• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Dac-0405
DCAR_026423

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Nuclear pore complex protein
Gene Name: DCAR_026423
Ensembl Gene: DCAR_026423
Ensembl Protein: KZM89348
Organism: Daucus carota
Taxa ID: 79200
LLPS Type: Client


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Chromatin, Nuclear pore complex, NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ FUNCTION

Functions as a component of the nuclear pore complex (NPC).

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblKZM89348KZM89348
UniProtA0A164UTM4, A0A164UTM4_DAUCS
GeneBankLNRQ01000007KZM89348.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MEIDMIEPED  IAVRERFRRY  GKRPLPPKSY  EIRSNSALII  ENIKQELESF  DAAAHSQGIA  60
61    SNTHSNFNRR  SLIDSHGGSE  IEAASNAVLQ  FGNHPLKICK  TEDDDLTYSG  DAMFAFFAQL  120
121   LDSTLQGLMP  VSDLILKLEK  ECRDVSKSIR  YGSEKLRIGE  DKLMRQTARL  LLDEAASWSL  180
181   LWHLYGKGSE  EFPEDLVVTP  TTSHLEACQF  VVEDHTAQLC  LRIIQWLEGL  AAKSLDLDNE  240
241   IRGSHVGTHL  PSTGVWHHTQ  RLLRKGVSNP  KIIHHLDFDA  PTREHAQALP  DDKKQDESLL  300
301   EDVWILLRAG  RLEEACNLCR  SAGQPWRAAT  LCAFGGLDHF  PSVEALMKNG  KNRSLQAVEL  360
361   ESGIGHQRRL  WKWASYVASE  RIAEEEGSKY  EAAIYASQCS  NLKRILSICT  DWEELTSLQS  420
421   ACWAMAKSWF  NVQVDMELAR  FQPGAISQLK  SCEDAIENSP  GEQVCVSQPI  AGPESWPLQV  480
481   LNQQPRDLSA  LLQNLHSSDV  VHEAVHRGCR  EQHRQIEMRL  MLGDIPQLLD  LIWSWISPSE  540
541   DDQNVFRPRG  DPQMIRFGAH  LVLVLRYLLA  EEMADTFKEK  IMTLGDLIIH  MYAMFLFSKQ  600
601   HEDLVGIYAS  QLARHRCIDL  FVHMMELRLN  GSVHVRYNIF  LSAIGYLPFT  AEDETKGSFI  660
661   EIIERVLSRS  RELKVENYEK  ASIVAEQHRI  QSKQKAMVIQ  WLCFTPPSTI  TDVKSVSAKL  720
721   LFRALMHSNV  LFREFSLLSM  WRVPAMPVGA  HTLLSLLAEP  LNQLTDSAEG  YDVTENLKEF  780
781   NDWSEYYSCD  ATYRNWLKID  MENAEVAPHE  LSGEEKQRAV  AAARETLDSS  LQLLQRSGNS  840
841   WLILAENGID  ESPEPVFLEL  HATAMLCLPS  GECMSPDPTV  CTTLMSCLYS  SVSEEVVLNR  900
901   QLMVDVTMAA  KNNYCINVVL  RCLAAEGDGL  GPHELNDGGL  LATVIASGFK  GELVRFQAGS  960
961   TIEISRIDAW  YSNSEGSLEE  PATYIVRGLC  RRCCIPEIIL  RCMQVSVSLM  ESGNLPEGHD  1020
1021  DFIELVSCPE  TRFLCLFSQQ  QLQEFLLYER  DFSICKMAEL  QDEPIS  1066
