• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Thc-2255
TCM_034759

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Cyclin A3,1
Gene Name: TCM_034759
Ensembl Gene: TCM_034759
Ensembl Protein: EOY15801
Organism: Theobroma cacao
Taxa ID: 3641
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblEOY15801EOY15801
UniProtA0A061FFH1, A0A061FFH1_THECC
GeneBankCM001886EOY15801.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MADQENCARV  TRAAAKKRAA  EAAGIMEERV  TNKKRVVLGE  LSNLSNVLSV  NKALGKENRK  60
61    QQPKVKGKAK  TRVAKPALKE  KKEEAQDEKD  VDIDAKSDNP  QMCGHYVSDI  YEYLHQMEVD  120
121   PKRRPLPDYI  EKVQKDVTAN  MRGILVDWLV  EVAEEYKLVS  DTLYMTISYI  DRFLSLNTLN  180
181   RQRLQLLGVS  SMLIASKYEE  INPPNVEDFC  YITDNTYTKD  EVVKMEADIL  KSLKFELGNP  240
241   TIKTFLRRLT  RVAQEDNKAS  SLQLEFLGYY  LAELSLLDYG  CVKFLPSMVA  ASVTFLTRFI  300
301   IQPKRHPWSS  AVQQYSGYKA  SDLKECVLII  HDLYLSRRGG  ALQAVREKYK  QHKFKCVAMM  360
361   PASPEIPASY  FEDVQEVDIS  YAEDVQVVKV  390
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGCCGATC  AGGAGAACTG  TGCGAGAGTG  ACGAGGGCGG  CCGCCAAGAA  GAGGGCTGCC  60
61    GAGGCGGCGG  GGATAATGGA  GGAGAGGGTG  ACGAACAAGA  AGAGGGTTGT  TTTGGGGGAG  120
121   CTTTCCAACT  TGTCTAACGT  TCTTTCGGTG  AATAAAGCGC  TGGGGAAGGA  GAACCGGAAG  180
181   CAGCAGCCTA  AAGTGAAGGG  GAAGGCAAAG  ACGAGAGTCG  CAAAGCCAGC  GTTGAAGGAG  240
241   AAGAAAGAGG  AAGCTCAAGA  TGAAAAAGAT  GTGGATATTG  ATGCTAAATC  TGATAACCCA  300
301   CAAATGTGTG  GGCATTATGT  GTCTGATATC  TATGAATATC  TTCACCAAAT  GGAGGTGGAT  360
361   CCGAAGAGAA  GACCTTTACC  TGATTATATT  GAGAAGGTAC  AGAAGGATGT  TACCGCAAAT  420
421   ATGAGAGGGA  TTTTGGTGGA  TTGGCTAGTA  GAAGTTGCAG  AGGAATACAA  GCTTGTTTCA  480
481   GATACTTTAT  ATATGACCAT  TTCTTACATC  GATAGATTCT  TATCGTTAAA  TACTCTAAAT  540
541   AGGCAAAGGC  TTCAGCTACT  GGGTGTATCT  TCAATGCTCA  TTGCCTCAAA  GTATGAGGAA  600
601   ATCAATCCTC  CAAATGTGGA  AGATTTTTGC  TATATAACGG  ATAATACATA  CACTAAAGAT  660
661   GAGGTAGTGA  AAATGGAGGC  AGATATACTC  AAGTCCTTGA  AGTTTGAATT  GGGCAATCCT  720
721   ACAATTAAAA  CATTTCTGAG  GAGACTTACC  AGAGTTGCAC  AAGAGGATAA  CAAGGCTTCC  780
781   AGCTTGCAGC  TAGAGTTCCT  TGGATATTAC  CTTGCAGAGT  TGAGTTTGTT  GGACTATGGA  840
841   TGTGTAAAAT  TTTTACCGTC  TATGGTTGCT  GCTTCTGTTA  CTTTTCTTAC  AAGATTCATA  900
901   ATTCAACCAA  AGAGACATCC  TTGGAGCTCT  GCTGTGCAAC  AATACTCAGG  TTACAAAGCA  960
961   TCTGATCTAA  AAGAATGTGT  CCTTATCATA  CATGACTTGT  ACTTGAGTAG  AAGAGGAGGT  1020
1021  GCACTTCAAG  CAGTTAGAGA  AAAATACAAG  CAGCATAAGT  TCAAATGCGT  GGCAATGATG  1080
