• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Sol-1013

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Ensembl Gene: Solyc11g062320.2
Ensembl Protein: Solyc11g062320.2.1
Organism: Solanum lycopersicum
Taxa ID: 4081
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Nucleolus, Centrosome/Spindle pole bodyPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblSolyc11g062320.2.1Solyc11g062320.2.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MADSSSSSSS  TASSWSSMLS  GKSDVEIEEL  LDRMLTRLAL  CDDSKLQDLL  TKLLPLSIAS  60
61    LSSPAPLVRN  KVLEILSHVN  KRVKHQNDIG  LPLSDLWQLY  MESSASSMVR  NFCIMYVEMA  120
121   VDRTIKEDKE  NMAPNFLANI  SKLPLQHQDI  LLRVTTKVIG  ECHSIKISDE  VAAKYRRSGD  180
181   LPDHKIFLEF  CLHMVLYQPT  SQSSTCPAGL  SIAQCDRVTG  KRQLTNDYLR  NVKLGILNVV  240
241   QAMELSTELV  YPLYVAASSD  CQESIVKRGE  ELHKKNASGV  NLEDANLVSK  LFVLFNGTAG  300
301   TDQIPPESRV  SPGNPSLRAK  LMSIFCRSIT  AANSFPLTLQ  CIFGCIYGSN  TTSRLKQLGM  360
361   EFTVWVFKHG  TMDQLRLMGP  VILTGILKSL  DGYSAAESDV  IARETKAFAF  QAIGLLAKRM  420
421   PQLFRDKVDV  ASRLFAALQS  EAQFLRLTIQ  EATNSLAFAY  KGAPQNVLND  LEALLLRSSQ  480
481   VEESEVRFCA  MRWATLLFDM  QHCPSRFICM  VGAADTKLDI  REIALEGLFP  DEDQRKAVSK  540
541   SLNLKYPKLC  DMLDYIIQQQ  PALLDSASVA  GSKLLFPSKS  YVAMIKFLLR  CFEADMKQNN  600
601   LVEGAHFSAT  VEKLCLLLEH  AMAYEGSVDL  HANASKALIS  VGSHMPEVIT  SRYVDKVAWM  660
661   KQFLGHIDLD  TRESISRLIG  IASCSLPLRS  LSDLISELIA  SISTTPKLRF  EMQHGVLCTL  720
721   GYVTANCMSR  TISIPEALLQ  STLKCLVDVV  NLETATLASF  AMQALGHVGL  CVPLPLLLVD  780
781   SSSVPILVVL  REKLSKLLAG  EDVKAVQKIV  ISLGHLCVKE  LSSSHLNIAL  DLIFSLSQSK  840
841   VEDILFGAGE  ALSFLWGGVP  VTADMILKSN  YTSLSMSSNF  LMGDVSSTSS  TCVESEANED  900
901   GHGTVRDAIT  RKIFDDLLYS  SRKQERCAGT  VWLLSLTMYC  GQHQAIQKLL  PDIQEAFSHL  960
961   LAEQNELTQE  LASQGLSVVY  ELGDASMKKS  LVNALVGTLT  GSGKRKRAVK  LVEDSEVFQE  1020
1021  GTIGESPSGG  KLSTYKELCN  LANEMGQPDM  IYKFMDLANY  QASLNSKRGA  AFGFSKIAKH  1080
1081  AGDALQPYLH  ALVPRLLRYQ  YDPDKNVLLF  QDSFVISTIL  IRMCRMR  1127
