• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Sol-2420

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Ensembl Gene: Solyc01g110990.2
Ensembl Protein: Solyc01g110990.2.1.1
Organism: Solanum lycopersicum
Taxa ID: 4081
LLPS Type: Client


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblSolyc01g110990.2.1Solyc01g110990.2.1.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     AESELKKLEY  LSLISKVCSE  LEAHLGFGDK  VLAEFITELG  RSCLTVDEFD  DKLKESGAEM  60
61    PDYFVRTLLT  IIHAILPPSA  KSKSEKESNK  DGNDSEFSAL  KIRDNRDRVK  ELEKEIELEA  120
121   RSKRRDEKGE  ERDRRREGDR  DYRRERGRDR  RDRDRGRDRD  RDDGRVERRA  SERRRDRDGD  180
181   GDVYAKGSRD  DYEQDGDDDR  RDRRKSRHHV  DEPELYAVYK  GRVSRVMDSG  CFVQLNEFRG  240
241   KEGLVHVSQL  ATRRVSNAKD  LVKRDQDVFV  KVISISGQKL  SLSMRDVDQN  TGKDLLPLKK  300
301   SSDGGGLTTN  PSGMNNEGSK  TGIGLSGIRI  AEQEDVVPSR  RPVKRMSSPE  KWEAKQLIAA  360
361   GVLGVHEHPM  FDEEGDGMLY  QEEDGVDEEL  EVELNEDEPP  FLQGQSRYSV  DMSPVKIFKN  420
421   PEGSLSRAAA  LQSALIKERR  EVREQQQRTM  LDSIPKDLNR  PWEDPMPETG  ERHLAQELRG  480
481   VGLSAYDMPE  WKKDAYGKAV  TFGQRSKLSL  QEQRQSLPIY  KLKKELVQAV  HDNQVLVVIG  540
541   ETGSGKTTQV  TQYLAEAGYT  TRGKIGCTQP  RRVAATSVAK  RVAEEFGCRL  GEEVGYAIRF  600
601   EDCTGPETVI  KYMTDGMLWR  EILIDDNLSQ  YSVIMLDEAH  ERTINTDVLF  GLLKQLMKRR  660
661   PDLRLIVTSA  TLDAEKFSGY  FFDCNIFTIP  GRTFPVEILY  TKQPESDYLD  ASLITVMQIH  720
721   LTEPEGDILL  FLTGQEEIDY  ACQCLYERMK  GLGKNVPELI  ILPVYSALPS  EMQSRIFDPA  780
781   PPGKRKVVVA  TNIAEASLTI  DGIFYVIDPG  FAKQNVYNPK  QGLDSLVITP  ISQASAKQRA  840
841   GRAGRTGPGK  CYRLYTESAF  HSEMSPTAVP  EIQRINLGNT  VIMMKAMGIN  DLLSFDFMDP  900
901   PTPQALISAM  EQLYTLGALD  EEGLLTKLGR  KMAEFPLDPP  LSKMLLASVD  FGCSDEILTI  960
961   IAMIQTGNVF  YRPREKQAQA  DQKKAKFFQP  EGDHLTLFAV  YEAWKAKNFS  GPWCFENFVQ  1020
1021  SRSLRRAQDV  RKQLLSIMDK  YKLDVVSAGR  NFTKIQKAIG  AGFFFHAARK  DPQEGYRTLV  1080
1081  ENQPVYIHPS  SALFQRQPDW  VIYHELVMTT  KEYMREVTVV  DPKWLVELAP  RFFKTADPTK  1140
1141  LTKRKRQERI  EPLYDRYNEP  NSWRLSKRRA  1170
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     GCAGAAAGCG  AGTTGAAGAA  ATTGGAATAC  CTCTCGCTAA  TTTCTAAGGT  ATGTTCCGAG  60
61    TTGGAGGCAC  ATTTAGGGTT  TGGTGATAAG  GTTTTAGCTG  AATTTATAAC  TGAACTTGGT  120
121   AGAAGTTGCT  TAACAGTAGA  TGAATTTGAT  GACAAATTGA  AAGAAAGTGG  TGCTGAAATG  180
181   CCCGACTATT  TCGTAAGAAC  GTTGCTCACT  ATAATCCATG  CTATTTTGCC  TCCTAGTGCC  240
241   AAGTCCAAGT  CGGAGAAGGA  GTCGAACAAG  GATGGCAATG  ATTCCGAGTT  TTCAGCTCTG  300
