• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Thc-2281
TCM_026351

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: GDP-mannose 3,5-epimerase 1
Gene Name: TCM_026351
Ensembl Gene: TCM_026351
Ensembl Protein: EOY11078
Organism: Theobroma cacao
Taxa ID: 3641
LLPS Type: Client


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblEOY11078EOY11078
UniProtA0A061F2D5, A0A061F2D5_THECC
GeneBankCM001883EOY11078.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MVALSLFIER  RALQASQSIP  IRLLSQVSTL  SRSLHLSLLF  KSSQLLTRFR  MGSADGTNYG  60
61    AFTYEALERE  PYWPSEKLRI  SITGAGGFIA  SHIARRLKSE  GHYIIASDWK  KNEHMTEDMF  120
121   CHEFHLADLR  VMDNCLKVTN  GVDHVFNLAA  DMGGMGFIQS  NHSVIMYNNT  MISFNMLEAA  180
181   RINGVKRFFY  ASSACIYPEF  KQLETNVSLK  ESDAWPAEPQ  DAYGLEKLAT  EELCKHYTKD  240
241   FGIECRIGRF  HNIYGPFGTW  KGGREKAPAA  FCRKAITSTD  KFEMWGDGLQ  TRSFTFIDEC  300
301   VEGVLRLTKS  DFREPVNIGS  DEMVSMNEMA  EIVLSFEDKK  LPIHHIPGPE  GVRGRNSDNT  360
361   LIKEKLGWAP  TMRLKDGLRI  TYFWIKEQIE  KEKSQGIDLT  IYGSSKVVGT  QAPVQLGSLR  420
421   AADGKE  426
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGTGGCTC  TCTCTCTATT  TATAGAAAGG  AGAGCGTTAC  AGGCTTCACA  ATCCATACCC  60
61    ATTCGTCTCC  TATCTCAAGT  TTCCACCCTT  TCTCGCTCCT  TGCATTTATC  TCTTCTCTTC  120
121   AAAAGTTCCC  AACTTTTAAC  TCGTTTCAGA  ATGGGAAGTG  CTGATGGGAC  CAACTATGGT  180
181   GCTTTCACCT  ATGAGGCCCT  GGAGAGGGAG  CCTTACTGGC  CATCTGAGAA  ACTCCGAATT  240
241   TCAATTACTG  GGGCAGGTGG  GTTCATTGCA  TCCCACATTG  CTCGACGTCT  GAAGAGTGAA  300
301   GGCCATTACA  TCATTGCTTC  TGACTGGAAG  AAGAATGAGC  ACATGACTGA  AGATATGTTT  360
361   TGTCATGAAT  TCCATCTCGC  TGATCTTCGG  GTCATGGACA  ATTGCTTGAA  AGTTACCAAT  420
421   GGAGTGGATC  ATGTTTTCAA  CCTTGCTGCC  GATATGGGTG  GGATGGGTTT  TATTCAGTCC  480
481   AATCACTCTG  TCATTATGTA  CAACAACACA  ATGATCAGTT  TCAACATGCT  TGAGGCTGCT  540
541   AGGATCAACG  GAGTTAAGAG  GTTTTTCTAT  GCCTCCAGTG  CTTGTATCTA  CCCTGAATTT  600
601   AAGCAGTTGG  AGACTAATGT  GAGCTTGAAA  GAATCCGATG  CCTGGCCTGC  TGAGCCTCAA  660
661   GATGCTTATG  GCTTGGAGAA  GCTTGCGACA  GAGGAGTTGT  GCAAGCACTA  CACTAAAGAC  720
721   TTTGGAATTG  AATGTCGCAT  TGGACGGTTC  CACAACATTT  ATGGCCCTTT  TGGAACATGG  780
781   AAAGGTGGAA  GGGAGAAGGC  TCCAGCTGCC  TTTTGCAGAA  AAGCTATTAC  ATCCACCGAT  840
841   AAGTTTGAGA  TGTGGGGAGA  TGGTCTTCAG  ACCCGATCTT  TCACCTTCAT  TGATGAATGT  900
901   GTAGAAGGTG  TACTTAGATT  GACGAAGTCT  GATTTCCGTG  AGCCTGTGAA  CATTGGAAGC  960
961   GATGAGATGG  TTAGCATGAA  TGAGATGGCT  GAGATTGTTC  TTAGCTTTGA  GGATAAAAAG  1020
1021  CTTCCAATTC  ATCATATCCC  TGGTCCAGAG  GGTGTCCGTG  GTCGTAATTC  AGACAATACA  1080
1081  TTGATCAAAG  AAAAACTTGG  GTGGGCTCCC  ACGATGAGGT  TGAAGGATGG  CCTGAGAATT  1140
1141  ACATACTTCT  GGATCAAGGA  ACAAATTGAG  AAAGAGAAGT  CTCAAGGCAT  TGACCTGACT  1200
1201  ATTTATGGGT  CATCTAAGGT  GGTGGGAACT  CAAGCACCAG  TTCAGTTGGG  CTCACTTCGT  1260
1261  GCTGCAGACG  GCAAAGAATG  A  1281

