Equus caballus      Droplet


※ Droplet introduction

    Interactions between diverse synthetic, multivalent macromolecules (including multi-domain proteins and RNA) produce sharp liquid-liquid-demixing phase separations, generating micrometre-sized liquid droplets in aqueous solution (1-2). In vitro phase separation assays with purified proteins have become the standard way to investigate proteins that form membrane-less compartments. By now, various proteins have been purified and tested for their ability to phase separate and form liquid condensates in vitro (3).

References
1. Li P., Banjade S., Cheng H.C., et al. (2012) Phase transitions in the assembly of multivalent signalling proteins. Nature, 483, 336-40. PMID: 22398450
2. Kato M., Han T.W., Xie S., et al. (2012) Cell-free formation of RNA granules: low complexity sequence domains form dynamic fibers within hydrogels. Cell, 149, 753-67. PMID: 22579281
3. Alberti S., Saha S., Woodruff J.B., et al. (2018) A User’s Guide for Phase Separation Assays with Purified Proteins. J. Mol. Biol., 430, 4806-4820. PMID: 29944854


There are 107 genes.  Reviewed (0 or Unreviewed (107

No.StatusDrLLPS IDEnsemble Gene IDUniProt AccessionGene Name
1
LLPS-Eqc-0378
ENSECAG00000005064.2
2
LLPS-Eqc-0958
ENSECAG00000039140.1
3
LLPS-Eqc-1057
ENSECAG00000022361.2
4
LLPS-Eqc-1092
ENSECAG00000012967.2
5
LLPS-Eqc-1131
ENSECAG00000022120.2
6
LLPS-Eqc-1372
ENSECAG00000031050.1
7
LLPS-Eqc-1658
ENSECAG00000021065.2
8
LLPS-Eqc-1823
ENSECAG00000032164.1
9
LLPS-Eqc-2009
ENSECAG00000028247.1
10
LLPS-Eqc-3405
ENSECAG00000032767.1
11
LLPS-Eqc-4421
ENSECAG00000005151.2
F6PP94
12
LLPS-Eqc-4587
ENSECAG00000012712.2
13
LLPS-Eqc-2747
ENSECAG00000006078.2
F7BU40
AGO2
14
LLPS-Eqc-2123
ENSECAG00000023800.2
F6XJN4
AK2
15
LLPS-Eqc-4276
ENSECAG00000021011.2
F6XL78
APP
16
LLPS-Eqc-0795
ENSECAG00000014347.2
F7C0A5
ATXN2
17
LLPS-Eqc-0368
ENSECAG00000007301.2
F7DLP2
ATXN2L
18
LLPS-Eqc-2662
ENSECAG00000023961.2
F6YZI7
AURKA
19
LLPS-Eqc-1309
ENSECAG00000014384.2
F7DPL7
AURKB
20
LLPS-Eqc-1183
ENSECAG00000022028.2
F6Z1K1
C23H9orf72
21
LLPS-Eqc-3520
ENSECAG00000000031.2
F6TEC0
CAMK2G
22
LLPS-Eqc-2851
ENSECAG00000008048.2
F6W843
CBX1
23