301   AAGATCAGAG  ATAATAGGGA  TAGGGTTAAG  GAGTTGGAGA  AGGAGATTGA  ATTGGAGGCT  360
361   AGGAGTAAGA  GGAGAGATGA  AAAGGGAGAA  GAACGGGATA  GGAGGCGAGA  GGGGGATAGA  420
421   GATTATAGAA  GAGAAAGGGG  TAGAGACAGG  AGGGATAGGG  ATAGGGGTAG  GGATCGAGAT  480
481   AGAGATGATG  GTAGAGTTGA  ACGCAGGGCT  TCAGAAAGGC  GCAGAGACAG  GGATGGAGAT  540
541   GGAGATGTAT  ATGCAAAGGG  TAGTAGAGAT  GATTATGAGC  AAGACGGGGA  TGATGATCGG  600
601   AGGGATAGGA  GAAAATCGAG  GCATCATGTG  GATGAGCCAG  AGTTGTATGC  AGTATATAAG  660
661   GGGAGGGTAT  CAAGGGTGAT  GGATTCTGGT  TGTTTTGTTC  AGCTGAATGA  ATTTAGAGGG  720
721   AAAGAAGGCT  TGGTGCATGT  TTCACAACTT  GCTACTAGAA  GGGTTAGTAA  TGCCAAAGAT  780
781   TTGGTAAAAC  GGGACCAGGA  CGTTTTTGTG  AAGGTTATCT  CTATTAGTGG  GCAGAAGCTG  840
841   AGTTTGTCAA  TGAGAGATGT  TGATCAGAAT  ACAGGAAAGG  ATCTGCTTCC  ATTGAAGAAG  900
901   AGCTCTGACG  GTGGTGGATT  GACAACAAAT  CCTTCAGGCA  TGAATAATGA  GGGCTCTAAG  960
961   ACCGGAATTG  GCCTGTCAGG  AATTAGGATT  GCGGAGCAAG  AGGATGTAGT  TCCATCACGT  1020
1021  AGACCGGTGA  AGAGAATGAG  TTCACCTGAA  AAGTGGGAAG  CGAAACAACT  TATTGCTGCA  1080
1081  GGTGTCCTGG  GGGTCCATGA  ACATCCCATG  TTTGATGAAG  AAGGGGATGG  AATGCTATAT  1140
1141  CAGGAAGAAG  ATGGTGTTGA  TGAAGAGCTT  GAGGTTGAAT  TGAATGAAGA  TGAACCCCCT  1200
1201  TTCTTGCAAG  GGCAGAGTCG  TTATTCAGTT  GATATGTCTC  CTGTCAAAAT  TTTTAAAAAT  1260
1261  CCTGAAGGAT  CATTGAGTCG  TGCTGCTGCA  CTACAATCAG  CTTTGATAAA  GGAGAGAAGG  1320
1321  GAAGTAAGGG  AGCAGCAACA  GAGAACGATG  CTTGATTCTA  TCCCAAAGGA  TCTCAACAGA  1380
1381  CCATGGGAAG  ACCCAATGCC  GGAGACAGGT  GAGAGGCATT  TGGCTCAGGA  ACTGAGGGGT  1440
1441  GTTGGTTTGT  CTGCCTATGA  CATGCCAGAA  TGGAAAAAAG  ATGCTTATGG  TAAAGCCGTG  1500
1501  ACCTTTGGCC  AGAGGTCTAA  GCTATCCCTC  CAGGAGCAGA  GGCAGAGTCT  TCCTATTTAC  1560
1561  AAATTGAAGA  AAGAACTGGT  TCAGGCTGTC  CATGATAATC  AGGTCCTGGT  CGTCATTGGT  1620
1621  GAAACAGGTT  CTGGCAAGAC  AACACAGGTG  ACACAGTATC  TAGCCGAGGC  AGGGTATACA  1680
1681  ACGAGGGGAA  AAATTGGCTG  TACTCAACCT  CGTCGAGTGG  CTGCAACATC  TGTGGCAAAG  1740
1741  AGAGTTGCTG  AGGAGTTTGG  TTGTCGATTA  GGTGAGGAGG  TCGGTTATGC  TATTCGTTTT  1800
1801  GAAGATTGTA  CTGGGCCAGA  AACTGTTATC  AAATATATGA  CTGATGGTAT  GCTTTGGAGG  1860
1861  GAGATCCTGA  TTGATGATAA  TTTGTCCCAG  TACTCAGTCA  TAATGCTTGA  TGAAGCACAT  1920
1921  GAAAGAACAA  TTAACACTGA  TGTTCTCTTT  GGTTTGCTTA  AGCAGCTTAT  GAAGAGAAGA  1980
1981  CCTGACCTTC  GTCTAATTGT  CACGTCTGCA  ACTTTGGATG  CAGAGAAATT  TTCTGGTTAT  2040
2041  TTCTTTGACT  GCAACATCTT  TACAATCCCA  GGAAGAACTT  TTCCAGTTGA  GATACTCTAC  2100
2101  ACAAAGCAGC  CAGAAAGTGA  TTACCTTGAT  GCGTCTTTAA  TTACTGTTAT  GCAGATCCAC  2160
