• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Brn-2559
BnaC05g16220D

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: BnaC05g16220D protein
Gene Name: BnaC05g16220D, GSBRNA2T00047818001
Ensembl Gene: GSBRNA2T00047818001
Ensembl Protein: CDY31513
Organism: Brassica napus
Taxa ID: 3708
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Nuclear speckle, NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblCDY31513CDY31513
UniProtA0A078H3Y2, A0A078H3Y2_BRANA
GeneBankLK032273CDY31513.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MEVVKSNKER  KKERSSDKRR  EKDRRKRRSE  RVKSSDDSED  EYDRGDDDDE  ERERRKEKER  60
61    RRRDKERGKR  RSERRKSSDS  EDEDEEDGGR  DKRRVKDKER  GHREHRDKDR  KRDREREERK  120
121   EKEREREREK  DRVRRERERE  EREKERLKER  ERREREREDG  ERDRREREKE  RSRRNRERGR  180
181   SREDGHEESD  DDVKRELKRR  RRESGERKEK  EREKSVGRSS  RHGDDNGDSP  RRKSVEEDDE  240
241   KKEKKTREEE  LEEEQKKLDE  EVEKRRRRVQ  EWQELKRKKE  EAESESKGDT  DDKELKAGKA  300
301   WTLDGESDDE  EGHPEENPET  EMDVDGETKP  GNGADAKMVE  AENEVAVTVS  EVGGDGAADE  360
361   EEIDPLDAFM  NAMVLPEVEK  LSSSTPPAIE  DSILVTKNNG  KKSDHQPKKG  FNKSLGRIMQ  420
421   GEDSDSDYSE  PKDDDDPSLE  EDDEEFMKRV  KKTKAEKLAL  VDHSKIEYEP  FRKNFYIEVK  480
481   EISRMTQEEV  NAYRKEFELK  VHGKDVPRPI  KSWHQTGLTS  KILDTMNKLK  YEKPMPIQTQ  540
541   ALPIIMSGRD  CIGVAKTGSG  KTLGFVLPML  RHIKDQPPVE  AGEGPIGLVM  APTRELVQQI  600
601   HSDIKKFSKA  LGIRCVPVYG  GSGVAQQISE  LKRGTEIVVC  TPGRMIDILC  TSSGKITNLR  660
661   RVTFLVMDEA  DRMFDMGFEP  QITRIIQNIR  PDRQTVLFSA  TFPRQVETLA  RKVLNKPIEI  720
721   QVGGRSVVNK  DITQLVEVRP  ESERFLRLLE  LLGEWYEKGK  ILVFQSDRES  TISDFKSNVC  780
781   NILIATSVAA  RGLDVKDLEL  VVNYDAPNHY  EDYVHRVGRT  GRAGRKGCAV  TFISEDDAKY  840
841   APDLVKALEL  SEQPIPDDLK  AIADGFMAKV  RQGTEQAHGT  GYGGSGFKFN  EEEEEVRKAA  900
901   KKAQAKEYGF  EEDKSDSEDE  NDVVRKAGTV  AAIAAAAKAN  AAAMNPPVTT  NQLLPNGGGL  960
961   TSLPGTLPVT  IPVLPNDGAG  RAAAMVAAIN  LQHNLAKIQA  DAMPEHYEAE  LEINDFPQNA  1020
1021  RWKVTHKETL  GPISDWTGAA  ITTRGQFYPP  GRILGPGERK  LYLFIEGPTE  KSVKTAKVEL  1080
1081  KRVLEDITNQ  AMSLPGGSQA  GKYSVI  1106
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGAGGTCG  TTAAATCCAA  TAAGGAGAGG  AAGAAGGAGA  GGAGTTCTGA  TAAGCGCCGG  60
61    GAGAAGGATA  GACGGAAGAG  GCGGTCTGAG  AGAGTTAAGA  GTAGTGATGA  TTCTGAAGAT  120
