• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Sol-2303

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Ensembl Gene: Solyc10g006770.3
Ensembl Protein: Solyc10g006770.3.1.1
Organism: Solanum lycopersicum
Taxa ID: 4081
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Stress granule, OthersPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblSolyc10g006770.3.1Solyc10g006770.3.1.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MVQERTGNGA  PSNGNSAGGN  AYTIDLNTFS  KRLKALYSHW  HKHKDDLWAS  SDVLAIATPP  60
61    PSEDLRYLKS  SALNIWLLGY  EFPETIMVFG  DKQIHFLCSQ  KKASLLSVVK  SAAKEAVDVD  120
121   VILHVKAKNE  DGTTQMDNVL  HNICMQPKSY  GPDCSVVIGY  IAREAPEGKL  LEIWTDKMRN  180
181   SSLTLSDISN  GLADLFAVKE  QNEIINVKKA  AYLTASAMKN  FVVPKLEKVI  DEEKKVTHSL  240
241   LMDDTEKAIL  EPAKIKVKLK  AENVDICYPP  IFQSGGNFDL  RPSATSNDEQ  LYYDSASVII  300
301   CAVGSRYNSY  CSNVARTFLI  DSTSTQNKAY  EVLLKAHEAA  IGALKPGNKL  SSVYQTALEV  360
361   VERDAPEFVS  NLTKSAGTGI  GLEFRESGLI  INAKNDKVVR  AGMVFNVSLG  FHNLQAGTTT  420
421   EKSKNFSLLL  ADTVIVTNDG  HDVVTHLSSK  ALKDVAYSFN  EDEEDEEDVK  VKADSSRMEA  480
481   LYSKATLRSN  NQEELRRQHQ  AELARQKNEE  TARRLAGGGA  LTGNNKGAAK  ASSDLVAYKS  540
541   INDLPPPRDM  TIQVDQKNEA  ILLPIYGTMV  PFHVATVKTV  SSQQDTNRNC  YIRVIFNVPG  600
601   TPFTPVDANA  LKNQSAIYLK  EVSFRSKDPR  HISEVVQQIK  TLRRNVMARE  SERAERATLV  660
661   TQEKLVLAGN  KFKPVRLSDL  SIRPSFGGRA  RKLPGTLEAH  VNGFRYSTSR  PDERVDIMFG  720
721   NIKHAFFQPA  EKEMITLLHF  HLHNHIMVGN  KKTKDVQFYV  EVMDVVQTLG  GGKRSAYDPD  780
781   EIEEEQRERD  RKNKFNMDFQ  NFVNRVNDVW  SQPQLKGLDL  EFDQPLRELG  FHGVPYKSSA  840
841   FIVPTSSCLV  ELIETPFLVI  TLSDIEIVNL  ERVGFGQKNF  DMAIVFKDFK  RDVMRIDSIP  900
901   VSALDGIKEW  LDTTDIKYYE  SKMNLNWREV  LKTITEDPQR  FIDEGGWEFL  NIDASDSESE  960
961   NSEESDQGYE  PSDAEPESDS  EDEASDSESL  VDSEEEEEDS  DEDSEEEKGK  TWEELEKEAS  1020
1021  NADREKGDEP  DSEDERRRKK  NFGKSRSGPS  SAGSKRMKFR  1060
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGTGCAAG  AGAGAACTGG  AAATGGAGCA  CCTTCAAATG  GGAATTCAGC  AGGTGGAAAT  60
61    GCTTATACAA  TTGACTTGAA  TACATTCAGT  AAGCGACTGA  AGGCCTTGTA  TTCACACTGG  120
121   CACAAACATA  AGGATGACCT  TTGGGCCTCT  TCTGATGTCC  TTGCTATAGC  TACACCGCCA  180
181   CCTTCGGAGG  ACCTGAGATA  CTTGAAATCC  TCAGCTTTAA  ATATTTGGTT  GCTAGGTTAT  240
