• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Arl-1256
ARALYDRAFT_473774

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Ubiquitin interaction motif-containing protein
Gene Name: ARALYDRAFT_473774
Ensembl Gene: fgenesh2_kg.1__3728__AT1G43690.1
Ensembl Protein: fgenesh2_kg.1__3728__AT1G43690.1
Organism: Arabidopsis lyrata
Taxa ID: 81972
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MADHQEDEDL  KLALQMSMQY  NPPEPKRSKP  IEEETGSGSQ  SGGESPEAKS  RRLQRELMAA  60
61    AAEKRMVLFP  KSPSPVNQAR  VLPIRVGGDK  DDEVVKSVGS  DLGKELSMEE  SDQLFSMVFG  120
121   NEVSKSVLAQ  WTNQGIRFSP  DPETTIGLVQ  HEGGPCGVLA  ALQAFVLKYL  LYFPGDRVAS  180
181   PSMGVWTLSK  DRHVVSDSFS  SVTEEAKTRA  LVRSMCEILF  MCGNNNRAVI  ASFTNFEDSS  240
241   TNQKDEAMAS  GLPIESASDL  QKILRFETFT  TQASALNKLE  GTITAFQSRM  GALLFLISAL  300
301   LSRGLDSVQA  DRDDPNLPLV  TAPFGHASQE  IVNLLLCGEA  VPNVFDGRMD  LGGGMFLKGI  360
361   SKNVDVGFLT  LLESLNFCKV  GQNLKCPKWP  IWVIGSESHY  TVLFALDPSV  QEENVLELRE  420
421   SEIRRAFDAR  DESGGGGFIS  VEAFHQVVQE  TNIRLPTEKL  NDICATGFIV  WSELWQVILE  480
481   LDRNLGGIKD  STGMMGKKVF  DIYHFNGIAK  SDINGGGQSI  AVEGGTVPMQ  RPRLTKLNVA  540
541   VPPKWTPEEY  MSCALPPSSS  EKDAEVNQPK  PVQHAPLVDC  IRTRWSRAAC  SWSGDPPSIV  600
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGCGGATC  ATCAAGAAGA  CGAAGATTTG  AAATTGGCTC  TACAGATGAG  TATGCAATAC  60
61    AATCCTCCTG  AGCCAAAACG  GAGCAAACCC  ATTGAAGAAG  AAACTGGATC  CGGATCTCAA  120
121   TCTGGTGGTG  AATCACCGGA  GGCGAAATCT  CGGCGGTTGC  AGCGAGAGCT  TATGGCTGCT  180
181   GCTGCTGAGA  AACGTATGGT  TTTGTTTCCT  AAGAGTCCTT  CTCCTGTGAA  CCAAGCTAGG  240
241   GTTTTGCCAA  TTAGGGTTGG  TGGTGATAAG  GATGATGAAG  TTGTGAAGAG  TGTGGGATCT  300
301   GATTTGGGGA  AGGAGTTATC  GATGGAAGAG  TCTGATCAGT  TGTTTTCAAT  GGTGTTTGGG  360
361   AATGAGGTTT  CGAAAAGTGT  ACTTGCTCAA  TGGACTAATC  AGGGCATAAG  GTTTAGCCCT  420
421   GATCCTGAAA  CTACTATAGG  ATTAGTGCAG  CATGAAGGTG  GGCCCTGCGG  TGTTTTAGCA  480
481   GCACTACAAG  CATTTGTTCT  TAAATACCTT  CTTTACTTTC  CGGGTGACAG  AGTAGCTTCC  540
541   CCAAGTATGG  GTGTCTGGAC  ATTATCTAAA  GATCGTCATG  TTGTATCTGA  TTCCTTCTCT  600
601   TCTGTAACCG  AAGAAGCAAA  AACAAGGGCC  CTTGTTAGAA  GCATGTGTGA  GATTCTATTT  660
661   ATGTGTGGAA  ACAACAACCG  CGCTGTAATA  GCAAGTTTCA  CTAATTTTGA  GGATTCCAGT  720
721   ACTAATCAGA  AAGATGAGGC  AATGGCTAGT  GGGCTCCCCA  TTGAATCTGC  TTCAGATTTG  780
781   CAGAAGATCT  TAAGGTTTGA  GACATTCACT  ACTCAAGCCA  GTGCCCTTAA  TAAGCTAGAA  840
841   GGCACAATAA  CTGCTTTCCA  AAGTCGCATG  GGTGCTTTGC  TGTTCCTAAT  TTCTGCTTTA  900
901   CTCTCCCGTG  GACTGGATTC  CGTTCAAGCC  GACAGGGATG  ATCCAAACCT  CCCTCTAGTC  960
961   ACTGCACCAT  TTGGACATGC  CTCCCAGGAA  ATTGTAAACC  TGCTGTTGTG  TGGAGAAGCG  1020
1021  GTTCCTAATG  TGTTTGATGG  AAGGATGGAT  CTTGGAGGCG  GCATGTTTCT  AAAAGGCATA  1080
1081  TCTAAGAATG  TGGATGTGGG  CTTCCTCACG  TTGCTCGAGT  CTCTCAATTT  CTGCAAAGTC  1140
1141  GGTCAGAATC  TCAAGTGTCC  CAAATGGCCA  ATATGGGTTA  TTGGCAGCGA  GTCACATTAC  1200