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGCGGACT  CTTCTTCTTC  TTCTTCGAGT  ACGGCATCGT  CTTGGTCATC  TATGCTCTCT  60
61    GGAAAATCGG  ATGTCGAGAT  AGAGGAACTC  CTTGATCGAA  TGCTCACAAG  GCTCGCACTT  120
121   TGCGATGACT  CCAAGCTACA  AGACTTGCTC  ACCAAACTTC  TACCTCTCTC  CATTGCTTCC  180
181   CTTTCATCTC  CTGCTCCTCT  TGTCCGCAAT  AAAGTACTTG  AGATTCTAAG  CCATGTGAAC  240
241   AAGAGAGTGA  AGCACCAGAA  TGACATTGGT  TTGCCATTAT  CTGACTTGTG  GCAGTTGTAT  300
301   ATGGAATCTA  GTGCATCATC  AATGGTTAGG  AATTTCTGCA  TCATGTATGT  TGAGATGGCA  360
361   GTTGATCGTA  CAATAAAGGA  GGATAAAGAA  AATATGGCAC  CTAACTTCTT  AGCTAACATT  420
421   TCAAAGCTAC  CTCTTCAACA  TCAAGACATA  CTGTTGAGGG  TCACAACTAA  GGTGATTGGG  480
481   GAATGCCATT  CTATTAAAAT  AAGTGATGAA  GTAGCGGCAA  AGTATAGAAG  ATCTGGTGAT  540
541   TTGCCAGACC  ACAAGATATT  TCTTGAATTT  TGCCTTCACA  TGGTTTTATA  TCAACCAACT  600
601   TCTCAAAGCA  GCACTTGCCC  TGCCGGACTT  TCGATTGCTC  AATGTGATCG  TGTTACTGGG  660
661   AAACGACAAT  TGACAAATGA  CTATTTAAGA  AATGTGAAGT  TGGGAATCTT  GAATGTCGTT  720
721   CAAGCTATGG  AATTGTCTAC  AGAACTTGTT  TATCCCCTCT  ATGTGGCTGC  CTCTTCAGAT  780
781   TGTCAAGAGT  CTATTGTTAA  GAGAGGAGAG  GAGCTTCACA  AGAAGAATGC  TTCTGGTGTG  840
841   AATTTGGAGG  ATGCAAACCT  CGTGAGCAAA  CTGTTTGTGC  TATTTAATGG  TACCGCTGGA  900
901   ACTGACCAAA  TTCCACCAGA  GTCTAGAGTT  AGTCCTGGAA  ATCCATCTTT  GAGAGCAAAA  960
961   CTGATGTCTA  TTTTTTGCCG  ATCAATAACT  GCAGCAAACA  GTTTTCCGTT  GACTCTACAG  1020
1021  TGTATTTTTG  GCTGCATATA  CGGAAGTAAT  ACAACGTCAA  GGTTGAAGCA  ATTGGGGATG  1080
1081  GAGTTCACAG  TATGGGTCTT  CAAGCATGGA  ACAATGGACC  AGTTGAGGCT  TATGGGCCCT  1140
1141  GTTATACTGA  CTGGGATTCT  GAAATCTCTT  GATGGTTATT  CAGCAGCAGA  ATCAGATGTT  1200
1201  ATTGCACGGG  AGACGAAAGC  ATTTGCCTTC  CAAGCAATTG  GCTTGCTTGC  TAAGAGGATG  1260
1261  CCTCAACTTT  TTAGAGATAA  AGTCGATGTT  GCTTCAAGGC  TCTTTGCTGC  CCTGCAATCT  1320
1321  GAGGCCCAAT  TTCTCCGTCT  TACTATTCAA  GAAGCAACAA  ATTCCCTTGC  TTTTGCTTAC  1380
1381  AAGGGTGCAC  CACAAAATGT  ATTAAATGAT  CTGGAGGCGC  TCCTTCTGAG  AAGTTCTCAA  1440
1441  GTGGAGGAAA  GCGAAGTGCG  CTTTTGTGCT  ATGAGATGGG  CAACCTTGTT  GTTTGACATG  1500