2161  TTGACAGAAC  CTGAAGGTGA  TATCCTCCTC  TTCTTGACTG  GTCAAGAGGA  GATTGATTAT  2220
2221  GCTTGCCAAT  GTCTCTATGA  GAGGATGAAA  GGACTAGGTA  AAAATGTTCC  TGAACTGATC  2280
2281  ATACTACCTG  TCTATAGTGC  CTTGCCCAGT  GAAATGCAGT  CCAGAATTTT  TGATCCTGCC  2340
2341  CCTCCTGGGA  AAAGAAAAGT  TGTTGTTGCT  ACAAATATTG  CTGAAGCATC  TTTGACAATT  2400
2401  GACGGTATAT  TCTATGTTAT  TGATCCTGGA  TTTGCAAAGC  AAAATGTCTA  CAATCCAAAA  2460
2461  CAGGGTCTTG  ATTCACTTGT  TATTACCCCA  ATTTCACAAG  CATCGGCAAA  GCAACGAGCA  2520
2521  GGGCGTGCTG  GACGTACTGG  ACCTGGGAAG  TGCTATCGTC  TGTATACTGA  GAGTGCATTC  2580
2581  CATAGTGAAA  TGTCTCCTAC  TGCAGTTCCA  GAAATCCAGA  GGATAAATCT  TGGGAACACC  2640
2641  GTTATTATGA  TGAAAGCAAT  GGGTATTAAT  GATCTTTTGT  CATTTGATTT  CATGGACCCA  2700
2701  CCTACCCCTC  AGGCTCTCAT  ATCTGCCATG  GAGCAACTTT  ACACTCTTGG  AGCACTGGAT  2760
2761  GAAGAGGGGC  TTCTGACGAA  ACTGGGAAGA  AAAATGGCAG  AATTCCCATT  AGATCCTCCT  2820
2821  TTGTCCAAGA  TGCTTCTTGC  TAGTGTGGAC  TTCGGTTGTA  GTGATGAGAT  CTTGACCATC  2880
2881  ATTGCTATGA  TTCAAACTGG  AAACGTCTTT  TACCGACCAA  GGGAAAAACA  AGCTCAGGCC  2940
2941  GATCAGAAAA  AGGCCAAATT  TTTTCAGCCT  GAGGGTGATC  ATCTTACCTT  GTTTGCTGTT  3000
3001  TACGAGGCTT  GGAAAGCGAA  AAACTTTTCA  GGTCCATGGT  GTTTTGAAAA  TTTTGTTCAG  3060
3061  TCACGATCAC  TTAGGAGGGC  ACAGGATGTC  AGAAAACAGT  TGCTCTCCAT  CATGGACAAG  3120
3121  TATAAATTGG  ATGTTGTGAG  TGCCGGAAGG  AACTTCACAA  AGATCCAGAA  GGCTATTGGA  3180
3181  GCAGGTTTCT  TTTTTCATGC  TGCTAGAAAG  GATCCTCAAG  AGGGTTATAG  AACTTTAGTT  3240
3241  GAGAACCAGC  CAGTTTACAT  CCATCCTAGC  AGTGCTCTTT  TCCAAAGACA  GCCGGACTGG  3300
3301  GTTATTTATC  ACGAGCTTGT  TATGACAACA  AAGGAGTACA  TGCGTGAGGT  GACCGTGGTA  3360
3361  GATCCTAAAT  GGCTTGTTGA  GTTGGCACCA  AGATTCTTCA  AGACGGCTGA  CCCAACAAAA  3420
3421  TTAACGAAGC  GCAAGAGACA  GGAACGTATT  GAACCTCTTT  ATGATAGATA  TAATGAGCCA  3480
3481  AATTCATGGC  GATTGAGTAA  ACGCCGAGCA  TGA  3513

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Sot-1017Solanum tuberosum92.850.01677
LLPS-Ors-0088Oryza sativa92.670.01043
LLPS-Thc-0741Theobroma cacao90.520.01722
LLPS-Viv-2152Vitis vinifera90.130.01720
LLPS-Hea-2559Helianthus annuus90.10.01714
LLPS-Pot-1442Populus trichocarpa89.490.01706
LLPS-Gor-0031Gossypium raimondii89.270.01685
LLPS-Phv-0474Phaseolus vulgaris89.260.01707
LLPS-Cus-1784Cucumis sativus88.950.01693
LLPS-Via-2191Vigna angularis88.890.01706
LLPS-Vir-1539Vigna radiata88.70.01675
LLPS-Glm-0752Glycine max88.470.01695
LLPS-Met-2475Medicago truncatula88.320.01688
