• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Ten-1304

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Pumilio RNA-binding family member 2
Ensembl Gene: ENSTNIG00000003116.1
Ensembl Protein: ENSTNIP00000005688.1
Organism: Tetraodon nigroviridis
Taxa ID: 99883
LLPS Type: Regulator


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
P-body, Stress granulePredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblENSTNIT00000005836.1ENSTNIP00000005688.1
UniProtH3CBR6, H3CBR6_TETNG

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MSIPCSILGM  NDVAWQETRG  GMLHANGAPE  TGGVRVHGGG  PLAPVGGQSP  GVPHLQGMDR  60
61    VGNPTPGTPQ  PLLSGRSQDD  ATVGYFFQRQ  PGEQLGGCTP  SKHRWPTGDA  NHVDQSQLRA  120
121   VDEMNYDFQA  LALESRGMGE  LLPAKKLWDS  DELAKEGRKG  LLLGEEWREN  AWGSSHHSVS  180
181   QPIMVQRRPG  QSFHGNGDAN  SVLSPRSEGG  GLGVSMVEYV  LSSSPGDNLT  SCLHMQGAGD  240
241   AAPDGREKSD  AQEKVSPFEE  DKNQEMKVGE  ENDPAKANGR  GLLNGMDRDC  KDFNPTPGSR  300
301   QASPTEAVER  MGTSQSGMEM  MAQHHPHMLQ  QHNPTQNKPS  AEDFQNQEAQ  SMGGLEQQAG  360
361   VESLQFDYAG  NQIQVDSSGA  AVGLFDYNSQ  QQLFQRSNPL  TVQQLTAAQQ  QQYALAAAQQ  420
421   QHLAYSAGLA  PAFVPNPYII  NAGPPGTDPY  TAAGLAATLA  GPTVVPPQYY  GVPWGVYPAN  480
481   LFQQQPASTA  GHSANQQASN  QGPGPGQPQV  MRTGTNQRPL  TPGQGQQSQQ  ESLAAAAAAN  540
541   PALAYTGMPG  YQVLAPAAYY  DQTGALVMGP  GARTGLGGPV  RLVQTPLLIN  PAAAQAGAAA  600
601   VSASGSGNNM  SGPPANGLYR  SMPQPQPQPQ  QQQAPPPSSG  LPSSSFYGSG  SVSNTSQSSS  660
661   LFSHTSAAPP  PSSSLGFSST  GGSLGVGLGS  ALGGFGSSVS  SSTSSSVSRR  DSLLASSDLY  720
721   KRGGSSLTPI  GQPFYNSLGY  SSSPSPIGLT  PGHSPLTPPP  SLPSSHGSSS  SLHLGGLTNG  780
781   SGRYISAAPG  AEAKYRNNSG  TSSLFNSSSQ  LFPPSRPRYS  RSDVMPSGRS  RLLEDFRNNR  840
841   FPNLQLRDLP  GHMVEFSQDQ  HGSRFIQQKL  ERATPAERQM  VFGEILQAAY  QLMTDVFGNY  900
901   VIQKFFEFGS  ADQKLALATR  IRGHVLPLAL  QMYGCRVIQK  ALESISSEQQ  VISDIVRELD  960
961   GHVLKCVKDQ  NGNHVVQKCI  ECVQPQALQF  IIDAFKGQVF  VLSTHPYGCR  VIQRILEHCT  1020
1021  QEQTLPILEE  LHQHSEQLGQ  DQYGNYVIQH  VLEHGRPEDK  SKIVAEVRGK  VLVLSQHKFA  1080
1081  RTLWEKCVIH  SSRAERALLI  DEVCCQKDGP  HSALYTMMKD  QYANYVVQRM  IDMAEPAQRK  1140
1141  IIMHKIRPHI  ATLRKYTYGK  HILAKLEKYY  MKSGSELGPI  GGPTNGAL  1188
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGAGCATTC  CATGCAGCAT  CCTAGGTATG  AATGACGTGG  CCTGGCAGGA  GACAAGAGGC  60
