• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Fia-2489
LMNB2

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Uncharacterized protein
Gene Name: LMNB2
Ensembl Gene: ENSFALG00000011960.1
Ensembl Protein: ENSFALP00000012489.1
Organism: Ficedula albicollis
Taxa ID: 59894
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Paraspeckle, P-body, Postsynaptic densityPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MSRCPHACHP  SAMSGTPSRG  TPGGTPLSPT  RISRLQEKEE  LRQLNDRLAV  YIDRVRALEL  60
61    ENDRLLLKIS  EKEEVTTREV  SGIKSLYESE  LADARRVLDE  TAKERARLQI  EIGKLRAELE  120
121   EFNKSYKKKD  ADLSVAQGRI  KDLEVLFHRS  EAELNTVLNE  KRSLEAEVAD  LRAQLAKAED  180
181   GHAVAKKQLE  KETLMRVDLE  NRCQSLQEDL  DFRKNVFEEE  IRETRKRHEH  RLIEVDTSRQ  240
241   QEYESKMTQA  LEDLRNQHDE  QVKLYKMELE  QTYQAKLENA  KLSSDQNDKA  AGAAREELKE  300
301   ARMRIEALSY  QLSGLQKQAS  AAEDRIRELE  EMMAGEREKF  RKMLDAKERE  MTDMRDQMQL  360
361   QLTEYQELLD  VKLALDMEIS  AYRKLLEGEE  ERLKLSPSPS  SRVTVSRATS  SSSSSSTSLV  420
421   RSSRGKRKRI  EAEELSGSGT  SGIGTGSISG  SSSSSSFQMS  QQASATGSIS  IEEIDLEGKY  480
481   VQLKNNSEKD  QSLGNWRLKR  QIGDGDEIAY  KFTPKYVLRA  GQTVTIWGAD  AGVSHSPPSV  540
541   LVWKSQGSWG  TGANTRTYLV  NAEGEEVAVR  SVTKSVVVRE  NEEEEDETEY  GEEDLFNQQG  600
601   DPRTTSRGCT  VM  612
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGAGTCGCT  GCCCGCACGC  CTGCCATCCC  AGCGCCATGT  CAGGCACTCC  GAGCCGCGGC  60
61    ACCCCCGGCG  GGACTCCTCT  GTCGCCGACC  CGCATCTCAC  GGCTGCAGGA  GAAGGAGGAA  120
121   CTGCGACAGC  TCAATGACCG  CCTGGCCGTT  TACATTGACC  GTGTGCGGGC  GCTGGAGCTG  180
181   GAGAATGACC  GGCTGCTGCT  GAAGATCTCG  GAGAAGGAGG  AGGTCACCAC  CAGGGAGGTG  240
241   AGCGGAATCA  AGAGTCTCTA  TGAGTCGGAG  CTGGCTGATG  CTCGAAGAGT  TCTGGATGAA  300
301   ACTGCCAAAG  AGAGGGCTAG  ATTACAAATT  GAAATAGGAA  AACTGAGAGC  AGAACTTGAG  360
361   GAGTTCAATA  AAAGCTACAA  GAAGAAAGAT  GCAGATTTGT  CTGTGGCTCA  GGGTCGCATC  420
421   AAGGATCTGG  AAGTTCTCTT  CCATAGAAGT  GAAGCAGAGC  TCAATACTGT  CCTGAATGAG  480
481   AAACGCAGTC  TGGAAGCAGA  GGTGGCTGAT  CTGCGTGCCC  AGCTTGCTAA  GGCTGAAGAT  540
541   GGTCATGCTG  TGGCAAAGAA  GCAGTTGGAG  AAGGAGACAC  TTATGCGTGT  GGACCTGGAA  600
601   AATCGGTGCC  AGAGTTTGCA  AGAGGATCTG  GACTTCAGGA  AGAATGTATT  TGAGGAGGAA  660
661   ATAAGGGAAA  CAAGAAAACG  ACACGAACAT  CGTTTGATTG  AGGTGGACAC  AAGCCGCCAA  720
