LLPS-Art-1130
SHD

▼ OVERVIEW

Status: Reviewed
Protein Name: Chaperone protein htpG family protein
Gene Name: SHD, AtHsp90-7, AtHsp90.7, HEAT SHOCK PROTEIN 90-7, HEAT SHOCK PROTEIN 90.7, HSP90.7, SHEPHERD, At4g24190, T22A6.20, T22A6_20
Ensembl Gene: AT4G24190
Ensembl Protein: AT4G24190.2
Organism: Arabidopsis thaliana
Taxa ID: 3702
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateDescriptionTissue/CellPMIDs
Nucleolus
"...We identified 1602 proteins in the nucleolar and 2544 proteins in the nuclear fraction with an overlap of 1429 proteins."
Arabidopsis thaliana cells26980300

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblAT4G24190.2AT4G24190.2
EnsemblAT4G24190.1AT4G24190.1
UniProtF4JQ55, F4JQ55_ARATH
GeneBankCP002687AEE84862.1
RefSeqNM_202877.1NP_974606.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MRKRTLVSVL  FLFSLLFLLP  DQGTKLHANA  EESSDDVTDP  PKVEEKIGGH  GGLSTDSDVV  60
61    HRESESMSKK  TLRSNAEKFE  FQAEVSRLMD  IIINSLYSNK  DIFLRELISN  ASDALDKIRF  120
121   LALTDKDVLG  EGDTAKLEIQ  IKLDKAKKIL  SIRDRGIGMT  KEDLIKNLGT  IAKSGTSAFV  180
181   EKMQSSGDLN  LIGQFGVGFY  SAYLVADYIE  VISKHNDDSQ  YVWESKANGK  FAVSEDTWNE  240
241   PLGRGTEIRL  HLRDEAGEYL  EESKLKELVK  RYSEFINFPI  SLWASKEVET  EVPVEEDESA  300
301   DEETETTSTE  EEKEEDAEEE  DGEKKQKTKK  VKETVYEWEL  LNDVKAIWLR  SPKEVTEEEY  360
361   TKFYHSLSKD  FTDEKPMAWS  HFNAEGDVEF  KAVLYVPPKA  PHDLYESYYN  SNKANLKLYV  420
421   RRVFISDEFD  ELLPKYLSFL  KGLVDSDTLP  LNVSREMLQQ  HSSLKTIKKK  LIRKALDMIR  480
481   KLAEEDPDEI  HDDEKKDVEK  SGENDEKKGQ  YTKFWNEFGK  SVKLGIIEDA  ANRNRLAKLL  540
541   RFETTKSDGK  LTSLDQYIKR  MKKSQKDIFY  ITGSSKEQLE  KSPFLERLIK  KGYEVIFFTD  600
601   PVDEYLMQYL  MDYEDKKFQN  VSKEGLKVGK  DSKDKELKEA  FKELTKWWKG  NLASENVDDV  660
661   KISNRLADTP  CVVVTSKFGW  SANMERIMQS  QTLSDANKQA  YMRGKRVLEI  NPRHPIIKEL  720
721   KDRIASDPED  ESVKETAQLM  YQTALIESGF  ILTDPKDFAA  RIYNSVKSGL  NISPDAVADE  780
781   EIEAAEEPET  SEATETKSDD  LAGGLNIEAE  PVEQQEENTK  DEL  823
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGAGGAAGA  GGACGCTCGT  GTCCGTTTTG  TTCCTTTTCT  CGCTTCTGTT  TCTTCTTCCA  60
61    GATCAAGGAA  GAAAGTTACA  CGCGAATGCA  GAAGAGAGTT  CCGATGATGT  TACAGATCCA  120
121   CCAAAAGTTG  AGGAGAAAAT  TGGTGGTCAC  GGTGGTTTAT  CGACGGATTC  CGATGTAGTT  180
181   CATAGAGAGT  CTGAGTCGAT  GTCAAAGAAG  ACGCTTCGCA  GTAACGCGGA  GAAGTTTGAG  240
241   TTCCAAGCTG  AGGTTTCTCG  GCTTATGGAC  ATTATTATCA  ACTCTCTATA  CAGTAACAAG  300
