• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Thc-1055
TCM_040022

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: ARM repeat superfamily protein isoform 3
Gene Name: TCM_040022
Ensembl Gene: TCM_040022
Ensembl Protein: EOY32287
Organism: Theobroma cacao
Taxa ID: 3641
LLPS Type: LLPS regulator


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Nuclear pore complex, Nucleolus, Stress granule, OthersPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblEOY32287EOY32287
EnsemblEOY32289EOY32289
EnsemblEOY32288EOY32288
UniProtA0A061GYQ5, A0A061GYQ5_THECC
GeneBankCM001887EOY32289.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MDQQSQLAVI  LGPDPAPFET  LISHLMSSSN  EQRSHAEVLF  NLCKQSDPDA  LCLRLAHLLQ  60
61    VCAQPETRAM  AAILLRKLLT  RDDSYIWPRL  NISTQSSLKS  VLLAQIQVEN  TKTLSKKLCD  120
121   TVAELASSIL  PENGWPELLP  FMFQCVSSDS  PRLQESAFLI  FAQLSQYIGD  VLTPFIKDLH  180
181   AVFLRCLSES  SNADVKIAAL  NAVINFIQCL  TSLSDRDRFQ  DLLPAMMRTL  TEALNNGNEA  240
241   TAQEALELLI  ELAGTEPRFL  RRQLVDVVGS  MLQIAEAESL  EEGTRHLAIE  FVITLAEARE  300
301   RAPGMMRKLP  QFISRLFAIL  MGMLLDIEDD  PAWYTAETED  EDAGETSNYS  VGQECLDRLA  360
361   ISLGGNTIVP  VASEQLPAYL  AASEWQKHHA  ALIALAQIAE  GCAKVMIKNL  EQVVSMVLNS  420
421   FHDSHPRVRW  AAINAIGQLS  TDLGPDLQNQ  YHQRVLPALA  AAMDDFQNPR  VQAHAASAVL  480
481   NFSENCTPEI  LTPYLDGIVS  KLLVLLQNGK  QMVQEGALTA  LASVADSSQE  HFQKYYDAVM  540
541   PYLKTILVNA  TDKSNRMLRA  KSMECISLVG  MAVGKEKFRD  DAKQVMEVLM  SLQGSQMETD  600
601   DPTTSYMLQA  WARLCKCLGQ  DFLPYMRVVM  PPLLQSAQLK  PDVTITSADS  DNDIEDSDDE  660
661   SMETITLGDK  RIGIKTSVLE  EKATACNMLC  CYADELKEGF  FPWIDQVAPT  LVPLLKFYFH  720
721   EEVRKAAVSA  MPELLRSAKL  AVEKGMAQGR  NETYVKQLSD  FIIPALVEAL  HKEPDTEICA  780
781   SMLDALNECL  QQITGPLLDE  GQVRSIVDEI  KQVITASASR  KRERAERAKA  EDFDAEEGEF  840
841   VKEENEQEEE  VFDQVGEILG  TLIKTFKASF  LPFFDELSSY  LTPMWGKDKT  AEERRIAICI  900
901   FDDIAEQCRE  AALKYYETYL  PFILEACNDE  NPDVRQQAAV  YGLGVCAEFG  GPVFKPLVGE  960
961   ALSRLNVVIR  HPNALQPENV  MAYDNAVSAL  GKICLFHRDR  IDAAQVVPAW  LNCLPIKGDL  1020
1021  IEAKVVHEQL  CSMVERSDNE  VLGPNHQYLP  KIVAVFAEVL  CGKDLATEQT  ASRMVNLLRQ  1080
1081  LQQTLPPATL  ASTWSSLQPQ  QQLALQSILS  1110
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGACCAGC  AATCTCAGCT  CGCCGTCATC  TTAGGACCCG  ACCCCGCTCC  TTTCGAAACC  60
