• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Coc-2275
CCACVL1_02366

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Single-stranded nucleic acid binding R3H
Gene Name: CCACVL1_02366
Ensembl Gene: CCACVL1_02366
Ensembl Protein: OMP03560
Organism: Corchorus capsularis
Taxa ID: 210143
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
P-body, Stress granule, OthersPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblOMP03560OMP03560
UniProtA0A1R3K8Y3, A0A1R3K8Y3_COCAP
GeneBankAWWV01006023OMP03560.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MTRTRKAAEA  MRIQVTQLLE  KFRESKEEVY  TFEAGLSKND  RAFVHRTCRK  MGLQSKSSGL  60
61    GKQRRLSVYK  KKGQLNNMNE  RGSLTNVTFS  EGAQMVLQDL  FAYYPPEDGE  LQEKLIGKYS  120
121   GKTAKVRKKK  DDIFSKPLMS  GTEVSEKVKS  LASRIKKDPK  LRQINEERLK  LPIASFKEVI  180
181   TSTVESHQVV  LISGETGCGK  TTQVPQFLLE  HMWGKGEACK  IVCTQPRRIS  AISVSERIAN  240
241   ERGENVGNDV  GYKIRLESKG  GRHSSIVFCT  NGVLLRVLVS  SSRLKRREDI  ADLTYIIMDE  300
301   IHERDSYCDF  MMTIIRDILP  LNPHLRLVLM  SATLDAERFS  QYFGGCPIIR  VPGFTYPVKA  360
361   FYLEDVLSIL  KSEENNHLVS  PTATVPDEDL  ELTEEDRIAL  DEAINLAWSS  DEFDLLLDLV  420
421   SVEGGRTVHN  YQHSLTGVTP  LMVFAGKGRV  ADVCMLLSFG  VDCHLRAKDG  KRALEFAEQG  480
481   NQQEAAEIIK  RHMESLPSSS  GKQPQLLDRY  IVAVDTDIID  VVLIEQLLRK  ICNDSNEGAI  540
541   LVFLPGWEDI  NRTREKLLAN  PLFKDSSRFL  IISLHSMVPS  AEQRKVFKRP  PAGCRKIVLS  600
601   TNIAESSITI  DDVVYVIDSG  RMKEKSYDPY  NNVSTLQSSW  ISKANAKQRE  GRAGRCQPGI  660
661   CYHLYTKLRA  ASMADFQVPE  IKRMPIEELC  LQVKLLDPNC  KVEDFLQKTL  DPPVSEAIRN  720
721   AIIVLQDIGA  LSHDEELTEL  GEKLGYLPVH  PLTSRMLFFA  ILMNCLDPAL  TLACASDFRD  780
781   PFVLPMFPNE  KKKAAAARDE  LASLYGGQSD  QLAVVAAFDG  WKHAKERGNE  AFFCSKYFVS  840
841   ISTMNMLFGM  RNQLQAELMR  HGFIQDDVSS  CSLNARDPGI  VHAVLVAGLY  PMVGRLVPLR  900
901   QGNRFLVETA  GGSKVRLHCH  SINSKLSLKR  SDDCPLIVYD  EITRGDGGMH  IKNCTVVGPL  960
961   PLLLLATEIA  VVPPKGNGDN  EDDNSDGDAS  DDADECNTEG  GEMMMVDKSN  GNKEKVMSSP  1020
1021  DNSVILVVDR  WLSFRSTALD  VAQMYCLRER  LSAAILSKVK  HPRQVLNPVL  GASIYAIACI  1080
1081  LSYDGLSGIS  IQGESVDSLT  LRVRDTEIDK  PMPGRRGQGP  NTSRLPVDSS  SHQKAKLPAT  1140
1141  NGIEPSSYNE  QALAMSAGQS  LHQAPSQASI  SDASSSGVSK  QDSERNSCKR  RRGKKSKR  1198
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGACGAGGA  CGAGAAAAGC  GGCTGAAGCC  ATGAGAATCC  AAGTGACCCA  ACTGCTTGAG  60