721   CAGGAGTATG  AATCCAAAAT  GACTCAGGCT  CTGGAGGATC  TGCGAAATCA  GCATGATGAA  780
781   CAAGTCAAAC  TGTATAAGAT  GGAGCTGGAG  CAGACCTATC  AGGCTAAGCT  TGAGAATGCC  840
841   AAATTGTCCT  CTGACCAAAA  TGACAAAGCT  GCTGGTGCAG  CTCGAGAGGA  GCTGAAGGAA  900
901   GCTCGCATGA  GGATAGAAGC  TCTCAGCTAC  CAGCTTTCTG  GTCTTCAGAA  ACAGGCCAGT  960
961   GCAGCAGAAG  ATCGCATTCG  GGAGCTGGAG  GAAATGATGG  CTGGTGAGCG  GGAGAAGTTT  1020
1021  AGGAAGATGC  TGGATGCAAA  GGAGAGGGAA  ATGACCGACA  TGAGGGACCA  GATGCAGCTT  1080
1081  CAGCTTACGG  AGTACCAAGA  GCTGCTTGAT  GTTAAATTAG  CGCTGGACAT  GGAGATCAGT  1140
1141  GCTTACCGGA  AACTCCTGGA  AGGAGAAGAG  GAAAGGTTGA  AACTCTCTCC  AAGTCCCTCC  1200
1201  TCCCGTGTCA  CAGTCTCTCG  AGCTACCTCC  AGCAGCAGCA  GCAGCAGCAC  TTCGCTTGTT  1260
1261  CGCTCTTCCC  GAGGCAAGAG  AAAGCGCATT  GAAGCAGAGG  AGCTTTCCGG  CAGTGGAACA  1320
1321  AGTGGCATTG  GCACGGGGAG  TATCAGTGGC  AGCAGCAGTA  GCAGTAGCTT  TCAAATGTCC  1380
1381  CAGCAAGCTT  CAGCTACAGG  AAGTATCAGC  ATAGAAGAGA  TAGACCTGGA  GGGAAAATAT  1440
1441  GTTCAGCTTA  AGAACAACTC  AGAGAAGGAT  CAGTCCTTGG  GTAACTGGAG  ACTGAAAAGA  1500
1501  CAAATTGGAG  ATGGAGACGA  AATTGCTTAC  AAATTTACTC  CTAAGTATGT  CCTCAGAGCT  1560
1561  GGACAGACTG  TTACAATCTG  GGGTGCAGAT  GCGGGCGTGT  CTCACAGCCC  CCCCTCTGTT  1620
1621  CTGGTGTGGA  AGAGCCAAGG  CAGCTGGGGC  ACCGGGGCAA  ATACCCGCAC  GTACCTCGTC  1680
1681  AACGCTGAAG  GAGAGGAAGT  TGCAGTGAGA  AGCGTTACTA  AATCAGTAGT  TGTGCGAGAG  1740
1741  AATGAAGAGG  AAGAAGACGA  AACAGAATAC  GGAGAGGAAG  ACCTTTTCAA  TCAACAGGGC  1800
1801  GATCCCAGAA  CAACCTCTAG  AGGATGCACA  GTGATGTGA  1839

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Tag-2235Taeniopygia guttata98.030.0 951
LLPS-Caj-2300Callithrix jacchus84.662e-99 314
LLPS-Sah-1384Sarcophilus harrisii83.840.0 786
LLPS-Mea-2268Mesocricetus auratus83.190.0 547
LLPS-Dio-1094Dipodomys ordii82.710.0 534
LLPS-Pes-1885Pelodiscus sinensis82.620.0 754
LLPS-Poa-2077Pongo abelii80.370.0 660
LLPS-Hos-1497Homo sapiens78.60.0 764
LLPS-Pat-3324Pan troglodytes78.420.0 763
LLPS-Fud-0458Fukomys damarensis77.565e-155 461
LLPS-Ict-1285Ictidomys tridecemlineatus77.40.0 729
LLPS-Sus-1191Sus scrofa77.240.0 721
LLPS-Ora-1730Ornithorhynchus anatinus77.220.0 617
LLPS-Pap-1603Pan paniscus76.620.0 677
LLPS-Otg-3327Otolemur garnettii76.450.0 764
LLPS-Gog-1150Gorilla gorilla76.422e-143 434
