• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Sol-2229

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Ensembl Gene: Solyc05g054040.3
Ensembl Protein: Solyc05g054040.3.1
Organism: Solanum lycopersicum
Taxa ID: 4081
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblSolyc05g054040.3.1Solyc05g054040.3.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MEKKMMSYVV  VLIVLCCGVT  PARSDGSDHK  YKAGDQVTMY  ANKVGPFHNP  SETYRFFDLP  60
61    FCAPVSSLPK  DVFTAHVTEK  KEALGEVLNG  DRLVSAPYKL  DFMYDKDSEI  VCKKKLSKEE  120
121   VSLFRNAVAK  DYYFQMYYDD  LPIWGFLGKV  DKEGKTDPSE  YKYYLFKHLH  FEIFYNNDRV  180
181   VEINARTDPN  ALVDITEDKE  VDVDFMYSVK  WKESTTPFEK  RMEKYSQSSS  MPHHLEIHWF  240
241   SIINSCVTVL  LLTGFLATIL  MRVLKNDFVK  YAHDEEAADD  QEETGWKYIH  GDVFRYPKYK  300
301   SLLAAAVGSG  TQLFTMTIFI  FILALVGVFY  PYNRGALFTA  LVVIYALTSG  IAGYTASAFY  360
361   CQLEGTNWVR  NLILTGALFC  GPLFLTFCFL  NSVAIGYTAT  AALPFGTIMV  IFLIWALVTS  420
421   PLLVLGGIAG  KNSKSEFQAP  CRTTKYPREI  PPSPWYRGTL  SQMAMAGFLP  FSAIYIELYY  480
481   IFASVWGHRI  YTIYSILFIV  FIILLIVTAF  ITVALTYFQL  AAEDHEWWWR  AFLCGGSTGL  540
541   FIYGYCLYYY  YARSDMTGFM  QTSFFFGYMA  CICYGFFLML  GSVGFRAALF  FVRHIYRSIK  600
601   CE  602
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGAGAAGA  AGATGATGAG  TTACGTCGTC  GTTTTGATCG  TTTTGTGTTG  TGGGGTTACT  60
61    CCGGCGAGAT  CGGACGGTTC  CGATCATAAG  TACAAGGCCG  GAGATCAGGT  TACTATGTAT  120
121   GCTAACAAGG  TTGGTCCTTT  CCATAATCCA  AGCGAAACGT  ACCGATTCTT  TGATCTTCCA  180
181   TTCTGTGCAC  CAGTTTCAAG  CTTACCGAAG  GATGTGTTTA  CAGCTCATGT  GACTGAGAAA  240
241   AAGGAAGCTC  TTGGTGAAGT  CTTAAATGGT  GATCGATTGG  TCAGTGCTCC  TTACAAGCTC  300
301   GACTTTATGT  ACGACAAGGA  CTCAGAAATA  GTGTGCAAAA  AGAAGTTATC  GAAGGAAGAA  360
361   GTTTCTCTAT  TCCGTAATGC  CGTTGCCAAG  GACTATTACT  TCCAAATGTA  TTATGATGAC  420
421   TTGCCCATTT  GGGGTTTCTT  AGGGAAAGTC  GATAAGGAGG  GAAAAACAGA  TCCCAGCGAG  480
481   TACAAATATT  ACCTGTTTAA  ACATCTCCAT  TTTGAGATCT  TTTACAACAA  TGATCGTGTG  540
541   GTTGAGATCA  ATGCACGAAC  TGATCCTAAT  GCCTTGGTTG  ATATCACAGA  GGATAAGGAA  600
601   GTAGATGTTG  ACTTTATGTA  CTCTGTGAAA  TGGAAGGAGT  CAACTACTCC  TTTTGAGAAG  660
661   AGGATGGAAA  AATACTCACA  GTCATCATCA  ATGCCACATC  ACTTGGAAAT  CCATTGGTTC  720
721   TCAATTATCA  ACTCCTGTGT  GACAGTTCTT  CTCTTAACTG  GTTTTCTCGC  AACAATTCTT  780
781   ATGCGCGTTC  TTAAGAATGA  CTTTGTCAAG  TATGCACATG  ATGAGGAGGC  AGCTGATGAC  840
841   CAAGAAGAAA  CTGGGTGGAA  ATACATTCAT  GGTGATGTTT  TTAGGTATCC  GAAGTACAAA  900
901   TCGTTGTTGG  CTGCTGCTGT  TGGTTCTGGT  ACCCAACTCT  TTACAATGAC  CATCTTTATT  960
961   TTCATTCTTG  CACTTGTTGG  TGTTTTCTAT  CCTTACAATC  GTGGAGCTTT  ATTCACTGCA  1020
1021  CTGGTTGTCA  TATATGCTCT  CACGTCTGGG  ATTGCTGGCT  ATACTGCATC  CGCTTTCTAC  1080
1081  TGTCAACTAG  AAGGAACAAA  CTGGGTCAGG  AACTTGATAT  TGACTGGGGC  ATTGTTTTGT  1140
1141  GGACCGCTGT  TTCTCACATT  CTGCTTTCTT  AACTCCGTTG  CTATCGGCTA  CACTGCCACT  1200
1201  GCTGCGCTAC  CTTTTGGAAC  CATCATGGTC  ATTTTTCTAA  TATGGGCTCT  TGTAACATCA  1260
1261  CCTTTGCTCG  TATTGGGAGG  GATAGCTGGA  AAGAATAGTA  AATCTGAATT  CCAAGCTCCT  1320