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Gor-0311Gossypium raimondii97.070.0 774
LLPS-Mae-0410Manihot esculenta96.810.0 771
LLPS-Coc-1829Corchorus capsularis96.540.0 766
LLPS-Viv-1562Vitis vinifera95.740.0 764
LLPS-Hea-1014Helianthus annuus95.510.0 638
LLPS-Pot-1756Populus trichocarpa95.480.0 760
LLPS-Prp-1448Prunus persica94.950.0 756
LLPS-Cus-1158Cucumis sativus94.950.0 759
LLPS-Amt-0372Amborella trichopoda94.710.0 756
LLPS-Lep-1525Leersia perrieri93.920.0 751
LLPS-Sol-2338Solanum lycopersicum93.880.0 753
LLPS-Nia-2446Nicotiana attenuata93.620.0 752
LLPS-Dac-0111Daucus carota93.620.0 750
LLPS-Orp-1092Oryza punctata93.420.0 752
LLPS-Orbr-0497Oryza brachyantha93.390.0 748
LLPS-Sei-0164Setaria italica93.140.0 751
LLPS-Ors-0590Oryza sativa93.120.0 747
LLPS-Orr-1999Oryza rufipogon93.120.0 747
LLPS-Orm-2013Oryza meridionalis93.120.0 747
LLPS-Org-2112Oryza glaberrima93.120.0 747
LLPS-Orb-0842Oryza barthii93.120.0 747
LLPS-Orgl-1609Oryza glumaepatula93.120.0 747
LLPS-Glm-0163Glycine max93.090.0 751
LLPS-Sob-2268Sorghum bicolor92.860.0 746
LLPS-Ori-2229Oryza indica92.860.0 745
LLPS-Orni-1821Oryza nivara92.860.0 745
LLPS-Brr-1951Brassica rapa92.720.0 733
LLPS-Mua-0077Musa acuminata92.370.0 747
LLPS-Brd-1567Brachypodium distachyon92.350.0 741
LLPS-Zem-0462Zea mays92.330.0 743
LLPS-Met-1387Medicago truncatula92.330.0 739
LLPS-Hov-1554Hordeum vulgare92.330.0 720
LLPS-Phv-0708Phaseolus vulgaris92.290.0 744
LLPS-Tra-1948Triticum aestivum92.060.0 733
LLPS-Tru-1484Triticum urartu91.780.0 715
LLPS-Via-1555Vigna angularis91.760.0 745
LLPS-Arl-1059Arabidopsis lyrata91.510.0 740
LLPS-Sot-2203Solanum tuberosum91.490.0 735
LLPS-Art-0516Arabidopsis thaliana91.250.0 735
LLPS-Bro-0856Brassica oleracea91.080.0 735
LLPS-Brn-0261Brassica napus91.080.0 738
LLPS-Sem-0037Selaginella moellendorffii88.980.0 706
LLPS-Vir-0124Vigna radiata87.770.0 700
LLPS-Php-2255Physcomitrella patens87.470.0 690
LLPS-Chr-0014Chlamydomonas reinhardtii76.390.0 603
LLPS-Osl-1059Ostreococcus lucimarinus70.280.0 553
LLPS-Chc-0017Chondrus crispus68.141e-171 492
LLPS-Gas-0813Galdieria sulphuraria67.358e-175 500
LLPS-Cym-0195Cyanidioschyzon merolae64.744e-174 499
LLPS-Miv-1088Microbotryum violaceum28.622e-2097.4