1081  CCTGCTTCTC  CGGAGATTCC  CGCTTCTTAT  TTTGAAGATG  TTCAAGAAGT  TGATATTTCC  1140
1141  TATGCTGAAG  ATGTTCAAGT  GGTGAAAGTT  TGA  1173

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Gor-0465Gossypium raimondii85.270.0 590
LLPS-Coc-1065Corchorus capsularis83.290.0 602
LLPS-Mae-1500Manihot esculenta74.272e-177 506
LLPS-Viv-1434Vitis vinifera72.74e-164 472
LLPS-Met-0743Medicago truncatula72.565e-136 400
LLPS-Pot-0015Populus trichocarpa71.733e-174 498
LLPS-Mua-2092Musa acuminata69.896e-131 386
LLPS-Sob-1590Sorghum bicolor68.481e-127 382
LLPS-Orr-1234Oryza rufipogon68.488e-121 362
LLPS-Ori-1243Oryza indica68.122e-119 358
LLPS-Lep-2172Leersia perrieri67.639e-121 362
LLPS-Zem-1750Zea mays67.397e-127 380
LLPS-Tra-1319Triticum aestivum67.033e-127 379
LLPS-Tru-0984Triticum urartu66.932e-117 349
LLPS-Arl-2435Arabidopsis lyrata66.41e-160 463
LLPS-Art-3083Arabidopsis thaliana66.47e-157 453
LLPS-Brn-2448Brassica napus66.382e-152 442
LLPS-Brr-0014Brassica rapa66.383e-152 442
LLPS-Nia-0180Nicotiana attenuata66.386e-156 451
LLPS-Bro-0338Brassica oleracea66.382e-152 442
LLPS-Hov-2142Hordeum vulgare66.33e-125 376
LLPS-Cus-0897Cucumis sativus66.291e-157 456
LLPS-Vir-0937Vigna radiata66.297e-118 353
LLPS-Ors-0209Oryza sativa66.185e-115 348
LLPS-Orni-0998Oryza nivara65.814e-114 345
LLPS-Orgl-0489Oryza glumaepatula65.811e-114 347
LLPS-Org-0522Oryza glaberrima65.811e-114 347
LLPS-Hea-1621Helianthus annuus64.811e-145 426
LLPS-Prp-1281Prunus persica64.812e-154 448
LLPS-Sot-1084Solanum tuberosum62.965e-152 441
LLPS-Orp-2374Oryza punctata61.817e-125 372
LLPS-Dac-1676Daucus carota60.91e-142 417
LLPS-Sol-2448Solanum lycopersicum60.853e-146 427
LLPS-Sem-0233Selaginella moellendorffii59.641e-105 324
LLPS-Brd-1166Brachypodium distachyon59.481e-131 390
LLPS-Sei-0662Setaria italica58.263e-123 369
LLPS-Amt-0073Amborella trichopoda57.032e-92 295
LLPS-Php-1316Physcomitrella patens56.896e-105 326
LLPS-Phv-0572Phaseolus vulgaris56.762e-127 378
LLPS-Via-2386Vigna angularis55.21e-94 298
LLPS-Orb-1405Oryza barthii54.122e-90 288
LLPS-Orm-1269Oryza meridionalis54.123e-91 290
LLPS-Orbr-0060Oryza brachyantha53.551e-96 304
LLPS-Xet-2370Xenopus tropicalis46.789e-53 187
LLPS-Asm-3410Astyanax mexicanus46.095e-57 198
LLPS-Tar-2475Takifugu rubripes45.561e-57 200
LLPS-Xim-3658Xiphophorus maculatus45.423e-56 197
LLPS-Scm-3134Scophthalmus maximus45.352e-53 189
LLPS-Sah-0885Sarcophilus harrisii45.312e-56 195
LLPS-Leo-1110Lepisosteus oculatus45.313e-55 194
LLPS-Icp-2043Ictalurus punctatus45.315e-55 193
LLPS-Anc-0543Anolis carolinensis45.311e-59 203