LLPS-Eqc-1654
ENSECAG00000008101.2
F6UM66
CBX5
24
LLPS-Eqc-0078
ENSECAG00000015768.2
Q9XT26
CCNT1
25
LLPS-Eqc-3675
ENSECAG00000014570.2
F7DTX6
CDK7
26
LLPS-Eqc-3855
ENSECAG00000007965.2
F6V4K1
CDK9
27
LLPS-Eqc-4763
ENSECAG00000008722.2
F6WH19
CPEB2
28
LLPS-Eqc-1680
ENSECAG00000009325.2
F6WIH8
CSTF2
29
LLPS-Eqc-4215
ENSECAG00000004701.2
F6S3U2
CSTF2T
30
LLPS-Eqc-4327
ENSECAG00000021450.2
F6X4S0
CTTN
31
LLPS-Eqc-3269
ENSECAG00000024868.2
F6PJM6
DAB2IP
32
LLPS-Eqc-2311
ENSECAG00000021055.2
F6UBT9
DAXX
33
LLPS-Eqc-0479
ENSECAG00000011805.2
F6VE09
DAZAP1
34
LLPS-Eqc-3517
ENSECAG00000024754.2
F6SI49
DCP1A
35
LLPS-Eqc-1858
ENSECAG00000005486.2
F6Z9X4
DCP2
36
LLPS-Eqc-3736
ENSECAG00000023616.2
F6YN18
DDX4
37
LLPS-Eqc-1237
ENSECAG00000000539.2
F7CXI1
DDX6
38
LLPS-Eqc-1008
ENSECAG00000024301.2
F6Z169
DLG4
39
LLPS-Eqc-3204
ENSECAG00000013739.2
F6ZYR8
DLGAP1
40
LLPS-Eqc-0294
ENSECAG00000024965.2
F6S1R4
DYRK1A
41
LLPS-Eqc-2114
ENSECAG00000017994.2
F6S066
EDC3
42
LLPS-Eqc-1870
ENSECAG00000011147.2
F6U301
EIF4G3
43
LLPS-Eqc-4652
ENSECAG00000011106.2
F7BWV3
ELN
44
LLPS-Eqc-3687
ENSECAG00000000784.2
F7DV79
ESRP1
45
LLPS-Eqc-1214
ENSECAG00000009550.2
F7BH02
FLNA
46
LLPS-Eqc-2169
ENSECAG00000015849.2
F6XT77
FLNB
47
LLPS-Eqc-1072
ENSECAG00000008319.2
F6T9G2
FYN
48
LLPS-Eqc-1327
ENSECAG00000013624.2
F7BNM9
GAR1
49
LLPS-Eqc-2188
ENSECAG00000008068.2
F6TYL7
GNL2
50
LLPS-Eqc-3391
ENSECAG00000010007.2
F7BQS3
GRB2
51
LLPS-Eqc-4612
ENSECAG00000021195.2
F6YDK2
GSPT1
52
LLPS-Eqc-0010
ENSECAG00000008676.2
F6YZ44
HNRNPA1
53
LLPS-Eqc-0215
ENSECAG00000000782.2
F6VYB1
HNRNPA2B1
54
LLPS-Eqc-1025
ENSECAG00000023237.2
F6VWK4
HNRNPA3
55
LLPS-Eqc-1187
ENSECAG00000009344.2
F6WHS3
HNRNPD
56
LLPS-Eqc-3437
ENSECAG00000022692.2
F6UQU2
HNRNPDL
57
LLPS-Eqc-0498
ENSECAG00000014429.2
F7C113
HNRNPH1
58
LLPS-Eqc-0340
ENSECAG00000023575.2
F6UAN2
HNRNPH2
59
LLPS-Eqc-4583
ENSECAG00000007190.2
F7BZZ0
HNRNPH3
60
LLPS-Eqc-0605
ENSECAG00000023105.2
F6VIN3
HOMER3
61
LLPS-Eqc-0296
ENSECAG00000014808.3
F6T1Z3
IPO5
62
LLPS-Eqc-2485
ENSECAG00000012054.2
F7BIS4
ITSN1
63
LLPS-Eqc-2087
ENSECAG00000014560.2
F7DTB6
KPNB1
64
LLPS-Eqc-1090
ENSECAG00000021184.2
F6T7Q5
LAT
65
LLPS-Eqc-0768
ENSECAG00000011192.2
