• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Coc-1327
CCACVL1_25522

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Argonaute/Dicer protein, PAZ
Gene Name: CCACVL1_25522
Ensembl Gene: CCACVL1_25522
Ensembl Protein: OMO58271
Organism: Corchorus capsularis
Taxa ID: 210143
LLPS Type: Scaffold


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Droplet, Nuclear speckle, Nucleolus, P-body, Stress granule, OthersPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblOMO58271OMO58271
UniProtA0A1R3GJN5, A0A1R3GJN5_COCAP
GeneBankAWWV01014235OMO58271.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MPSSSATPAH  QPSSSSGGTG  VQSVTRDVEK  LALEPAAASM  APPLPPSSSK  AVRFPQRPGR  60
61    GTVGRQCLVR  ANHFLVKVAD  NDLHHYDVSI  TPEVISKKVN  RDIMTELALK  YRQSHLGGRM  120
121   PAYDGRKSLY  TAGALPFESK  EFLVKLIDKD  RGDSSSGSAR  KERQFKVAIK  LASKPDLHYL  180
181   REFLSRRHFE  APQETIQVLD  VVLRAKPSEM  YTVVGRSFFH  TSLGTSGELG  DGVEYWMGYY  240
241   QSLRPTQMGL  SLNIDLSARS  FYEPILVTEF  IAKHFRKRDL  SRPLSDQDRV  KVKKALKGVR  300
301   VELRHMGYVK  TSKIVSISNV  PISQLMFTLD  DKKSKVSVVQ  YFREKYSIPL  KYTNLPALQS  360
361   GTDTKPIYLP  MELCWIVKGQ  RYTKKLNDLQ  VRNLLRATCQ  RPHDRESNIK  KMVEANGFNM  420
421   DQLVNREFGI  QVQSEPAVVN  ARVLPAPRLN  YHESGREKSV  NPGFGSWNMI  NKKLVNGGRV  480
481   DSWSCVNFSS  DGRLTDRFCT  ELVKMCNTKG  MEFCQTPSIG  FRHARPERIE  QTLIEVHKES  540
541   TDKKRPLQLL  IIILPDQSGS  YGKIKRICET  ELGIVTQCCQ  PKQASRLSPQ  YLENLSLKIN  600
601   VKAGGRNTVL  DDAIQKRIPL  VTDRPTIIFG  ADVTHPQPGE  DSSPSIAAVV  ASMDWPHVTK  660
661   YRGIVSAQPH  REEIIQDLYK  TYQDPQKGVV  HAGMIRELLV  AFYKLARTKP  HRIIFYRDGV  720
721   SEGQFSQVLL  HEMDAIRKAC  NSLEENYMPP  VTFVVVQKRH  HTRLFPTDKN  FADKSGNIQA  780
781   GTVVDTQICH  PTEFDFYLNS  HAGIQGTSKP  THYHVLYDEN  KFSADIMQVL  TNNLCYTFAR  840
841   CTRSVSIVPP  AYYAHLAAFR  ARYYMEDDVS  DSGSTGGGRL  ARDRNVEVRP  LPSIKDNVKD  900
901   VMFYC  905
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGCCGTCTT  CGTCTGCGAC  TCCGGCTCAT  CAGCCCTCTT  CGAGTTCTGG  GGGTACTGGT  60
61    GTCCAATCTG  TGACGAGAGA  CGTTGAGAAG  CTTGCATTGG  AGCCAGCGGC  TGCGAGTATG  120
121   GCGCCTCCTC  TTCCACCGTC  GTCGTCAAAG  GCGGTTAGGT  TCCCGCAAAG  GCCAGGGAGG  180
181   GGTACCGTCG  GTAGACAATG  CCTTGTTAGA  GCCAATCACT  TTCTCGTTAA  AGTTGCTGAT  240
241   AATGATCTTC  ATCACTACGA  TGTTTCAATA  ACTCCTGAGG  TGATATCAAA  GAAGGTGAAC  300
301   AGAGACATAA  TGACTGAACT  GGCTCTGAAG  TATAGACAGT  CACACCTAGG  TGGTCGGATG  360
361   CCGGCGTATG  ATGGTCGGAA  GAGTTTGTAC  ACTGCTGGTG  CTCTTCCTTT  TGAGTCAAAG  420
421   GAGTTTCTTG  TCAAGTTGAT  AGATAAGGAC  CGTGGTGATT  CTTCATCTGG  CTCAGCAAGG  480
