• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Sol-1138

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Ensembl Gene: Solyc06g083540.3
Ensembl Protein: Solyc06g083540.3.1
Organism: Solanum lycopersicum
Taxa ID: 4081
LLPS Type: Client


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblSolyc06g083540.3.1Solyc06g083540.3.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MQILQWLFKN  ANDTNFNTNS  SKKQVVTDEE  VNSQGIVLFE  ISGKKRNRAG  KSANSSCCNI  60
61    LNWFNTLRRK  DIAKEYFYST  IRLNRLESSR  RKQQLVHCMK  MKKQSLTRGL  SFRRNSDSAI  120
121   AKVLPVSDAV  GTKNSHKEQN  LSADKKEKAN  GDKMKTVSKM  KELIRWAAAV  KSQKGGKYFS  180
181   QKVQTLRPPG  ILFSFLVSCQ  DCLVLGGLCN  STNGPNFVLW  KVDEETMEFS  ELAIMPQALM  240
241   YCLFDSDEDD  KFASLKCVGL  GNLVYVYNEE  HHKNYTACVC  EFSNDFRMCS  WRKLPNLPPN  300
301   AKKMDRYQKV  EKPKPELPIN  ENEIRITSQG  LVRNYISYAT  SLLQERSGKE  IILKAMGQAI  360
361   SKTVAVAEII  KRRIPRLHQD  AAISSVSITD  VWEPIEEGLL  PVEQTRHVSM  ISITLSTTEL  420
421   NKDSPGYQAP  SDIQQTNYYN  NNNNYAPRYS  YQPRQQQPPP  RQAQAVFNAG  NEENGGYSNW  480
481   GRGGGRGGWG  YRDSGYGRVR  GGGGRGYGYG  GGRGRMGNRP  RGGNNNQA  528
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGCAGATCC  TTCAATGGCT  TTTCAAGAAT  GCAAATGATA  CCAATTTTAA  CACCAATTCT  60
61    AGCAAGAAGC  AAGTTGTTAC  TGATGAGGAA  GTGAACTCCC  AAGGCATTGT  CCTGTTTGAG  120
121   ATTTCTGGAA  AAAAGAGAAA  TCGAGCTGGA  AAATCAGCGA  ATTCGAGCTG  CTGCAACATC  180
181   CTCAATTGGT  TCAACACATT  ACGCAGAAAA  GACATTGCGA  AAGAGTATTT  CTACAGCACG  240
241   ATTCGTCTAA  ATAGATTGGA  AAGTTCGCGA  AGGAAACAAC  AGCTTGTACA  TTGCATGAAG  300
301   ATGAAAAAAC  AGAGTCTTAC  TCGTGGATTA  AGCTTTCGTC  GAAACTCAGA  TTCTGCCATA  360
361   GCCAAAGTTC  TGCCAGTTAG  TGATGCAGTA  GGAACAAAAA  ATAGCCATAA  AGAGCAAAAC  420
421   CTTAGTGCAG  ATAAGAAGGA  AAAGGCCAAT  GGAGATAAAA  TGAAGACAGT  TTCAAAGATG  480
481   AAGGAACTAA  TAAGATGGGC  TGCTGCTGTT  AAATCACAAA  AGGGAGGAAA  ATACTTTAGT  540
541   CAAAAGGTAC  AAACACTTAG  ACCACCTGGG  ATTTTGTTCT  CATTCTTGGT  ATCTTGTCAA  600
601   GATTGTTTAG  TTTTAGGTGG  ATTATGTAAT  TCAACAAATG  GACCAAATTT  TGTTCTATGG  660
661   AAGGTTGATG  AGGAAACAAT  GGAGTTTAGT  GAACTTGCTA  TAATGCCTCA  AGCATTGATG  720
721   TATTGTTTGT  TTGATAGTGA  TGAAGATGAC  AAATTTGCTA  GTTTGAAATG  TGTTGGATTG  780
781   GGGAATCTTG  TTTATGTTTA  CAATGAAGAA  CATCATAAGA  ATTACACTGC  TTGTGTTTGT  840
841   GAATTTAGTA  ATGATTTTAG  GATGTGTAGT  TGGAGAAAGT  TGCCTAATTT  GCCACCAAAT  900
901   GCTAAAAAAA  TGGATAGGTA  CCAAAAAGTA  GAGAAACCTA  AGCCTGAATT  ACCCATTAAC  960
961   GAGAATGAGA  TCAGAATTAC  TTCACAGGGA  CTTGTTAGAA  ACTACATCAG  CTATGCTACT  1020
1021  AGTCTGCTTC  AGGAGAGGAG  TGGGAAAGAG  ATCATTTTGA  AAGCAATGGG  TCAGGCAATA  1080
1081  AGCAAGACTG  TAGCTGTTGC  AGAGATCATT  AAGAGAAGAA  TTCCTCGTCT  GCATCAAGAT  1140
1141  GCTGCTATCA  GCTCAGTGAG  CATCACAGAT  GTATGGGAAC  CTATTGAAGA  GGGCCTATTG  1200