241   GAGTTTCCTG  AGACGATTAT  GGTTTTCGGA  GACAAGCAAA  TACATTTTCT  GTGTAGCCAG  300
301   AAGAAAGCCT  CATTGCTTAG  TGTTGTAAAA  TCTGCTGCTA  AAGAGGCTGT  GGATGTGGAC  360
361   GTTATCCTGC  ATGTGAAGGC  GAAAAATGAG  GATGGGACTA  CTCAAATGGA  CAATGTGCTT  420
421   CACAATATCT  GTATGCAGCC  AAAGTCATAT  GGTCCTGATT  GTTCAGTCGT  CATTGGATAT  480
481   ATTGCAAGAG  AGGCCCCTGA  AGGAAAACTC  CTGGAGATAT  GGACCGATAA  GATGAGAAAT  540
541   TCAAGCCTTA  CTCTTAGTGA  TATCTCAAAT  GGGCTGGCTG  ACCTCTTTGC  TGTGAAGGAA  600
601   CAGAATGAGA  TAATAAATGT  GAAGAAAGCT  GCATATTTGA  CTGCTTCTGC  AATGAAGAAC  660
661   TTTGTTGTTC  CAAAGCTTGA  GAAAGTTATT  GATGAGGAGA  AGAAAGTAAC  TCATTCTTTA  720
721   TTAATGGATG  ACACAGAAAA  GGCTATTCTA  GAACCTGCAA  AAATTAAGGT  GAAGCTGAAA  780
781   GCTGAGAATG  TTGATATATG  TTACCCCCCA  ATCTTCCAGA  GTGGTGGGAA  TTTCGATCTT  840
841   AGACCTAGTG  CTACAAGCAA  TGATGAACAA  TTGTACTATG  ATTCTGCCAG  TGTCATCATA  900
901   TGTGCAGTTG  GATCACGATA  CAACAGTTAC  TGTTCAAATG  TTGCCAGAAC  ATTTCTCATT  960
961   GATTCAACTT  CGACGCAGAA  CAAGGCTTAT  GAGGTTCTTC  TTAAAGCTCA  CGAGGCAGCT  1020
1021  ATTGGTGCAT  TGAAGCCTGG  AAACAAGCTT  AGCTCCGTGT  ATCAAACAGC  TCTAGAAGTG  1080
1081  GTTGAGAGGG  ATGCTCCTGA  ATTTGTTAGC  AACCTGACAA  AGTCTGCTGG  GACTGGGATT  1140
1141  GGTCTTGAGT  TCCGGGAGTC  TGGCTTGATC  ATCAATGCTA  AGAATGATAA  GGTGGTGAGA  1200
1201  GCAGGAATGG  TTTTCAACGT  GTCACTTGGT  TTCCACAATT  TGCAAGCTGG  GACCACCACT  1260
1261  GAGAAGAGTA  AGAATTTTTC  ACTTTTGTTG  GCAGATACGG  TTATCGTCAC  AAATGATGGC  1320
1321  CATGATGTGG  TTACTCATTT  GAGCTCTAAA  GCCTTGAAGG  ATGTAGCCTA  TTCTTTCAAT  1380
1381  GAAGATGAGG  AAGATGAGGA  AGACGTTAAA  GTGAAAGCTG  ATTCAAGCAG  GATGGAAGCC  1440
1441  TTGTATTCCA  AGGCAACACT  TAGGTCAAAC  AACCAAGAAG  AGCTCCGAAG  GCAGCATCAA  1500
1501  GCAGAACTTG  CCCGTCAGAA  GAATGAAGAA  ACTGCTCGTC  GTCTTGCTGG  TGGAGGAGCT  1560
1561  TTAACGGGGA  ATAACAAGGG  TGCTGCTAAG  GCCTCAAGTG  ACCTTGTTGC  GTATAAGAGC  1620
1621  ATCAATGATC  TACCACCTCC  TAGGGATATG  ACTATTCAGG  TTGACCAAAA  GAATGAAGCC  1680
1681  ATTCTTCTAC  CAATATATGG  TACTATGGTT  CCTTTCCATG  TGGCTACTGT  TAAGACTGTT  1740
1741  TCAAGCCAGC  AGGATACCAA  CCGTAACTGT  TATATCCGTG  TCATTTTCAA  TGTTCCTGGT  1800
1801  ACCCCTTTTA  CACCTGTTGA  TGCAAATGCT  CTTAAGAATC  AGAGTGCTAT  TTACCTGAAG  1860
