• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Fia-1028
APP

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Amyloid beta precursor protein
Gene Name: APP
Ensembl Gene: ENSFALG00000011958.1
Ensembl Protein: ENSFALP00000012506.1
Organism: Ficedula albicollis
Taxa ID: 59894
LLPS Type: Scaffold


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Centrosome/Spindle pole bodyPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblENSFALT00000012556.1ENSFALP00000012506.1
UniProtU3KBV2, U3KBV2_FICAL
GeneBankAGTO01010866

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     ALAGLKCQIV  RLKLFFSFQV  PADGNAGLLA  EPQIAMFCGK  LNMHMNVQNG  KWESDPSGTK  60
61    TCIGTKEGIL  QYCQEVYPEL  QITNVVEANQ  PVTIQNWCKR  GWKQCNGHPH  IVVPYRCLVG  120
121   EFVSDALLVP  DKCKFLHQER  MDVCETHLHW  HTVAKESCSE  KSMNLHDYGM  LLPCGIDKFR  180
181   GVEFVCCPLA  EESENLDSAD  AEDDDSDVWW  GGADADYADG  SDDKAVEEQA  EEDEELTVEI  240
241   EETGEEYEEA  TERTTSIATT  TTTTTESVEE  VVREVCSEQA  ETGPCRAMIS  RWYFDVAEGK  300
301   CAPFFYGGCG  GNRNNFDSEE  YCMAVCGSII  PTTAASTPDA  VDKYLETPGD  ENEHAHFQKA  360
361   KERLEAKHRE  RMSQVMREWE  EAERQAKNLP  KADKKAVIQH  FQEKVESLEQ  EAANERQQLV  420
421   ETHMARVEAM  LNDRRRIALE  NYITALQTVP  PRPRHVFNML  KKYVRAEQKD  RQHTLKHFEH  480
481   VRMVDPKKAA  QIRSQVMTHL  RVIYERMNQS  LSFLYNVPAV  AEEIQDEVDE  LLQKEQNYSD  540
541   DVLANMISEP  RISYGNDALM  PSLTETKTTV  ELLPVDGDFS  LDDLQPWHPF  GVDSVPANTE  600
601   NEGLVEPVDA  RPAADRGLTT  RPGSGLTNVK  TEEISEVKMD  AEFRHDSGYE  VHHQKLVFFA  660
661   EDVGSNKGAI  IGLMVGGVVI  ATVIVITLVM  LKKKQYTSIH  HGVVEVDAAV  TPEERHLSKM  720
721   QQNGYENPTY  KFFEQMQN  738
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     GCTTTGGCTG  GATTGAAATG  TCAAATTGTG  AGATTAAAAC  TTTTCTTCTC  CTTCCAGGTG  60
61    CCTGCTGATG  GAAATGCAGG  GCTGCTGGCA  GAGCCTCAGA  TTGCCATGTT  CTGTGGCAAA  120
121   CTCAACATGC  ATATGAATGT  GCAGAATGGA  AAGTGGGAAT  CAGACCCCTC  TGGCACCAAG  180
181   ACCTGCATTG  GGACGAAAGA  AGGAATTCTT  CAGTACTGCC  AGGAAGTGTA  CCCTGAATTG  240
241   CAAATCACCA  ATGTTGTTGA  AGCCAACCAG  CCAGTTACAA  TACAGAACTG  GTGCAAGAGG  300
301   GGATGGAAGC  AGTGCAATGG  TCACCCGCAT  ATTGTGGTTC  CCTACAGGTG  TCTGGTGGGC  360
361   GAGTTTGTGA  GTGATGCCCT  TCTGGTGCCA  GACAAGTGCA  AGTTCCTCCA  CCAGGAAAGA  420
421   ATGGATGTGT  GTGAAACTCA  CCTGCATTGG  CATACTGTTG  CTAAAGAGTC  CTGTAGTGAG  480
481   AAGAGCATGA  ATCTGCACGA  CTATGGCATG  CTGCTGCCCT  GTGGAATTGA  CAAGTTTCGT  540
541   GGTGTGGAGT  TTGTCTGCTG  CCCCTTAGCA  GAGGAAAGCG  AAAATCTTGA  TTCAGCTGAT  600