61    GGGATGCTGC  ATGCAAATGG  TGCTCCTGAG  ACTGGAGGTG  TCAGAGTTCA  CGGGGGAGGC  120
121   CCCCTGGCCC  CGGTGGGGGG  ACAGTCCCCG  GGGGTCCCGC  ATTTACAGGG  GATGGACAGG  180
181   GTCGGGAACC  CCACCCCCGG  GACGCCGCAG  CCGCTGCTGA  GCGGACGATC  TCAGGATGAT  240
241   GCCACGGTGG  GATACTTCTT  TCAAAGGCAA  CCTGGGGAGC  AGCTCGGAGG  GTGCACACCC  300
301   AGCAAGCACC  GTTGGCCAAC  TGGAGACGCC  AATCATGTTG  ATCAGTCTCA  GCTCCGGGCT  360
361   GTTGATGAGA  TGAACTATGA  CTTCCAGGCC  CTGGCTCTGG  AATCAAGAGG  AATGGGAGAG  420
421   CTTCTGCCAG  CCAAAAAACT  GTGGGACTCT  GATGAGTTGG  CCAAGGAAGG  AAGAAAAGGA  480
481   TTGCTTCTAG  GCGAAGAGTG  GAGGGAGAAT  GCATGGGGAT  CATCGCATCA  TTCAGTGTCT  540
541   CAGCCAATCA  TGGTACAGCG  GCGACCGGGC  CAGAGTTTCC  ATGGGAACGG  TGATGCCAAT  600
601   TCTGTCCTTT  CACCTCGCTC  AGAAGGTGGA  GGCCTGGGGG  TGAGCATGGT  GGAGTACGTT  660
661   CTGAGCTCTT  CCCCGGGTGA  CAATCTGACC  TCATGCTTGC  ATATGCAGGG  TGCAGGAGAT  720
721   GCTGCCCCAG  ACGGTAGAGA  AAAGAGTGAT  GCACAAGAAA  AGGTTTCTCC  GTTTGAAGAA  780
781   GACAAGAACC  AGGAGATGAA  GGTTGGAGAG  GAGAACGATC  CTGCTAAAGC  TAACGGGAGA  840
841   GGTCTTTTGA  ACGGGATGGA  CAGAGACTGC  AAGGATTTTA  ATCCAACCCC  TGGAAGCCGT  900
901   CAGGCTTCTC  CCACTGAGGC  TGTGGAGCGG  ATGGGCACCA  GCCAGTCAGG  GATGGAAATG  960
961   ATGGCTCAGC  ACCACCCTCA  CATGCTTCAA  CAACACAACC  CCACCCAAAA  CAAACCTTCG  1020
1021  GCCGAGGACT  TCCAGAATCA  GGAGGCCCAG  AGCATGGGAG  GTCTCGAGCA  GCAGGCCGGT  1080
1081  GTGGAGTCCC  TCCAGTTTGA  CTATGCAGGG  AACCAGATTC  AGGTGGATTC  CTCGGGGGCT  1140
1141  GCAGTAGGAT  TGTTTGACTA  CAACTCTCAG  CAGCAGTTGT  TCCAGAGGTC  TAATCCTCTG  1200
1201  ACTGTTCAAC  AGCTCACTGC  AGCCCAGCAA  CAGCAGTATG  CCTTGGCTGC  AGCCCAACAG  1260
1261  CAGCATCTTG  CTTACTCAGC  TGGCCTTGCC  CCTGCATTTG  TGCCAAACCC  TTACATCATT  1320
1321  AATGCAGGCC  CACCTGGAAC  CGATCCGTAC  ACTGCTGCTG  GGCTGGCAGC  AACGCTTGCA  1380
1381  GGACCCACAG  TGGTTCCGCC  GCAGTACTAC  GGAGTTCCCT  GGGGCGTGTA  CCCTGCCAAT  1440
1441  CTTTTCCAGC  AACAGCCTGC  ATCAACTGCT  GGTCACTCAG  CCAATCAGCA  AGCATCCAAT  1500
1501  CAGGGACCAG  GGCCAGGCCA  GCCACAGGTG  ATGCGTACTG  GAACCAATCA  GCGACCTCTT  1560
1561  ACGCCAGGGC  AGGGACAACA  GAGTCAGCAG  GAATCCCTAG  CTGCAGCAGC  TGCTGCTAAC  1620
1621  CCAGCCTTAG  CTTACACAGG  AATGCCTGGT  TATCAGGTGT  TGGCCCCTGC  TGCCTATTAT  1680
1681  GACCAGACTG  GAGCTTTGGT  TATGGGCCCA  GGTGCAAGAA  CAGGTCTAGG  TGGGCCAGTT  1740
1741  CGTCTAGTCC  AGACCCCTCT  CCTCATAAAC  CCTGCAGCGG  CACAGGCTGG  AGCAGCTGCA  1800
