• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Loa-1334
CSDE1

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Cold shock domain containing E1
Gene Name: CSDE1
Ensembl Gene: ENSLAFG00000007150.4
Ensembl Protein: ENSLAFP00000006015.4
Organism: Loxodonta africana
Taxa ID: 9785
LLPS Type: LLPS regulator


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
P-body, Stress granulePredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblENSLAFT00000007150.4ENSLAFP00000006015.4
UniProtG3SZH0, G3SZH0_LOXAF

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     FFNTSNFHPL  KRVLKEESAN  TTESAIFDYR  CEMSFDPNLL  HNNGHNGYPN  GTSAALRETG  60
61    VIEKLLTSYG  FIQCSERQAR  LFFHCSQYNG  NLQDLKVGDD  VEFEVSSDRR  TGKPIAVKLV  120
121   KIKPEILPEE  RMNGQEVFYL  TYTPEDVEGN  VQLETGDKIN  FVIDNNKHTG  AVSARNIMLL  180
181   KKKQTRCQGV  VCAMKEAFGF  IERGDVVKEI  FFHYSEFKGD  LEFLQPGDDV  EFTIKDRNGK  240
241   EVATDVRLLP  QGTVIFEDIS  IEHFEGTVTK  VIPKVPSKNQ  NDPLPGRIKV  DFVIPKELPF  300
301   GDKDTKSKVT  LLEGDHVRFN  ISTDRRDKLE  RATNIEVLSN  TFQFTNEARE  MGVIAAMRDG  360
361   FGFIKCVDRD  ARMFFHFSEI  LDGNQLHIAD  EVEFTVVPDM  LSAQRNHAIR  IKKLPKGTVS  420
421   FHSHPDHRFL  GTVEKEATFS  NPKTTSPNKG  KEKEAEDGII  AYDDCGVKLT  IAFQAKDVEG  480
481   SAPPQIGDKV  EFSISDKQRP  GQQMAACVRL  IVRNSSSKRF  LGYVAALKDN  FGFIETANHD  540
541   KEIFFHYSEF  SGDVDSLELG  DMVEYSLSKG  KGNKISAEKV  NKTHSVNGIT  EEADPTIYSG  600
601   KVIRPLRSVD  PTQTEYQGMI  EIVEEGDMKG  EVYPFGIVGM  ANKGDCLQKG  ESVKFQLCVL  660
661   GQNAQTMAYN  ITPLRRATVE  CVKDQFGFIN  YEVGDSKKLF  FHVKEVQDGV  ELQAGDEVEF  720
721   SVILNQRTGK  CSACNVWRVC  EGPKTVAAPR  PDRLVNRLKN  ITLDDASAPR  LMVLRQPRGP  780
781   DNSMGFGAER  KIRQAGVID  799
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     TTTTTTAATA  CTAGCAACTT  TCATCCTTTG  AAACGTGTGC  TGAAAGAAGA  ATCAGCAAAT  60
61    ACTACTGAAA  GTGCAATATT  TGATTATCGC  TGCGAGATGA  GCTTTGATCC  AAACCTTCTC  120
121   CACAACAATG  GACACAATGG  GTACCCCAAT  GGTACTTCAG  CAGCACTGCG  TGAAACTGGG  180
181   GTTATTGAAA  AACTGCTAAC  CTCTTACGGA  TTTATTCAGT  GTTCAGAACG  TCAAGCTAGA  240
241   CTTTTCTTCC  ACTGTTCACA  GTATAATGGC  AACCTGCAGG  ACTTAAAAGT  AGGAGATGAT  300
301   GTTGAATTTG  AAGTATCCTC  TGACCGGCGG  ACTGGGAAAC  CCATTGCTGT  TAAACTGGTG  360
361   AAGATAAAAC  CAGAAATCCT  CCCTGAAGAA  CGAATGAATG  GACAAGAAGT  GTTTTATCTG  420
421   ACTTATACCC  CTGAAGATGT  TGAAGGGAAT  GTTCAGCTGG  AGACCGGAGA  TAAAATAAAC  480
481   TTTGTAATTG  ATAACAATAA  ACATACTGGT  GCTGTAAGTG  CTCGTAATAT  TATGCTGTTG  540
541   AAAAAGAAGC  AAACTCGCTG  TCAGGGAGTA  GTTTGTGCCA  TGAAGGAGGC  GTTTGGCTTT  600
601   ATTGAAAGAG  GTGATGTTGT  AAAAGAGATA  TTCTTTCACT  ATAGTGAATT  TAAGGGTGAC  660