1861  GAAGTTTCAT  TTCGTTCCAA  GGATCCAAGG  CACATAAGTG  AAGTGGTTCA  GCAGATTAAA  1920
1921  ACTCTTAGAC  GTAATGTCAT  GGCCAGGGAG  TCTGAGAGAG  CCGAAAGGGC  AACTTTGGTG  1980
1981  ACTCAGGAAA  AGCTTGTACT  TGCAGGGAAT  AAATTCAAAC  CAGTTAGGCT  GTCTGACTTA  2040
2041  TCGATTCGTC  CCTCTTTTGG  TGGTCGTGCA  AGAAAGCTTC  CGGGTACATT  GGAAGCTCAT  2100
2101  GTTAATGGTT  TCCGGTACTC  GACCTCAAGA  CCAGATGAGC  GTGTTGACAT  CATGTTTGGC  2160
2161  AACATCAAGC  ATGCGTTCTT  CCAGCCAGCA  GAGAAGGAGA  TGATTACCCT  TCTTCACTTT  2220
2221  CATCTGCATA  ACCACATAAT  GGTAGGAAAC  AAGAAAACCA  AGGATGTGCA  ATTCTATGTT  2280
2281  GAGGTAATGG  ATGTGGTGCA  AACACTAGGA  GGTGGAAAGC  GGTCTGCCTA  TGACCCAGAT  2340
2341  GAGATTGAGG  AAGAACAGAG  AGAAAGAGAT  CGGAAGAACA  AATTCAACAT  GGACTTTCAG  2400
2401  AATTTTGTGA  ACCGGGTGAA  TGATGTGTGG  AGCCAGCCCC  AGCTTAAAGG  ACTTGACCTG  2460
2461  GAGTTTGATC  AACCTCTGAG  AGAACTTGGG  TTCCATGGGG  TGCCCTATAA  ATCATCAGCA  2520
2521  TTCATTGTGC  CAACCTCAAG  CTGTTTGGTT  GAGCTGATAG  AGACCCCATT  TCTCGTAATA  2580
2581  ACCTTAAGTG  ATATTGAGAT  TGTCAACTTG  GAGAGAGTTG  GATTTGGGCA  GAAGAATTTT  2640
2641  GATATGGCAA  TTGTCTTCAA  GGACTTCAAG  CGTGATGTCA  TGCGCATAGA  TTCAATTCCT  2700
2701  GTCTCTGCAC  TTGATGGCAT  CAAGGAGTGG  CTTGACACAA  CTGACATCAA  GTATTATGAG  2760
2761  AGCAAGATGA  ACCTGAATTG  GCGTGAAGTA  CTGAAGACCA  TAACTGAAGA  TCCCCAAAGG  2820
2821  TTTATAGATG  AAGGTGGTTG  GGAATTTTTA  AACATAGATG  CTTCTGACTC  AGAATCTGAA  2880
2881  AATTCGGAGG  AGTCAGACCA  AGGCTATGAA  CCCTCAGACG  CTGAACCTGA  GTCAGATTCA  2940
2941  GAAGACGAAG  CCTCTGATAG  TGAATCTCTG  GTGGATTCCG  AGGAAGAAGA  GGAAGACTCA  3000
3001  GATGAAGACT  CGGAGGAAGA  AAAAGGCAAA  ACATGGGAAG  AGTTGGAGAA  GGAGGCAAGC  3060
3061  AACGCAGATA  GGGAGAAAGG  AGATGAACCT  GACAGTGAGG  ATGAGAGGAG  GAGAAAGAAG  3120
3121  AACTTTGGCA  AGTCCCGATC  CGGTCCAAGT  TCTGCTGGTT  CTAAGCGAAT  GAAGTTCAGG  3180
3181  TAG  3183

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Nia-2326Nicotiana attenuata88.880.01720
LLPS-Phv-0992Phaseolus vulgaris83.282e-179 537
LLPS-Sot-1101Solanum tuberosum82.390.01508
LLPS-Viv-0923Vitis vinifera76.050.01499
LLPS-Thc-0079Theobroma cacao76.00.01486
LLPS-Prp-0430Prunus persica75.880.01485
LLPS-Pot-0141Populus trichocarpa75.560.01424
LLPS-Hea-0112Helianthus annuus75.240.01495