1801  GTGTCAGCAT  CTGGCTCCGG  TAACAACATG  TCTGGCCCTC  CTGCCAACGG  ACTTTACCGC  1860
1861  TCAATGCCTC  AGCCTCAACC  CCAGCCGCAG  CAGCAACAGG  CCCCCCCACC  GAGCAGCGGT  1920
1921  CTGCCCTCCA  GCTCTTTTTA  TGGCTCTGGA  TCAGTCTCCA  ACACGTCTCA  GAGCAGCTCC  1980
1981  CTGTTCTCGC  ATACATCTGC  CGCACCACCT  CCAAGCTCCT  CCCTGGGCTT  CAGCAGCACC  2040
2041  GGCGGCTCCC  TCGGTGTAGG  TTTGGGTTCT  GCTCTGGGAG  GCTTTGGATC  TTCTGTATCC  2100
2101  AGCTCTACCA  GTAGCAGCGT  ATCTCGAAGA  GACTCACTGT  TGGCCAGTTC  TGATTTATAT  2160
2161  AAACGTGGGG  GCAGCAGTTT  AACTCCCATC  GGGCAGCCTT  TTTATAACAG  CCTGGGTTAC  2220
2221  TCCTCTTCAC  CCAGTCCCAT  TGGCCTCACA  CCGGGCCACT  CTCCTCTTAC  TCCTCCGCCA  2280
2281  TCGCTACCCT  CTTCTCATGG  CTCGTCTTCT  AGCCTTCACC  TCGGTGGGCT  AACGAATGGA  2340
2341  AGCGGGCGTT  ACATTTCCGC  AGCTCCTGGA  GCGGAGGCCA  AGTACCGAAA  CAACAGCGGC  2400
2401  ACTTCCAGCC  TCTTCAATTC  CAGCAGCCAG  CTCTTCCCTC  CTTCTCGGCC  ACGCTACAGT  2460
2461  CGTTCAGATG  TCATGCCCTC  TGGACGCAGC  CGGCTGCTGG  AAGACTTCAG  AAACAACCGC  2520
2521  TTCCCAAACC  TGCAACTTCG  TGACCTCCCA  GGACACATGG  TGGAGTTCTC  TCAAGACCAG  2580
2581  CACGGATCCA  GATTTATTCA  ACAGAAGCTG  GAGAGGGCCA  CTCCTGCAGA  GAGACAGATG  2640
2641  GTGTTTGGTG  AGATTCTGCA  AGCAGCATAC  CAACTGATGA  CTGATGTATT  TGGGAATTAT  2700
2701  GTCATCCAGA  AGTTTTTTGA  GTTTGGAAGT  GCAGACCAGA  AGCTGGCCCT  GGCGACACGC  2760
2761  ATCCGTGGAC  ACGTGCTTCC  TCTGGCTCTA  CAGATGTACG  GCTGCAGAGT  CATTCAGAAA  2820
2821  GCTCTGGAAT  CCATCTCCTC  AGAGCAGCAG  GTAATTAGTG  ACATTGTCCG  TGAGCTGGAT  2880
2881  GGCCACGTTT  TGAAATGTGT  AAAGGACCAG  AATGGAAACC  ACGTGGTACA  GAAATGTATC  2940
2941  GAGTGCGTCC  AACCTCAAGC  CCTTCAGTTC  ATTATTGATG  CCTTCAAGGG  ACAGGTCTTT  3000
3001  GTGCTTTCCA  CACACCCTTA  CGGCTGCAGA  GTTATTCAAA  GGATTTTGGA  GCACTGCACC  3060
3061  CAGGAGCAAA  CTCTGCCCAT  TCTGGAAGAG  CTGCATCAGC  ACTCGGAACA  ATTGGGCCAG  3120
3121  GATCAATATG  GCAACTACGT  GATTCAGCAT  GTCTTGGAAC  ATGGCAGACC  AGAGGATAAA  3180
3181  AGCAAAATAG  TTGCAGAGGT  CCGCGGAAAA  GTTCTTGTTC  TTAGCCAGCA  CAAATTTGCA  3240
3241  AGAACGTTGT  GGGAGAAGTG  TGTGATCCAT  TCGTCGCGTG  CAGAGAGAGC  TTTGCTTATA  3300
3301  GATGAGGTAT  GCTGTCAGAA  AGACGGGCCC  CACAGTGCCC  TGTACACCAT  GATGAAAGAC  3360
3361  CAGTACGCCA  ACTACGTCGT  CCAAAGAATG  ATCGACATGG  CCGAACCAGC  TCAGCGTAAA  3420
3421  ATCATCATGC  ACAAGATCCG  GCCTCACATT  GCCACTTTAC  GAAAGTACAC  TTATGGGAAA  3480