1201  CCTGTGGAGC  AGACTCGGCA  TGTCTCAATG  ATTTCAATCA  CCTTGTCAAC  AACAGAACTG  1260
1261  AACAAGGACT  CTCCAGGGTA  TCAAGCACCT  TCTGATATTC  AGCAGACTAA  TTACTACAAC  1320
1321  AATAACAACA  ACTACGCCCC  ACGTTATAGT  TACCAGCCTC  GACAGCAGCA  ACCACCACCT  1380
1381  AGACAAGCAC  AAGCAGTTTT  CAATGCTGGT  AATGAAGAAA  ATGGTGGGTA  CTCAAACTGG  1440
1441  GGGCGAGGTG  GAGGCCGTGG  TGGCTGGGGA  TATCGTGATT  CTGGATATGG  AAGAGTCAGG  1500
1501  GGTGGAGGTG  GCAGAGGTTA  TGGTTATGGT  GGTGGACGTG  GACGGATGGG  CAACCGTCCA  1560
1561  AGGGGTGGCA  ATAACAACCA  GGCTTAG  1587

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Sot-2272Solanum tuberosum99.252e-86 275
LLPS-Nia-0847Nicotiana attenuata90.231e-77 253
LLPS-Via-0600Vigna angularis83.756e-38 145
LLPS-Met-2040Medicago truncatula81.951e-68 231
LLPS-Phv-2155Phaseolus vulgaris81.822e-70 233
LLPS-Cus-1425Cucumis sativus81.36e-64 211
LLPS-Mae-2270Manihot esculenta81.066e-66 220
LLPS-Gor-1921Gossypium raimondii81.065e-67 223
LLPS-Coc-0403Corchorus capsularis81.063e-68 226
LLPS-Sei-2205Setaria italica80.474e-63 214
LLPS-Glm-1502Glycine max80.32e-69 232
LLPS-Art-0196Arabidopsis thaliana79.71e-66 229
LLPS-Viv-2304Vitis vinifera79.552e-67 224
LLPS-Orr-0007Oryza rufipogon79.177e-57 199
LLPS-Orm-0894Oryza meridionalis79.177e-44 163
LLPS-Orni-1051Oryza nivara79.177e-57 199
LLPS-Orb-2301Oryza barthii79.177e-57 199
LLPS-Orgl-1734Oryza glumaepatula79.177e-57 199
LLPS-Orbr-1802Oryza brachyantha78.912e-61 209
LLPS-Ors-2245Oryza sativa78.915e-61 209
LLPS-Orp-1310Oryza punctata78.915e-62 213
LLPS-Org-1846Oryza glaberrima78.914e-61 209
LLPS-Ori-1611Oryza indica78.914e-61 209
LLPS-Lep-1882Leersia perrieri78.917e-62 212
LLPS-Pot-0878Populus trichocarpa78.796e-62 212
LLPS-Arl-1833Arabidopsis lyrata78.25e-65 223
LLPS-Mua-1664Musa acuminata78.031e-64 218
LLPS-Vir-1877Vigna radiata77.896e-42 158
LLPS-Zem-2458Zea mays77.861e-61 212
LLPS-Hov-1240Hordeum vulgare77.346e-60 207
LLPS-Tra-1630Triticum aestivum77.343e-60 207
LLPS-Brd-1414Brachypodium distachyon77.346e-60 207
LLPS-Sob-1079Sorghum bicolor77.273e-61 211
LLPS-Hea-1365Helianthus annuus76.693e-63 215
LLPS-Prp-1011Prunus persica74.441e-58 204
LLPS-Brn-2303Brassica napus72.931e-58 204
LLPS-Bro-0685Brassica oleracea72.184e-58 203
LLPS-Dac-0929Daucus carota72.183e-62 212
LLPS-Php-0464Physcomitrella patens71.651e-57 199
LLPS-Amt-2337Amborella trichopoda70.876e-56 194
LLPS-Brr-0620Brassica rapa70.681e-57 196
LLPS-Sem-2221Selaginella moellendorffii68.51e-51 182
LLPS-Thc-1194Theobroma cacao67.721e-51 183
LLPS-Tru-1553Triticum urartu65.357e-50 180
LLPS-Chr-0441Chlamydomonas reinhardtii47.061e-30 125
LLPS-Gas-0987Galdieria sulphuraria45.384e-27 114
LLPS-Mod-3077Monodelphis domestica36.762e-1887.8
LLPS-Anc-1765Anolis carolinensis36.53e-1990.1