61    AAGTTTCGGG  AATCAAAAGA  AGAAGTCTAT  ACCTTTGAAG  CCGGCCTTTC  AAAAAATGAC  120
121   CGAGCATTCG  TGCACAGGAC  ATGCCGGAAA  ATGGGTCTTC  AATCCAAAAG  TTCTGGGCTT  180
181   GGTAAACAGA  GACGTCTCTC  TGTCTACAAA  AAAAAAGGGC  AACTCAACAA  TATGAACGAA  240
241   AGGGGGAGTC  TCACTAATGT  GACATTTTCG  GAGGGGGCAC  AAATGGTTTT  GCAGGACTTA  300
301   TTTGCATATT  ATCCCCCTGA  GGATGGAGAA  CTTCAAGAGA  AATTGATTGG  AAAATATAGT  360
361   GGAAAGACTG  CTAAAGTACG  AAAAAAGAAA  GATGATATTT  TTTCCAAGCC  ATTAATGAGT  420
421   GGCACAGAGG  TTTCTGAGAA  GGTTAAATCA  CTTGCATCTA  GGATTAAGAA  AGATCCGAAA  480
481   TTGAGACAGA  TTAATGAAGA  GAGGTTAAAG  CTGCCAATTG  CATCATTTAA  GGAAGTCATT  540
541   ACATCTACAG  TAGAATCTCA  CCAGGTTGTC  CTCATTTCTG  GTGAGACTGG  GTGTGGAAAG  600
601   ACAACACAGG  TTCCACAATT  CCTTTTGGAG  CATATGTGGG  GAAAAGGAGA  GGCTTGTAAA  660
661   ATAGTATGTA  CTCAGCCGCG  GCGTATATCT  GCTATATCAG  TGTCTGAGAG  AATTGCTAAT  720
721   GAAAGAGGAG  AAAATGTTGG  AAATGATGTT  GGATACAAGA  TTCGCTTGGA  AAGTAAAGGT  780
781   GGCCGGCACT  CATCGATTGT  TTTCTGCACA  AATGGTGTAC  TTCTAAGGGT  GCTGGTTTCC  840
841   AGCAGTCGGT  TGAAGAGGAG  AGAAGACATT  GCTGACTTGA  CTTACATCAT  TATGGATGAA  900
901   ATTCATGAAA  GGGACAGCTA  CTGTGATTTC  ATGATGACAA  TCATCAGGGA  CATTCTTCCT  960
961   TTGAATCCTC  ATTTACGGCT  GGTATTGATG  AGTGCTACTC  TTGATGCCGA  ACGGTTTTCA  1020
1021  CAATATTTTG  GCGGTTGCCC  TATTATCCGC  GTCCCTGGGT  TTACATATCC  TGTAAAAGCT  1080
1081  TTCTATTTAG  AGGATGTGCT  GTCTATCTTG  AAATCTGAAG  AGAATAATCA  TCTTGTTTCA  1140
1141  CCTACCGCAA  CTGTCCCAGA  CGAAGACTTG  GAATTAACAG  AAGAAGATAG  GATTGCATTA  1200
1201  GATGAAGCTA  TTAATTTGGC  TTGGTCAAGT  GATGAATTTG  ATCTCCTTCT  AGATTTGGTT  1260
1261  TCTGTTGAAG  GAGGGCGAAC  AGTTCATAAC  TACCAGCATT  CTTTGACTGG  AGTAACGCCA  1320
1321  CTGATGGTAT  TTGCTGGAAA  GGGTAGAGTG  GCTGATGTTT  GCATGCTTCT  ATCATTTGGC  1380
1381  GTGGACTGCC  ATCTAAGGGC  CAAGGACGGG  AAAAGAGCTT  TGGAGTTTGC  AGAGCAGGGA  1440
1441  AACCAGCAGG  AAGCTGCTGA  AATAATAAAA  AGGCATATGG  AAAGTCTCCC  TTCCAGTTCT  1500
1501  GGGAAACAAC  CACAGTTACT  GGATAGATAC  ATAGTAGCAG  TTGATACTGA  CATTATTGAT  1560
1561  GTTGTTCTTA  TTGAGCAGTT  ATTAAGGAAG  ATATGTAATG  ATTCAAATGA  AGGAGCTATC  1620
1621  CTCGTTTTCC  TTCCTGGGTG  GGAGGATATA  AATAGAACCA  GAGAGAAATT  ACTTGCCAAC  1680
1681  CCCCTTTTTA  AAGATTCTTC  CAGATTTCTT  ATAATATCTC  TGCATTCAAT  GGTTCCATCT  1740
1741  GCAGAACAGA  GGAAGGTCTT  TAAACGTCCA  CCTGCGGGTT  GCCGCAAAAT  TGTCCTTTCA  1800