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGAGATCG  ATATGATTGA  GCCGGAAGAT  ATCGCCGTCC  GAGAGCGTTT  TCGCCGTTAC  60
61    GGAAAAAGAC  CGTTACCTCC  AAAATCTTAC  GAAATCAGGT  CAAACTCCGC  GCTGATTATC  120
121   GAAAATATCA  AACAAGAGCT  TGAGAGTTTT  GATGCTGCTG  CACATTCACA  AGGAATTGCA  180
181   TCAAACACAC  ATTCTAATTT  TAACAGGAGA  TCCTTGATTG  ATAGTCATGG  AGGGTCCGAG  240
241   ATTGAAGCTG  CTTCTAATGC  AGTTCTTCAA  TTCGGAAATC  ATCCCCTCAA  AATATGCAAA  300
301   ACCGAGGACG  ATGACTTAAC  GTATAGTGGA  GACGCAATGT  TTGCTTTCTT  TGCTCAGCTT  360
361   CTGGATTCTA  CTCTTCAAGG  TTTAATGCCC  GTCTCTGATT  TGATATTGAA  ACTGGAGAAA  420
421   GAATGTCGTG  ATGTGTCAAA  GTCAATAAGG  TATGGCAGTG  AGAAACTAAG  GATTGGAGAG  480
481   GACAAACTAA  TGAGGCAGAC  CGCTCGACTT  CTACTAGACG  AGGCTGCTTC  CTGGTCTCTT  540
541   CTGTGGCATC  TTTACGGCAA  AGGCAGTGAA  GAATTTCCAG  AAGATCTAGT  CGTGACTCCA  600
601   ACAACATCTC  ACTTGGAGGC  TTGCCAGTTT  GTTGTGGAAG  ATCACACAGC  ACAACTTTGC  660
661   CTTAGAATCA  TCCAGTGGCT  TGAAGGTTTA  GCTGCTAAAT  CTCTTGATTT  GGATAATGAG  720
721   ATTCGAGGTT  CTCATGTTGG  TACTCATTTG  CCTAGTACAG  GGGTTTGGCA  CCATACTCAA  780
781   CGCTTATTAC  GAAAGGGCGT  CTCAAATCCA  AAAATTATCC  ATCATTTGGA  TTTTGATGCT  840
841   CCAACTCGGG  AACATGCTCA  GGCACTGCCT  GATGACAAAA  AACAAGATGA  ATCACTTTTG  900
901   GAAGATGTCT  GGATTCTGTT  AAGGGCTGGA  AGACTGGAAG  AGGCATGCAA  TCTTTGCCGA  960
961   TCTGCTGGAC  AGCCATGGAG  GGCTGCAACT  TTATGTGCTT  TTGGAGGATT  GGATCACTTT  1020
1021  CCGTCGGTTG  AAGCTTTAAT  GAAAAATGGC  AAGAACAGAA  GCCTGCAAGC  AGTTGAGCTG  1080
1081  GAAAGTGGGA  TTGGTCATCA  ACGCCGTCTT  TGGAAATGGG  CTTCCTATGT  TGCATCTGAG  1140
1141  AGGATTGCAG  AGGAAGAGGG  CAGTAAATAT  GAAGCAGCAA  TTTATGCTTC  CCAATGCAGT  1200
1201  AACTTGAAGC  GCATTCTTTC  TATTTGCACA  GATTGGGAGG  AACTGACCAG  TTTGCAGTCT  1260
1261  GCCTGCTGGG  CAATGGCCAA  GTCATGGTTC  AATGTTCAGG  TTGACATGGA  ATTAGCTCGC  1320
1321  TTTCAACCGG  GTGCTATAAG  TCAGTTAAAA  AGCTGTGAAG  ATGCTATTGA  AAATAGTCCT  1380
1381  GGAGAACAGG  TTTGTGTTTC  TCAGCCAATA  GCTGGACCGG  AAAGTTGGCC  TCTCCAAGTA  1440
1441  TTGAATCAGC  AACCTCGAGA  TCTTTCTGCG  CTTCTGCAGA  ATCTCCATTC  TAGTGATGTG  1500
1501  GTGCATGAAG  CTGTTCATCG  CGGCTGCAGA  GAGCAGCATA  GGCAAATTGA  GATGCGTCTT  1560
1561  ATGCTAGGAG  ATATACCACA  GCTTCTGGAT  CTTATCTGGT  CGTGGATATC  GCCTTCTGAA  1620