61    CTAATCTCCC  ACTTGATGTC  CTCCTCCAAC  GAACAACGTT  CTCACGCCGA  GGTCTTATTC  120
121   AATCTTTGCA  AGCAGTCGGA  CCCAGACGCC  CTCTGTCTCC  GCCTCGCTCA  CCTCCTCCAA  180
181   GTCTGCGCTC  AACCTGAGAC  TCGTGCCATG  GCCGCTATTC  TCCTCCGTAA  GCTCTTGACA  240
241   CGTGACGACT  CTTATATCTG  GCCTCGCCTC  AACATCTCCA  CCCAGTCCTC  CCTCAAATCG  300
301   GTGCTTTTGG  CTCAAATCCA  AGTCGAAAAC  ACTAAAACTT  TGTCTAAAAA  GTTGTGCGAC  360
361   ACTGTTGCGG  AGCTTGCTTC  CAGTATTTTG  CCAGAGAATG  GCTGGCCGGA  GCTTTTGCCG  420
421   TTTATGTTCC  AGTGTGTCTC  TTCGGATTCC  CCTAGATTGC  AGGAATCCGC  CTTTTTGATA  480
481   TTCGCTCAGC  TGAGTCAGTA  TATCGGTGAT  GTCTTGACTC  CTTTTATAAA  GGATCTACAC  540
541   GCTGTGTTCT  TGAGGTGCTT  GAGTGAAAGT  TCTAATGCCG  ACGTCAAAAT  CGCCGCGTTG  600
601   AATGCTGTCA  TCAACTTTAT  TCAGTGTTTG  ACCAGCTTAT  CTGATAGGGA  TAGGTTTCAG  660
661   GATCTTTTGC  CGGCGATGAT  GAGGACCTTG  ACGGAAGCTT  TGAATAACGG  GAACGAGGCC  720
721   ACCGCTCAGG  AAGCGCTGGA  GTTGTTGATT  GAGTTGGCAG  GGACGGAGCC  ACGGTTTCTT  780
781   CGGAGGCAGC  TTGTTGATGT  GGTGGGGTCT  ATGCTGCAGA  TTGCGGAGGC  AGAATCACTT  840
841   GAGGAAGGGA  CACGTCACTT  GGCGATTGAG  TTTGTTATTA  CCTTGGCAGA  AGCAAGGGAA  900
901   CGTGCCCCTG  GAATGATGAG  GAAGTTGCCG  CAGTTTATTA  GCAGGCTATT  TGCAATTTTG  960
961   ATGGGAATGT  TGCTGGATAT  TGAGGATGAT  CCAGCATGGT  ACACTGCAGA  AACTGAGGAC  1020
1021  GAAGATGCTG  GAGAGACTAG  CAATTACAGT  GTTGGGCAGG  AGTGTTTGGA  TCGTTTGGCT  1080
1081  ATATCCTTGG  GTGGAAATAC  AATTGTTCCA  GTTGCATCCG  AGCAGTTGCC  AGCTTATTTG  1140
1141  GCTGCTTCTG  AGTGGCAAAA  GCACCATGCT  GCATTGATTG  CCCTTGCACA  GATTGCTGAG  1200
1201  GGTTGTGCCA  AGGTCATGAT  TAAAAATCTG  GAACAAGTGG  TTTCGATGGT  CTTGAACTCC  1260
1261  TTTCATGATT  CCCATCCCCG  TGTGAGGTGG  GCAGCTATTA  ATGCAATTGG  ACAATTGTCT  1320
1321  ACTGATTTGG  GCCCGGATTT  GCAAAACCAA  TATCATCAAA  GAGTATTACC  AGCACTAGCT  1380
1381  GCTGCCATGG  ACGACTTCCA  GAATCCACGA  GTACAGGCAC  ATGCTGCTTC  AGCTGTGCTC  1440
1441  AACTTCAGTG  AGAACTGCAC  TCCGGAAATT  TTAACACCTT  ACTTGGATGG  AATAGTTAGC  1500
1501  AAATTACTTG  TACTTTTACA  GAATGGGAAA  CAAATGGTGC  AAGAAGGTGC  CTTGACAGCT  1560
1561  TTGGCATCAG  TTGCTGACTC  ATCTCAGGAG  CACTTCCAAA  AATATTATGA  TGCAGTTATG  1620
1621  CCTTACCTGA  AAACTATCTT  GGTGAATGCG  ACTGACAAAT  CTAACCGCAT  GCTTCGTGCC  1680
1681  AAATCCATGG  AATGCATTAG  TCTTGTTGGA  ATGGCTGTCG  GGAAGGAGAA  GTTCAGAGAT  1740
1741  GATGCCAAGC  AGGTTATGGA  AGTGCTTATG  TCATTGCAAG  GATCCCAAAT  GGAAACAGAT  1800