1321  TGTCGTACCA  CCAAGTATCC  AAGAGAGATA  CCGCCATCGC  CTTGGTACCG  TGGAACTCTG  1380
1381  TCTCAGATGG  CAATGGCTGG  GTTTTTGCCT  TTTAGTGCCA  TATATATTGA  ACTTTACTAC  1440
1441  ATATTTGCAA  GTGTTTGGGG  TCACAGAATT  TACACAATTT  ACAGTATCTT  GTTTATAGTC  1500
1501  TTCATTATCC  TTCTAATTGT  CACCGCTTTT  ATAACCGTGG  CATTGACATA  CTTCCAACTT  1560
1561  GCTGCTGAAG  ATCACGAATG  GTGGTGGAGG  GCTTTCCTTT  GTGGTGGATC  AACTGGACTG  1620
1621  TTCATCTACG  GATACTGCTT  GTATTACTAT  TATGCACGTT  CCGATATGAC  AGGGTTCATG  1680
1681  CAAACCTCAT  TCTTCTTCGG  GTACATGGCT  TGCATCTGCT  ATGGTTTCTT  TCTCATGCTC  1740
1741  GGGTCTGTTG  GTTTCCGTGC  AGCCCTATTC  TTTGTCCGTC  ACATATATCG  ATCGATCAAA  1800
1801  TGCGAGTAA  1809

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Ori-2318Oryza indica91.138e-95 322
LLPS-Nia-1803Nicotiana attenuata91.070.01042
LLPS-Sot-1835Solanum tuberosum90.670.01040
LLPS-Dac-2377Daucus carota86.580.0 866
LLPS-Tru-1303Triticum urartu85.930.0 858
LLPS-Cus-1689Cucumis sativus85.330.0 972
LLPS-Prp-0933Prunus persica85.020.0 968
LLPS-Bro-0790Brassica oleracea84.830.0 947
LLPS-Brn-2848Brassica napus84.480.0 939
LLPS-Phv-0204Phaseolus vulgaris84.10.0 941
LLPS-Via-2397Vigna angularis84.050.0 942
LLPS-Art-1363Arabidopsis thaliana83.930.0 941
LLPS-Gor-1844Gossypium raimondii83.50.0 958
LLPS-Brr-2618Brassica rapa83.360.0 941
LLPS-Hea-2041Helianthus annuus83.280.0 944
LLPS-Pot-2193Populus trichocarpa83.060.0 956
LLPS-Zem-0562Zea mays82.990.0 908
LLPS-Mua-1678Musa acuminata82.460.0 938
LLPS-Orm-1448Oryza meridionalis82.230.0 738
LLPS-Mae-0377Manihot esculenta81.50.0 941
LLPS-Vir-1532Vigna radiata81.490.0 827
LLPS-Glm-2876Glycine max81.230.0 945
LLPS-Brd-0371Brachypodium distachyon78.830.0 891
LLPS-Sob-0953Sorghum bicolor78.830.0 898
LLPS-Amt-1507Amborella trichopoda78.690.0 899
LLPS-Orni-0859Oryza nivara78.660.0 894
LLPS-Orgl-1391Oryza glumaepatula78.660.0 894
LLPS-Orr-2049Oryza rufipogon78.660.0 894
LLPS-Lep-1099Leersia perrieri78.30.0 864
LLPS-Tra-2380Triticum aestivum78.140.0 882
LLPS-Orb-2394Oryza barthii77.990.0 861
LLPS-Org-1203Oryza glaberrima77.990.0 863
LLPS-Orp-2379Oryza punctata77.590.0 900
LLPS-Orbr-0555Oryza brachyantha77.550.0 859
LLPS-Ors-2177Oryza sativa77.470.0 855
LLPS-Sei-1856Setaria italica76.410.0 897
LLPS-Met-1349Medicago truncatula75.130.0 871
LLPS-Php-1393Physcomitrella patens72.880.0 831
LLPS-Sem-2316Selaginella moellendorffii65.850.0 733
LLPS-Chr-1325Chlamydomonas reinhardtii65.60.0 715
LLPS-Lac-1388Latimeria chalumnae37.234e-78 263
LLPS-Coc-0554Corchorus capsularis34.846e-99 330
LLPS-Xet-1340Xenopus tropicalis34.494e-83 280
LLPS-Hov-1583Hordeum vulgare34.235e-102 330
LLPS-Thc-0330Theobroma cacao33.921e-101 328
LLPS-Cae-1598Caenorhabditis elegans33.723e-98 320
LLPS-Abg-1748Absidia glauca33.666e-89 295
LLPS-Anp-2770Anas platyrhynchos33.51e-96 315
LLPS-Aon-2005Aotus nancymaae33.455e-84 282
LLPS-Icp-2769Ictalurus punctatus33.442e-100 326
LLPS-Aim-1186Ailuropoda melanoleuca33.396e-98 319
LLPS-Viv-2308Vitis vinifera33.391e-99 323