661   CTAGAATTCT  TACAGCCTGG  AGATGATGTG  GAGTTCACAA  TCAAGGACAG  AAATGGTAAA  720
721   GAAGTTGCAA  CAGATGTCAG  ACTATTGCCT  CAAGGAACAG  TCATTTTTGA  AGATATCAGC  780
781   ATTGAACATT  TTGAAGGAAC  TGTAACCAAA  GTTATCCCAA  AAGTACCCAG  TAAAAACCAG  840
841   AATGACCCAT  TGCCAGGACG  CATCAAAGTT  GATTTTGTGA  TTCCTAAAGA  ACTTCCCTTT  900
901   GGAGACAAAG  ATACAAAATC  CAAGGTGACC  CTTCTGGAAG  GTGACCATGT  TAGGTTTAAT  960
961   ATTTCAACAG  ACCGACGTGA  TAAATTAGAG  CGAGCAACCA  ATATAGAAGT  TCTATCAAAT  1020
1021  ACATTTCAGT  TCACTAATGA  AGCCAGAGAA  ATGGGTGTGA  TTGCTGCCAT  GAGAGATGGT  1080
1081  TTTGGTTTCA  TCAAGTGTGT  GGATCGTGAT  GCTCGTATGT  TCTTCCACTT  CAGTGAAATA  1140
1141  TTGGATGGGA  ACCAGCTCCA  TATTGCAGAT  GAAGTAGAGT  TTACTGTAGT  TCCTGATATG  1200
1201  CTCTCTGCCC  AAAGAAATCA  TGCTATTAGG  ATTAAAAAAC  TTCCCAAGGG  CACGGTTTCG  1260
1261  TTTCATTCCC  ATCCAGATCA  TCGTTTTCTG  GGCACTGTAG  AAAAAGAAGC  CACTTTTTCC  1320
1321  AATCCCAAAA  CCACTAGCCC  AAATAAAGGC  AAAGAGAAGG  AGGCTGAGGA  TGGCATTATT  1380
1381  GCCTATGATG  ATTGTGGGGT  GAAACTGACT  ATTGCTTTTC  AAGCCAAGGA  TGTGGAAGGA  1440
1441  TCTGCTCCTC  CTCAAATAGG  AGATAAGGTT  GAATTTAGTA  TTAGTGACAA  ACAGAGGCCC  1500
1501  GGTCAGCAGA  TGGCTGCTTG  TGTGCGACTT  ATAGTTCGTA  ATTCCAGCTC  CAAGAGGTTC  1560
1561  TTGGGTTATG  TGGCAGCGCT  GAAGGATAAT  TTTGGATTTA  TTGAAACAGC  TAATCATGAT  1620
1621  AAGGAAATCT  TCTTCCATTA  CAGTGAGTTC  TCTGGTGATG  TCGATAGCCT  GGAATTGGGG  1680
1681  GACATGGTTG  AGTATAGCTT  GTCCAAAGGC  AAGGGCAACA  AAATCAGTGC  AGAAAAAGTG  1740
1741  AATAAAACAC  ACTCAGTGAA  TGGTATTACT  GAAGAAGCTG  ATCCCACTAT  CTACTCTGGT  1800
1801  AAAGTCATTC  GCCCCCTGAG  GAGTGTTGAT  CCAACACAGA  CCGAGTACCA  AGGAATGATT  1860
1861  GAGATTGTGG  AAGAGGGGGA  TATGAAAGGT  GAGGTATATC  CATTTGGCAT  AGTTGGGATG  1920
1921  GCCAACAAAG  GGGATTGCCT  GCAGAAAGGG  GAGAGTGTCA  AGTTCCAGTT  GTGTGTCCTG  1980
1981  GGCCAGAATG  CACAGACTAT  GGCCTACAAC  ATCACACCCC  TGCGTAGGGC  CACAGTGGAG  2040
2041  TGTGTGAAAG  ATCAGTTTGG  CTTCATTAAC  TATGAAGTAG  GAGATAGCAA  GAAGCTCTTT  2100
2101  TTCCATGTGA  AAGAAGTTCA  GGATGGTGTT  GAGCTACAGG  CAGGAGATGA  GGTGGAATTC  2160
2161  TCAGTGATTC  TTAATCAGCG  TACTGGCAAA  TGCAGCGCCT  GTAATGTTTG  GCGAGTCTGC  2220
2221  GAAGGCCCCA  AGACTGTTGC  AGCTCCAAGA  CCTGATCGGT  TGGTCAATCG  CTTGAAGAAC  2280
2281  ATCACCCTGG  ATGATGCCAG  TGCTCCTCGC  CTAATGGTTC  TTCGTCAGCC  AAGGGGACCA  2340
2341  GATAACTCAA  TGGGATTTGG  TGCCGAAAGA  AAGATCCGTC  AAGCTGGTGT  CATTGAC  2397

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Caf-3218Canis familiaris97.490.01529
LLPS-Otg-2416Otolemur garnettii97.410.01556
LLPS-Eqc-3913Equus caballus97.150.01552
LLPS-Ova-2194Ovis aries96.890.01546
LLPS-Tut-0212Tursiops truncatus96.50.01543