121   GAGTACGATA  GAGGGGATGA  TGATGATGAA  GAGAGGGAGA  GGCGTAAAGA  AAAGGAGAGG  180
181   AGGCGGAGGG  ATAAAGAGAG  GGGGAAGAGA  CGGTCTGAGA  GAAGGAAGAG  TAGTGATTCT  240
241   GAAGATGAGG  ATGAAGAAGA  TGGCGGGAGA  GATAAACGCC  GAGTGAAGGA  CAAGGAGAGA  300
301   GGGCACAGAG  AACATAGGGA  CAAAGATCGG  AAAAGGGATA  GAGAGAGGGA  AGAGAGGAAG  360
361   GAGAAAGAAA  GAGAACGAGA  AAGGGAGAAG  GATAGAGTTA  GGAGAGAACG  GGAACGAGAG  420
421   GAGCGTGAGA  AGGAGAGACT  GAAAGAAAGA  GAGAGGCGGG  AGCGTGAACG  GGAAGATGGA  480
481   GAGAGGGATA  GGAGGGAACG  TGAGAAAGAA  AGGAGTAGGA  GGAACCGGGA  AAGGGGGAGG  540
541   TCAAGGGAGG  ATGGACATGA  AGAGAGTGAT  GATGATGTCA  AGCGTGAACT  GAAACGTAGA  600
601   AGAAGAGAGA  GTGGAGAACG  GAAGGAGAAG  GAGCGTGAGA  AGAGTGTTGG  TAGATCTAGC  660
661   AGGCATGGAG  ATGACAATGG  AGATAGTCCA  AGGAGAAAGA  GTGTCGAGGA  GGATGATGAA  720
721   AAGAAAGAGA  AGAAAACGAG  GGAAGAAGAA  CTAGAGGAGG  AGCAGAAGAA  GTTGGATGAG  780
781   GAGGTTGAGA  AACGAAGGAG  AAGAGTTCAG  GAGTGGCAAG  AGTTGAAGAG  GAAAAAAGAG  840
841   GAAGCTGAAA  GTGAAAGTAA  GGGTGATACG  GATGATAAAG  AGCTAAAGGC  CGGCAAGGCT  900
901   TGGACTCTTG  ATGGGGAATC  TGATGATGAA  GAAGGGCATC  CGGAGGAAAA  CCCAGAAACA  960
961   GAGATGGATG  TTGATGGAGA  AACTAAACCC  GGAAATGGTG  CAGATGCCAA  GATGGTAGAA  1020
1021  GCGGAGAACG  AGGTGGCTGT  TACTGTCTCT  GAAGTTGGAG  GTGATGGGGC  TGCAGATGAA  1080
1081  GAGGAAATTG  ATCCTTTAGA  TGCTTTTATG  AATGCGATGG  TATTACCTGA  GGTTGAGAAG  1140
1141  CTTAGCAGCA  GTACTCCTCC  AGCAATTGAA  GATAGTATTT  TGGTAACTAA  GAATAATGGG  1200
1201  AAGAAAAGTG  ATCACCAGCC  GAAGAAAGGT  TTTAACAAAT  CCCTTGGTAG  GATAATGCAA  1260
1261  GGTGAAGATT  CTGATTCTGA  TTATTCAGAA  CCGAAGGATG  ATGATGATCC  AAGTTTAGAA  1320
1321  GAAGATGATG  AGGAGTTCAT  GAAGAGAGTA  AAGAAGACAA  AAGCAGAAAA  ATTGGCTCTT  1380
1381  GTTGACCACT  CAAAAATAGA  GTATGAACCT  TTCCGGAAGA  ACTTCTATAT  TGAAGTGAAG  1440
1441  GAGATCTCAA  GGATGACACA  AGAAGAAGTT  AACGCTTACA  GAAAGGAATT  TGAGCTGAAA  1500
1501  GTCCATGGAA  AGGATGTACC  GAGACCCATA  AAATCTTGGC  ACCAGACTGG  ACTAACCAGC  1560
1561  AAAATTTTGG  ATACCATGAA  CAAGCTCAAG  TATGAAAAGC  CAATGCCTAT  CCAAACGCAA  1620
1621  GCACTGCCAA  TCATCATGAG  CGGTCGAGAT  TGCATTGGAG  TTGCAAAAAC  CGGATCAGGT  1680
1681  AAAACGCTAG  GTTTTGTTTT  GCCTATGTTG  AGGCATATCA  AGGATCAGCC  TCCCGTTGAA  1740