LLPS-Gor-0569Gossypium raimondii74.670.01455
LLPS-Vir-0175Vigna radiata74.170.01393
LLPS-Mae-1134Manihot esculenta74.110.01449
LLPS-Cus-0061Cucumis sativus73.950.01441
LLPS-Via-0001Vigna angularis73.570.01420
LLPS-Glm-0108Glycine max73.160.01432
LLPS-Coc-1223Corchorus capsularis72.760.01418
LLPS-Sob-0413Sorghum bicolor72.380.01391
LLPS-Dac-0267Daucus carota72.220.01425
LLPS-Zem-0253Zea mays72.190.01384
LLPS-Sei-0757Setaria italica72.190.01387
LLPS-Arl-1888Arabidopsis lyrata72.00.01360
LLPS-Orp-0077Oryza punctata71.960.01395
LLPS-Met-0861Medicago truncatula71.920.01404
LLPS-Org-1278Oryza glaberrima71.670.01390
LLPS-Orm-0100Oryza meridionalis71.670.01391
LLPS-Orgl-0962Oryza glumaepatula71.580.01387
LLPS-Brd-0219Brachypodium distachyon71.530.01372
LLPS-Art-0521Arabidopsis thaliana71.50.01358
LLPS-Lep-0880Leersia perrieri71.50.01378
LLPS-Mua-0469Musa acuminata71.480.01234
LLPS-Orni-0151Oryza nivara71.480.01387
LLPS-Orb-0980Oryza barthii71.480.01383
LLPS-Orbr-0574Oryza brachyantha71.390.01394
LLPS-Ors-0052Oryza sativa71.390.01382
LLPS-Brn-0836Brassica napus70.790.01331
LLPS-Amt-1037Amborella trichopoda70.750.01262
LLPS-Bro-0512Brassica oleracea70.680.01328
LLPS-Brr-0285Brassica rapa70.680.01326
LLPS-Tra-3041Triticum aestivum70.370.01360
LLPS-Hov-0642Hordeum vulgare69.890.01352
LLPS-Orr-0694Oryza rufipogon65.460.01231
LLPS-Php-0638Physcomitrella patens61.470.01140
LLPS-Sem-0880Selaginella moellendorffii58.340.01117
LLPS-Ori-1783Oryza indica52.450.0 943
LLPS-Tru-1541Triticum urartu50.590.0 881
LLPS-Chr-0267Chlamydomonas reinhardtii49.330.0 828
LLPS-Osl-0304Ostreococcus lucimarinus43.780.0 736
LLPS-Pes-1217Pelodiscus sinensis38.32e-90 305
LLPS-Gas-0072Galdieria sulphuraria37.640.0 582
LLPS-Scp-1039Schizosaccharomyces pombe36.580.0 580
LLPS-Ran-0509Rattus norvegicus36.490.0 585
LLPS-Mum-0211Mus musculus36.490.0 585
LLPS-Mea-1308Mesocricetus auratus36.490.0 582
LLPS-Xet-1517Xenopus tropicalis36.480.0 568
LLPS-Dar-0703Danio rerio36.450.0 587
LLPS-Urm-3008Ursus maritimus36.380.0 581
LLPS-Bot-1136Bos taurus36.380.0 580
LLPS-Ova-0020Ovis aries36.310.0 576
LLPS-Nol-0032Nomascus leucogenys36.280.0 581
LLPS-Ict-2112Ictidomys tridecemlineatus36.280.0 580
LLPS-Cas-0434Carlito syrichta36.280.0 581