LLPS-Aim-3374Ailuropoda melanoleuca96.50.01541
LLPS-Myl-2253Myotis lucifugus96.50.01542
LLPS-Sah-1337Sarcophilus harrisii94.420.01522
LLPS-Mod-3935Monodelphis domestica93.980.01560
LLPS-Mup-4187Mustela putorius furo93.870.01508
LLPS-Poa-2476Pongo abelii93.860.01531
LLPS-Mam-2040Macaca mulatta93.640.01537
LLPS-Fec-1216Felis catus93.640.01541
LLPS-Pat-4587Pan troglodytes93.640.01537
LLPS-Pap-3463Pan paniscus93.640.01537
LLPS-Hos-0992Homo sapiens93.640.01537
LLPS-Man-3838Macaca nemestrina93.640.01537
LLPS-Paa-0890Papio anubis93.640.01537
LLPS-Chs-2488Chlorocebus sabaeus93.640.01537
LLPS-Maf-3099Macaca fascicularis93.640.01537
LLPS-Cea-3568Cercocebus atys93.640.01537
LLPS-Gog-4013Gorilla gorilla93.640.01537
LLPS-Nol-2832Nomascus leucogenys93.520.01535
LLPS-Fud-3822Fukomys damarensis93.480.01529
LLPS-Mal-3126Mandrillus leucophaeus93.390.01532
LLPS-Sus-2809Sus scrofa93.390.01535
LLPS-Caj-4003Callithrix jacchus93.390.01536
LLPS-Mum-4786Mus musculus93.360.01523
LLPS-Aon-4623Aotus nancymaae93.270.01528
LLPS-Ran-2484Rattus norvegicus93.230.01521
LLPS-Mea-2699Mesocricetus auratus93.230.01523
LLPS-Orc-1222Oryctolagus cuniculus93.140.01533
LLPS-Cas-2577Carlito syrichta93.020.01531
LLPS-Bot-3117Bos taurus93.020.01527
LLPS-Dio-3195Dipodomys ordii92.980.01521
LLPS-Anp-1607Anas platyrhynchos91.790.01459
LLPS-Cap-2966Cavia porcellus91.00.01454
LLPS-Urm-3954Ursus maritimus90.060.01425
LLPS-Pes-3339Pelodiscus sinensis88.50.0 806
LLPS-Rhb-2845Rhinopithecus bieti88.030.01410
LLPS-Gaga-3733Gallus gallus87.980.01412
LLPS-Meg-1046Meleagris gallopavo87.980.01415
LLPS-Fia-0904Ficedula albicollis87.590.01435
LLPS-Anc-3629Anolis carolinensis87.220.01433
LLPS-Tag-2238Taeniopygia guttata86.620.01414
LLPS-Xet-0043Xenopus tropicalis82.020.01353
LLPS-Ict-0607Ictidomys tridecemlineatus79.280.01212
LLPS-Asm-3771Astyanax mexicanus76.780.01223
LLPS-Leo-0081Lepisosteus oculatus76.520.01251
LLPS-Icp-3463Ictalurus punctatus76.260.01219
LLPS-Lac-3102Latimeria chalumnae75.530.01223
LLPS-Pof-4134Poecilia formosa75.530.01040
LLPS-Ora-0449Ornithorhynchus anatinus74.940.01160
LLPS-Gaa-3484Gasterosteus aculeatus74.560.01232
LLPS-Tar-2566Takifugu rubripes74.510.01192
LLPS-Ten-1743Tetraodon nigroviridis73.567e-131 397
LLPS-Xim-1665Xiphophorus maculatus73.450.01214
LLPS-Scf-2710Scleropages formosus72.830.01189
LLPS-Orn-1943Oreochromis niloticus72.710.01212
LLPS-Dar-3070Danio rerio72.320.01206
LLPS-Scm-0270Scophthalmus maximus72.00.01204
LLPS-Orl-3384Oryzias latipes71.950.01217
LLPS-Drm-0438Drosophila melanogaster46.413e-119 392
LLPS-Cii-1759Ciona intestinalis41.336e-174 530
LLPS-Cis-0946Ciona savignyi40.524e-164 503
LLPS-Osl-1376Ostreococcus lucimarinus27.514e-1480.1