301   GACATTTTCT  TAAGAGAGTT  GATCTCCAAT  GCTTCTGATG  CCTTGGACAA  AATTAGGTTC  360
361   CTTGCACTCA  CTGACAAAGA  CGTTTTGGGT  GAAGGTGACA  CTGCTAAGCT  TGAGATCCAG  420
421   ATTAAGCTAG  ACAAAGCCAA  GAAGATTCTT  TCTATTCGAG  ACCGGGGAAT  TGGTATGACT  480
481   AAGGAAGACT  TAATCAAGAA  CCTTGGTACC  ATAGCAAAAT  CTGGAACGTC  AGCTTTTGTT  540
541   GAGAAAATGC  AATCAAGTGG  GGATTTGAAC  CTTATTGGAC  AATTTGGAGT  TGGATTCTAC  600
601   TCTGCCTATC  TTGTTGCTGA  CTACATTGAA  GTCATTAGCA  AGCACAATGA  TGACAGCCAG  660
661   TATGTATGGG  AATCAAAGGC  TAACGGTAAA  TTTGCTGTTT  CCGAGGATAC  ATGGAATGAG  720
721   CCTCTTGGAC  GTGGAACCGA  GATTAGATTA  CATCTTAGGG  ATGAAGCTGG  CGAGTACCTA  780
781   GAAGAAAGTA  AACTTAAGGA  ATTGGTGAAG  AGATATTCTG  AATTCATTAA  CTTCCCTATC  840
841   TCCCTCTGGG  CTAGCAAAGA  GGTTGAAACC  GAGGTCCCAG  TTGAGGAAGA  TGAATCAGCT  900
901   GATGAGGAAA  CTGAAACCAC  CTCTACCGAG  GAAGAAAAGG  AAGAAGATGC  TGAGGAGGAA  960
961   GATGGTGAGA  AAAAGCAGAA  AACCAAGAAG  GTGAAAGAAA  CAGTTTATGA  ATGGGAGCTT  1020
1021  CTGAATGATG  TTAAGGCTAT  ATGGCTGAGA  AGTCCAAAGG  AGGTGACAGA  GGAAGAGTAC  1080
1081  ACTAAATTCT  ACCACTCTCT  CTCAAAGGAT  TTTACCGACG  AGAAGCCAAT  GGCTTGGAGT  1140
1141  CACTTTAATG  CTGAAGGTGA  TGTTGAATTC  AAGGCTGTGT  TGTATGTTCC  TCCGAAAGCT  1200
1201  CCCCATGATC  TATACGAGAG  CTATTACAAC  AGCAACAAGG  CGAACTTGAA  GCTATATGTC  1260
1261  AGGAGGGTGT  TCATCTCAGA  TGAATTTGAT  GAGCTTCTGC  CTAAGTATTT  GAGTTTCTTG  1320
1321  AAGGGTCTTG  TTGACTCTGA  CACATTGCCT  CTAAATGTAT  CAAGAGAAAT  GCTTCAACAA  1380
1381  CACAGCAGCT  TAAAGACAAT  TAAGAAGAAG  CTTATCCGAA  AGGCGCTTGA  TATGATCCGC  1440
1441  AAGCTTGCTG  AAGAAGATCC  TGATGAAATC  CATGATGATG  AGAAAAAAGA  TGTGGAGAAG  1500
1501  TCTGGTGAGA  ACGATGAGAA  GAAGGGTCAA  TACACAAAAT  TCTGGAACGA  GTTTGGCAAG  1560
1561  TCTGTCAAAC  TAGGTATCAT  TGAGGATGCT  GCTAACAGGA  ACCGCTTGGC  AAAACTTCTT  1620
1621  CGTTTTGAGA  CAACAAAGTC  CGATGGAAAA  TTGACTTCCC  TGGATCAGTA  CATTAAGAGA  1680
1681  ATGAAAAAGA  GCCAAAAGGA  CATATTTTAC  ATCACAGGAA  GCAGCAAGGA  ACAGCTAGAG  1740
1741  AAATCTCCAT  TCCTGGAGAG  GCTCATCAAG  AAGGGCTATG  AGGTCATCTT  CTTCACAGAC  1800
1801  CCAGTTGATG  AATACTTGAT  GCAATACCTG  ATGGATTACG  AAGACAAAAA  GTTCCAGAAT  1860
1861  GTGTCCAAGG  AAGGACTGAA  GGTTGGGAAA  GATTCAAAAG  ACAAGGAGCT  GAAGGAAGCA  1920
1921  TTCAAGGAGC  TAACAAAGTG  GTGGAAAGGA  AATCTCGCTA  GCGAAAACGT  AGACGATGTC  1980
1981  AAAATCAGCA  ACCGTTTGGC  TGACACTCCA  TGTGTAGTCG  TAACATCCAA  GTTTGGATGG  2040
