• Disorder
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  • Proteomics
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  • Methylation

LLPS-Aim-4146
COL1A1

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: Uncharacterized protein
Gene Name: COL1A1
Ensembl Gene: ENSAMEG00000011903.1
Ensembl Protein: ENSAMEP00000012684.1
Organism: Ailuropoda melanoleuca
Taxa ID: 9646
LLPS Type: Regulator


▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Stress granulePredicted from orthologs(View)

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MFSFVDLRLL  LLVAATALLT  HGQEEGQEED  SKSQIPPVTC  VQNGLRYYDR  DVWKPEACRI  60
61    CVCDNGNVLC  DDVICDETKN  CPGAQVPPGE  CCPVCPDGEG  TALGAWGWGG  AGPKGDTGPR  120
121   GPRGPAGPPG  RDGIPGQPGL  PGPPGPPGPP  GPPGLGGNFA  PQMSYGYDEK  STGGISVPGP  180
181   MGPSGPRGLP  GPPGAPGPQG  FQGPPGEPGE  PGASGPMGPR  GPPGPPGKNG  DDGEAGKPGR  240
241   PGERGPPGPQ  GARGLPGTAG  LPGMKGHRGF  SGLDGAKGDA  GPAGPKGEPG  SPGENGAPGQ  300
301   MGPRGLPGER  GRPGAPGPAV  STPGPLGDTF  PFHSQGPTGP  AGPPGFPGAV  GAKGEAGPQG  360
361   ARGSEGPQGV  RGEPGPPGPA  GAAGPAGNPG  ADGQPGAKGA  NGAPGIAGAP  GFPGARGPSG  420
421   PQGPSGPPGP  KGNSGDGSPH  CRPSPGLCPL  QGPTGIQGPP  GPAGEEGKRG  ARGEPGPTGL  480
481   PGPPGERGGP  GSRGFPGADG  VAGPKGPAGE  RGSPGPAGPK  GSPGEAGRPG  EAGLPGAKGL  540
541   TGSPGSPGPD  GKTGPPGPAG  QDGRPGPPGP  PGARGQAGVM  GFPGPKGAAG  EPGKAGERGV  600
601   PGPPGAVGPA  GKDGEAGAQG  PPGPAGPAGE  RGEQGPAGSP  GFQGLPGPAG  PPGEAGKPGE  660
661   QGVPGDLGAP  GPSGARGERG  FPGERGVQGP  PGPAGPRGAN  GAPGNDGAKG  DAGAPGAPGS  720
721   QGAPGLQGMP  GERGAAGLPG  PKGDRGDAGP  KGADGSPGKD  GVRGLTGPIG  PPGPAGAPGD  780
781   KGEAGPSGPA  GPTGARGAPG  DRGEPGPPGP  AGFAGPPGAD  GQPGAKGEPG  DAGAKGDAGP  840
841   PGPAGPTGPP  GPIGNVGAPG  PKGARGSAGP  PGATGFPGAA  GRVGPPGPSG  NAGPPGPPGP  900
901   AGKEGGKGPR  GETGPAGRPG  EVGPPGPPGP  AGEKGSPGAD  GPAGAPGTPG  PQGIAGQRGV  960
961   VGLPGQRGER  GFPGLPGPSG  EPGKQGPSGA  SGERGPPGPM  GPPGLAGPPG  ESGREGSPGA  1020
1021  EGSPGRDGSP  GPKGDRGETG  PAGPPGAPGA  PGAPGPVGPA  GKSGDRGETG  PAGPAGPIGP  1080
1081  VGARGPAGPQ  GPRGDKGETG  EQGDRGIKGH  RGFSGLQGPP  GPPGSPGEQG  PSGASGPAGP  1140
1141  RGPPGSAGSP  GKDGLNGLPG  PIGPPGPRGR  TGDAGPVGPP  GPPGPPGPPG  PPSGGFDFSF  1200
1201  LPQPPQEKAH  DGGRYYRADD  ANVVRDRDLE  VDTTLKSLSQ  QIENIRSPEG  SRKNPARTCR  1260