LLPS-Mam-1625Macaca mulatta36.280.0 580
LLPS-Eqc-1920Equus caballus36.280.0 579
LLPS-Caf-3563Canis familiaris36.280.0 579
LLPS-Poa-0956Pongo abelii36.280.0 580
LLPS-Rhb-0209Rhinopithecus bieti36.280.0 581
LLPS-Orc-0876Oryctolagus cuniculus36.280.0 580
LLPS-Fec-0406Felis catus36.280.0 579
LLPS-Hos-0102Homo sapiens36.280.0 580
LLPS-Pap-1504Pan paniscus36.280.0 580
LLPS-Pat-0880Pan troglodytes36.280.0 580
LLPS-Mup-2171Mustela putorius furo36.280.0 579
LLPS-Aim-1191Ailuropoda melanoleuca36.280.0 583
LLPS-Paa-0120Papio anubis36.280.0 580
LLPS-Caj-2769Callithrix jacchus36.280.0 580
LLPS-Fud-0086Fukomys damarensis36.280.0 580
LLPS-Gog-2163Gorilla gorilla36.280.0 580
LLPS-Sus-1433Sus scrofa36.280.0 580
LLPS-Cea-1249Cercocebus atys36.280.0 580
LLPS-Aon-2365Aotus nancymaae36.280.0 581
LLPS-Chs-0374Chlorocebus sabaeus36.280.0 580
LLPS-Maf-0967Macaca fascicularis36.280.0 580
LLPS-Mod-0039Monodelphis domestica36.240.0 578
LLPS-Loa-2185Loxodonta africana36.170.0 580
LLPS-Asm-0661Astyanax mexicanus36.170.0 577
LLPS-Orl-2636Oryzias latipes36.160.0 583
LLPS-Scj-1252Schizosaccharomyces japonicus36.112e-180 560
LLPS-Myl-3169Myotis lucifugus36.070.0 569
LLPS-Dio-1621Dipodomys ordii36.070.0 579
LLPS-Scc-0135Schizosaccharomyces cryophilus36.060.0 571
LLPS-Drm-0312Drosophila melanogaster36.044e-180 563
LLPS-Ora-0860Ornithorhynchus anatinus36.031e-175 547
LLPS-Cap-1952Cavia porcellus35.961e-171 533
LLPS-Tar-1935Takifugu rubripes35.860.0 580
LLPS-Icp-0046Ictalurus punctatus35.790.0 582
LLPS-Scm-0668Scophthalmus maximus35.753e-178 555
LLPS-Anc-1380Anolis carolinensis35.710.0 579
LLPS-Orn-0440Oreochromis niloticus35.710.0 563
LLPS-Spr-0262Sporisorium reilianum35.692e-170 535
LLPS-Scf-2052Scleropages formosus35.680.0 576
LLPS-Man-2736Macaca nemestrina35.545e-175 547
LLPS-Ten-1440Tetraodon nigroviridis35.390.0 577
LLPS-Pof-1559Poecilia formosa35.370.0 580
LLPS-Otg-0540Otolemur garnettii35.262e-171 538
LLPS-Xim-0358Xiphophorus maculatus35.260.0 580
LLPS-Chc-0776Chondrus crispus34.947e-158 504
LLPS-Cae-0908Caenorhabditis elegans34.942e-161 511
LLPS-Miv-1021Microbotryum violaceum34.93e-160 508
LLPS-Sah-2636Sarcophilus harrisii34.624e-145 462
LLPS-Lac-0540Latimeria chalumnae34.618e-171 536
LLPS-Usm-0212Ustilago maydis34.598e-159 504