3481  CACATTTTGG  CCAAGCTAGA  GAAATACTAC  ATGAAGAGTG  GATCCGAACT  GGGACCAATC  3540
3541  GGCGGTCCCA  CAAATGGCGC  TCTT  3564

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Gaa-3157Gasterosteus aculeatus97.010.0 825
LLPS-Tar-0529Takifugu rubripes93.820.0 826
LLPS-Pof-1913Poecilia formosa92.710.0 811
LLPS-Xim-0458Xiphophorus maculatus92.710.0 811
LLPS-Scm-0450Scophthalmus maximus92.70.0 813
LLPS-Orl-4089Oryzias latipes91.480.0 805
LLPS-Orn-3010Oreochromis niloticus90.090.0 728
LLPS-Dar-4055Danio rerio89.940.0 792
LLPS-Nol-4003Nomascus leucogenys87.710.0 768
LLPS-Mea-3708Mesocricetus auratus87.710.0 771
LLPS-Aim-1872Ailuropoda melanoleuca87.710.0 769
LLPS-Lac-1312Latimeria chalumnae87.50.0 769
LLPS-Mum-3842Mus musculus87.50.0 769
LLPS-Ova-1843Ovis aries87.50.0 762
LLPS-Bot-3439Bos taurus87.50.0 762
LLPS-Orc-2501Oryctolagus cuniculus87.290.0 761
LLPS-Rhb-3980Rhinopithecus bieti87.290.0 761
LLPS-Man-1248Macaca nemestrina87.290.0 761
LLPS-Loa-4137Loxodonta africana87.290.0 765
LLPS-Hos-0193Homo sapiens87.290.0 761
LLPS-Urm-2085Ursus maritimus87.290.0 761
LLPS-Pap-4018Pan paniscus87.290.0 761
LLPS-Pat-3139Pan troglodytes87.290.0 761
LLPS-Ict-2376Ictidomys tridecemlineatus87.290.0 761
LLPS-Mam-2125Macaca mulatta87.290.0 761
LLPS-Caf-3849Canis familiaris87.290.0 761
LLPS-Poa-4145Pongo abelii87.290.0 761
LLPS-Cap-4498Cavia porcellus87.290.0 761
LLPS-Eqc-0098Equus caballus87.290.0 761
LLPS-Caj-4594Callithrix jacchus87.290.0 761
LLPS-Gog-2180Gorilla gorilla87.290.0 761
LLPS-Cea-1196Cercocebus atys87.290.0 762
LLPS-Aon-3176Aotus nancymaae87.290.0 761
LLPS-Maf-0984Macaca fascicularis87.290.0 761
LLPS-Chs-3265Chlorocebus sabaeus87.290.0 761
LLPS-Mal-1057Mandrillus leucophaeus87.290.0 761
LLPS-Mup-1110Mustela putorius furo87.290.0 761
LLPS-Dio-3555Dipodomys ordii87.290.0 766
LLPS-Scf-2583Scleropages formosus87.290.0 771
LLPS-Tut-0775Tursiops truncatus87.290.0 756
LLPS-Fec-0307Felis catus87.080.0 758
LLPS-Fia-3807Ficedula albicollis86.860.0 761
LLPS-Fud-3995Fukomys damarensis86.860.0 761
LLPS-Myl-4327Myotis lucifugus86.860.0 760
LLPS-Pes-2312Pelodiscus sinensis86.650.0 760
LLPS-Anp-1820Anas platyrhynchos86.650.0 760
LLPS-Meg-0412Meleagris gallopavo86.650.0 761
LLPS-Tag-3323Taeniopygia guttata86.650.0 761
LLPS-Gaga-3584Gallus gallus86.650.0 761
LLPS-Anc-1728Anolis carolinensis86.440.0 759
LLPS-Cas-2719Carlito syrichta85.350.0 761