LLPS-Urm-1506Ursus maritimus33.394e-98 319
LLPS-Fec-1009Felis catus33.394e-98 320
LLPS-Ere-0383Erinaceus europaeus33.282e-82 278
LLPS-Dar-2753Danio rerio33.282e-99 323
LLPS-Fia-1039Ficedula albicollis33.288e-82 276
LLPS-Eqc-1977Equus caballus33.286e-97 316
LLPS-Orl-4008Oryzias latipes33.115e-96 314
LLPS-Rhb-4813Rhinopithecus bieti33.111e-96 315
LLPS-Otg-4134Otolemur garnettii33.111e-96 316
LLPS-Caf-3211Canis familiaris33.117e-97 316
LLPS-Mea-3902Mesocricetus auratus33.19e-83 279
LLPS-Sus-2102Sus scrofa32.953e-96 314
LLPS-Chs-4369Chlorocebus sabaeus32.953e-96 315
LLPS-Gog-3956Gorilla gorilla32.953e-96 315
LLPS-Dio-1842Dipodomys ordii32.952e-96 315
LLPS-Bot-4199Bos taurus32.952e-96 315
LLPS-Loa-4498Loxodonta africana32.952e-95 313
LLPS-Pat-0488Pan troglodytes32.953e-96 315
LLPS-Hos-3362Homo sapiens32.953e-96 315
LLPS-Orc-4114Oryctolagus cuniculus32.956e-97 316
LLPS-Poa-3468Pongo abelii32.953e-96 315
LLPS-Ict-0586Ictidomys tridecemlineatus32.953e-96 315
LLPS-Nol-4034Nomascus leucogenys32.953e-96 315
LLPS-Myl-2870Myotis lucifugus32.892e-93 307
LLPS-Cas-2187Carlito syrichta32.893e-97 317
LLPS-Sah-1577Sarcophilus harrisii32.872e-98 320
LLPS-Leo-0968Lepisosteus oculatus32.811e-100 326
LLPS-Xim-4085Xiphophorus maculatus32.813e-98 320
LLPS-Fud-2004Fukomys damarensis32.781e-95 313
LLPS-Pes-0533Pelodiscus sinensis32.784e-94 309
LLPS-Tag-3096Taeniopygia guttata32.781e-95 313
LLPS-Gaga-3628Gallus gallus32.782e-94 310
LLPS-Tum-0680Tuber melanosporum32.741e-84 284
LLPS-Caj-2401Callithrix jacchus32.726e-97 317
LLPS-Osl-0275Ostreococcus lucimarinus32.721e-96 315
LLPS-Tar-0091Takifugu rubripes32.677e-78 266
LLPS-Meg-2207Meleagris gallopavo32.622e-94 310
LLPS-Scm-3992Scophthalmus maximus32.628e-97 316
LLPS-Gaa-3825Gasterosteus aculeatus32.547e-99 321
LLPS-Arl-2223Arabidopsis lyrata32.482e-95 312
LLPS-Tut-1061Tursiops truncatus32.473e-82 278
LLPS-Scf-2432Scleropages formosus32.452e-96 315
LLPS-Mod-4184Monodelphis domestica32.245e-92 304
LLPS-Orn-1665Oreochromis niloticus32.224e-100 325
LLPS-Mum-3874Mus musculus31.955e-95 311
LLPS-Cis-1762Ciona savignyi31.913e-85 285
LLPS-Mup-1099Mustela putorius furo31.911e-90 299
LLPS-Fus-0699Fusarium solani31.883e-82 277
LLPS-Ten-1691Tetraodon nigroviridis31.851e-95 313
LLPS-Ora-2814Ornithorhynchus anatinus31.848e-84 282
LLPS-Ova-0823Ovis aries31.86e-96 313
LLPS-Cea-0012Cercocebus atys31.712e-96 315
LLPS-Maf-2053Macaca fascicularis31.712e-96 315
LLPS-Paa-3202Papio anubis31.712e-96 315
LLPS-Man-4106Macaca nemestrina31.712e-96 315
LLPS-Mam-4453Macaca mulatta31.712e-96 315
LLPS-Asm-0562Astyanax mexicanus31.671e-96 316
LLPS-Anc-2216Anolis carolinensis31.639e-83 279
LLPS-Cym-0520Cyanidioschyzon merolae31.615e-72 250
LLPS-Pof-3344Poecilia formosa31.513e-78 267
LLPS-Ran-4442Rattus norvegicus31.491e-94 310
LLPS-Pap-0523Pan paniscus31.131e-82 278
LLPS-Mal-1791Mandrillus leucophaeus31.051e-90 299
LLPS-Cii-2011Ciona intestinalis30.092e-77 265
LLPS-Gas-0321Galdieria sulphuraria30.081e-76 262
LLPS-Chc-0989Chondrus crispus29.958e-74 254
LLPS-Cap-1802Cavia porcellus29.923e-84 282