1621  GATGATCAAA  ATGTCTTCAG  GCCTCGTGGT  GATCCACAAA  TGATTAGGTT  TGGTGCACAT  1680
1681  TTAGTGCTTG  TGCTTCGATA  TTTACTTGCA  GAAGAGATGG  CAGATACTTT  CAAAGAGAAG  1740
1741  ATAATGACTC  TTGGTGACCT  CATCATACAC  ATGTACGCAA  TGTTTTTATT  TTCCAAACAA  1800
1801  CACGAGGATT  TGGTCGGAAT  CTATGCTTCT  CAGCTGGCAA  GGCATCGGTG  CATTGATCTG  1860
1861  TTTGTGCACA  TGATGGAGTT  GCGGCTTAAT  GGAAGTGTGC  ATGTCAGATA  TAATATATTC  1920
1921  CTTTCAGCTA  TAGGGTACTT  GCCATTCACT  GCTGAAGATG  AAACAAAGGG  CAGTTTTATT  1980
1981  GAAATTATAG  AAAGGGTTCT  ATCAAGATCA  AGAGAATTAA  AAGTTGAAAA  TTATGAAAAA  2040
2041  GCTTCCATTG  TGGCAGAGCA  GCATAGAATA  CAAAGTAAAC  AGAAAGCTAT  GGTGATTCAG  2100
2101  TGGCTCTGCT  TTACGCCGCC  TTCGACAATC  ACTGATGTTA  AGAGTGTTAG  TGCCAAACTT  2160
2161  CTCTTTCGAG  CACTGATGCA  CAGCAATGTC  CTGTTCCGGG  AATTTTCTCT  TCTGTCTATG  2220
2221  TGGAGAGTAC  CAGCAATGCC  CGTTGGAGCT  CACACCTTGC  TTAGTTTACT  TGCTGAGCCC  2280
2281  TTGAATCAGC  TTACAGATTC  TGCTGAGGGT  TATGATGTTA  CTGAAAATCT  GAAGGAGTTC  2340
2341  AATGACTGGA  GTGAGTACTA  CTCATGTGAT  GCAACTTACC  GCAATTGGCT  AAAGATTGAT  2400
2401  ATGGAGAATG  CCGAAGTTGC  TCCTCACGAA  TTATCAGGTG  AGGAAAAGCA  AAGAGCAGTT  2460
2461  GCAGCAGCAA  GAGAAACATT  AGATTCATCA  CTGCAGCTGT  TACAAAGAAG  CGGAAATTCG  2520
2521  TGGTTAATTC  TGGCTGAAAA  TGGTATAGAT  GAATCACCCG  AACCTGTATT  TTTGGAGTTA  2580
2581  CATGCAACTG  CAATGCTTTG  TCTTCCTTCT  GGTGAGTGCA  TGTCTCCAGA  TCCCACTGTG  2640
2641  TGCACTACAT  TAATGAGTTG  CCTTTACTCT  TCAGTGAGTG  AGGAAGTTGT  GCTGAATCGC  2700
2701  CAATTAATGG  TAGATGTCAC  CATGGCAGCT  AAGAACAATT  ACTGCATTAA  TGTTGTGCTT  2760
2761  CGCTGCTTGG  CAGCAGAGGG  TGACGGGCTG  GGACCACATG  AACTCAATGA  TGGTGGTCTT  2820
2821  CTTGCTACTG  TAATTGCATC  AGGCTTCAAA  GGTGAGCTTG  TTCGATTTCA  AGCTGGATCA  2880
2881  ACAATTGAGA  TCTCTAGAAT  CGATGCCTGG  TATTCAAACA  GTGAAGGTTC  TTTGGAGGAA  2940
2941  CCAGCAACAT  ACATTGTGAG  GGGGCTTTGT  CGCAGGTGTT  GCATTCCAGA  AATTATTCTT  3000
3001  CGCTGTATGC  AGGTTTCTGT  TTCACTTATG  GAGTCTGGAA  ATCTACCCGA  AGGCCATGAC  3060
3061  GATTTTATTG  AACTCGTGTC  ATGCCCTGAA  ACTAGATTTT  TGTGTTTGTT  TAGTCAGCAA  3120
3121  CAGTTACAGG  AATTCTTGTT  GTACGAGAGA  GATTTCTCTA  TATGCAAGAT  GGCGGAGCTT  3180
3181  CAGGATGAAC  CTATCTCCTG  A  3201

