TGATGCAACA  2340
2341  GTTGAGGAAG  AAGAAGACGA  AGCTGAAGAA  CCTGAGACTG  AAACCAAGGC  AGAAGAGGAG  2400
2401  TCTGCATCGG  ATGAGTCTGA  ACTCAAGGAT  GAGCTATAG  2439

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Sot-0902Solanum tuberosum96.130.01376
LLPS-Orb-1382Oryza barthii92.045e-106 348
LLPS-Orr-0383Oryza rufipogon92.045e-106 348
LLPS-Orp-1219Oryza punctata92.045e-106 349
LLPS-Lep-1766Leersia perrieri89.159e-140 439
LLPS-Viv-1383Vitis vinifera88.287e-154 477
LLPS-Orgl-1351Oryza glumaepatula87.643e-142 447
LLPS-Nia-1518Nicotiana attenuata87.370.01268
LLPS-Orni-1741Oryza nivara87.315e-143 448
LLPS-Ori-0110Oryza indica87.314e-142 447
LLPS-Ors-0992Oryza sativa87.082e-144 452
LLPS-Brd-0540Brachypodium distachyon86.721e-141 445
LLPS-Org-0069Oryza glaberrima86.729e-143 448
LLPS-Mua-1116Musa acuminata86.641e-150 469
LLPS-Arl-0229Arabidopsis lyrata86.355e-142 446
LLPS-Bro-0586Brassica oleracea86.352e-141 445
LLPS-Art-1130Arabidopsis thaliana86.191e-138 438
LLPS-Brr-0468Brassica rapa85.982e-140 442
LLPS-Prp-1405Prunus persica85.310.01215
LLPS-Pot-1430Populus trichocarpa85.270.01208
LLPS-Thc-0278Theobroma cacao85.179e-137 433
LLPS-Mae-1333Manihot esculenta85.050.01209
LLPS-Vir-2184Vigna radiata85.010.0 747
LLPS-Orbr-0990Oryza brachyantha84.831e-146 458
LLPS-Amt-1925Amborella trichopoda84.760.0 745
LLPS-Dac-0516Daucus carota84.170.01202
LLPS-Hea-1556Helianthus annuus84.150.01196
LLPS-Zem-0693Zea mays84.144e-145 454
LLPS-Sob-1375Sorghum bicolor84.142e-145 454
LLPS-Glm-1695Glycine max84.020.01195
LLPS-Tru-1135Triticum urartu83.935e-139 440
LLPS-Gor-2429Gossypium raimondii83.796e-142 446
LLPS-Sei-0523Setaria italica83.459e-145 453
LLPS-Via-1195Vigna angularis83.250.01194
LLPS-Tra-2148Triticum aestivum83.15e-142 447
LLPS-Cus-2170Cucumis sativus82.990.01188
LLPS-Met-0496Medicago truncatula82.990.01193
LLPS-Phv-2191Phaseolus vulgaris81.720.01184
LLPS-Php-1798Physcomitrella patens74.536e-114 373
LLPS-Sem-1856Selaginella moellendorffii72.76e-118 384
LLPS-Chr-1361Chlamydomonas reinhardtii68.63e-98 330
LLPS-Miv-0391Microbotryum violaceum60.952e-64 234
LLPS-Orm-0577Oryza meridionalis59.912e-62 228
LLPS-Crn-0985Cryptococcus neoformans58.961e-61 226
LLPS-Cym-0073Cyanidioschyzon merolae58.411e-62 229
LLPS-Drm-0096Drosophila melanogaster58.147e-61 224
LLPS-Orl-1351Oryzias latipes58.022e-61 226
LLPS-Ran-0580Rattus norvegicus57.553e-61 225
LLPS-Mal-0477Mandrillus leucophaeus57.554e-61 225
LLPS-Paa-2223Papio anubis57.554e-61 225
LLPS-Aim-2395Ailuropoda melanoleuca57.555e-61 225
LLPS-Mup-0230Mustela putorius furo57.554e-61 225
LLPS-Ova-0115Ovis aries57.553e-61 225
LLPS-Bot-1373Bos taurus57.553e-61 225
LLPS-Gog-0051Gorilla gorilla57.554e-61 225
LLPS-Caj-0065Callithrix jacchus57.554e-61 225
LLPS-Maf-0551Macaca fascicularis57.554e-61 225
LLPS-Mum-2034Mus musculus57.553e-61 225
LLPS-Chs-0852Chlorocebus sabaeus57.554e-61 225
LLPS-Cea-0472Cercocebus atys57.554e-61 225
LLPS-Cas-0545Carlito syrichta57.553e-61 225
LLPS-Poa-0251Pongo abelii57.554e-61 225
LLPS-Caf-2777Canis familiaris57.554e-61 225
LLPS-Eqc-3536Equus caballus57.554e-61 225
LLPS-Cap-3767Cavia porcellus57.554e-61 225
LLPS-Mam-0102Macaca mulatta57.554e-61 225
LLPS-Urm-1065Ursus maritimus57.553e-61 225
LLPS-Sah-0727Sarcophilus harrisii57.211e-61 227
LLPS-Rhb-3503Rhinopithecus bieti57.211e-62 229
LLPS-Loa-0363Loxodonta africana57.213e-62 228
LLPS-Lac-3075Latimeria chalumnae57.142e-61 226
LLPS-Mel-0789Melampsora laricipopulina57.088e-61 224
LLPS-Leo-0184Lepisosteus oculatus57.084e-61 225
LLPS-Xet-0387Xenopus tropicalis56.742e-61 226
LLPS-Asm-2298Astyanax mexicanus56.61e-60 224
LLPS-Meg-1925Meleagris gallopavo56.284e-60 222
LLPS-Spr-0136Sporisorium reilianum56.161e-62 229
LLPS-Put-0779Puccinia triticina56.075e-61 224
LLPS-Ten-1260Tetraodon nigroviridis55.925e-60 221
LLPS-Anc-1968Anolis carolinensis55.762e-60 223
LLPS-Dar-1009Danio rerio55.662e-60 223
LLPS-Pes-1314Pelodiscus sinensis54.82e-42 168
LLPS-Pat-1292Pan troglodytes54.84e-43 171
LLPS-Gaa-1503Gasterosteus aculeatus54.33e-61 225
LLPS-Cii-0155Ciona intestinalis50.070.0 573
LLPS-Nec-0286Neurospora crassa48.090.0 546