LLPS-Coc-0598Corchorus capsularis88.020.01679
LLPS-Sob-1828Sorghum bicolor87.020.01645
LLPS-Dac-0105Daucus carota86.880.01642
LLPS-Lep-2120Leersia perrieri86.840.01647
LLPS-Art-0625Arabidopsis thaliana86.80.01662
LLPS-Orbr-0461Oryza brachyantha86.740.01627
LLPS-Orb-2104Oryza barthii86.630.01649
LLPS-Ori-2481Oryza indica86.630.01649
LLPS-Orni-1875Oryza nivara86.630.01649
LLPS-Orgl-1807Oryza glumaepatula86.630.01650
LLPS-Orp-2104Oryza punctata86.630.01662
LLPS-Orr-0026Oryza rufipogon86.630.01650
LLPS-Org-1489Oryza glaberrima86.630.01650
LLPS-Sei-1623Setaria italica86.60.01645
LLPS-Brr-0131Brassica rapa86.50.01618
LLPS-Brn-1957Brassica napus86.290.01613
LLPS-Tra-2894Triticum aestivum86.290.01648
LLPS-Hov-0308Hordeum vulgare86.190.01648
LLPS-Bro-1706Brassica oleracea86.190.01611
LLPS-Brd-0498Brachypodium distachyon85.980.01639
LLPS-Amt-1670Amborella trichopoda85.730.01634
LLPS-Mae-1738Manihot esculenta83.90.01578
LLPS-Php-1440Physcomitrella patens83.070.01573
LLPS-Prp-1646Prunus persica80.660.01521
LLPS-Mua-1638Musa acuminata74.90.01337
LLPS-Tru-0252Triticum urartu73.890.0 989
LLPS-Zem-0891Zea mays73.570.01380
LLPS-Mel-0307Melampsora laricipopulina70.890.0 840
LLPS-Osl-1432Ostreococcus lucimarinus68.040.01293
LLPS-Asm-2486Astyanax mexicanus67.110.01272
LLPS-Icp-1314Ictalurus punctatus67.110.01277
LLPS-Dar-0098Danio rerio67.110.01276
LLPS-Orc-3627Oryctolagus cuniculus67.090.01228
LLPS-Aon-0238Aotus nancymaae67.010.01274
LLPS-Sah-0378Sarcophilus harrisii67.010.01274
LLPS-Mum-1655Mus musculus67.010.01273
LLPS-Caj-0739Callithrix jacchus67.010.01275
LLPS-Gog-2467Gorilla gorilla67.010.01274
LLPS-Bot-2925Bos taurus67.010.01272
LLPS-Ova-0333Ovis aries67.010.01273
LLPS-Aim-2024Ailuropoda melanoleuca67.010.01273
LLPS-Mup-3720Mustela putorius furo67.010.01273
LLPS-Ran-1510Rattus norvegicus67.010.01274
LLPS-Loa-3265Loxodonta africana67.010.01272
LLPS-Pap-0563Pan paniscus67.010.01274
LLPS-Urm-0423Ursus maritimus67.010.01271
LLPS-Pat-2266Pan troglodytes67.010.01274
LLPS-Hos-0903Homo sapiens67.010.01274
LLPS-Mod-0735Monodelphis domestica67.010.01274
LLPS-Fec-2507Felis catus67.010.01273
LLPS-Caf-2788Canis familiaris67.010.01273
LLPS-Poa-4028Pongo abelii67.010.01274
LLPS-Eqc-1424Equus caballus67.010.01273
LLPS-Ict-1993Ictidomys tridecemlineatus67.010.01272
LLPS-Cas-3884Carlito syrichta67.010.01272
LLPS-Cea-3455Cercocebus atys66.910.01272
LLPS-Maf-2200Macaca fascicularis66.910.01273
LLPS-Paa-3807Papio anubis66.910.01272
LLPS-Man-0858Macaca nemestrina66.910.01272
