• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Bro-2553
106305719

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: Uncharacterized protein
Gene Name: 106305719
Ensembl Gene: Bo7g097560
Ensembl Protein: Bo7g097560.1
Organism: Brassica oleracea
Taxa ID: 109376
LLPS Type: Client


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Nucleolus, siRNA bodyPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblBo7g097560.1Bo7g097560.1
UniProtA0A0D3DDA5, A0A0D3DDA5_BRAOL
RefSeqXM_013742074.1XP_013597528.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MGSRGDKGKN  VSSGGSNAEV  EQLAKGFSET  KLGPSQDDGG  EWEVISKRNK  NKPGNAAAGK  60
61    LWATAPNQNP  PRAWGGQQQQ  QGRGNNGYGR  GRGTQVSTGR  GAGRGQAMNR  GYVGASAPVT  120
121   RPPLEGGWSW  QSRPGAAQQT  VTEEVPEVED  DDVSEGEEDD  CDALDDSDED  LASDDYDSDV  180
181   SQQSHGTRKQ  NKWFKKFFDS  LDSLSIEQIN  EPQRQWHCPA  CQNGPGAIDW  YKLQPLVAHA  240
241   RTKGARRVKL  HRELAEVLDR  DLQMRGASVI  PCGEIYGQWK  GLGEEEKDHD  IVWPPMVVIM  300
301   NTRLDKDEKD  KWLGMGNPEL  LEYFNEYPAI  KARHSYGPQG  HRGISVLIFE  STATGYFEAD  360
361   RLHRDLAQKG  FDRDAWDRRR  RWFSGGVRQL  YGFLATKQDL  DSFNQHSQGK  TGLTYEMKSY  420
421   QEYVVKELRQ  IAEDNQQLNW  FKNKLTKQNK  HAKGLEESLG  ILSEKLRKTA  EDNRIVRQRT  480
481   KMQHEQNREE  MDSQDKFFKE  SIKQIHEKRD  AKEENFEMLQ  QHERAKVVDL  RKRAEEVSSF  540
541   IECQEKEMKE  FVEEREKLIE  EQEKKMADLK  KKYFEEMLDL  ERGFDKALEQ  LMSKHGLHDA  600
601   DDTEDY  606
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGGTTCAA  GGGGTGATAA  GGGAAAGAAC  GTCTCTTCGG  GTGGCTCTAA  CGCAGAGGTT  60
61    GAGCAGCTGG  CGAAAGGCTT  TTCAGAGACG  AAGCTGGGTC  CTTCACAAGA  CGATGGAGGA  120
121   GAGTGGGAGG  TCATCTCCAA  GCGGAACAAG  AACAAGCCTG  GTAACGCTGC  TGCTGGGAAG  180
181   TTATGGGCCA  CAGCTCCTAA  CCAGAACCCT  CCTAGAGCGT  GGGGTGGTCA  GCAGCAGCAG  240
241   CAAGGGAGGG  GTAACAATGG  CTACGGGAGA  GGAAGGGGAA  CGCAGGTCTC  TACTGGTCGC  300
301   GGAGCTGGGC  GTGGACAAGC  GATGAACAGA  GGGTATGTTG  GTGCTTCGGC  TCCTGTGACT  360
361   CGACCTCCTC  TGGAAGGAGG  ATGGAGTTGG  CAGTCTAGAC  CGGGCGCTGC  TCAGCAGACT  420
421   GTGACTGAGG  AGGTTCCAGA  GGTGGAGGAT  GATGATGTTT  CTGAGGGAGA  GGAGGATGAT  480
481   TGCGATGCTT  TGGATGATTC  TGATGAAGAC  CTCGCGAGTG  ATGACTACGA  CTCCGATGTG  540
541   AGCCAGCAGA  GCCATGGGAC  GAGGAAGCAG  AACAAGTGGT  TTAAGAAGTT  TTTCGACAGC  600
601   TTGGATAGCT  TGTCTATCGA  GCAGATAAAC  GAGCCACAGA  GGCAGTGGCA  TTGTCCGGCT  660
661   TGCCAGAACG  GGCCTGGCGC  TATTGACTGG  TACAAACTTC  AGCCACTTGT  AGCTCACGCG  720
721   AGGACAAAGG  GAGCTAGACG  TGTTAAGCTC  CACAGGGAAC  TGGCTGAGGT  TCTGGACAGG  780
781   GATCTGCAGA  TGAGGGGAGC  ATCTGTCATT  CCCTGCGGTG  AAATTTACGG  GCAGTGGAAG  840
841   GGTTTGGGTG  AGGAGGAAAA  GGACCATGAT  ATTGTCTGGC  CGCCAATGGT  TGTCATCATG  900
901   AATACTAGGC  TGGACAAGGA  CGAGAAAGAC  AAGTGGCTAG  GAATGGGCAA  CCCGGAGCTG  960
961   CTGGAGTACT  TTAACGAGTA  TCCTGCTATT  AAAGCACGCC  ACTCCTATGG  TCCACAGGGC  1020
1021  CATCGTGGGA  TTAGTGTTCT  GATCTTTGAG  AGTACCGCCA  CTGGCTACTT  TGAGGCTGAC  1080
1081  CGCCTACACA  GGGACTTAGC  TCAAAAGGGG  TTTGATAGAG  ACGCCTGGGA  CCGTCGCCGC  1140
1141  AGATGGTTTT  CTGGAGGTGT  TCGCCAGCTG  TATGGCTTCC  TTGCGACCAA  GCAAGATCTG  1200
1201  GATTCATTCA  ATCAACACAG  TCAAGGGAAA  ACAGGGCTGA  CGTACGAGAT  GAAGTCGTAC  1260
1261  CAGGAGTATG  TGGTGAAGGA  GCTGAGGCAG  ATCGCTGAAG  ACAATCAGCA  GCTTAACTGG  1320
1321  TTCAAGAACA  AGCTGACGAA  ACAGAACAAG  CACGCCAAGG  GGCTTGAGGA  ATCGCTGGGG  1380
1381  ATTTTGAGCG  AGAAGCTGCG  TAAAACTGCA  GAAGATAATC  GTATCGTGAG  ACAGAGAACA  1440
1441  AAGATGCAGC  ATGAGCAGAA  CCGAGAAGAG  ATGGATTCAC  AAGACAAGTT  TTTCAAAGAG  1500
1501  TCCATCAAGC  AGATACATGA  GAAAAGGGAC  GCAAAGGAAG  AGAACTTCGA  GATGCTGCAG  1560
1561  CAGCATGAGC  GTGCTAAAGT  TGTTGATTTG  CGAAAGAGGG  CTGAAGAAGT  GTCCAGCTTC  1620
1621  ATAGAATGCC  AAGAGAAAGA  GATGAAAGAG  TTTGTGGAGG  AGAGGGAGAA  GCTGATAGAA  1680
1681  GAGCAGGAGA  AGAAGATGGC  AGACTTGAAG  AAAAAGTATT  TCGAGGAGAT  GCTTGATCTT  1740
1741  GAGAGGGGAT  TTGATAAGGC  GTTGGAGCAG  CTCATGAGCA  AGCACGGCCT  CCACGATGCA  1800
1801  GATGACACAG  AAGACTACTA  G  1821

