• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Xet-a099
tuba1a

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: Tubulin alpha chain
Gene Name: tuba1a, tuba1b
Ensembl Gene: ENSXETG00000011186.3
Ensembl Protein: ENSXETP00000024445.3
Organism: Xenopus tropicalis
Taxa ID: 8364
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Nucleolus, Stress granule, Postsynaptic densityPredicted from orthologs(View)

▼ FUNCTION


Tubulin is the major constituent of microtubules. It binds two moles of GTP, one at an exchangeable site on the beta chain and one at a non-exchangeable site on the alpha chain.

▼ CROSS REFERENCE


▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MRECISIHVG  QAGVQIGNAC  WELYCLEHGI  QPDGQMPSDK  TIGGGDDSFN  TFFSETGAGK  60
61    HVPRAVFVDL  EPTVIDEVRT  GTYRQLFHPE  QLITGKEDAA  NNYARGHYTI  GKEIIDLVLD  120
121   RIRKLADQCT  GLQGFLVFHS  FGGGTGSGFT  SLLMERLSVD  YGKKSKLEFS  IYPAPQVSTA  180
181   VVEPYNSILT  THTTLEHSDC  AFMVDNEAIY  DICRRNLDIE  RPTYTNLNRL  IGQIVSSITA  240
241   SLRFDGALNV  DLTEFQTNLV  PYPRIHFPLA  TYAPVISAEK  AYHEQLSVAE  ITNACFEPAN  300
301   QMVKCDPRHG  KYMACCLLYR  GDVVPKDVNA  AIATIKTKRT  IQFVDWCPTG  FKVGINYQPP  360
361   TVVPGGDLAK  VQRAVCMLSN  TTAIAEAWAR  LDHKFDLMYA  KRAFVHWYVG  EGMEEGEFSE  420
421   AREDMAALEK  DYEEVGVDSV  EGEGEEEGEE  Y  451
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGCGTGAGT  GCATCTCTAT  ACACGTTGGC  CAGGCTGGTG  TGCAGATCGG  CAATGCCTGC  60
61    TGGGAACTGT  ATTGTCTGGA  ACATGGCATC  CAACCTGATG  GGCAGATGCC  CAGTGACAAG  120
121   ACCATTGGAG  GAGGGGACGA  CTCCTTCAAC  ACCTTTTTCA  GTGAAACTGG  AGCAGGAAAG  180
181   CATGTCCCCA  GGGCTGTCTT  TGTAGACTTG  GAACCCACTG  TCATTGATGA  GGTGCGCACT  240
241   GGCACATACC  GCCAACTCTT  CCACCCAGAG  CAACTTATCA  CTGGAAAGGA  AGATGCTGCC  300
301   AATAACTATG  CCCGTGGTCA  CTACACAATT  GGCAAGGAGA  TCATTGACCT  GGTGCTGGAC  360
361   AGGATCCGCA  AACTGGCTGA  CCAGTGCACA  GGTCTCCAGG  GTTTCCTGGT  CTTCCACAGC  420
421   TTTGGTGGTG  GTACTGGTTC  TGGATTCACC  TCCCTGCTGA  TGGAGCGTCT  CTCTGTTGAT  480
481   TATGGAAAGA  AGTCTAAACT  AGAGTTCTCC  ATCTATCCAG  CTCCTCAGGT  CTCCACAGCT  540
541   GTGGTTGAGC  CCTACAACTC  TATACTCACC  ACTCACACCA  CCCTGGAGCA  CTCTGACTGT  600
601   GCTTTCATGG  TAGACAATGA  GGCCATTTAT  GACATCTGCC  GCAGGAATCT  AGATATTGAA  660
661   CGCCCAACCT  ACACCAACCT  GAACAGGCTT  ATAGGCCAGA  TTGTGTCTTC  CATCACAGCC  720
721   TCTCTGAGGT  TTGATGGAGC  CCTGAATGTA  GATCTCACAG  AGTTCCAGAC  CAACTTGGTG  780
781   CCCTATCCCC  GTATTCACTT  CCCTCTTGCC  ACCTATGCCC  CTGTCATCTC  TGCAGAGAAG  840
841   GCTTATCACG  AGCAGCTTTC  TGTTGCTGAG  ATCACAAATG  CCTGCTTTGA  ACCAGCTAAC  900
901   CAGATGGTGA  AATGTGATCC  ACGCCACGGT  AAATACATGG  CTTGTTGCCT  GTTGTACCGT  960
961   GGTGATGTGG  TACCCAAAGA  TGTAAATGCA  GCTATTGCCA  CCATCAAGAC  AAAGCGTACC  1020
1021  ATCCAGTTTG  TGGATTGGTG  CCCAACTGGT  TTCAAAGTTG  GTATCAACTA  TCAGCCCCCA  1080
1081  ACTGTGGTTC  CAGGGGGAGA  CCTGGCTAAG  GTGCAGCGTG  CTGTGTGTAT  GCTGAGCAAT  1140
1141  ACCACTGCAA  TTGCTGAGGC  CTGGGCTCGT  CTGGACCACA  AGTTTGATCT  CATGTATGCC  1200
1201  AAGCGTGCCT  TCGTGCACTG  GTATGTGGGT  GAGGGTATGG  AGGAGGGTGA  GTTCTCTGAG  1260
1261  GCCCGTGAAG  ACATGGCTGC  CCTGGAGAAG  GATTATGAGG  AGGTTGGTGT  AGACTCTGTG  1320
1321  GAAGGAGAGG  GTGAAGAGGA  AGGAGAAGAA  TATTAA  1356

▼ KEYWORD


ID
Family
Complete proteome
Cytoplasm
Cytoskeleton
GTP-binding
Microtubule
Nucleotide-binding
Reference proteome

▼ GENE ONTOLOGY


ID
Classification
Description
Cellular Component
Cytoplasm
Cellular Component
Microtubule
Molecular Function
GTP binding
Molecular Function
GTPase activity
Molecular Function
Structural constituent of cytoskeleton
Biological Process
Microtubule cytoskeleton organization
Biological Process
Microtubule-based process
Biological Process
Mitotic cell cycle

▼ KEGG