1261  DLKMCHSDWK  SGEYWIDPNQ  GCNLDAIKVF  CNMETGETCV  YPTQPHVAQK  NWYISKNPKE  1320
1321  KRHVWYGESM  TDGFQFEYGG  QGSDPADVAI  QLTFLRLMST  EASQNITYHC  KNSVAYMDQQ  1380
1381  TGNLKKALLL  QGSNEIEIRA  EGNSRFTYSV  TYDGCTSHTG  AWGKTVIEYK  TTKTSRLPII  1440
1441  DVAPLDVGAP  DQEFGMDVGP  VCFL  1464
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGTTCAGCT  TTGTGGACCT  CCGGCTCCTG  CTCCTCGTAG  CGGCCACCGC  CCTCCTGACG  60
61    CACGGCCAAG  AGGAGGGCCA  AGAAGAAGAC  AGTAAGTCGC  AAATCCCACC  AGTCACCTGC  120
121   GTACAGAACG  GCCTCAGGTA  CTATGACCGA  GACGTATGGA  AACCCGAGGC  CTGCCGGATC  180
181   TGTGTCTGCG  ACAACGGCAA  CGTGTTGTGC  GATGACGTGA  TCTGCGACGA  AACCAAGAAC  240
241   TGTCCCGGCG  CCCAAGTCCC  CCCGGGCGAA  TGCTGCCCCG  TCTGCCCCGA  CGGCGAGGGT  300
301   ACAGCTCTGG  GGGCCTGGGG  CTGGGGGGGG  GCGGGACCCA  AGGGAGACAC  TGGCCCCCGA  360
361   GGTCCAAGGG  GACCTGCCGG  CCCCCCTGGC  CGAGATGGCA  TCCCCGGCCA  GCCTGGACTT  420
421   CCCGGCCCCC  CCGGACCTCC  CGGCCCCCCC  GGACCTCCTG  GCCTCGGAGG  AAACTTTGCT  480
481   CCCCAAATGT  CTTACGGCTA  TGATGAGAAA  TCAACTGGAG  GAATCTCCGT  GCCTGGCCCC  540
541   ATGGGTCCTT  CTGGTCCTCG  TGGTCTCCCT  GGCCCCCCTG  GCGCACCTGG  TCCCCAAGGT  600
601   TTCCAAGGCC  CCCCTGGTGA  GCCTGGCGAG  CCTGGAGCCT  CAGGTCCCAT  GGGTCCCCGT  660
661   GGTCCCCCTG  GCCCCCCTGG  CAAGAACGGA  GATGATGGTG  AAGCTGGAAA  GCCTGGTCGT  720
721   CCTGGTGAGC  GTGGGCCTCC  TGGACCTCAG  GGTGCTCGGG  GATTGCCTGG  AACAGCTGGT  780
781   CTTCCTGGAA  TGAAGGGACA  CAGAGGTTTC  AGTGGTTTGG  ATGGTGCCAA  GGGAGATGCT  840
841   GGTCCTGCTG  GTCCCAAGGG  TGAGCCCGGT  AGCCCTGGTG  AAAATGGAGC  TCCTGGTCAG  900
901   ATGGGACCCC  GTGGTCTGCC  TGGTGAGAGA  GGTCGCCCTG  GAGCCCCTGG  CCCTGCTGTA  960
961   AGTACTCCTG  GCCCCTTGGG  GGACACATTT  CCATTTCATT  CACAGGGTCC  CACTGGCCCT  1020
1021  GCTGGTCCTC  CTGGCTTCCC  TGGTGCTGTT  GGTGCTAAGG  GTGAAGCTGG  TCCCCAAGGA  1080
1081  GCCCGTGGCT  CTGAAGGTCC  CCAGGGTGTG  CGTGGTGAGC  CCGGCCCCCC  TGGCCCTGCT  1140
1141  GGTGCTGCTG  GCCCTGCTGG  AAACCCTGGT  GCTGATGGAC  AGCCTGGTGC  TAAAGGTGCT  1200
1201  AATGGTGCTC  CTGGCATTGC  TGGTGCTCCC  GGCTTCCCCG  GTGCCCGAGG  CCCTTCTGGA  1260
1261  CCCCAGGGCC  CCAGCGGTCC  TCCTGGTCCC  AAGGGTAACA  GCGGGGATGG  GAGCCCTCAC  1320
1321  TGCCGGCCTT  CCCCTGGCCT  CTGCCCTCTC  CAGGGCCCCA  CTGGTATTCA  AGGCCCCCCT  1380
1381  GGCCCTGCTG  GGGAAGAAGG  AAAGCGAGGA  GCCCGAGGTG  AACCCGGACC  CACTGGCCTG  1440