LLPS-Xet-1935Xenopus tropicalis84.750.0 742
LLPS-Mod-3851Monodelphis domestica84.570.0 751
LLPS-Leo-1056Lepisosteus oculatus84.270.0 748
LLPS-Ran-0566Rattus norvegicus84.010.0 758
LLPS-Sah-3765Sarcophilus harrisii83.30.0 735
LLPS-Paa-3080Papio anubis81.140.0 717
LLPS-Sus-3805Sus scrofa81.110.0 741
LLPS-Drm-0264Drosophila melanogaster78.261e-175 566
LLPS-Cis-1382Ciona savignyi71.531e-139 432
LLPS-Cii-1802Ciona intestinalis68.410.0 563
LLPS-Abg-1760Absidia glauca60.982e-135 443
LLPS-Cae-1048Caenorhabditis elegans58.432e-123 403
LLPS-Sem-1425Selaginella moellendorffii57.658e-130 407
LLPS-Php-0521Physcomitrella patens57.064e-125 419
LLPS-Sot-2137Solanum tuberosum56.475e-124 413
LLPS-Amt-1515Amborella trichopoda56.211e-119 402
LLPS-Prp-1527Prunus persica55.728e-121 405
LLPS-Nia-1680Nicotiana attenuata55.592e-123 410
LLPS-Pot-0498Populus trichocarpa55.293e-120 403
LLPS-Sei-0567Setaria italica55.031e-115 397
LLPS-Orbr-0178Oryza brachyantha55.06e-120 404
LLPS-Mua-0374Musa acuminata55.08e-123 403
LLPS-Thc-2449Theobroma cacao55.04e-120 403
LLPS-Glm-1400Glycine max55.03e-118 397
LLPS-Hov-1500Hordeum vulgare54.972e-118 399
LLPS-Mae-2515Manihot esculenta54.732e-118 398
LLPS-Viv-1167Vitis vinifera54.711e-119 403
LLPS-Ors-0206Oryza sativa54.717e-120 404
LLPS-Gor-2131Gossypium raimondii54.718e-119 400
LLPS-Org-1582Oryza glaberrima54.717e-120 404
LLPS-Orr-1748Oryza rufipogon54.717e-120 404
LLPS-Orni-0010Oryza nivara54.711e-119 403
LLPS-Orb-1936Oryza barthii54.717e-120 404
LLPS-Ori-2257Oryza indica54.719e-120 403
LLPS-Met-2458Medicago truncatula54.714e-117 394
LLPS-Lep-2265Leersia perrieri54.714e-120 404
LLPS-Orgl-0177Oryza glumaepatula54.716e-120 404
LLPS-Sol-0286Solanum lycopersicum54.71e-123 412
LLPS-Cus-1840Cucumis sativus54.525e-112 381
LLPS-Yal-1117Yarrowia lipolytica54.491e-121 400
LLPS-Sob-0281Sorghum bicolor54.446e-118 397
LLPS-Coc-0556Corchorus capsularis54.415e-119 400
LLPS-Orm-1524Oryza meridionalis54.412e-118 398
LLPS-Brd-2251Brachypodium distachyon54.413e-118 398
LLPS-Tra-0804Triticum aestivum54.398e-117 395
LLPS-Phv-1241Phaseolus vulgaris54.122e-118 399
LLPS-Brr-1802Brassica rapa54.124e-115 390
LLPS-Art-2609Arabidopsis thaliana54.124e-119 399
LLPS-Bro-0325Brassica oleracea54.123e-116 390
LLPS-Dac-0757Daucus carota54.124e-118 397
LLPS-Brn-2662Brassica napus54.122e-116 391