1741  GCTGGCGAGG  GGCCAATCGG  GCTGGTAATG  GCACCTACTA  GGGAGCTTGT  TCAGCAGATT  1800
1801  CATAGCGATA  TCAAAAAGTT  TTCAAAGGCA  CTGGGTATAA  GATGTGTTCC  TGTGTATGGA  1860
1861  GGATCAGGAG  TTGCGCAGCA  AATTAGTGAG  CTAAAGCGAG  GGACAGAGAT  TGTTGTGTGC  1920
1921  ACTCCTGGAA  GGATGATTGA  CATTCTTTGC  ACAAGCAGTG  GGAAAATCAC  CAATCTGCGG  1980
1981  AGAGTCACAT  TTTTGGTAAT  GGATGAAGCT  GATCGCATGT  TTGACATGGG  TTTTGAGCCT  2040
2041  CAGATTACTC  GTATTATTCA  AAATATTCGA  CCTGATCGGC  AGACTGTGCT  CTTTTCTGCC  2100
2101  ACTTTTCCAC  GTCAAGTTGA  AACATTGGCA  CGTAAGGTCT  TGAACAAGCC  TATTGAAATA  2160
2161  CAGGTTGGTG  GAAGGAGTGT  TGTGAATAAG  GATATAACAC  AGTTAGTTGA  AGTCAGACCG  2220
2221  GAGAGTGAGA  GGTTCTTAAG  ACTGCTGGAA  CTTCTTGGAG  AATGGTATGA  GAAAGGAAAG  2280
2281  ATATTGGTTT  TTCAGTCTGA  TCGTGAATCA  ACAATATCTG  ATTTTAAGAG  CAATGTGTGC  2340
2341  AATATATTGA  TTGCCACAAG  TGTTGCAGCT  AGGGGTCTAG  ATGTGAAAGA  CCTTGAGTTG  2400
2401  GTTGTAAACT  ATGATGCTCC  GAACCACTAT  GAAGATTATG  TGCATCGCGT  TGGCAGGACA  2460
2461  GGAAGGGCAG  GGCGGAAAGG  CTGTGCCGTG  ACATTTATCT  CTGAAGATGA  TGCAAAATAT  2520
2521  GCACCAGATT  TAGTAAAGGC  CCTGGAACTT  TCTGAGCAGC  CAATCCCCGA  TGATCTGAAA  2580
2581  GCAATCGCTG  ACGGTTTCAT  GGCAAAGGTT  AGACAGGGTA  CTGAGCAAGC  CCATGGAACT  2640
2641  GGCTATGGAG  GTAGTGGCTT  TAAATTCAAC  GAAGAGGAGG  AAGAAGTTAG  GAAAGCAGCA  2700
2701  AAGAAAGCAC  AAGCGAAGGA  GTATGGGTTT  GAGGAAGATA  AGTCTGACTC  AGAAGATGAG  2760
2761  AATGATGTTG  TAAGAAAGGC  AGGTACTGTT  GCCGCCATTG  CTGCTGCTGC  TAAAGCTAAT  2820
2821  GCTGCTGCAA  TGAATCCTCC  TGTGACTACA  AACCAGTTGC  TGCCGAATGG  TGGTGGGCTT  2880
2881  ACCTCTCTGC  CAGGTACCCT  TCCGGTTACT  ATCCCTGTCC  TTCCTAATGA  TGGGGCAGGC  2940
2941  CGTGCTGCAG  CCATGGTTGC  TGCCATTAAC  CTGCAACATA  ACCTGGCAAA  GATTCAAGCT  3000
3001  GATGCAATGC  CTGAACACTA  TGAAGCAGAA  CTGGAGATCA  ATGATTTCCC  GCAAAACGCT  3060
3061  CGTTGGAAGG  TCACCCACAA  AGAAACATTG  GGTCCAATAT  CAGACTGGAC  TGGAGCCGCA  3120
3121  ATTACCACTA  GAGGTCAGTT  TTATCCTCCT  GGACGTATCC  TGGGACCTGG  GGAACGCAAG  3180
3181  CTCTACTTGT  TCATCGAAGG  GCCTACCGAA  AAATCCGTGA  AGACGGCGAA  AGTTGAACTC  3240
3241  AAGCGTGTTC  TTGAAGACAT  TACTAATCAG  GCTATGTCAC  TTCCTGGAGG  ATCGCAAGCT  3300
3301  GGAAAGTACT  CCGTCATATA  A  3321

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Bro-2150Brassica oleracea94.40.01338