1441  CCTGGACCCC  CCGGCGAGCG  TGGCGGACCT  GGTAGCCGTG  GTTTCCCTGG  TGCAGATGGT  1500
1501  GTCGCTGGTC  CCAAGGGTCC  CGCTGGTGAA  CGTGGCTCTC  CCGGCCCCGC  TGGCCCCAAA  1560
1561  GGTTCCCCTG  GTGAAGCGGG  TCGTCCCGGT  GAAGCTGGTC  TGCCTGGTGC  CAAGGGTCTG  1620
1621  ACTGGAAGTC  CTGGCAGTCC  CGGTCCAGAT  GGCAAAACTG  GCCCCCCTGG  TCCCGCTGGT  1680
1681  CAAGATGGTC  GCCCTGGCCC  CCCAGGCCCC  CCCGGTGCCC  GTGGTCAGGC  CGGCGTGATG  1740
1741  GGTTTCCCTG  GGCCTAAAGG  TGCTGCTGGA  GAGCCTGGCA  AGGCTGGAGA  GAGAGGTGTG  1800
1801  CCTGGCCCCC  CTGGTGCTGT  TGGTCCCGCT  GGCAAAGACG  GAGAAGCTGG  GGCTCAGGGA  1860
1861  CCCCCTGGCC  CTGCTGGCCC  CGCTGGCGAG  AGAGGCGAAC  AAGGCCCAGC  TGGCTCCCCC  1920
1921  GGATTCCAGG  GTCTCCCTGG  CCCCGCTGGT  CCTCCCGGTG  AAGCAGGCAA  ACCCGGTGAA  1980
1981  CAGGGTGTTC  CTGGCGACCT  TGGTGCCCCC  GGCCCCTCTG  GAGCAAGAGG  CGAGAGAGGT  2040
2041  TTCCCTGGTG  AACGTGGTGT  GCAAGGTCCC  CCCGGCCCCG  CAGGTCCCCG  CGGAGCCAAC  2100
2101  GGTGCCCCTG  GCAATGACGG  TGCTAAGGGT  GATGCTGGTG  CCCCCGGAGC  CCCAGGTAGC  2160
2161  CAGGGCGCTC  CTGGACTTCA  GGGAATGCCT  GGTGAACGAG  GCGCAGCTGG  GCTTCCCGGC  2220
2221  CCTAAGGGTG  ACAGAGGCGA  TGCTGGTCCC  AAAGGTGCTG  ACGGTTCTCC  TGGCAAAGAT  2280
2281  GGTGTCCGTG  GTCTGACTGG  ACCCATTGGT  CCTCCTGGCC  CCGCCGGTGC  CCCTGGTGAC  2340
2341  AAGGGTGAAG  CTGGTCCTAG  CGGCCCTGCT  GGTCCCACTG  GAGCTCGTGG  CGCCCCCGGA  2400
2401  GACCGTGGTG  AGCCTGGTCC  CCCCGGCCCT  GCTGGCTTCG  CTGGCCCCCC  TGGTGCTGAT  2460
2461  GGTCAACCCG  GTGCTAAAGG  CGAACCTGGT  GATGCTGGTG  CTAAAGGCGA  CGCTGGTCCC  2520
2521  CCTGGCCCCG  CTGGACCCAC  TGGACCCCCT  GGCCCCATTG  GTAACGTTGG  TGCTCCTGGA  2580
2581  CCCAAAGGTG  CTCGTGGCAG  TGCTGGTCCC  CCTGGTGCTA  CTGGTTTCCC  TGGTGCTGCT  2640
2641  GGCCGAGTCG  GTCCCCCCGG  CCCCTCTGGA  AATGCTGGAC  CCCCTGGACC  CCCTGGCCCT  2700
2701  GCTGGCAAAG  AAGGTGGCAA  AGGCCCCCGT  GGTGAGACCG  GCCCCGCTGG  ACGTCCTGGT  2760
2761  GAAGTCGGTC  CCCCCGGTCC  CCCTGGCCCC  GCTGGCGAGA  AAGGATCTCC  TGGTGCTGAC  2820
2821  GGACCTGCTG  GTGCTCCCGG  CACTCCCGGA  CCTCAAGGCA  TTGCTGGACA  GCGTGGTGTG  2880
2881  GTCGGCCTGC  CCGGTCAGCG  AGGAGAGAGA  GGCTTCCCCG  GTCTTCCTGG  CCCCTCTGGT  2940
2941  GAACCTGGCA  AGCAAGGTCC  TTCCGGAGCA  AGTGGGGAGC  GTGGCCCCCC  TGGTCCCATG  3000
3001  GGCCCCCCTG  GATTGGCTGG  ACCCCCTGGC  GAGTCTGGAC  GTGAGGGATC  TCCTGGTGCT  3060