LLPS-Pes-2334Pelodiscus sinensis66.910.01274
LLPS-Mam-3332Macaca mulatta66.910.01273
LLPS-Sus-2794Sus scrofa66.80.01270
LLPS-Lac-0039Latimeria chalumnae66.80.01276
LLPS-Fud-1606Fukomys damarensis66.70.01265
LLPS-Anc-0576Anolis carolinensis66.70.01270
LLPS-Fia-0492Ficedula albicollis66.60.01269
LLPS-Tag-2271Taeniopygia guttata66.60.01267
LLPS-Xim-0529Xiphophorus maculatus66.560.01271
LLPS-Pof-2925Poecilia formosa66.560.01269
LLPS-Scf-0914Scleropages formosus66.490.01265
LLPS-Orn-3892Oreochromis niloticus66.490.01270
LLPS-Otg-0353Otolemur garnettii66.460.01247
LLPS-Orl-0562Oryzias latipes66.320.01268
LLPS-Gaa-0465Gasterosteus aculeatus66.080.01259
LLPS-Rhb-3647Rhinopithecus bieti65.980.01248
LLPS-Chs-0455Chlorocebus sabaeus65.870.01244
LLPS-Cis-1570Ciona savignyi65.860.01098
LLPS-Drm-1045Drosophila melanogaster65.520.01226
LLPS-Ten-0974Tetraodon nigroviridis65.480.01219
LLPS-Gaga-0702Gallus gallus65.00.01224
LLPS-Cii-1599Ciona intestinalis64.90.01204
LLPS-Cap-2434Cavia porcellus64.760.01250
LLPS-Scm-1930Scophthalmus maximus64.380.01231
LLPS-Dio-1202Dipodomys ordii63.190.01178
LLPS-Tar-1558Takifugu rubripes63.010.01216
LLPS-Gas-0830Galdieria sulphuraria61.870.01088
LLPS-Abg-0647Absidia glauca61.530.01123
LLPS-Lem-0975Leptosphaeria maculans59.210.01090
LLPS-Mal-0907Mandrillus leucophaeus58.850.0 964
LLPS-Sem-1166Selaginella moellendorffii58.510.0 787
LLPS-Nia-0421Nicotiana attenuata58.350.0 767
LLPS-Asc-0801Aspergillus clavatus56.880.0 767
LLPS-Nef-0604Neosartorya fischeri56.720.0 769
LLPS-Asfu-0907Aspergillus fumigatus56.720.0 769
LLPS-Aso-1402Aspergillus oryzae56.410.0 762
LLPS-Asf-0065Aspergillus flavus56.410.0 762
LLPS-Mea-1657Mesocricetus auratus56.380.0 778
LLPS-Myl-4043Myotis lucifugus56.350.0 773
LLPS-Asni-1217Aspergillus niger56.30.0 764
LLPS-Ast-0804Aspergillus terreus56.090.0 759
LLPS-Orm-1553Oryza meridionalis56.080.0 769
LLPS-Asn-0289Aspergillus nidulans55.830.0 753
LLPS-Scj-0978Schizosaccharomyces japonicus55.40.0 734
LLPS-Scc-0974Schizosaccharomyces cryophilus55.280.01039
LLPS-Crn-0954Cryptococcus neoformans55.10.0 756
LLPS-Nol-1134Nomascus leucogenys55.070.0 753
LLPS-Yal-0638Yarrowia lipolytica54.60.0 753
LLPS-Usm-0019Ustilago maydis54.590.0 729
LLPS-Scp-0755Schizosaccharomyces pombe54.580.01042
LLPS-Cae-0860Caenorhabditis elegans54.480.0 755
LLPS-Pug-0719Puccinia graminis54.010.0 735
LLPS-Put-0979Puccinia triticina53.590.0 736
LLPS-Asg-0664Ashbya gossypii49.740.0 925
LLPS-Kop-1335Komagataella pastoris49.170.0 885
LLPS-Sac-1485Saccharomyces cerevisiae48.080.0 900