1201  ACCGTCCTGT  TTGCACTCGA  CCCATCTGTC  CAAGAAGAAA  ACGTACTTGA  GCTGAGAGAG  1260
1261  TCTGAGATAA  GAAGAGCTTT  CGATGCAAGA  GACGAAAGCG  GAGGAGGAGG  CTTCATCAGC  1320
1321  GTGGAGGCCT  TTCACCAAGT  TGTTCAGGAA  ACAAACATCA  GACTCCCAAC  AGAGAAGCTC  1380
1381  AACGATATCT  GCGCCACGGG  TTTCATCGTG  TGGAGCGAGT  TATGGCAAGT  GATCTTGGAA  1440
1441  CTAGACCGAA  ATTTGGGAGG  GATAAAGGAT  TCAACAGGAA  TGATGGGAAA  GAAAGTGTTT  1500
1501  GATATTTATC  ACTTCAACGG  GATTGCCAAA  TCCGATATAA  ACGGTGGTGG  TCAATCAATC  1560
1561  GCTGTGGAAG  GTGGGACGGT  TCCTATGCAA  AGGCCAAGGC  TGACAAAACT  AAACGTCGCT  1620
1621  GTTCCTCCTA  AATGGACACC  AGAAGAGTAC  ATGTCATGTG  CACTGCCGCC  GAGCAGCTCT  1680
1681  GAGAAAGACG  CAGAAGTGAA  TCAGCCTAAA  CCGGTACAGC  ATGCACCATT  GGTGGATTGT  1740
1741  ATCAGAACTC  GGTGGTCGCG  TGCTGCTTGT  AGCTGGTCTG  GAGATCCTCC  AAGTATAGTC  1800
1801  TGA  1803

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Art-0566Arabidopsis thaliana92.520.01132
LLPS-Brr-2235Brassica rapa82.70.0 986
LLPS-Brn-1943Brassica napus81.70.0 992
LLPS-Bro-1195Brassica oleracea81.70.0 992
LLPS-Coc-1869Corchorus capsularis68.560.0 827
LLPS-Ors-1012Oryza sativa68.01e-138 412
LLPS-Mae-0056Manihot esculenta67.80.0 815
LLPS-Thc-0071Theobroma cacao66.990.0 816
LLPS-Pot-0687Populus trichocarpa66.510.0 797
LLPS-Cus-0913Cucumis sativus66.450.0 756
LLPS-Gor-0560Gossypium raimondii66.40.0 810
LLPS-Sei-0281Setaria italica66.248e-178 516
LLPS-Glm-1427Glycine max65.650.0 758
LLPS-Viv-1065Vitis vinifera65.540.0 774
LLPS-Via-1369Vigna angularis64.680.0 749
LLPS-Phv-0119Phaseolus vulgaris64.190.0 748
LLPS-Met-2243Medicago truncatula63.640.0 757
LLPS-Hov-0990Hordeum vulgare63.140.0 639
LLPS-Orbr-0418Oryza brachyantha62.80.0 629
LLPS-Vir-1315Vigna radiata62.780.0 620
LLPS-Prp-0282Prunus persica62.710.0 771
LLPS-Nia-0066Nicotiana attenuata62.180.0 761
LLPS-Ori-1107Oryza indica62.10.0 574
LLPS-Orb-1699Oryza barthii62.010.0 626
LLPS-Hea-1700Helianthus annuus62.010.0 711
LLPS-Dac-1117Daucus carota61.060.0 715
LLPS-Amt-1821Amborella trichopoda60.870.0 558
LLPS-Sol-0846Solanum lycopersicum60.060.0 731
LLPS-Mua-0204Musa acuminata59.320.0 673
LLPS-Zem-1040Zea mays58.620.0 669
LLPS-Sob-1974Sorghum bicolor57.210.0 657
LLPS-Tra-3103Triticum aestivum56.710.0 672
LLPS-Brd-1845Brachypodium distachyon56.180.0 660
LLPS-Orp-1722Oryza punctata56.120.0 654
LLPS-Tru-0069Triticum urartu55.496e-173 511
LLPS-Orgl-1401Oryza glumaepatula55.320.0 633
LLPS-Orni-0921Oryza nivara55.320.0 632
LLPS-Orr-1645Oryza rufipogon55.320.0 632
LLPS-Org-0304Oryza glaberrima55.320.0 632
LLPS-Lep-1048Leersia perrieri53.590.0 632
LLPS-Sem-0068Selaginella moellendorffii51.420.0 562
LLPS-Sot-0587Solanum tuberosum50.313e-28 115
LLPS-Php-1397Physcomitrella patens47.613e-175 518
LLPS-Urm-0032Ursus maritimus39.753e-22 105
LLPS-Orl-0242Oryzias latipes38.367e-45 173
LLPS-Orn-4022Oreochromis niloticus36.892e-46 179