2041  AGTGCTAATA  TGGAGAGGAT  CATGCAGTCC  CAAACTCTCT  CGGATGCTAA  TAAGCAAGCT  2100
2101  TACATGCGCG  GAAAGAGAGT  CCTCGAGATC  AACCCACGAC  ACCCTATCAT  CAAAGAACTC  2160
2161  AAGGATAGAA  TTGCAAGTGA  CCCAGAGGAT  GAGAGTGTGA  AGGAAACAGC  ACAGCTCATG  2220
2221  TACCAGACAG  CTTTGATCGA  GAGTGGATTC  ATACTCACCG  ACCCAAAAGA  CTTTGCTGCC  2280
2281  CGTATTTATA  ACTCAGTCAA  GAGCGGTCTG  AACATCAGCC  CTGATGCAGT  AGCCGACGAG  2340
2341  GAAATCGAGG  CAGCAGAGGA  ACCAGAGACC  AGTGAGGCAA  CTGAGACGAA  ATCAGATGAC  2400
2401  TTGGCTGGTG  GTCTAAACAT  TGAAGCCGAA  CCCGTTGAGC  AACAAGAAGA  GAACACCAAG  2460
2461  GACGAACTGT  AG  2472

▼ ANNOTATION

Disorder
IUPred2A
Physicochemical
Compute pI/MwAAindex
Localization
COMPARTMENTS

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Arl-0229Arabidopsis lyrata97.450.01428
LLPS-Brn-0452Brassica napus94.050.01385
LLPS-Bro-0586Brassica oleracea93.920.01384
LLPS-Brr-0468Brassica rapa93.80.01383
LLPS-Pot-1430Populus trichocarpa87.610.0 782
LLPS-Mae-1333Manihot esculenta87.610.0 786
LLPS-Dac-0516Daucus carota87.160.0 801
LLPS-Cus-2170Cucumis sativus86.930.0 795
LLPS-Met-0496Medicago truncatula86.930.0 788
LLPS-Prp-1405Prunus persica86.90.0 796
LLPS-Thc-0278Theobroma cacao86.524e-140 442
LLPS-Viv-1383Vitis vinifera86.240.0 785
LLPS-Sol-1083Solanum lycopersicum86.194e-151 470
LLPS-Tru-1135Triticum urartu85.931e-145 458
LLPS-Sob-1375Sorghum bicolor85.822e-150 469
LLPS-Sei-0523Setaria italica85.821e-150 469
LLPS-Hea-1556Helianthus annuus85.711e-152 474
LLPS-Sot-0902Solanum tuberosum85.550.0 760
LLPS-Zem-0693Zea mays85.454e-149 465
LLPS-Glm-1695Glycine max85.023e-151 471
LLPS-Via-1195Vigna angularis85.024e-151 470
LLPS-Vir-2184Vigna radiata84.880.0 766
LLPS-Tra-2148Triticum aestivum84.75e-147 460
LLPS-Amt-1925Amborella trichopoda84.670.0 763
LLPS-Brd-0540Brachypodium distachyon84.333e-147 460
LLPS-Orr-0383Oryza rufipogon83.990.01105
LLPS-Orb-1382Oryza barthii83.990.01105
LLPS-Phv-2191Phaseolus vulgaris83.974e-149 465
LLPS-Nia-1518Nicotiana attenuata83.910.01251
LLPS-Lep-1766Leersia perrieri83.330.01192
LLPS-Ori-0110Oryza indica83.110.01197
LLPS-Orni-1741Oryza nivara83.110.01199
LLPS-Orbr-0990Oryza brachyantha82.960.01201
LLPS-Ors-0992Oryza sativa82.830.01201
LLPS-Orp-1219Oryza punctata82.780.01096
LLPS-Orgl-1351Oryza glumaepatula82.720.01197
LLPS-Org-0069Oryza glaberrima82.690.01197
LLPS-Gor-2429Gossypium raimondii82.010.01209
LLPS-Mua-1116Musa acuminata80.370.01181