LLPS-Asn-0734Aspergillus nidulans34.592e-173 542
LLPS-Trr-0067Trichoderma reesei34.589e-168 528
LLPS-Zyt-0432Zymoseptoria tritici34.581e-174 546
LLPS-Cym-0446Cyanidioschyzon merolae34.552e-146 476
LLPS-Ast-0587Aspergillus terreus34.524e-170 534
LLPS-Tum-0571Tuber melanosporum34.522e-165 521
LLPS-Yal-1083Yarrowia lipolytica34.521e-160 508
LLPS-Cogr-0553Colletotrichum graminicola34.54e-160 508
LLPS-Fuo-0288Fusarium oxysporum34.443e-165 521
LLPS-Fuv-0301Fusarium verticillioides34.441e-165 523
LLPS-Blg-0464Blumeria graminis34.246e-170 533
LLPS-Kop-0002Komagataella pastoris34.231e-148 476
LLPS-Nef-0985Neosartorya fischeri34.25e-172 539
LLPS-Map-0091Magnaporthe poae34.21e-160 509
LLPS-Asni-0356Aspergillus niger34.172e-170 535
LLPS-Trv-0275Trichoderma virens34.167e-165 520
LLPS-Mal-2748Mandrillus leucophaeus34.142e-155 495
LLPS-Cog-0054Colletotrichum gloeosporioides34.15e-161 510
LLPS-Mao-0555Magnaporthe oryzae34.12e-163 517
LLPS-Ved-0380Verticillium dahliae33.991e-156 498
LLPS-Gag-0467Gaeumannomyces graminis33.993e-157 500
LLPS-Asfu-0746Aspergillus fumigatus33.932e-172 540
LLPS-Dos-0637Dothistroma septosporum33.862e-166 524
LLPS-Asc-0065Aspergillus clavatus33.861e-171 538
LLPS-Abg-0281Absidia glauca33.822e-154 495
LLPS-Coo-0462Colletotrichum orbiculare33.782e-159 506
LLPS-Asg-0681Ashbya gossypii33.711e-145 469
LLPS-Fus-0032Fusarium solani33.643e-164 519
LLPS-Crn-0197Cryptococcus neoformans33.647e-161 510
LLPS-Nec-0735Neurospora crassa33.582e-161 511
LLPS-Beb-0249Beauveria bassiana33.547e-159 504
LLPS-Asf-0042Aspergillus flavus33.474e-167 526
LLPS-Aso-0015Aspergillus oryzae33.474e-167 526
LLPS-Mel-0924Melampsora laricipopulina33.48e-162 513
LLPS-Scs-0024Sclerotinia sclerotiorum33.332e-166 524
LLPS-Pug-0346Puccinia graminis33.275e-157 501
LLPS-Cii-0654Ciona intestinalis33.199e-151 483
LLPS-Phn-1224Phaeosphaeria nodorum32.923e-159 505
LLPS-Gaa-0782Gasterosteus aculeatus32.881e-153 491
LLPS-Lem-0222Leptosphaeria maculans32.683e-157 500
LLPS-Sac-0143Saccharomyces cerevisiae32.551e-144 467
LLPS-Pyt-0653Pyrenophora teres32.51e-155 496
LLPS-Anp-0186Anas platyrhynchos32.232e-24 109
LLPS-Cis-1350Ciona savignyi32.135e-135 441
LLPS-Pytr-0179Pyrenophora triticirepentis32.087e-154 491
LLPS-Put-0417Puccinia triticina31.03e-121 404