▼ KEYWORD

ID
Family
Complete proteome
Membrane
mRNA transport
Nuclear pore complex
Nucleus
Protein transport
Reference proteome
Translocation
Transport

▼ GENE ONTOLOGY

ID
Classification
Description
Cellular Component
Nuclear membrane
Cellular Component
Nuclear pore outer ring
Molecular Function
Structural constituent of nuclear pore
Biological Process
MRNA export from nucleus
Biological Process
Posttranscriptional tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery
Biological Process
Protein import into nucleus

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Nia-0949Nicotiana attenuata79.319e-97 311
LLPS-Viv-0499Vitis vinifera74.660.01333
LLPS-Glm-0882Glycine max70.980.01201
LLPS-Via-0736Vigna angularis70.760.01149
LLPS-Thc-0246Theobroma cacao70.420.01434
LLPS-Mae-0806Manihot esculenta69.560.01518
LLPS-Sol-0436Solanum lycopersicum69.180.01506
LLPS-Prp-0056Prunus persica67.650.01457
LLPS-Pot-0081Populus trichocarpa67.610.01471
LLPS-Mua-0352Musa acuminata66.070.01160
LLPS-Hea-0042Helianthus annuus65.740.01325
LLPS-Gor-1084Gossypium raimondii65.450.01443
LLPS-Phv-0381Phaseolus vulgaris64.410.01389
LLPS-Bro-1318Brassica oleracea64.230.01380
LLPS-Brn-2831Brassica napus64.190.01382
LLPS-Brr-1354Brassica rapa64.040.01382
LLPS-Cus-0704Cucumis sativus63.890.01335
LLPS-Coc-0239Corchorus capsularis63.50.0 784
LLPS-Met-0186Medicago truncatula63.060.01371
LLPS-Sot-1967Solanum tuberosum63.011e-1990.5
LLPS-Art-0044Arabidopsis thaliana62.370.01362
LLPS-Arl-0743Arabidopsis lyrata62.120.01361
LLPS-Ors-2095Oryza sativa61.376e-180 541
LLPS-Orni-0118Oryza nivara60.380.01221
LLPS-Ori-0059Oryza indica60.380.01220
LLPS-Brd-0622Brachypodium distachyon60.320.01188
LLPS-Tra-0274Triticum aestivum60.290.01184
LLPS-Orgl-1944Oryza glumaepatula60.290.01221
LLPS-Orb-0063Oryza barthii60.230.01224
LLPS-Orr-1556Oryza rufipogon60.190.01219
LLPS-Sei-0774Setaria italica59.830.01197
LLPS-Sob-1753Sorghum bicolor59.590.01162
LLPS-Orbr-0274Oryza brachyantha59.380.01202
LLPS-Orp-0190Oryza punctata59.060.01059
LLPS-Amt-0668Amborella trichopoda58.940.01253
LLPS-Orm-1397Oryza meridionalis58.870.01208
LLPS-Hov-1092Hordeum vulgare58.70.01146
LLPS-Vir-0291Vigna radiata58.640.01183
LLPS-Tru-0492Triticum urartu58.590.01152
LLPS-Zem-0422Zea mays57.30.01100
LLPS-Lep-1455Leersia perrieri56.270.01103
LLPS-Php-0937Physcomitrella patens46.430.0 845
LLPS-Sem-0893Selaginella moellendorffii43.130.0 744
LLPS-Cym-0918Cyanidioschyzon merolae35.42e-0656.6
LLPS-Cis-0081Ciona savignyi31.031e-1171.6
LLPS-Gaa-0174Gasterosteus aculeatus28.753e-25 117
LLPS-Dio-0009Dipodomys ordii28.193e-23 110
LLPS-Gas-0165Galdieria sulphuraria28.142e-0656.6
LLPS-Sus-0153Sus scrofa28.121e-25 119
LLPS-Man-1420Macaca nemestrina28.112e-21 105
LLPS-Loa-0191Loxodonta africana27.748e-23 109
LLPS-Mup-1682Mustela putorius furo27.74e-22 107
LLPS-Otg-2095Otolemur garnettii27.567e-24 113