LLPS-Nol-1953Nomascus leucogenys76.240.0 709
LLPS-Xet-2733Xenopus tropicalis75.730.0 762
LLPS-Cap-0574Cavia porcellus75.56e-161 482
LLPS-Chs-2418Chlorocebus sabaeus75.210.0 762
LLPS-Paa-1031Papio anubis75.040.0 760
LLPS-Cea-1611Cercocebus atys74.870.0 758
LLPS-Mam-2701Macaca mulatta74.870.0 760
LLPS-Man-0085Macaca nemestrina74.870.0 759
LLPS-Myl-1237Myotis lucifugus74.656e-137 420
LLPS-Loa-2339Loxodonta africana74.630.0 731
LLPS-Rhb-0150Rhinopithecus bieti74.580.0 753
LLPS-Mup-0126Mustela putorius furo74.570.0 753
LLPS-Fec-1818Felis catus74.40.0 760
LLPS-Bot-0817Bos taurus73.550.0 736
LLPS-Asm-1296Astyanax mexicanus73.228e-164 488
LLPS-Aon-0733Aotus nancymaae71.60.0 728
LLPS-Mum-0894Mus musculus71.330.0 717
LLPS-Icp-2872Ictalurus punctatus71.234e-168 499
LLPS-Eqc-0433Equus caballus70.474e-146 445
LLPS-Ran-1731Rattus norvegicus68.880.0 729
LLPS-Orn-0081Oreochromis niloticus68.092e-150 453
LLPS-Xim-1195Xiphophorus maculatus67.811e-159 477
LLPS-Dar-3048Danio rerio67.70.0 683
LLPS-Lac-1287Latimeria chalumnae67.520.0 693
LLPS-Pof-1334Poecilia formosa67.242e-157 471
LLPS-Orl-0033Oryzias latipes66.383e-154 463
LLPS-Scf-0112Scleropages formosus65.450.0 691
LLPS-Gaa-2260Gasterosteus aculeatus65.345e-152 457
LLPS-Scm-2112Scophthalmus maximus65.242e-152 459
LLPS-Tar-0266Takifugu rubripes64.675e-147 444
LLPS-Ten-0329Tetraodon nigroviridis62.998e-140 426
LLPS-Mod-1852Monodelphis domestica59.266e-128 398
LLPS-Meg-2532Meleagris gallopavo59.022e-1686.7
LLPS-Ere-0048Erinaceus europaeus58.972e-127 397
LLPS-Orc-0021Oryctolagus cuniculus58.693e-127 396
LLPS-Tut-0526Tursiops truncatus58.42e-126 394
LLPS-Mal-4209Mandrillus leucophaeus58.47e-127 395
LLPS-Maf-2362Macaca fascicularis58.47e-127 395
LLPS-Caf-2407Canis familiaris58.43e-126 397
LLPS-Anp-2884Anas platyrhynchos58.142e-84 278
LLPS-Urm-1891Ursus maritimus56.69e-89 293
LLPS-Ova-1051Ovis aries54.20.0 546
LLPS-Gaga-0639Gallus gallus53.951e-180 533
LLPS-Anc-1355Anolis carolinensis53.762e-127 395
LLPS-Aim-2140Ailuropoda melanoleuca52.995e-175 517
LLPS-Leo-2642Lepisosteus oculatus49.492e-159 477
LLPS-Cas-3831Carlito syrichta47.618e-128 395
LLPS-Cae-0484Caenorhabditis elegans43.524e-1995.5
LLPS-Drm-2307Drosophila melanogaster38.571e-64 230
LLPS-Cii-1519Ciona intestinalis37.085e-54 197
LLPS-Cis-1761Ciona savignyi36.063e-48 180