1801  ACCAATATTG  CCGAAAGTTC  CATTACAATT  GATGATGTTG  TCTATGTTAT  AGATAGTGGT  1860
1861  CGAATGAAAG  AGAAGAGCTA  TGATCCTTAT  AATAATGTAT  CAACCCTTCA  GTCCTCATGG  1920
1921  ATTTCCAAAG  CAAATGCCAA  GCAACGAGAG  GGGCGTGCAG  GCCGGTGTCA  GCCTGGAATT  1980
1981  TGTTATCATC  TTTATACAAA  ACTTCGAGCA  GCTTCTATGG  CAGATTTCCA  AGTTCCAGAA  2040
2041  ATTAAGAGAA  TGCCAATTGA  GGAGCTCTGT  TTACAGGTGA  AACTGCTTGA  TCCAAATTGC  2100
2101  AAAGTAGAGG  ATTTCTTGCA  AAAGACATTG  GATCCTCCTG  TTTCTGAAGC  CATACGTAAT  2160
2161  GCAATTATTG  TTCTTCAAGA  TATTGGGGCT  CTCTCACATG  ATGAGGAACT  GACAGAACTT  2220
2221  GGAGAGAAGC  TTGGTTATCT  TCCTGTTCAC  CCATTGACGA  GCAGGATGCT  TTTCTTTGCC  2280
2281  ATATTGATGA  ACTGCCTTGA  TCCAGCTTTG  ACTTTAGCAT  GTGCCTCGGA  CTTCAGGGAT  2340
2341  CCATTTGTCC  TCCCCATGTT  TCCAAATGAA  AAGAAGAAGG  CTGCTGCTGC  TAGGGATGAG  2400
2401  CTTGCCTCAT  TATATGGTGG  GCAAAGTGAT  CAGCTGGCAG  TCGTAGCTGC  TTTTGATGGC  2460
2461  TGGAAGCATG  CAAAAGAAAG  GGGTAATGAA  GCATTCTTTT  GTTCAAAATA  CTTTGTCTCA  2520
2521  ATAAGCACCA  TGAATATGCT  ATTTGGCATG  CGTAATCAGC  TCCAGGCTGA  ACTAATGCGG  2580
2581  CATGGGTTTA  TTCAAGATGA  CGTCTCAAGT  TGTAGTCTAA  ATGCACGTGA  CCCTGGGATA  2640
2641  GTCCATGCGG  TCCTTGTGGC  TGGTTTGTAT  CCAATGGTTG  GGAGGTTGGT  CCCTCTTAGA  2700
2701  CAGGGCAACC  GATTTCTTGT  AGAGACTGCT  GGTGGCAGCA  AAGTTCGGTT  ACACTGTCAC  2760
2761  TCAATCAATT  CTAAGTTATC  ACTTAAGCGA  TCTGATGATT  GCCCTTTGAT  TGTATATGAT  2820
2821  GAAATAACCC  GTGGTGATGG  TGGTATGCAC  ATAAAGAACT  GTACTGTTGT  TGGGCCACTT  2880
2881  CCATTGTTAC  TGCTTGCAAC  AGAGATTGCT  GTGGTTCCTC  CAAAAGGGAA  TGGTGACAAT  2940
2941  GAAGATGATA  ACAGCGATGG  TGATGCAAGT  GATGATGCCG  ATGAATGTAA  CACTGAAGGA  3000
3001  GGTGAAATGA  TGATGGTAGA  TAAGTCCAAT  GGAAATAAAG  AGAAGGTCAT  GTCCTCTCCT  3060
3061  GATAACTCTG  TTATATTGGT  TGTTGATCGG  TGGCTTTCAT  TCAGATCAAC  AGCGCTTGAT  3120
3121  GTTGCTCAAA  TGTACTGCTT  GAGAGAACGA  TTATCTGCAG  CAATCTTATC  CAAAGTAAAG  3180
3181  CATCCACGCC  AAGTTCTTAA  TCCTGTTCTT  GGGGCTTCTA  TATATGCAAT  AGCCTGCATT  3240
3241  TTGTCGTATG  ATGGGCTATC  AGGCATTTCA  ATTCAAGGAG  AATCTGTGGA  TTCACTGACA  3300
3301  TTGAGGGTAC  GTGATACTGA  GATTGACAAA  CCCATGCCAG  GGAGGAGAGG  TCAGGGTCCA  3360
3361  AATACAAGTA  GGTTGCCAGT  TGACAGTTCA  AGTCACCAGA  AAGCCAAGCT  CCCTGCAACA  3420
3421  AATGGAATCG  AGCCCTCAAG  TTACAATGAA  CAGGCACTGG  CAATGTCAGC  TGGTCAGAGC  3480
3481  CTACATCAGG  CTCCATCCCA  AGCCTCTATT  TCAGATGCTT  CTTCTTCAGG  TGTGTCTAAA  3540