3061  GAAGGCTCCC  CTGGACGAGA  TGGTTCTCCC  GGCCCCAAGG  GTGACCGTGG  TGAGACCGGC  3120
3121  CCTGCTGGAC  CTCCTGGTGC  CCCTGGTGCT  CCTGGTGCCC  CTGGCCCCGT  CGGCCCCGCT  3180
3181  GGCAAGAGCG  GCGACCGTGG  TGAGACTGGT  CCTGCTGGTC  CTGCTGGCCC  GATCGGCCCT  3240
3241  GTTGGTGCTC  GTGGTCCTGC  TGGACCCCAA  GGCCCCCGTG  GTGACAAGGG  TGAGACAGGC  3300
3301  GAACAGGGTG  ACAGAGGCAT  AAAGGGTCAC  CGTGGCTTCT  CTGGTCTCCA  GGGTCCCCCT  3360
3361  GGTCCTCCTG  GCTCTCCTGG  TGAACAAGGT  CCTTCTGGAG  CTTCTGGTCC  TGCTGGTCCC  3420
3421  CGAGGTCCCC  CCGGCTCTGC  CGGTTCTCCT  GGCAAAGACG  GACTCAACGG  TCTCCCAGGC  3480
3481  CCCATTGGCC  CCCCTGGTCC  TCGTGGTCGT  ACTGGTGATG  CTGGCCCTGT  TGGTCCCCCT  3540
3541  GGCCCTCCTG  GACCCCCTGG  TCCCCCCGGT  CCTCCCAGCG  GCGGTTTCGA  CTTCAGCTTC  3600
3601  CTGCCCCAGC  CACCTCAAGA  GAAGGCTCAC  GACGGCGGCC  GCTACTACCG  GGCCGATGAT  3660
3661  GCCAATGTGG  TCCGTGACCG  TGACCTCGAG  GTGGACACCA  CCCTCAAGAG  CCTGAGCCAG  3720
3721  CAGATCGAGA  ACATCCGGAG  CCCTGAAGGA  AGCCGCAAGA  ACCCTGCCCG  CACCTGCCGC  3780
3781  GACCTCAAGA  TGTGCCACTC  CGACTGGAAG  AGCGGAGAAT  ACTGGATTGA  CCCCAACCAA  3840
3841  GGATGCAACC  TGGATGCCAT  CAAGGTCTTC  TGCAACATGG  AGACAGGTGA  GACCTGCGTG  3900
3901  TACCCCACTC  AGCCCCATGT  GGCCCAGAAG  AACTGGTACA  TCAGCAAGAA  CCCCAAGGAA  3960
3961  AAGAGGCACG  TCTGGTACGG  CGAGAGCATG  ACCGACGGAT  TCCAGTTCGA  GTATGGTGGC  4020
4021  CAGGGCTCCG  ATCCTGCTGA  TGTGGCCATT  CAGCTGACGT  TCCTGCGCCT  GATGTCCACC  4080
4081  GAGGCTTCCC  AGAACATCAC  CTATCACTGC  AAGAACAGCG  TGGCCTACAT  GGACCAGCAG  4140
4141  ACCGGCAACC  TCAAGAAGGC  CCTGCTCCTC  CAGGGCTCCA  ACGAGATCGA  GATCCGGGCC  4200
4201  GAGGGCAACA  GCCGCTTCAC  CTACAGTGTC  ACCTACGACG  GTTGCACGAG  TCACACCGGA  4260
4261  GCCTGGGGCA  AGACAGTGAT  CGAATACAAA  ACCACCAAGA  CCTCCCGTTT  GCCCATCATC  4320
4321  GATGTGGCAC  CATTGGACGT  CGGCGCCCCA  GACCAGGAAT  TCGGCATGGA  TGTTGGCCCT  4380
4381  GTCTGCTTCC  TG  4392

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Rhb-2149Rhinopithecus bieti100.07e-20 101
LLPS-Hos-1373Homo sapiens100.07e-20 101
LLPS-Pap-1436Pan paniscus100.07e-20 101
LLPS-Pat-1091Pan troglodytes100.07e-20 101
LLPS-Fec-3071Felis catus100.06e-20 101
LLPS-Man-0647Macaca nemestrina100.07e-20 101
LLPS-Caf-1540Canis familiaris100.06e-20 101
LLPS-Poa-3469Pongo abelii100.06e-20 101
LLPS-Gog-4278Gorilla gorilla100.06e-20 101
LLPS-Caj-1606Callithrix jacchus100.06e-20 101