LLPS-Via-1969Vigna angularis54.123e-118 399
LLPS-Zem-2364Zea mays53.859e-119 399
LLPS-Arl-0680Arabidopsis lyrata53.821e-120 389
LLPS-Orp-0353Oryza punctata53.28e-117 391
LLPS-Vir-0094Vigna radiata53.071e-118 397
LLPS-Tru-0915Triticum urartu53.032e-118 391
LLPS-Hea-2588Helianthus annuus52.976e-119 395
LLPS-Asc-1471Aspergillus clavatus52.348e-107 364
LLPS-Asfu-1017Aspergillus fumigatus51.014e-105 359
LLPS-Zyt-1241Zymoseptoria tritici50.969e-75 254
LLPS-Chc-1229Chondrus crispus50.91e-102 357
LLPS-Blg-0492Blumeria graminis50.885e-102 351
LLPS-Scp-1116Schizosaccharomyces pombe50.864e-110 368
LLPS-Nef-0927Neosartorya fischeri50.729e-106 361
LLPS-Trv-0386Trichoderma virens50.661e-92 305
LLPS-Scs-0542Sclerotinia sclerotiorum50.412e-109 372
LLPS-Miv-0030Microbotryum violaceum50.155e-93 328
LLPS-Coo-0057Colletotrichum orbiculare50.01e-98 340
LLPS-Scc-0378Schizosaccharomyces cryophilus50.02e-110 369
LLPS-Cogr-1517Colletotrichum graminicola49.72e-101 347
LLPS-Ved-1522Verticillium dahliae49.72e-99 341
LLPS-Asni-1611Aspergillus niger49.186e-103 354
LLPS-Asf-0135Aspergillus flavus49.177e-107 353
LLPS-Aso-1369Aspergillus oryzae49.173e-105 358
LLPS-Cog-1474Colletotrichum gloeosporioides49.115e-102 349
LLPS-Trr-0034Trichoderma reesei48.19e-97 318
LLPS-Beb-1256Beauveria bassiana48.022e-95 330
LLPS-Scj-0581Schizosaccharomyces japonicus47.671e-104 356
LLPS-Crn-1256Cryptococcus neoformans47.633e-95 325
LLPS-Pytr-1477Pyrenophora triticirepentis47.552e-89 315
LLPS-Pyt-0456Pyrenophora teres47.556e-90 316
LLPS-Cym-0908Cyanidioschyzon merolae47.252e-98 348
LLPS-Kop-0956Komagataella pastoris47.091e-98 337
LLPS-Spr-0342Sporisorium reilianum46.52e-94 332
LLPS-Usm-0066Ustilago maydis46.51e-86 308
LLPS-Put-0636Puccinia triticina46.22e-89 312
LLPS-Asg-1498Ashbya gossypii46.119e-89 310
LLPS-Mao-0430Magnaporthe oryzae45.932e-97 337
LLPS-Chr-0995Chlamydomonas reinhardtii45.888e-96 340
LLPS-Ast-1117Aspergillus terreus45.162e-93 325
LLPS-Fus-1588Fusarium solani44.981e-74 258
LLPS-Sac-1567Saccharomyces cerevisiae44.514e-82 293
LLPS-Phn-1364Phaeosphaeria nodorum44.486e-86 305
LLPS-Asn-1529Aspergillus nidulans43.991e-81 291
LLPS-Dos-1587Dothistroma septosporum43.784e-82 294
LLPS-Gas-0776Galdieria sulphuraria43.78e-93 326
LLPS-Map-0498Magnaporthe poae43.242e-83 298
LLPS-Gag-0922Gaeumannomyces graminis42.743e-85 302
LLPS-Nec-0479Neurospora crassa38.222e-67 248