LLPS-Brr-1063Brassica rapa91.610.01311
LLPS-Sol-0098Solanum lycopersicum86.219e-56 215
LLPS-Sot-1560Solanum tuberosum85.473e-56 217
LLPS-Pot-0354Populus trichocarpa85.473e-58 223
LLPS-Arl-2966Arabidopsis lyrata85.020.01147
LLPS-Art-0985Arabidopsis thaliana83.20.01172
LLPS-Amt-1059Amborella trichopoda82.014e-59 226
LLPS-Dac-0636Daucus carota81.363e-54 211
LLPS-Sem-0301Selaginella moellendorffii79.71e-164 504
LLPS-Viv-0106Vitis vinifera79.415e-56 216
LLPS-Sei-0974Setaria italica77.971e-51 202
LLPS-Orb-1279Oryza barthii77.126e-52 201
LLPS-Sob-0107Sorghum bicolor77.122e-51 201
LLPS-Mae-0493Manihot esculenta76.472e-56 218
LLPS-Lep-0198Leersia perrieri74.361e-48 192
LLPS-Php-0581Physcomitrella patens72.760.0 765
LLPS-Prp-0417Prunus persica72.390.01065
LLPS-Cus-0813Cucumis sativus71.720.01046
LLPS-Vir-0218Vigna radiata71.140.0 999
LLPS-Orbr-2071Oryza brachyantha71.013e-51 201
LLPS-Gor-2213Gossypium raimondii70.960.01051
LLPS-Thc-0661Theobroma cacao70.940.01040
LLPS-Coc-1183Corchorus capsularis70.660.01044
LLPS-Glm-2267Glycine max70.330.01025
LLPS-Tra-0077Triticum aestivum70.311e-45 183
LLPS-Hov-0740Hordeum vulgare70.291e-50 199
LLPS-Phv-0700Phaseolus vulgaris70.050.01032
LLPS-Met-0682Medicago truncatula69.980.01033
LLPS-Nia-0562Nicotiana attenuata69.720.01008
LLPS-Hea-0573Helianthus annuus69.020.0 984
LLPS-Orni-0133Oryza nivara68.780.0 973
LLPS-Ori-1084Oryza indica68.780.0 973
LLPS-Orgl-0742Oryza glumaepatula68.780.0 973
LLPS-Ors-0253Oryza sativa68.780.0 973
LLPS-Org-0400Oryza glaberrima68.780.0 972
LLPS-Orr-1764Oryza rufipogon68.780.0 973
LLPS-Orp-1677Oryza punctata68.430.0 966
LLPS-Orm-0129Oryza meridionalis68.430.0 973
LLPS-Osl-0551Ostreococcus lucimarinus66.430.0 570
LLPS-Chr-0764Chlamydomonas reinhardtii66.380.0 611
LLPS-Tru-0412Triticum urartu66.15e-41 167
LLPS-Brd-0796Brachypodium distachyon65.970.0 961
LLPS-Mam-1751Macaca mulatta63.932e-1585.5
LLPS-Urm-0929Ursus maritimus61.332e-176 551
LLPS-Gas-1051Galdieria sulphuraria60.819e-159 509
LLPS-Mua-1642Musa acuminata60.410.0 737
LLPS-Dio-1579Dipodomys ordii60.186e-175 547
LLPS-Pes-1469Pelodiscus sinensis59.451e-173 545
LLPS-Fia-0312Ficedula albicollis59.247e-178 551
LLPS-Tag-1621Taeniopygia guttata59.242e-176 552
LLPS-Rhb-1137Rhinopithecus bieti59.231e-141 458