1801  GATCCGACAA  CAAGTTACAT  GCTGCAAGCA  TGGGCCAGAC  TGTGCAAGTG  TTTGGGACAA  1860
1861  GACTTCCTCC  CTTACATGAG  AGTTGTCATG  CCTCCCCTTC  TCCAGTCTGC  TCAACTTAAG  1920
1921  CCAGATGTAA  CTATTACATC  TGCAGATTCA  GATAATGACA  TTGAGGACTC  TGATGATGAA  1980
1981  AGTATGGAAA  CCATTACTCT  TGGGGACAAA  AGAATTGGGA  TCAAGACTAG  CGTCCTGGAG  2040
2041  GAAAAGGCTA  CAGCATGTAA  CATGCTGTGC  TGCTATGCTG  ATGAGTTGAA  GGAAGGATTT  2100
2101  TTTCCATGGA  TAGATCAGGT  TGCCCCGACT  CTAGTTCCTC  TTCTTAAATT  TTATTTCCAT  2160
2161  GAGGAAGTTA  GAAAAGCTGC  TGTTTCAGCT  ATGCCGGAGT  TACTGCGCTC  TGCAAAATTA  2220
2221  GCTGTGGAGA  AGGGGATGGC  TCAGGGGCGT  AATGAGACTT  ATGTAAAGCA  ATTGTCTGAC  2280
2281  TTCATTATTC  CAGCTCTGGT  GGAGGCATTA  CATAAGGAGC  CTGATACGGA  AATATGTGCA  2340
2341  AGCATGTTGG  ATGCATTGAA  CGAATGCTTG  CAGATCACTG  GTCCACTTTT  AGATGAAGGC  2400
2401  CAGGTTAGAT  CTATTGTGGA  CGAGATAAAA  CAAGTAATCA  CAGCTAGTGC  GAGCAGAAAA  2460
2461  AGGGAGAGAG  CTGAAAGAGC  CAAAGCTGAA  GACTTTGATG  CTGAGGAGGG  AGAGTTTGTT  2520
2521  AAAGAGGAAA  ATGAGCAGGA  GGAAGAAGTT  TTTGACCAAG  TGGGTGAAAT  CTTGGGTACT  2580
2581  TTGATAAAAA  CATTTAAAGC  CTCTTTCTTG  CCATTCTTTG  ATGAGCTATC  TTCATATCTT  2640
2641  ACACCTATGT  GGGGCAAGGA  TAAGACAGCT  GAAGAAAGAA  GAATTGCAAT  TTGTATTTTT  2700
2701  GATGATATTG  CAGAGCAGTG  TCGTGAGGCA  GCTCTAAAAT  ATTATGAGAC  ATATCTTCCT  2760
2761  TTCATATTGG  AGGCTTGCAA  TGATGAGAAC  CCAGATGTGC  GACAGGCAGC  AGTATATGGG  2820
2821  CTTGGTGTTT  GTGCGGAATT  TGGTGGGCCT  GTATTTAAAC  CTCTTGTTGG  AGAGGCTCTA  2880
2881  TCAAGGTTAA  ATGTTGTAAT  ACGGCATCCT  AATGCTTTAC  AACCTGAAAA  TGTGATGGCA  2940
2941  TATGATAATG  CTGTTTCTGC  ATTAGGAAAA  ATATGCCTGT  TCCATCGTGA  CAGGATTGAT  3000
3001  GCAGCTCAGG  TTGTTCCTGC  ATGGTTAAAC  TGCTTGCCAA  TAAAAGGTGA  TCTGATTGAA  3060
3061  GCCAAAGTTG  TTCATGAACA  ACTTTGTTCA  ATGGTAGAGA  GGTCAGACAA  TGAAGTTTTG  3120
3121  GGTCCCAACC  ATCAGTATCT  TCCTAAGATT  GTTGCAGTAT  TTGCCGAGGT  TCTATGTGGT  3180
3181  AAGGATCTAG  CCACAGAACA  AACTGCAAGT  CGGATGGTGA  ATCTACTGAG  GCAGCTTCAG  3240
3241  CAGACGTTGC  CACCAGCAAC  ATTGGCCTCA  ACTTGGTCAT  CTTTGCAGCC  ACAGCAACAG  3300
3301  CTTGCTTTGC  AATCCATCCT  CTCATAG  3327

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Coc-0406Corchorus capsularis96.530.01974
LLPS-Gor-1127Gossypium raimondii96.250.01970
LLPS-Mae-1734Manihot esculenta90.670.01831