LLPS-Tag-1145Taeniopygia guttata45.312e-58 202
LLPS-Gaga-2191Gallus gallus45.214e-57 198
LLPS-Pof-1325Poecilia formosa45.049e-56 195
LLPS-Orn-0969Oreochromis niloticus44.966e-56 196
LLPS-Ten-1430Tetraodon nigroviridis44.963e-56 196
LLPS-Bot-0520Bos taurus44.924e-56 196
LLPS-Ova-1750Ovis aries44.923e-56 196
LLPS-Pes-0150Pelodiscus sinensis44.926e-59 202
LLPS-Gaa-0880Gasterosteus aculeatus44.572e-53 189
LLPS-Tut-1450Tursiops truncatus44.531e-55 195
LLPS-Ict-3608Ictidomys tridecemlineatus44.537e-56 195
LLPS-Ora-1781Ornithorhynchus anatinus44.148e-55 191
LLPS-Scf-2728Scleropages formosus44.146e-56 196
LLPS-Aim-0466Ailuropoda melanoleuca44.148e-56 195
LLPS-Urm-1998Ursus maritimus44.149e-56 195
LLPS-Mod-2216Monodelphis domestica44.142e-54 191
LLPS-Fec-3039Felis catus44.148e-56 195
LLPS-Otg-0357Otolemur garnettii44.142e-55 194
LLPS-Caf-0660Canis familiaris44.147e-56 195
LLPS-Eqc-0576Equus caballus44.142e-57 195
LLPS-Meg-2623Meleagris gallopavo44.051e-55 189
LLPS-Orl-2998Oryzias latipes43.911e-55 195
LLPS-Mea-1673Mesocricetus auratus43.757e-54 190
LLPS-Aon-1841Aotus nancymaae43.752e-55 194
LLPS-Caj-2864Callithrix jacchus43.752e-55 194
LLPS-Pap-4193Pan paniscus43.753e-55 195
LLPS-Pat-0566Pan troglodytes43.758e-56 195
LLPS-Hos-0966Homo sapiens43.753e-55 194
LLPS-Cap-2637Cavia porcellus43.751e-54 192
LLPS-Cas-2712Carlito syrichta43.753e-55 194
LLPS-Mum-1706Mus musculus43.362e-53 189
LLPS-Maf-3673Macaca fascicularis43.368e-55 192
LLPS-Chs-0576Chlorocebus sabaeus43.367e-55 193
LLPS-Cea-1906Cercocebus atys43.368e-55 192
LLPS-Gog-3025Gorilla gorilla43.361e-54 192
LLPS-Fud-1076Fukomys damarensis43.362e-54 191
LLPS-Ran-1066Rattus norvegicus43.362e-53 189
LLPS-Mal-1878Mandrillus leucophaeus43.368e-55 192
LLPS-Paa-4030Papio anubis43.368e-55 192
LLPS-Myl-0761Myotis lucifugus43.361e-55 194
LLPS-Mup-0448Mustela putorius furo43.363e-55 194
LLPS-Man-1444Macaca nemestrina43.369e-55 192
LLPS-Orc-0676Oryctolagus cuniculus43.361e-54 192
LLPS-Rhb-1973Rhinopithecus bieti43.368e-55 192
LLPS-Poa-3707Pongo abelii43.361e-54 192
LLPS-Mam-3910Macaca mulatta43.368e-55 192
LLPS-Nol-2394Nomascus leucogenys43.361e-54 192
LLPS-Cis-1560Ciona savignyi43.215e-57 193
LLPS-Cii-1746Ciona intestinalis43.131e-62 213
LLPS-Dio-2676Dipodomys ordii42.974e-54 191
LLPS-Ere-0503Erinaceus europaeus42.971e-54 187
LLPS-Anp-2725Anas platyrhynchos42.914e-57 194
LLPS-Loa-1010Loxodonta africana42.647e-53 187
LLPS-Sus-2219Sus scrofa41.834e-52 185
LLPS-Fia-0463Ficedula albicollis41.737e-54 189
LLPS-Chr-0822Chlamydomonas reinhardtii39.297e-67 224