LLPS-Php-1798Physcomitrella patens75.574e-123 398
LLPS-Sem-1856Selaginella moellendorffii75.282e-127 410
LLPS-Chr-1361Chlamydomonas reinhardtii70.526e-114 373
LLPS-Miv-0391Microbotryum violaceum62.385e-78 273
LLPS-Orm-0577Oryza meridionalis61.322e-73 260
LLPS-Cii-0155Ciona intestinalis60.34e-63 231
LLPS-Abg-1489Absidia glauca59.729e-76 266
LLPS-Drm-0096Drosophila melanogaster59.722e-71 254
LLPS-Urm-1065Ursus maritimus59.132e-71 254
LLPS-Hos-0844Homo sapiens59.132e-71 254
LLPS-Mam-0102Macaca mulatta59.132e-71 254
LLPS-Caf-2777Canis familiaris59.132e-71 254
LLPS-Poa-0251Pongo abelii59.132e-71 254
LLPS-Cas-0545Carlito syrichta59.132e-71 254
LLPS-Cea-0472Cercocebus atys59.132e-71 254
LLPS-Maf-0551Macaca fascicularis59.132e-71 254
LLPS-Chs-0852Chlorocebus sabaeus59.132e-71 254
LLPS-Caj-0065Callithrix jacchus59.132e-71 254
LLPS-Gog-0051Gorilla gorilla59.132e-71 254
LLPS-Mal-0477Mandrillus leucophaeus59.132e-71 254
LLPS-Paa-2223Papio anubis59.132e-71 254
LLPS-Mup-0230Mustela putorius furo59.132e-71 254
LLPS-Cis-0485Ciona savignyi58.771e-69 249
LLPS-Leo-0184Lepisosteus oculatus58.656e-71 253
LLPS-Bot-1373Bos taurus58.654e-71 254
LLPS-Ova-0115Ovis aries58.654e-71 254
LLPS-Aim-2395Ailuropoda melanoleuca58.656e-71 254
LLPS-Crn-0985Cryptococcus neoformans58.496e-72 256
LLPS-Lac-3075Latimeria chalumnae58.418e-72 256
LLPS-Xet-0387Xenopus tropicalis58.296e-71 253
LLPS-Dar-1009Danio rerio58.172e-70 252
LLPS-Cym-0073Cyanidioschyzon merolae58.13e-72 257
LLPS-Mel-0789Melampsora laricipopulina57.552e-71 254
LLPS-Pof-2632Poecilia formosa57.412e-72 257
LLPS-Spr-0136Sporisorium reilianum57.415e-74 261
LLPS-Xim-1480Xiphophorus maculatus57.412e-72 258
LLPS-Put-0779Puccinia triticina57.216e-72 256
LLPS-Anc-1968Anolis carolinensis56.812e-70 252
LLPS-Osl-0555Ostreococcus lucimarinus56.742e-70 251
LLPS-Scf-2685Scleropages formosus56.52e-72 258
LLPS-Ten-1260Tetraodon nigroviridis56.486e-72 255
LLPS-Loa-0363Loxodonta africana56.251e-73 261
LLPS-Rhb-3503Rhinopithecus bieti56.255e-74 261
LLPS-Sah-0727Sarcophilus harrisii56.257e-73 259
LLPS-Pes-1314Pelodiscus sinensis56.075e-52 197
LLPS-Scm-2448Scophthalmus maximus56.021e-70 253
LLPS-Cogr-0855Colletotrichum graminicola50.00.0 598
LLPS-Nef-0130Neosartorya fischeri48.790.0 577
LLPS-Scj-0912Schizosaccharomyces japonicus48.790.0 608
LLPS-Ved-0533Verticillium dahliae47.730.0 576
LLPS-Blg-0383Blumeria graminis47.580.0 580
LLPS-Pyt-0490Pyrenophora teres47.360.0 585