LLPS-Pot-1344Populus trichocarpa89.640.01816
LLPS-Viv-1132Vitis vinifera89.570.01827
LLPS-Prp-0954Prunus persica89.390.01830
LLPS-Cus-0504Cucumis sativus88.390.01807
LLPS-Glm-1222Glycine max88.30.01774
LLPS-Sol-1073Solanum lycopersicum88.010.01795
LLPS-Sot-0465Solanum tuberosum88.010.01796
LLPS-Phv-0913Phaseolus vulgaris87.930.01764
LLPS-Via-0318Vigna angularis87.840.01762
LLPS-Met-1876Medicago truncatula87.480.01766
LLPS-Nia-0307Nicotiana attenuata87.10.01793
LLPS-Hea-1172Helianthus annuus86.730.01785
LLPS-Vir-0237Vigna radiata86.20.01720
LLPS-Arl-1452Arabidopsis lyrata84.080.01749
LLPS-Brn-0304Brassica napus83.950.01635
LLPS-Art-0699Arabidopsis thaliana83.710.01738
LLPS-Dac-1549Daucus carota83.360.01681
LLPS-Bro-1001Brassica oleracea83.350.01722
LLPS-Brr-0325Brassica rapa83.160.01711
LLPS-Amt-1057Amborella trichopoda82.540.01617
LLPS-Mua-0728Musa acuminata78.210.01537
LLPS-Orbr-0986Oryza brachyantha77.880.01423
LLPS-Tru-0721Triticum urartu77.070.01405
LLPS-Ors-0097Oryza sativa75.920.01516
LLPS-Orm-0042Oryza meridionalis75.920.01516
LLPS-Orr-0706Oryza rufipogon75.920.01517
LLPS-Orb-0259Oryza barthii75.920.01516
LLPS-Orni-0524Oryza nivara75.920.01516
LLPS-Orgl-0706Oryza glumaepatula75.920.01516
LLPS-Lep-0034Leersia perrieri75.50.01523
LLPS-Sob-0185Sorghum bicolor75.390.01536
LLPS-Tra-0962Triticum aestivum75.30.01497
LLPS-Brd-1120Brachypodium distachyon75.210.01513
LLPS-Sei-0642Setaria italica75.160.01533
LLPS-Zem-0962Zea mays74.820.01528
LLPS-Orp-2235Oryza punctata74.730.01480
LLPS-Sem-0433Selaginella moellendorffii74.080.01543
LLPS-Php-0568Physcomitrella patens73.350.01494
LLPS-Org-0769Oryza glaberrima72.660.01463
LLPS-Ori-0042Oryza indica72.390.01468
LLPS-Hov-0532Hordeum vulgare70.830.01427
LLPS-Osl-0567Ostreococcus lucimarinus48.650.0 850
LLPS-Chr-0039Chlamydomonas reinhardtii41.340.0 708
LLPS-Gaga-0591Gallus gallus39.258e-168 522
LLPS-Man-0949Macaca nemestrina38.373e-41 162
LLPS-Mam-4276Macaca mulatta38.373e-41 162
LLPS-Maf-4525Macaca fascicularis38.373e-41 162
LLPS-Cea-2265Cercocebus atys38.371e-41 163
LLPS-Mal-0205Mandrillus leucophaeus38.371e-41 163
LLPS-Paa-3662Papio anubis38.371e-41 163
LLPS-Rhb-3131Rhinopithecus bieti38.133e-41 162
LLPS-Caj-4593Callithrix jacchus37.889e-42 163
LLPS-Gas-0497Galdieria sulphuraria37.530.0 629
LLPS-Pap-2368Pan paniscus37.52e-41 162