LLPS-Xim-2166Xiphophorus maculatus36.511e-45 176
LLPS-Pof-2965Poecilia formosa36.519e-46 176
LLPS-Scm-2303Scophthalmus maximus35.852e-45 175
LLPS-Gaa-1622Gasterosteus aculeatus35.672e-44 172
LLPS-Dar-1064Danio rerio34.952e-43 169
LLPS-Pes-0861Pelodiscus sinensis34.184e-36 142
LLPS-Chr-1642Chlamydomonas reinhardtii34.094e-34 141
LLPS-Mup-1958Mustela putorius furo33.242e-44 166
LLPS-Dio-1459Dipodomys ordii32.566e-25 114
LLPS-Meg-2223Meleagris gallopavo31.431e-37 152
LLPS-Loa-2623Loxodonta africana31.181e-49 184
LLPS-Myl-1011Myotis lucifugus30.791e-50 187
LLPS-Fia-1364Ficedula albicollis30.773e-46 174
LLPS-Anp-2210Anas platyrhynchos30.677e-44 166
LLPS-Tar-2100Takifugu rubripes30.622e-44 169
LLPS-Tag-0655Taeniopygia guttata30.592e-45 171
LLPS-Fud-3544Fukomys damarensis30.573e-49 183
LLPS-Cap-1883Cavia porcellus30.573e-49 182
LLPS-Fec-0432Felis catus30.577e-50 184
LLPS-Ten-2357Tetraodon nigroviridis30.558e-45 170
LLPS-Ora-0694Ornithorhynchus anatinus30.491e-46 175
LLPS-Scf-3334Scleropages formosus30.462e-45 172
LLPS-Aim-1068Ailuropoda melanoleuca30.416e-50 185
LLPS-Asm-1238Astyanax mexicanus30.224e-44 168
LLPS-Cis-0608Ciona savignyi30.192e-49 183
LLPS-Eqc-0999Equus caballus30.158e-49 181
LLPS-Cas-0955Carlito syrichta30.158e-49 181
LLPS-Caf-2398Canis familiaris30.077e-46 172
LLPS-Otg-2747Otolemur garnettii30.021e-49 184
LLPS-Bot-0377Bos taurus29.983e-48 180
LLPS-Ova-2258Ovis aries29.985e-48 179
LLPS-Lac-3623Latimeria chalumnae29.986e-47 176
LLPS-Paa-1407Papio anubis29.944e-48 179
LLPS-Mal-1218Mandrillus leucophaeus29.944e-48 179
LLPS-Maf-2401Macaca fascicularis29.944e-48 179
LLPS-Chs-3654Chlorocebus sabaeus29.944e-48 179
LLPS-Cea-1952Cercocebus atys29.944e-48 179
LLPS-Sus-1210Sus scrofa29.941e-48 181
LLPS-Gog-0018Gorilla gorilla29.944e-48 179
LLPS-Caj-3198Callithrix jacchus29.944e-48 179
LLPS-Poa-0473Pongo abelii29.944e-48 179
LLPS-Mam-2735Macaca mulatta29.944e-48 179
LLPS-Ict-1568Ictidomys tridecemlineatus29.945e-49 182
LLPS-Nol-3215Nomascus leucogenys29.944e-48 179
LLPS-Pap-1383Pan paniscus29.944e-48 179
LLPS-Pat-3021Pan troglodytes29.944e-48 179
LLPS-Hos-0363Homo sapiens29.944e-48 179
LLPS-Man-2056Macaca nemestrina29.944e-48 179
LLPS-Orc-0581Oryctolagus cuniculus29.943e-47 177
LLPS-Leo-0372Lepisosteus oculatus29.834e-44 168
LLPS-Rhb-3170Rhinopithecus bieti29.811e-42 163
LLPS-Ran-1392Rattus norvegicus29.795e-49 182
LLPS-Xet-0121Xenopus tropicalis29.734e-48 179
LLPS-Aon-0213Aotus nancymaae29.722e-47 177
LLPS-Mod-1458Monodelphis domestica29.73e-45 171
LLPS-Icp-3612Ictalurus punctatus29.678e-46 173
LLPS-Gaga-1788Gallus gallus29.424e-45 171
LLPS-Mum-4418Mus musculus29.395e-47 176
LLPS-Sah-3767Sarcophilus harrisii29.348e-45 170
LLPS-Mea-3086Mesocricetus auratus29.153e-48 179
LLPS-Anc-2660Anolis carolinensis28.384e-45 171
LLPS-Cii-0762Ciona intestinalis28.011e-47 178
LLPS-Drm-1093Drosophila melanogaster27.058e-37 148
LLPS-Tut-1050Tursiops truncatus25.158e-1374.3