※ Regulator introduction

    The LLPS of scaffold proteins and the stability of MLOs can be modulated by PTMs and other proteins (1-4). For example, arginine methylation of FUS by PRMT1 or PRMT8 reduces the LLPS of FUS, and both PRMTs were classified as PTM regulators. Also, Buchan et al. conducted a microscopy-based genetic screen of >4000 gene deletions in Saccharomyces cerevisiae, and identified 125 genes to be involved in regulating the stability and formation of P-bodies and/or stress granules (5). None of these proteins have been characterized to undergo LLPS, and here we classified all the 125 proteins as MLO regulators.

References
1. Vernon, R.M. and Forman-Kay, J.D. (2019) First-generation predictors of biological protein phase separation. Current opinion in structural biology 58, 88-96. PMID: 31252218
2. Wang, Z. and Zhang, H. (2019) Phase Separation, Transition, and Autophagic Degradation of Proteins in Development and Pathogenesis. Trends in cell biology, 29, 417-427. PMID: 30826216
3. Alberti, S., Gladfelter, A. and Mittag, T. (2019) Considerations and challenges in studying liquid-liquid phase separation and biomolecular condensates. Cell, 176, 419-434. PMID: 30682370
4. Bergeron-Sandoval, L.P., Safaee, N. and Michnick, S.W. (2016) Mechanisms and Consequences of Macromolecular Phase Separation. Cell, 165, 1067-1079. PMID: 27203111
5. Buchan, J.R., Kolaitis, R.M., Taylor, J.P. and Parker, R. (2013) Eukaryotic stress granules are cleared by autophagy and Cdc48/VCP function. Cell, 176, 419-434. PMID: 23791177


Regulators  in eukaryotes (Total number, Predicted number):