LLPS-Nol-4204Nomascus leucogenys37.52e-41 162
LLPS-Gog-0999Gorilla gorilla37.52e-41 162
LLPS-Myl-0222Myotis lucifugus37.250.0 625
LLPS-Mup-1604Mustela putorius furo37.190.0 630
LLPS-Aon-1535Aotus nancymaae37.181e-42 166
LLPS-Urm-1324Ursus maritimus37.150.0 626
LLPS-Caf-1583Canis familiaris37.020.0 625
LLPS-Anp-0815Anas platyrhynchos37.00.0 630
LLPS-Aim-0582Ailuropoda melanoleuca36.980.0 628
LLPS-Meg-1166Meleagris gallopavo36.940.0 631
LLPS-Orc-0139Oryctolagus cuniculus36.880.0 622
LLPS-Chc-0096Chondrus crispus36.860.0 593
LLPS-Fud-0838Fukomys damarensis36.850.0 620
LLPS-Fec-1845Felis catus36.720.0 637
LLPS-Eqc-0296Equus caballus36.720.0 637
LLPS-Mum-0359Mus musculus36.720.0 637
LLPS-Sus-1182Sus scrofa36.720.0 638
LLPS-Fia-0710Ficedula albicollis36.680.0 619
LLPS-Ova-1606Ovis aries36.630.0 625
LLPS-Pat-0561Pan troglodytes36.620.0 635
LLPS-Hos-0614Homo sapiens36.620.0 635
LLPS-Ora-0313Ornithorhynchus anatinus36.620.0 624
LLPS-Chs-0797Chlorocebus sabaeus36.620.0 636
LLPS-Ran-0695Rattus norvegicus36.620.0 635
LLPS-Cap-0180Cavia porcellus36.610.0 623
LLPS-Poa-1543Pongo abelii36.530.0 635
LLPS-Orl-1219Oryzias latipes36.440.0 640
LLPS-Bot-0990Bos taurus36.440.0 635
LLPS-Pes-1912Pelodiscus sinensis36.350.0 606
LLPS-Ict-0998Ictidomys tridecemlineatus36.350.0 622
LLPS-Abg-0235Absidia glauca36.330.0 607
LLPS-Mod-0118Monodelphis domestica36.240.0 628
LLPS-Pof-1041Poecilia formosa36.160.0 648
LLPS-Cas-0562Carlito syrichta36.150.0 615
LLPS-Gaa-1086Gasterosteus aculeatus36.140.0 639
LLPS-Dio-0682Dipodomys ordii36.080.0 600
LLPS-Mea-0505Mesocricetus auratus36.010.0 619
LLPS-Orn-2027Oreochromis niloticus36.00.0 646
LLPS-Anc-1623Anolis carolinensis35.990.0 622
LLPS-Icp-0160Ictalurus punctatus35.940.0 646
LLPS-Xet-0018Xenopus tropicalis35.920.0 637
LLPS-Otg-2780Otolemur garnettii35.870.0 610
LLPS-Scm-0545Scophthalmus maximus35.790.0 641
LLPS-Xim-1401Xiphophorus maculatus35.790.0 645
LLPS-Tag-0108Taeniopygia guttata35.750.0 627
LLPS-Ten-1218Tetraodon nigroviridis35.570.0 644
LLPS-Asm-0038Astyanax mexicanus35.550.0 641
LLPS-Scf-0025Scleropages formosus35.510.0 639
LLPS-Dar-2296Danio rerio35.270.0 634
LLPS-Tar-0738Takifugu rubripes35.190.0 630
LLPS-Sah-0894Sarcophilus harrisii35.060.0 597
LLPS-Lac-2315Latimeria chalumnae34.590.0 605
LLPS-Loa-3433Loxodonta africana34.445e-177 556
LLPS-Leo-1195Lepisosteus oculatus34.440.0 600