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Brr-2481Brassica rapa95.060.0 964
LLPS-Brn-2314Brassica napus94.730.0 962
LLPS-Arl-2573Arabidopsis lyrata74.20.0 781
LLPS-Art-1588Arabidopsis thaliana71.820.0 755
LLPS-Cus-2133Cucumis sativus60.431e-155 470
LLPS-Coc-2074Corchorus capsularis55.880.0 549
LLPS-Gor-1188Gossypium raimondii55.450.0 559
LLPS-Glm-1161Glycine max54.590.0 554
LLPS-Lep-2173Leersia perrieri54.393e-138 423
LLPS-Pot-1373Populus trichocarpa54.150.0 536
LLPS-Prp-2524Prunus persica53.920.0 535
LLPS-Brd-1424Brachypodium distachyon53.698e-142 432
LLPS-Phv-1096Phaseolus vulgaris53.460.0 550
LLPS-Thc-1102Theobroma cacao53.450.0 541
LLPS-Org-0991Oryza glaberrima53.081e-129 400
LLPS-Orgl-2342Oryza glumaepatula53.082e-129 401
LLPS-Orb-1546Oryza barthii53.081e-123 402
LLPS-Ori-2241Oryza indica53.089e-130 401
LLPS-Amt-0296Amborella trichopoda53.079e-119 374
LLPS-Orr-1817Oryza rufipogon52.843e-123 402
LLPS-Orm-0990Oryza meridionalis52.847e-124 403
LLPS-Orp-1317Oryza punctata52.841e-131 406
LLPS-Ors-1794Oryza sativa52.848e-130 401
LLPS-Orni-2375Oryza nivara52.844e-123 401
LLPS-Met-1287Medicago truncatula52.412e-169 504
LLPS-Mae-2106Manihot esculenta52.092e-170 507
LLPS-Hea-2579Helianthus annuus52.015e-169 502
LLPS-Sob-1684Sorghum bicolor51.734e-143 435
LLPS-Viv-0702Vitis vinifera51.311e-173 518
LLPS-Via-1261Vigna angularis51.292e-169 503
LLPS-Sol-0998Solanum lycopersicum50.43e-154 465
LLPS-Sei-0478Setaria italica50.171e-144 439
LLPS-Zem-1963Zea mays50.03e-139 425
LLPS-Hov-1885Hordeum vulgare49.741e-148 450
LLPS-Tra-1976Triticum aestivum49.744e-150 453
LLPS-Vir-1934Vigna radiata49.684e-165 493
LLPS-Orbr-1338Oryza brachyantha49.331e-129 401
LLPS-Sot-1658Solanum tuberosum49.292e-117 363
LLPS-Nia-2330Nicotiana attenuata49.115e-146 446
LLPS-Tru-1535Triticum urartu48.372e-149 452
LLPS-Mua-1156Musa acuminata47.982e-157 474
LLPS-Dac-0840Daucus carota43.911e-136 420
LLPS-Php-0640Physcomitrella patens41.861e-77 267
LLPS-Sem-0244Selaginella moellendorffii24.827e-0859.3