3541  CAGGATTCCG  AGAGGAATTC  TTGCAAGCGG  CGACGTGGGA  AGAAGTCTAA  AAGGTGA  3597

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Thc-1304Theobroma cacao83.160.01932
LLPS-Gor-0042Gossypium raimondii73.740.01731
LLPS-Viv-2125Vitis vinifera69.550.01583
LLPS-Dac-0850Daucus carota68.270.01071
LLPS-Sol-0423Solanum lycopersicum67.910.01491
LLPS-Mae-2241Manihot esculenta67.740.01576
LLPS-Nia-1489Nicotiana attenuata67.540.01516
LLPS-Pot-1236Populus trichocarpa67.210.01565
LLPS-Prp-1521Prunus persica66.70.01454
LLPS-Cus-2031Cucumis sativus66.130.01461
LLPS-Glm-0912Glycine max65.570.01448
LLPS-Via-0671Vigna angularis65.570.01474
LLPS-Hea-0024Helianthus annuus64.740.01424
LLPS-Phv-1354Phaseolus vulgaris64.240.01430
LLPS-Art-2728Arabidopsis thaliana64.220.01392
LLPS-Arl-2438Arabidopsis lyrata64.210.01409
LLPS-Vir-0072Vigna radiata64.020.01272
LLPS-Brr-0857Brassica rapa63.910.01399
LLPS-Orbr-0269Oryza brachyantha63.630.01345
LLPS-Ori-0884Oryza indica63.490.01390
LLPS-Lep-0696Leersia perrieri63.450.01387
LLPS-Org-0873Oryza glaberrima63.340.01399
LLPS-Ors-0427Oryza sativa63.240.01398
LLPS-Tra-1020Triticum aestivum62.870.01376
LLPS-Met-1107Medicago truncatula62.770.01374
LLPS-Sob-0594Sorghum bicolor61.990.01380
LLPS-Hov-0023Hordeum vulgare61.760.01350
LLPS-Brd-1230Brachypodium distachyon61.090.01380
LLPS-Orb-2122Oryza barthii60.810.01303
LLPS-Sei-0533Setaria italica60.790.01391
LLPS-Zem-1508Zea mays60.340.01365
LLPS-Orp-0686Oryza punctata60.20.01287
LLPS-Orr-1882Oryza rufipogon60.060.01283
LLPS-Orni-0109Oryza nivara60.020.01286
LLPS-Orgl-1580Oryza glumaepatula59.930.01284
LLPS-Orm-1181Oryza meridionalis59.890.01276
LLPS-Amt-0757Amborella trichopoda58.480.01248
LLPS-Tru-1211Triticum urartu57.620.01265
LLPS-Bro-0553Brassica oleracea57.490.01295
LLPS-Brn-0103Brassica napus57.280.01295
LLPS-Sem-0965Selaginella moellendorffii52.290.0 937
LLPS-Php-1747Physcomitrella patens51.810.01101
LLPS-Mea-0922Mesocricetus auratus49.772e-55 214
LLPS-Mum-4477Mus musculus49.336e-56 215
LLPS-Poa-1040Pongo abelii49.281e-53 206
LLPS-Ran-1287Rattus norvegicus48.872e-54 211
LLPS-Fec-3419Felis catus48.871e-46 187
LLPS-Ten-1969Tetraodon nigroviridis48.788e-48 191
LLPS-Sah-2287Sarcophilus harrisii48.646e-51 201
LLPS-Cii-0563Ciona intestinalis48.566e-52 197
LLPS-Ova-2594Ovis aries48.51e-47 190
LLPS-Cap-4041Cavia porcellus48.132e-50 199