LLPS-Drm-0011Drosophila melanogaster34.360.0 608
LLPS-Scp-0265Schizosaccharomyces pombe33.582e-155 498
LLPS-Scj-0467Schizosaccharomyces japonicus33.491e-151 488
LLPS-Scc-0578Schizosaccharomyces cryophilus33.339e-153 491
LLPS-Crn-0073Cryptococcus neoformans33.081e-49 195
LLPS-Cym-0291Cyanidioschyzon merolae33.082e-112 385
LLPS-Cii-0738Ciona intestinalis33.062e-176 554
LLPS-Cis-0386Ciona savignyi32.941e-169 537
LLPS-Lem-1047Leptosphaeria maculans32.949e-138 455
LLPS-Phn-0120Phaeosphaeria nodorum32.823e-146 474
LLPS-Pyt-0136Pyrenophora teres32.752e-145 472
LLPS-Pytr-0271Pyrenophora triticirepentis32.047e-144 468
LLPS-Asn-0129Aspergillus nidulans31.815e-130 430
LLPS-Zyt-0447Zymoseptoria tritici31.792e-141 461
LLPS-Nec-0119Neurospora crassa31.682e-134 442
LLPS-Dos-0567Dothistroma septosporum31.613e-143 466
LLPS-Ast-0583Aspergillus terreus31.424e-128 426
LLPS-Aso-0331Aspergillus oryzae31.421e-128 426
LLPS-Asf-0301Aspergillus flavus31.425e-129 428
LLPS-Tum-0010Tuber melanosporum31.312e-130 432
LLPS-Fuv-0458Fusarium verticillioides31.243e-134 442
LLPS-Nef-1065Neosartorya fischeri31.062e-129 429
LLPS-Asfu-1087Aspergillus fumigatus30.975e-128 425
LLPS-Asc-0139Aspergillus clavatus30.93e-128 426
LLPS-Fus-0668Fusarium solani30.731e-130 432
LLPS-Ved-0697Verticillium dahliae30.618e-129 427
LLPS-Gag-0221Gaeumannomyces graminis30.587e-134 441
LLPS-Blg-0268Blumeria graminis30.572e-126 421
LLPS-Map-0196Magnaporthe poae30.499e-134 441
LLPS-Cogr-0387Colletotrichum graminicola30.418e-125 416
LLPS-Asni-0464Aspergillus niger30.47e-125 416
LLPS-Mao-0147Magnaporthe oryzae30.391e-134 443
LLPS-Cog-0495Colletotrichum gloeosporioides30.381e-129 429
LLPS-Coo-0363Colletotrichum orbiculare30.338e-124 414
LLPS-Yal-0004Yarrowia lipolytica30.321e-119 402
LLPS-Trv-1157Trichoderma virens30.213e-124 414
LLPS-Trr-0549Trichoderma reesei30.121e-123 413
LLPS-Beb-0043Beauveria bassiana29.395e-120 403
LLPS-Cae-0229Caenorhabditis elegans29.362e-117 396
LLPS-Miv-0049Microbotryum violaceum28.928e-58 222
LLPS-Sac-1073Saccharomyces cerevisiae28.268e-97 338
LLPS-Asg-0680Ashbya gossypii27.482e-104 360
LLPS-Kop-0114Komagataella pastoris27.313e-96 337
LLPS-Spr-0201Sporisorium reilianum23.351e-45 183
LLPS-Usm-0381Ustilago maydis23.334e-46 184
LLPS-Put-0695Puccinia triticina23.059e-46 184
LLPS-Pug-0517Puccinia graminis22.968e-48 190