481   AAGGAAAGGC  AATTTAAGGT  GGCAATCAAG  TTGGCATCCA  AACCTGACCT  TCATTATCTG  540
541   CGGGAGTTCT  TGAGCCGTAG  ACATTTTGAA  GCACCTCAGG  AGACTATTCA  AGTGCTGGAT  600
601   GTTGTGCTTA  GGGCTAAACC  ATCTGAGATG  TATACCGTGG  TTGGAAGGTC  ATTTTTCCAC  660
661   ACTAGCCTAG  GTACCTCAGG  AGAGCTTGGT  GATGGAGTAG  AGTACTGGAT  GGGTTATTAC  720
721   CAGAGTCTTC  GACCCACTCA  AATGGGCTTA  TCTCTCAATA  TTGATTTATC  TGCTCGATCA  780
781   TTCTACGAGC  CAATTTTAGT  TACTGAATTC  ATAGCCAAGC  ATTTTAGGAA  GCGGGATCTA  840
841   TCAAGGCCTC  TGTCTGATCA  AGATCGTGTT  AAAGTGAAAA  AGGCACTGAA  AGGTGTAAGG  900
901   GTTGAACTTA  GGCACATGGG  GTATGTTAAA  ACTAGCAAGA  TTGTTAGCAT  ATCCAATGTG  960
961   CCAATAAGCC  AGTTAATGTT  TACTCTTGAT  GATAAGAAGT  CCAAGGTGTC  TGTGGTTCAG  1020
1021  TATTTCCGGG  AGAAGTACAG  TATTCCACTG  AAATATACAA  ATTTGCCTGC  CCTTCAATCT  1080
1081  GGAACTGATA  CGAAACCAAT  CTACCTGCCT  ATGGAGTTGT  GCTGGATTGT  TAAAGGGCAG  1140
1141  AGGTACACGA  AGAAGTTAAA  TGATCTTCAA  GTAAGAAATC  TACTGAGAGC  AACATGTCAA  1200
1201  CGTCCACATG  ACAGGGAGAG  TAATATCAAG  AAGATGGTTG  AAGCTAATGG  ATTCAATATG  1260
1261  GACCAACTTG  TAAATAGAGA  ATTTGGTATT  CAAGTCCAAA  GTGAACCTGC  GGTGGTTAAT  1320
1321  GCCCGAGTTT  TGCCTGCTCC  AAGGCTTAAT  TATCATGAGA  GTGGACGAGA  AAAAAGTGTA  1380
1381  AATCCTGGGT  TTGGCTCGTG  GAACATGATT  AATAAGAAAT  TGGTTAATGG  TGGGAGAGTT  1440
1441  GATTCCTGGA  GTTGCGTTAA  CTTCTCTTCA  GATGGAAGAT  TGACTGACCG  CTTCTGCACA  1500
1501  GAGTTGGTGA  AAATGTGCAA  CACCAAAGGA  ATGGAATTTT  GCCAAACTCC  TTCAATTGGT  1560
1561  TTCCGTCATG  CTCGTCCTGA  GAGAATTGAG  CAAACTCTCA  TTGAAGTTCA  CAAGGAATCT  1620
1621  ACAGACAAGA  AGAGGCCACT  TCAGTTATTG  ATAATTATTT  TACCTGATCA  GAGTGGTTCA  1680
1681  TATGGGAAAA  TTAAGCGGAT  ATGTGAGACA  GAGCTGGGTA  TTGTTACTCA  ATGCTGTCAG  1740
1741  CCCAAGCAAG  CTTCAAGGTT  AAGCCCTCAA  TATCTTGAAA  ACCTTTCCCT  GAAGATCAAT  1800
1801  GTTAAGGCTG  GGGGACGAAA  TACTGTGTTG  GATGATGCCA  TTCAAAAAAG  AATTCCACTT  1860
1861  GTGACTGATC  GACCTACAAT  TATTTTTGGT  GCGGATGTGA  CTCATCCACA  GCCCGGGGAA  1920
1921  GATTCTAGTC  CTTCAATTGC  TGCGGTGGTT  GCTTCAATGG  ATTGGCCGCA  TGTAACAAAG  1980
1981  TATCGCGGCA  TTGTCTCTGC  ACAGCCTCAT  CGTGAGGAAA  TAATCCAGGA  TCTATATAAG  2040
2041  ACATATCAGG  ATCCTCAAAA  GGGTGTAGTT  CATGCTGGAA  TGATAAGGGA  ATTGCTTGTG  2100
2101  GCTTTCTACA  AGTTAGCAAG  AACAAAACCT  CATAGGATAA  TTTTCTACAG  AGATGGTGTT  2160
2161  AGTGAAGGGC  AATTCAGTCA  AGTTTTGCTT  CATGAGATGG  ATGCAATTAG  AAAGGCCTGT  2220
2221  AACTCACTCG  AGGAGAATTA  TATGCCACCA  GTTACATTTG  TTGTGGTGCA  GAAGAGGCAT  2280