F7AEU3
LBR
66
LLPS-Eqc-1047
ENSECAG00000006474.2
F7A860
LGALS3
67
LLPS-Eqc-1219
ENSECAG00000006699.2
F7A868
LOC100054206
68
LLPS-Eqc-1826
ENSECAG00000002201.2
F6ULU9
LOC100055584
69
LLPS-Eqc-1535
ENSECAG00000018113.2
F7CU94
LYZ
70
LLPS-Eqc-1463
ENSECAG00000010011.2
F7B3R2
MAP1LC3A
71
LLPS-Eqc-2994
ENSECAG00000006950.2
F7DH14
NBR1
72
LLPS-Eqc-3254
ENSECAG00000007966.2
F6WFB5
NCK1
73
LLPS-Eqc-3364
ENSECAG00000012641.2
F6PU40
NPHS1
74
LLPS-Eqc-0136
ENSECAG00000021950.2
F6X9D3
NPM1
75
LLPS-Eqc-2797
ENSECAG00000016010.2
F7DUR1
NUP153
76
LLPS-Eqc-0207
ENSECAG00000006129.2
F6Z9U7
NUP62
77
LLPS-Eqc-3985
ENSECAG00000015336.2
F6VXK5
NUP98
78
LLPS-Eqc-0520
ENSECAG00000020699.2
F6TQ92
PABPC1
79
LLPS-Eqc-2353
ENSECAG00000017777.2
F6RRI6
PLK1
80
LLPS-Eqc-2117
ENSECAG00000018485.2
F6Z7Q4
POLR2A
81
LLPS-Eqc-3739
ENSECAG00000024076.2
F6WZY9
PRMT1
82
LLPS-Eqc-0693
ENSECAG00000017286.2
F7AH65
PSPC1
83
LLPS-Eqc-0043
ENSECAG00000018845.2
F6UGL6
PTBP1
84
LLPS-Eqc-0430
ENSECAG00000023358.2
F7CQ02
RARA
85
LLPS-Eqc-4000
ENSECAG00000012667.2
F6T0W2
RBFOX1
86
LLPS-Eqc-3699
ENSECAG00000022859.2
F6UPI5
RBM14
87
LLPS-Eqc-1528
ENSECAG00000024257.2
F6YEU3
RBM3
88
LLPS-Eqc-3818
ENSECAG00000012475.2
F6SRR4
SGO1
89
LLPS-Eqc-2223
ENSECAG00000011905.2
F7BE23
SHANK3
90
LLPS-Eqc-1272
ENSECAG00000017604.2
F6RQQ4
SOS1
91
LLPS-Eqc-3816
ENSECAG00000020929.2
F6WA05
SQSTM1
92
LLPS-Eqc-3917
ENSECAG00000021229.2
F6T8R5
SURF6
93
LLPS-Eqc-3825
ENSECAG00000001372.2
F6XVE9
SYN1
94
LLPS-Eqc-0624
ENSECAG00000002612.2
F6YHV2
SYN2
95
LLPS-Eqc-1786
ENSECAG00000020868.2
F6TRP9
SYNGAP1
96
LLPS-Eqc-4087
ENSECAG00000000718.2
F7DSE1
TAF15
97
LLPS-Eqc-0335
ENSECAG00000008338.2
F6WAU6
TARDBP
98
LLPS-Eqc-1228
ENSECAG00000009970.2
F6Q5S4
TIAL1
99
LLPS-Eqc-0301
ENSECAG00000024424.2
F6QPI5
TNPO1
100
LLPS-Eqc-1461
ENSECAG00000009759.2
F6RUY8
TNRC6B
101
LLPS-Eqc-0097
ENSECAG00000008126.2
P79892
TP53
102
LLPS-Eqc-0069
ENSECAG00000034230.1
F7CD56
TUBA3D
103
LLPS-Eqc-2282
ENSECAG00000021994.2
F6XF79
UBXN6
104
LLPS-Eqc-3669
ENSECAG00000012944.2
F6PH09
UBXN8
105
LLPS-Eqc-3034
ENSECAG00000015578.2
F6TB03
WASL
106
LLPS-Eqc-1700
ENSECAG00000024920.2
F6S8L9
XPO1
107
LLPS-Eqc-0644
ENSECAG00000017464.2
F6QFK5
ZNF207