 Absidia glauca (363, 363) Ailuropoda melanoleuca (604, 604) Amborella trichopoda (352, 352)
 Anas platyrhynchos (482, 482) Anolis carolinensis (568, 568) Aotus nancymaae (643, 643)
 Arabidopsis lyrata (361, 361) Arabidopsis thaliana (366, 354) Ashbya gossypii (355, 355)
 Aspergillus clavatus (356, 356) Aspergillus flavus (331, 331) Aspergillus fumigatus (346, 346)
 Aspergillus nidulans (335, 335) Aspergillus niger (324, 324) Aspergillus oryzae (317, 317)
 Aspergillus terreus (331, 331) Astyanax mexicanus (597, 597) Beauveria bassiana (349, 349)
 Blumeria graminis (337, 337) Bos taurus (643, 643) Brachypodium distachyon (359, 359)
 Brassica napus (393, 393) Brassica oleracea (384, 384) Brassica rapa (370, 370)
 Caenorhabditis elegans (511, 167) Callithrix jacchus (654, 654) Canis familiaris (633, 633)
 Carlito syrichta (579, 579) Cavia porcellus (639, 639) Cercocebus atys (647, 647)
 Chlamydomonas reinhardtii (314, 314) Chlorocebus sabaeus (631, 627) Chondrus crispus (260, 260)
 Ciona intestinalis (429, 429) Ciona savignyi (363, 363) Colletotrichum gloeosporioides (319, 319)
 Colletotrichum graminicola (345, 345) Colletotrichum orbiculare (343, 343) Corchorus capsularis (342, 342)
 Cryptococcus neoformans (320, 320) Cucumis sativus (351, 351) Cyanidioschyzon merolae (244, 244)
 Danio rerio (607, 603) Daucus carota (352, 352) Dipodomys ordii (612, 612)
 Dothistroma septosporum (338, 338) Drosophila melanogaster (451, 422) Equus caballus (638, 638)
 Erinaceus europaeus (164, 164) Felis catus (648, 648) Ficedula albicollis (542, 542)
 Fukomys damarensis (614, 614) Fusarium oxysporum (334, 334) Fusarium solani (337, 337)
 Fusarium verticillioides (329, 329) Gaeumannomyces graminis (340, 340) Galdieria sulphuraria (287, 287)
 Gallus gallus (556, 555) Gasterosteus aculeatus (582, 582) Glycine max (391, 391)
 Gorilla gorilla (643, 643) Gossypium raimondii (378, 378) Helianthus annuus (377, 377)
 Homo sapiens (664, 307) Hordeum vulgare (321, 321) Ictalurus punctatus (599, 599)
 Ictidomys tridecemlineatus (625, 625) Komagataella pastoris (345, 345) Latimeria chalumnae (584, 584)
 Leersia perrieri (350, 350) Lepisosteus oculatus (578, 578) Leptosphaeria maculans (333, 333)
 Loxodonta africana (623, 623) Macaca fascicularis (652, 652) Macaca mulatta (626, 626)
 Macaca nemestrina (641, 641) Magnaporthe oryzae (341, 341) Magnaporthe poae (296, 296)
 Mandrillus leucophaeus (635, 635) Manihot esculenta (376, 376) Medicago truncatula (357, 357)
 Melampsora laricipopulina (315, 315) Meleagris gallopavo (469, 469) Mesocricetus auratus (593, 593)
 Microbotryum violaceum (325, 325) Monodelphis domestica (609, 609) Musa acuminata (357, 357)
 Mustela putorius furo (621, 621) Mus musculus (649, 586) Myotis lucifugus (623, 623)
 Neosartorya fischeri (345, 345) Neurospora crassa (346, 346) Nicotiana attenuata (365, 365)
 Nomascus leucogenys (626, 626) Oreochromis niloticus (590, 590) Ornithorhynchus anatinus (512, 512)
 Oryctolagus cuniculus (608, 608) Oryza barthii (343, 343) Oryza brachyantha (339, 339)
 Oryza glaberrima (334, 334) Oryza glumaepatula (345, 345) Oryza indica (340, 340)
 Oryza meridionalis (303, 303) Oryza nivara (338, 338) Oryza punctata (343, 343)
 Oryza rufipogon (354, 354) Oryza sativa (341, 341) Oryzias latipes (583, 583)
 Ostreococcus lucimarinus (290, 290) Otolemur garnettii (631, 631) Ovis aries (614, 614)
 Pan paniscus (638, 638) Pan troglodytes (650, 650) Papio anubis (647, 647)
 Pelodiscus sinensis (540, 540) Phaeosphaeria nodorum (324, 324) Phaseolus vulgaris (364, 364)
 Physcomitrella patens (390, 390) Poecilia formosa (599, 599) Pongo abelii (621, 621)
 Populus trichocarpa (386, 386) Prunus persica (366, 366) Puccinia graminis (317, 317)
 Puccinia triticina (274, 274) Pyrenophora teres (347, 347) Pyrenophora triticirepentis (334, 334)
 Rattus norvegicus (643, 633) Rhinopithecus bieti (633, 633) Saccharomyces cerevisiae (371, 215)
 Sarcophilus harrisii (568, 568) Schizosaccharomyces cryophilus (330, 330) Schizosaccharomyces japonicus (333, 333)
 Schizosaccharomyces pombe (336, 329) Scleropages formosus (600, 600) Sclerotinia sclerotiorum (230, 230)
 Scophthalmus maximus (582, 582) Selaginella moellendorffii (350, 350) Setaria italica (355, 355)
 Solanum lycopersicum (355, 355) Solanum tuberosum (328, 328) Sorghum bicolor (350, 350)
 Sporisorium reilianum (329, 329) Sus scrofa (649, 649) Taeniopygia guttata (510, 510)
 Takifugu rubripes (574, 574) Tetraodon nigroviridis (542, 542) Theobroma cacao (347, 347)
 Trichoderma reesei (335, 335) Trichoderma virens (341, 341) Triticum aestivum (378, 378)
 Triticum urartu (305, 305) Tuber melanosporum (336, 336) Tursiops truncatus (353, 353)
 Ursus maritimus (579, 579) Ustilago maydis (322, 322) Verticillium dahliae (335, 335)
 Vigna angularis (341, 341) Vigna radiata (315, 315) Vitis vinifera (356, 356)
 Xenopus tropicalis (558, 558) Xiphophorus maculatus (601, 601) Yarrowia lipolytica (342, 342)
 Zea mays (363, 363) Zymoseptoria tritici (323, 323)