2281  CATACTCGAT  TATTTCCTAC  TGACAAAAAC  TTTGCAGATA  AGAGTGGCAA  TATCCAAGCA  2340
2341  GGTACTGTTG  TTGATACTCA  AATTTGCCAC  CCCACTGAGT  TCGACTTTTA  TCTTAATAGC  2400
2401  CATGCTGGAA  TCCAGGGAAC  AAGTAAGCCA  ACTCACTACC  ATGTCCTGTA  TGATGAGAAC  2460
2461  AAGTTTTCTG  CGGACATCAT  GCAAGTGCTC  ACCAACAATC  TGTGTTACAC  ATTTGCAAGG  2520
2521  TGTACTCGGT  CAGTTTCTAT  AGTGCCTCCT  GCATATTATG  CCCATCTTGC  AGCCTTCCGT  2580
2581  GCGCGCTACT  ACATGGAGGA  TGATGTTTCT  GACAGTGGAT  CTACTGGTGG  TGGGAGACTT  2640
2641  GCTAGGGACC  GGAATGTGGA  GGTTCGGCCT  CTTCCAAGCA  TCAAAGATAA  CGTCAAGGAC  2700
2701  GTTATGTTCT  ACTGTTGA  2718

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Thc-1901Theobroma cacao77.170.01326
LLPS-Gor-2098Gossypium raimondii75.470.01325
LLPS-Mae-1714Manihot esculenta72.160.01284
LLPS-Pot-2197Populus trichocarpa70.550.01245
LLPS-Viv-2320Vitis vinifera69.820.01229
LLPS-Prp-1392Prunus persica68.510.01203
LLPS-Bro-1056Brassica oleracea67.480.01185
LLPS-Arl-0736Arabidopsis lyrata67.440.01187
LLPS-Brn-0739Brassica napus67.250.01176
LLPS-Brr-1966Brassica rapa67.010.01175
LLPS-Art-1796Arabidopsis thaliana65.940.01160
LLPS-Phv-1577Phaseolus vulgaris64.590.01109
LLPS-Glm-1478Glycine max64.170.01108
LLPS-Dac-2097Daucus carota64.03e-29 130
LLPS-Met-1903Medicago truncatula63.860.01115
LLPS-Orbr-1527Oryza brachyantha61.50.01066
LLPS-Ors-1714Oryza sativa61.260.01076
LLPS-Ori-1484Oryza indica61.260.01077
LLPS-Orni-1187Oryza nivara61.260.01077
LLPS-Orgl-0132Oryza glumaepatula61.260.01076
LLPS-Orp-1567Oryza punctata61.150.01077
LLPS-Sob-0054Sorghum bicolor60.090.01046
LLPS-Orm-2115Oryza meridionalis59.730.01064
LLPS-Sei-1195Setaria italica59.610.01037
LLPS-Org-0245Oryza glaberrima59.590.01044
LLPS-Brd-1215Brachypodium distachyon59.590.01035
LLPS-Tru-0259Triticum urartu59.360.01025
LLPS-Tra-1601Triticum aestivum59.360.01026
LLPS-Sem-1697Selaginella moellendorffii59.330.01033
LLPS-Zem-1219Zea mays59.160.01025
LLPS-Orb-1037Oryza barthii58.960.01035
LLPS-Sot-1268Solanum tuberosum58.910.01035
LLPS-Mua-1006Musa acuminata58.840.01044
LLPS-Nia-1214Nicotiana attenuata58.570.01031
LLPS-Lep-2105Leersia perrieri58.510.01017
LLPS-Php-1196Physcomitrella patens58.190.01018
LLPS-Cus-0919Cucumis sativus58.130.01022
LLPS-Sol-0574Solanum lycopersicum58.120.01033
LLPS-Orr-2092Oryza rufipogon57.950.0 970
LLPS-Amt-0377Amborella trichopoda57.910.01033
LLPS-Via-0388Vigna angularis57.520.01012
LLPS-Vir-0542Vigna radiata57.030.01003
LLPS-Hov-0883Hordeum vulgare56.840.0 968
LLPS-Icp-1320Ictalurus punctatus45.750.0 664