LLPS-Maf-0493Macaca fascicularis100.07e-20 101
LLPS-Chs-1595Chlorocebus sabaeus100.07e-20 101
LLPS-Cea-4564Cercocebus atys100.07e-20 101
LLPS-Aon-0094Aotus nancymaae100.06e-20 101
LLPS-Mal-0925Mandrillus leucophaeus100.07e-20 101
LLPS-Paa-4779Papio anubis100.06e-20 101
LLPS-Mup-0210Mustela putorius furo100.07e-20 101
LLPS-Eqc-1233Equus caballus99.015e-20 101
LLPS-Sus-4814Sus scrofa99.011e-19 100
LLPS-Ova-2769Ovis aries99.011e-19 100
LLPS-Bot-0652Bos taurus99.011e-19 100
LLPS-Myl-1325Myotis lucifugus98.713e-1895.9
LLPS-Cap-3686Cavia porcellus98.062e-1896.3
LLPS-Mea-1629Mesocricetus auratus98.065e-1895.1
LLPS-Otg-1000Otolemur garnettii98.022e-1999.8
LLPS-Loa-2078Loxodonta africana98.023e-1999.0
LLPS-Ran-1714Rattus norvegicus98.026e-20 101
LLPS-Mum-4362Mus musculus97.032e-1999.8
LLPS-Mod-4036Monodelphis domestica96.131e-1794.0
LLPS-Fud-3772Fukomys damarensis96.03e-1895.9
LLPS-Cas-1330Carlito syrichta94.842e-1689.7
LLPS-Sah-3229Sarcophilus harrisii94.843e-1792.8
LLPS-Gaga-2256Gallus gallus92.91e-1484.3
LLPS-Anc-1131Anolis carolinensis92.262e-1586.7
LLPS-Pes-0689Pelodiscus sinensis89.682e-1586.3
LLPS-Xet-3720Xenopus tropicalis87.663e-1172.8
LLPS-Scf-2828Scleropages formosus85.812e-1380.5
LLPS-Lac-3968Latimeria chalumnae85.544e-0862.4
LLPS-Orn-3572Oreochromis niloticus83.871e-1380.5
LLPS-Orl-0058Oryzias latipes83.877e-1171.6
LLPS-Asm-1089Astyanax mexicanus83.645e-139 470
LLPS-Icp-3925Ictalurus punctatus83.642e-137 466
LLPS-Scm-3591Scophthalmus maximus83.273e-138 469
LLPS-Dar-3379Danio rerio83.124e-1379.0
LLPS-Ten-3290Tetraodon nigroviridis82.97e-137 465
LLPS-Gaa-2774Gasterosteus aculeatus82.162e-136 463
LLPS-Xim-1734Xiphophorus maculatus80.33e-132 450
LLPS-Pof-1701Poecilia formosa78.952e-0760.5
LLPS-Tar-3405Takifugu rubripes78.067e-1171.6
LLPS-Ora-1692Ornithorhynchus anatinus54.07e-1171.2
LLPS-Urm-2475Ursus maritimus51.722e-1275.9
LLPS-Anp-1765Anas platyrhynchos48.282e-1172.8
LLPS-Tut-2163Tursiops truncatus48.283e-1069.3
LLPS-Meg-2792Meleagris gallopavo46.552e-1070.1
LLPS-Nol-3175Nomascus leucogenys46.433e-1069.3
LLPS-Ict-1621Ictidomys tridecemlineatus44.832e-0966.6
LLPS-Dio-3274Dipodomys ordii44.839e-1067.8
LLPS-Orc-3775Oryctolagus cuniculus43.14e-0965.5
LLPS-Leo-0311Lepisosteus oculatus43.14e-0862.4
LLPS-Fia-2157Ficedula albicollis41.676e-1067.8