601   GCTGAAGATG  ATGATTCAGA  TGTCTGGTGG  GGAGGTGCAG  ATGCAGACTA  TGCAGATGGA  660
661   AGCGATGATA  AGGCTGTAGA  AGAACAAGCA  GAGGAAGATG  AGGAGCTAAC  TGTTGAAATT  720
721   GAAGAGACAG  GAGAAGAGTA  TGAGGAGGCA  ACCGAAAGAA  CCACCAGTAT  TGCAACCACG  780
781   ACCACCACAA  CTACAGAGTC  TGTGGAAGAG  GTTGTCAGAG  AGGTGTGCTC  TGAGCAAGCC  840
841   GAGACCGGGC  CGTGCCGCGC  CATGATCTCC  CGCTGGTACT  TTGACGTGGC  CGAAGGAAAG  900
901   TGCGCGCCCT  TCTTTTACGG  CGGCTGCGGC  GGGAACCGGA  ACAACTTTGA  CTCGGAGGAA  960
961   TACTGCATGG  CGGTGTGTGG  CAGCATCATC  CCTACCACAG  CTGCTAGCAC  TCCTGATGCT  1020
1021  GTTGACAAAT  ACTTGGAGAC  ACCTGGAGAT  GAGAATGAAC  ATGCCCATTT  CCAGAAAGCC  1080
1081  AAGGAGAGGC  TTGAAGCTAA  GCATCGTGAA  AGAATGTCTC  AGGTCATGAG  AGAGTGGGAA  1140
1141  GAGGCAGAAC  GCCAAGCAAA  GAACTTGCCA  AAGGCTGACA  AGAAAGCTGT  TATCCAGCAT  1200
1201  TTCCAGGAGA  AAGTGGAATC  ACTGGAACAG  GAAGCAGCAA  ATGAAAGACA  GCAGCTTGTG  1260
1261  GAGACTCACA  TGGCACGAGT  GGAAGCCATG  CTGAATGACC  GTCGGCGCAT  TGCTCTGGAG  1320
1321  AACTACATCA  CAGCCCTGCA  GACTGTCCCA  CCCAGGCCTC  GTCACGTGTT  CAACATGCTG  1380
1381  AAGAAGTACG  TGCGTGCTGA  GCAGAAGGAC  AGACAGCACA  CTCTCAAACA  CTTCGAGCAC  1440
1441  GTCCGCATGG  TAGACCCCAA  GAAAGCTGCC  CAAATCAGAT  CTCAGGTTAT  GACACATCTA  1500
1501  CGAGTGATAT  ATGAACGCAT  GAACCAGTCT  CTCTCCTTCC  TCTACAATGT  GCCTGCTGTG  1560
1561  GCAGAGGAGA  TCCAGGATGA  AGTTGATGAA  TTACTTCAGA  AAGAACAAAA  CTACTCTGAT  1620
1621  GATGTTTTGG  CCAATATGAT  CAGCGAACCC  AGAATCAGCT  ATGGAAATGA  TGCTCTTATG  1680
1681  CCTTCATTGA  CGGAAACAAA  GACCACAGTT  GAACTTCTTC  CAGTGGATGG  AGACTTCAGC  1740
1741  CTAGATGACC  TTCAGCCATG  GCATCCCTTT  GGAGTTGATT  CTGTTCCAGC  CAATACTGAA  1800
1801  AATGAAGGCC  TAGTTGAGCC  CGTTGATGCC  CGTCCAGCTG  CAGACAGAGG  ACTCACCACA  1860
1861  CGACCAGGTT  CTGGGCTGAC  CAATGTTAAG  ACAGAAGAGA  TATCTGAGGT  GAAGATGGAC  1920
1921  GCAGAGTTTC  GGCATGACTC  AGGATACGAA  GTTCATCATC  AAAAGCTGGT  GTTCTTTGCT  1980
1981  GAAGATGTGG  GTTCAAATAA  AGGTGCCATC  ATTGGACTAA  TGGTGGGAGG  TGTTGTCATA  2040
2041  GCAACAGTGA  TTGTCATTAC  TTTGGTGATG  CTGAAGAAGA  AGCAGTACAC  ATCTATTCAT  2100
2101  CATGGGGTTG  TGGAGGTGGA  TGCTGCAGTG  ACACCAGAGG  AACGCCACCT  TTCCAAGATG  2160
2161  CAGCAAAATG  GCTACGAAAA  TCCCACATAC  AAGTTCTTTG  AACAGATGCA  GAACTAG  2217

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Meg-2010Meleagris gallopavo99.481e-122 391
LLPS-Tag-2371Taeniopygia guttata99.482e-122 391
LLPS-Gaga-2756Gallus gallus98.963e-120 385
LLPS-Mod-2930Monodelphis domestica96.177e-176 527
LLPS-Sah-2307Sarcophilus harrisii95.430.0 871
LLPS-Dio-2728Dipodomys ordii94.271e-113 368