LLPS-Orn-0066Oreochromis niloticus45.630.0 664
LLPS-Xim-0827Xiphophorus maculatus45.630.0 663
LLPS-Pof-2171Poecilia formosa45.510.0 661
LLPS-Asm-0287Astyanax mexicanus45.510.0 666
LLPS-Caf-0285Canis familiaris45.420.0 641
LLPS-Ten-0642Tetraodon nigroviridis45.390.0 662
LLPS-Dar-1445Danio rerio45.270.0 661
LLPS-Leo-0036Lepisosteus oculatus45.270.0 659
LLPS-Gaa-0337Gasterosteus aculeatus45.270.0 660
LLPS-Scf-1319Scleropages formosus45.270.0 664
LLPS-Fia-0314Ficedula albicollis45.240.0 657
LLPS-Gaga-1791Gallus gallus45.240.0 658
LLPS-Mod-2020Monodelphis domestica45.210.0 656
LLPS-Sah-0371Sarcophilus harrisii45.210.0 656
LLPS-Meg-1408Meleagris gallopavo45.170.0 659
LLPS-Eqc-2747Equus caballus45.170.0 660
LLPS-Anc-2268Anolis carolinensis45.110.0 658
LLPS-Pap-2421Pan paniscus45.050.0 658
LLPS-Pat-1288Pan troglodytes45.050.0 658
LLPS-Hos-1686Homo sapiens45.050.0 657
LLPS-Fec-1215Felis catus45.050.0 657
LLPS-Man-0597Macaca nemestrina45.050.0 657
LLPS-Loa-0458Loxodonta africana45.050.0 658
LLPS-Anp-2255Anas platyrhynchos45.050.0 658
LLPS-Otg-0257Otolemur garnettii45.050.0 657
LLPS-Rhb-1657Rhinopithecus bieti45.050.0 658
LLPS-Cap-1968Cavia porcellus45.050.0 657
LLPS-Mam-0317Macaca mulatta45.050.0 658
LLPS-Cas-1701Carlito syrichta45.050.0 660
LLPS-Ict-1492Ictidomys tridecemlineatus45.050.0 657
LLPS-Tag-0037Taeniopygia guttata45.050.0 658
LLPS-Mum-3526Mus musculus45.050.0 659
LLPS-Maf-2148Macaca fascicularis45.050.0 657
LLPS-Chs-2357Chlorocebus sabaeus45.050.0 658
LLPS-Ora-1431Ornithorhynchus anatinus45.050.0 657
LLPS-Aon-1901Aotus nancymaae45.050.0 658
LLPS-Sus-0984Sus scrofa45.050.0 659
LLPS-Gog-2446Gorilla gorilla45.050.0 658
LLPS-Fud-1411Fukomys damarensis45.050.0 657
LLPS-Caj-1086Callithrix jacchus45.050.0 658
LLPS-Tut-0067Tursiops truncatus45.050.0 657
LLPS-Dio-1607Dipodomys ordii45.050.0 658
LLPS-Bot-1928Bos taurus45.050.0 657
LLPS-Ran-1814Rattus norvegicus45.050.0 658
LLPS-Mal-1649Mandrillus leucophaeus45.050.0 657
LLPS-Mup-1124Mustela putorius furo45.050.0 657
LLPS-Aim-1246Ailuropoda melanoleuca44.940.0 652
LLPS-Paa-1348Papio anubis44.50.0 638
LLPS-Cii-0529Ciona intestinalis44.470.0 651
LLPS-Cea-2013Cercocebus atys44.360.0 628
LLPS-Cis-1295Ciona savignyi44.270.0 645
LLPS-Scm-4017Scophthalmus maximus44.120.0 620
LLPS-Xet-3559Xenopus tropicalis44.00.0 639
LLPS-Ova-3560Ovis aries43.550.0 625
LLPS-Pes-2874Pelodiscus sinensis43.510.0 632
LLPS-Orc-0262Oryctolagus cuniculus43.510.0 633
LLPS-Poa-0903Pongo abelii43.510.0 633
LLPS-Orl-3000Oryzias latipes43.440.0 644
LLPS-Tar-1591Takifugu rubripes42.860.0 620