LLPS-Anp-1613Anas platyrhynchos59.022e-175 550
LLPS-Meg-0542Meleagris gallopavo59.023e-176 551
LLPS-Lac-0463Latimeria chalumnae59.021e-176 553
LLPS-Gaga-1272Gallus gallus59.021e-175 551
LLPS-Fud-0588Fukomys damarensis58.812e-174 547
LLPS-Caj-1508Callithrix jacchus58.812e-174 547
LLPS-Gog-1706Gorilla gorilla58.812e-174 547
LLPS-Cea-1343Cercocebus atys58.813e-175 548
LLPS-Aon-2770Aotus nancymaae58.812e-174 547
LLPS-Sus-1247Sus scrofa58.811e-174 547
LLPS-Mum-2615Mus musculus58.818e-175 548
LLPS-Maf-1346Macaca fascicularis58.812e-174 546
LLPS-Ora-1195Ornithorhynchus anatinus58.813e-175 547
LLPS-Paa-3186Papio anubis58.813e-174 546
LLPS-Mal-3892Mandrillus leucophaeus58.812e-174 546
LLPS-Ova-1531Ovis aries58.811e-174 547
LLPS-Mup-0831Mustela putorius furo58.811e-174 547
LLPS-Aim-0891Ailuropoda melanoleuca58.811e-174 547
LLPS-Ran-2695Rattus norvegicus58.817e-175 548
LLPS-Orc-1272Oryctolagus cuniculus58.818e-175 548
LLPS-Otg-0283Otolemur garnettii58.811e-173 545
LLPS-Man-1485Macaca nemestrina58.812e-174 546
LLPS-Loa-1114Loxodonta africana58.819e-174 545
LLPS-Pap-0183Pan paniscus58.812e-174 547
LLPS-Pat-2515Pan troglodytes58.812e-174 547
LLPS-Hos-0438Homo sapiens58.812e-174 547
LLPS-Fec-3288Felis catus58.816e-175 548
LLPS-Ict-0244Ictidomys tridecemlineatus58.811e-175 545
LLPS-Nol-0789Nomascus leucogenys58.813e-174 546
LLPS-Cas-0408Carlito syrichta58.811e-174 547
LLPS-Xet-0012Xenopus tropicalis58.815e-175 548
LLPS-Caf-2351Canis familiaris58.811e-174 547
LLPS-Eqc-1843Equus caballus58.811e-174 548
LLPS-Cap-0233Cavia porcellus58.813e-174 546
LLPS-Anc-1834Anolis carolinensis58.791e-177 550
LLPS-Mea-1425Mesocricetus auratus58.62e-174 546
LLPS-Myl-0743Myotis lucifugus58.62e-173 545
LLPS-Bot-2215Bos taurus58.62e-173 545
LLPS-Drm-1047Drosophila melanogaster58.244e-162 520
LLPS-Leo-0364Lepisosteus oculatus58.172e-173 545
LLPS-Xim-1686Xiphophorus maculatus58.176e-174 546
LLPS-Orn-0658Oreochromis niloticus58.173e-173 545
LLPS-Sah-0310Sarcophilus harrisii57.963e-170 539
LLPS-Mod-0116Monodelphis domestica57.961e-172 542
LLPS-Orl-0778Oryzias latipes57.756e-173 544
LLPS-Pof-1782Poecilia formosa57.756e-172 541
LLPS-Fus-0273Fusarium solani57.661e-158 509
LLPS-Asm-2297Astyanax mexicanus57.329e-171 538
LLPS-Icp-0892Ictalurus punctatus57.325e-170 536