LLPS-Urm-2455Ursus maritimus93.711e-100 333
LLPS-Sus-1763Sus scrofa93.530.0 877
LLPS-Mup-1440Mustela putorius furo93.530.0 879
LLPS-Caf-1233Canis familiaris93.530.0 876
LLPS-Fud-0935Fukomys damarensis93.320.0 873
LLPS-Bot-0673Bos taurus93.320.0 875
LLPS-Ova-3063Ovis aries93.320.0 874
LLPS-Fec-2141Felis catus93.320.0 876
LLPS-Loa-1564Loxodonta africana93.320.0 873
LLPS-Cap-0068Cavia porcellus93.320.0 874
LLPS-Aon-4600Aotus nancymaae93.262e-114 369
LLPS-Ict-0588Ictidomys tridecemlineatus93.231e-113 367
LLPS-Chs-0807Chlorocebus sabaeus93.110.0 871
LLPS-Maf-2589Macaca fascicularis93.110.0 871
LLPS-Cea-2904Cercocebus atys93.110.0 870
LLPS-Caj-0189Callithrix jacchus93.110.0 871
LLPS-Aim-0364Ailuropoda melanoleuca93.110.0 871
LLPS-Myl-1807Myotis lucifugus93.110.0 871
LLPS-Paa-2768Papio anubis93.110.0 871
LLPS-Hos-2530Homo sapiens93.110.0 868
LLPS-Pap-0939Pan paniscus93.110.0 871
LLPS-Man-0549Macaca nemestrina93.110.0 871
LLPS-Rhb-2390Rhinopithecus bieti93.110.0 871
LLPS-Orc-0216Oryctolagus cuniculus93.110.0 873
LLPS-Mam-0552Macaca mulatta93.110.0 871
LLPS-Nol-2004Nomascus leucogenys93.110.0 870
LLPS-Gog-1731Gorilla gorilla92.930.0 869
LLPS-Cas-1402Carlito syrichta92.90.0 872
LLPS-Mal-1573Mandrillus leucophaeus92.720.0 868
LLPS-Pat-3091Pan troglodytes92.720.0 866
LLPS-Ran-0691Rattus norvegicus92.690.0 866
LLPS-Mum-0954Mus musculus92.480.0 864
LLPS-Mea-3987Mesocricetus auratus92.275e-114 369
LLPS-Poa-3126Pongo abelii92.191e-112 364
LLPS-Lac-2015Latimeria chalumnae91.32e-39 159
LLPS-Xet-2588Xenopus tropicalis90.291e-107 352
LLPS-Ora-1908Ornithorhynchus anatinus89.944e-108 343
LLPS-Anc-0267Anolis carolinensis87.861e-115 373
LLPS-Eqc-4276Equus caballus87.568e-114 370
LLPS-Leo-2697Lepisosteus oculatus84.781e-105 346
LLPS-Pof-2036Poecilia formosa84.021e-98 328
LLPS-Scf-0034Scleropages formosus83.331e-104 344
LLPS-Icp-0734Ictalurus punctatus80.466e-99 328
LLPS-Dar-3358Danio rerio79.92e-102 338
LLPS-Scm-0263Scophthalmus maximus78.874e-99 329
LLPS-Asm-0352Astyanax mexicanus73.947e-84 288
LLPS-Gaa-0777Gasterosteus aculeatus73.335e-85 291
LLPS-Orl-4026Oryzias latipes72.124e-83 286
LLPS-Tar-2185Takifugu rubripes71.521e-80 281
LLPS-Xim-1656Xiphophorus maculatus71.434e-80 278
LLPS-Orn-4105Oreochromis niloticus71.264e-82 283
LLPS-Ten-0790Tetraodon nigroviridis67.279e-74 259
LLPS-Ere-0575Erinaceus europaeus59.091e-1268.9
LLPS-Cii-0997Ciona intestinalis45.17e-0857.0
LLPS-Cae-1115Caenorhabditis elegans39.884e-32 137
LLPS-Drm-1324Drosophila melanogaster39.528e-31 134