LLPS-Tag-2749Taeniopygia guttata36.51e-1887.8
LLPS-Fia-2078Ficedula albicollis35.775e-1784.0
LLPS-Meg-2703Meleagris gallopavo35.773e-1784.3
LLPS-Lac-1435Latimeria chalumnae35.772e-1682.4
LLPS-Anp-0885Anas platyrhynchos35.773e-1784.7
LLPS-Gaga-0224Gallus gallus35.774e-1784.3
LLPS-Sah-2647Sarcophilus harrisii35.453e-1475.9
LLPS-Pes-0401Pelodiscus sinensis35.042e-1682.4
LLPS-Leo-0626Lepisosteus oculatus34.215e-1166.2
LLPS-Mea-0731Mesocricetus auratus34.179e-1680.1
LLPS-Ran-2812Rattus norvegicus34.175e-1680.9
LLPS-Ten-0479Tetraodon nigroviridis33.333e-1784.7
LLPS-Loa-0657Loxodonta africana33.098e-1783.2
LLPS-Aon-1422Aotus nancymaae33.095e-1783.6
LLPS-Xet-0770Xenopus tropicalis32.851e-1580.1
LLPS-Caf-2116Canis familiaris32.848e-1680.1
LLPS-Dar-0221Danio rerio32.522e-1375.5
LLPS-Tut-0178Tursiops truncatus32.484e-1063.5
LLPS-Rhb-0502Rhinopithecus bieti32.353e-1681.6
LLPS-Hos-0921Homo sapiens32.353e-1681.6
LLPS-Pap-4035Pan paniscus32.353e-1681.6
LLPS-Pat-3224Pan troglodytes32.353e-1681.6
LLPS-Cas-2671Carlito syrichta32.352e-1682.0
LLPS-Nol-3672Nomascus leucogenys32.353e-1681.6
LLPS-Poa-0235Pongo abelii32.353e-1681.6
LLPS-Cap-1842Cavia porcellus32.356e-1680.5
LLPS-Mam-1833Macaca mulatta32.353e-1681.6
LLPS-Gog-1191Gorilla gorilla32.353e-1681.6
LLPS-Fud-1103Fukomys damarensis32.354e-1681.3
LLPS-Maf-3356Macaca fascicularis32.353e-1681.6
LLPS-Chs-1405Chlorocebus sabaeus32.353e-1681.6
LLPS-Cea-3144Cercocebus atys32.353e-1681.6
LLPS-Paa-2913Papio anubis32.353e-1681.6
LLPS-Mal-0545Mandrillus leucophaeus32.353e-1681.6
LLPS-Dio-0052Dipodomys ordii32.353e-1681.3
LLPS-Xim-1190Xiphophorus maculatus32.319e-1577.4
LLPS-Orn-0754Oreochromis niloticus32.239e-1474.3
LLPS-Gaa-2560Gasterosteus aculeatus32.233e-1373.2
LLPS-Asm-3059Astyanax mexicanus32.172e-1168.2
LLPS-Orc-2777Oryctolagus cuniculus32.093e-1578.6
LLPS-Fec-0384Felis catus32.091e-1579.7
LLPS-Sus-0246Sus scrofa32.092e-1579.0
LLPS-Aim-0037Ailuropoda melanoleuca32.091e-1579.7
LLPS-Icp-0306Ictalurus punctatus32.01e-1168.9
LLPS-Otg-3179Otolemur garnettii31.622e-1579.0
LLPS-Man-0315Macaca nemestrina31.624e-1578.2
LLPS-Ict-0866Ictidomys tridecemlineatus31.629e-1577.0
LLPS-Mum-3133Mus musculus31.627e-1680.5
LLPS-Bot-2383Bos taurus31.621e-0962.0
LLPS-Tar-1103Takifugu rubripes31.412e-1374.3
LLPS-Scm-1495Scophthalmus maximus31.43e-1167.0
LLPS-Scf-1362Scleropages formosus31.42e-1373.9
LLPS-Urm-3751Ursus maritimus31.347e-1577.4
LLPS-Ora-1697Ornithorhynchus anatinus31.341e-1065.1
LLPS-Mup-1166Mustela putorius furo31.346e-1577.4
LLPS-Orl-1113Oryzias latipes31.292e-1373.6
LLPS-Pof-1104Poecilia formosa30.62e-1373.6
LLPS-Ova-1698Ovis aries30.61e-1373.9
LLPS-Myl-2780Myotis lucifugus30.172e-0858.9
LLPS-Caj-1476Callithrix jacchus29.668e-0959.7
LLPS-Eqc-4226Equus caballus29.178e-1165.9