LLPS-Bot-1589Bos taurus27.152e-23 111
LLPS-Mum-0016Mus musculus27.158e-23 109
LLPS-Pap-0112Pan paniscus27.143e-24 114
LLPS-Pat-0091Pan troglodytes27.144e-24 114
LLPS-Myl-0097Myotis lucifugus27.13e-22 107
LLPS-Caf-1983Canis familiaris27.062e-21 104
LLPS-Ova-2810Ovis aries26.978e-24 112
LLPS-Fud-0904Fukomys damarensis26.967e-25 116
LLPS-Tar-1060Takifugu rubripes26.849e-24 112
LLPS-Leo-1078Lepisosteus oculatus26.833e-29 130
LLPS-Aon-0503Aotus nancymaae26.771e-25 118
LLPS-Ict-0347Ictidomys tridecemlineatus26.773e-24 114
LLPS-Orc-1764Oryctolagus cuniculus26.593e-24 114
LLPS-Ran-0061Rattus norvegicus26.553e-24 114
LLPS-Mal-0615Mandrillus leucophaeus26.56e-24 113
LLPS-Chs-0325Chlorocebus sabaeus26.56e-24 113
LLPS-Scm-1602Scophthalmus maximus26.482e-24 114
LLPS-Mea-1496Mesocricetus auratus26.378e-23 109
LLPS-Gog-0161Gorilla gorilla26.341e-24 115
LLPS-Nol-0628Nomascus leucogenys26.342e-24 115
LLPS-Rhb-1687Rhinopithecus bieti26.328e-25 115
LLPS-Orl-1124Oryzias latipes26.33e-24 114
LLPS-Paa-1516Papio anubis26.286e-24 113
LLPS-Aim-0389Ailuropoda melanoleuca26.283e-20 101
LLPS-Maf-0518Macaca fascicularis26.281e-23 112
LLPS-Cea-0281Cercocebus atys26.287e-24 113
LLPS-Poa-0506Pongo abelii26.284e-25 117
LLPS-Mam-0006Macaca mulatta26.281e-23 112
LLPS-Hos-1595Homo sapiens26.282e-24 114
LLPS-Osl-0360Ostreococcus lucimarinus26.146e-36 152
LLPS-Urm-1042Ursus maritimus26.145e-21 103
LLPS-Eqc-0188Equus caballus26.097e-22 106
LLPS-Fec-2551Felis catus26.092e-22 108
LLPS-Sah-0067Sarcophilus harrisii25.899e-21 103
LLPS-Pof-1560Poecilia formosa25.841e-25 118
LLPS-Asm-2360Astyanax mexicanus25.824e-28 127
LLPS-Anp-0187Anas platyrhynchos25.793e-21 104
LLPS-Meg-2145Meleagris gallopavo25.724e-25 117
LLPS-Cap-2076Cavia porcellus25.74e-20 100
LLPS-Caj-0549Callithrix jacchus25.698e-26 119
LLPS-Gaga-0973Gallus gallus25.631e-24 115
LLPS-Scf-2412Scleropages formosus25.511e-30 135
LLPS-Cas-0744Carlito syrichta25.465e-23 110
LLPS-Dar-0163Danio rerio25.271e-29 131
LLPS-Xet-0200Xenopus tropicalis25.03e-1791.7
LLPS-Cii-0341Ciona intestinalis24.881e-22 108
LLPS-Pes-0727Pelodiscus sinensis24.771e-23 112
LLPS-Ora-1760Ornithorhynchus anatinus24.623e-21 104
LLPS-Chr-1317Chlamydomonas reinhardtii24.552e-1274.7
LLPS-Tum-0011Tuber melanosporum24.542e-1275.9
LLPS-Lac-1869Latimeria chalumnae24.491e-1792.8
LLPS-Spr-0574Sporisorium reilianum24.41e-1379.7
LLPS-Scc-1030Schizosaccharomyces cryophilus23.961e-1173.2
LLPS-Anc-0395Anolis carolinensis23.829e-24 112
LLPS-Fia-1139Ficedula albicollis23.684e-23 110
LLPS-Usm-0322Ustilago maydis23.439e-1686.7
LLPS-Tag-2093Taeniopygia guttata23.117e-22 106
LLPS-Drm-1384Drosophila melanogaster22.698e-1067.4
LLPS-Mel-0041Melampsora laricipopulina21.423e-0965.5
LLPS-Scp-0839Schizosaccharomyces pombe21.252e-0966.2
LLPS-Pug-0072Puccinia graminis20.852e-1069.3
LLPS-Scj-0681Schizosaccharomyces japonicus20.54e-1068.2