LLPS-Ten-2001Tetraodon nigroviridis57.176e-170 535
LLPS-Tar-0120Takifugu rubripes57.111e-169 535
LLPS-Scf-3370Scleropages formosus56.962e-169 535
LLPS-Scc-0319Schizosaccharomyces cryophilus56.776e-161 510
LLPS-Cis-1679Ciona savignyi56.715e-162 514
LLPS-Gaa-1752Gasterosteus aculeatus56.695e-170 535
LLPS-Scm-0521Scophthalmus maximus56.696e-168 531
LLPS-Cii-0672Ciona intestinalis56.627e-164 518
LLPS-Nef-0317Neosartorya fischeri56.594e-161 516
LLPS-Asfu-0977Aspergillus fumigatus56.591e-160 515
LLPS-Dar-3368Danio rerio56.483e-168 530
LLPS-Scp-1352Schizosaccharomyces pombe56.333e-156 498
LLPS-Asc-0815Aspergillus clavatus56.162e-160 514
LLPS-Abg-0143Absidia glauca56.032e-166 524
LLPS-Cog-1304Colletotrichum gloeosporioides55.862e-157 506
LLPS-Cae-0874Caenorhabditis elegans55.633e-159 505
LLPS-Tum-0195Tuber melanosporum55.26e-118 383
LLPS-Trr-0682Trichoderma reesei55.013e-155 502
LLPS-Scj-1360Schizosaccharomyces japonicus54.996e-158 504
LLPS-Spr-1189Sporisorium reilianum54.882e-150 487
LLPS-Coo-0247Colletotrichum orbiculare54.82e-156 504
LLPS-Trv-0633Trichoderma virens54.85e-153 496
LLPS-Asf-0976Aspergillus flavus54.641e-161 518
LLPS-Aso-1308Aspergillus oryzae54.645e-162 518
LLPS-Beb-0406Beauveria bassiana54.582e-155 501
LLPS-Mel-0262Melampsora laricipopulina54.578e-156 491
LLPS-Ved-0011Verticillium dahliae54.355e-153 494
LLPS-Chc-1118Chondrus crispus54.329e-156 497
LLPS-Usm-0919Ustilago maydis54.313e-148 481
LLPS-Mao-1454Magnaporthe oryzae54.273e-150 482
LLPS-Gag-0317Gaeumannomyces graminis54.262e-147 480
LLPS-Zyt-0034Zymoseptoria tritici54.043e-155 499
LLPS-Nec-0920Neurospora crassa53.785e-150 486
LLPS-Poa-1409Pongo abelii53.582e-134 439
LLPS-Pug-1283Puccinia graminis53.267e-150 489
LLPS-Put-0910Puccinia triticina53.264e-149 486
LLPS-Miv-1452Microbotryum violaceum53.168e-151 491
LLPS-Map-0271Magnaporthe poae53.152e-149 479
LLPS-Kop-0681Komagataella pastoris50.886e-139 446
LLPS-Crn-1369Cryptococcus neoformans50.641e-144 469
LLPS-Blg-1253Blumeria graminis49.13e-152 488
LLPS-Phn-0795Phaeosphaeria nodorum48.113e-1688.6
LLPS-Lem-1273Leptosphaeria maculans47.962e-130 434
LLPS-Pyt-0613Pyrenophora teres47.743e-129 430
LLPS-Pytr-0311Pyrenophora triticirepentis47.545e-126 421
LLPS-Zem-0931Zea mays45.858e-111 370