LLPS-Orn-0331Oreochromis niloticus48.062e-44 179
LLPS-Pap-4711Pan paniscus47.966e-54 209
LLPS-Otg-0151Otolemur garnettii47.965e-54 209
LLPS-Maf-1694Macaca fascicularis47.661e-49 197
LLPS-Chs-4546Chlorocebus sabaeus47.667e-50 198
LLPS-Gog-3109Gorilla gorilla47.661e-49 197
LLPS-Paa-4282Papio anubis47.667e-50 197
LLPS-Mal-1326Mandrillus leucophaeus47.667e-50 197
LLPS-Myl-3523Myotis lucifugus47.669e-50 197
LLPS-Man-4678Macaca nemestrina47.667e-50 197
LLPS-Hos-2377Homo sapiens47.661e-49 197
LLPS-Pat-2401Pan troglodytes47.661e-49 197
LLPS-Orc-4051Oryctolagus cuniculus47.663e-49 195
LLPS-Rhb-1062Rhinopithecus bieti47.668e-50 197
LLPS-Mam-4469Macaca mulatta47.667e-50 197
LLPS-Nol-2524Nomascus leucogenys47.662e-49 196
LLPS-Ict-1219Ictidomys tridecemlineatus47.667e-50 197
LLPS-Gaa-2713Gasterosteus aculeatus47.572e-49 193
LLPS-Sus-3820Sus scrofa47.511e-45 184
LLPS-Aon-1817Aotus nancymaae47.516e-54 209
LLPS-Caj-2625Callithrix jacchus47.519e-54 209
LLPS-Dio-0467Dipodomys ordii47.512e-53 207
LLPS-Mup-4142Mustela putorius furo47.511e-49 197
LLPS-Urm-3555Ursus maritimus47.511e-49 197
LLPS-Caf-2885Canis familiaris47.515e-50 198
LLPS-Eqc-3725Equus caballus47.515e-50 198
LLPS-Scm-1716Scophthalmus maximus47.324e-48 192
LLPS-Xim-0395Xiphophorus maculatus47.292e-43 177
LLPS-Anc-1610Anolis carolinensis47.278e-23 109
LLPS-Fud-2159Fukomys damarensis47.25e-50 198
LLPS-Loa-3857Loxodonta africana47.062e-49 196
LLPS-Cas-0166Carlito syrichta47.062e-49 196
LLPS-Tag-1824Taeniopygia guttata46.961e-51 203
LLPS-Xet-0676Xenopus tropicalis46.789e-51 200
LLPS-Icp-3525Ictalurus punctatus46.75e-37 155
LLPS-Bot-1135Bos taurus46.614e-49 195
LLPS-Pes-3464Pelodiscus sinensis46.613e-51 202
LLPS-Lac-3189Latimeria chalumnae46.185e-51 201
LLPS-Ora-0706Ornithorhynchus anatinus45.965e-54 209
LLPS-Orl-3134Oryzias latipes45.853e-52 204
LLPS-Fia-0694Ficedula albicollis45.738e-53 205
LLPS-Mod-2318Monodelphis domestica45.115e-53 206
LLPS-Pof-2124Poecilia formosa44.72e-47 189
LLPS-Dar-2928Danio rerio44.494e-49 194
LLPS-Cea-3253Cercocebus atys44.272e-106 365
LLPS-Aim-4348Ailuropoda melanoleuca44.276e-107 367
LLPS-Asm-3184Astyanax mexicanus43.98e-108 367
LLPS-Scf-1965Scleropages formosus42.731e-43 177
LLPS-Leo-0159Lepisosteus oculatus42.375e-41 169
LLPS-Osl-1069Ostreococcus lucimarinus40.760.0 662
LLPS-Tar-2328Takifugu rubripes39.773e-45 183
LLPS-Gaga-0758Gallus gallus33.280.0 621