1501  CAGCATTGCC  CAAGCAGATT  TATTTGTATG  GTTGGAGCTG  CTGACACTAA  GCTGGATATA  1560
1561  AGGGAAATTG  CATTAGAAGG  TTTATTTCCT  GATGAAGATC  AAAGGAAAGC  AGTAAGCAAA  1620
1621  AGCCTCAACT  TAAAGTACCC  AAAACTTTGT  GACATGCTAG  ACTATATTAT  CCAACAGCAG  1680
1681  CCTGCGCTGT  TGGATTCTGC  TAGCGTGGCA  GGTTCAAAGC  TTCTTTTCCC  ATCAAAATCT  1740
1741  TATGTGGCTA  TGATCAAGTT  TTTGTTGAGG  TGCTTTGAGG  CAGATATGAA  ACAGAATAAT  1800
1801  TTGGTGGAAG  GTGCCCATTT  TTCGGCTACA  GTTGAGAAAT  TATGCTTGCT  TCTTGAACAT  1860
1861  GCAATGGCTT  ATGAAGGTTC  TGTTGACCTG  CATGCTAATG  CCTCCAAAGC  GCTTATATCT  1920
1921  GTTGGATCTC  ATATGCCCGA  GGTGATAACT  TCTCGATATG  TTGATAAAGT  TGCATGGATG  1980
1981  AAGCAATTTC  TGGGGCATAT  TGACTTGGAT  ACACGTGAAT  CTATATCTCG  CTTAATTGGA  2040
2041  ATTGCTTCCT  GTTCACTTCC  TCTTCGCAGT  TTGTCTGATC  TTATTAGTGA  ATTGATTGCC  2100
2101  TCAATCAGTA  CAACACCTAA  GTTAAGGTTC  GAGATGCAGC  ATGGTGTGCT  ATGTACTTTA  2160
2161  GGCTATGTTA  CTGCAAATTG  CATGTCAAGA  ACTATTTCTA  TCCCAGAAGC  TTTACTCCAG  2220
2221  AGTACACTTA  AATGTCTGGT  CGATGTTGTC  AATTTAGAGA  CTGCCACATT  GGCTTCTTTT  2280
2281  GCAATGCAAG  CACTGGGCCA  TGTTGGACTT  TGTGTCCCAT  TGCCTCTCCT  GCTGGTAGAC  2340
2341  TCTAGTTCAG  TTCCCATATT  GGTTGTCTTG  CGTGAAAAGT  TAAGCAAGCT  GCTTGCTGGT  2400
2401  GAGGATGTGA  AAGCAGTGCA  GAAAATTGTT  ATTTCGTTGG  GACACTTGTG  TGTCAAGGAA  2460
2461  TTATCCTCTT  CACATCTAAA  TATTGCTCTT  GACCTGATTT  TCAGTCTAAG  CCAGTCAAAG  2520
2521  GTAGAAGATA  TCTTGTTTGG  TGCTGGGGAG  GCATTGTCAT  TTCTATGGGG  TGGTGTTCCT  2580
2581  GTTACTGCTG  ACATGATTCT  TAAGAGTAAC  TACACTTCAC  TTTCCATGAG  TTCGAACTTT  2640
2641  TTGATGGGAG  ATGTGTCTTC  TACAAGTTCT  ACCTGTGTGG  AATCTGAAGC  CAATGAAGAT  2700
2701  GGCCATGGTA  CAGTTAGAGA  TGCAATCACT  AGAAAGATTT  TTGATGATCT  ATTATACAGT  2760
2761  AGCCGGAAAC  AAGAGCGCTG  TGCTGGCACT  GTCTGGCTTT  TGTCGCTGAC  AATGTATTGT  2820
2821  GGTCAGCACC  AGGCTATCCA  GAAACTGCTT  CCTGACATCC  AGGAAGCATT  CTCTCACCTT  2880
2881  CTGGCTGAGC  AGAACGAGCT  TACACAGGAG  CTGGCATCTC  AGGGACTTAG  TGTTGTGTAT  2940
2941  GAGCTTGGTG  ATGCTTCTAT  GAAGAAAAGC  TTAGTGAATG  CTCTTGTTGG  CACTCTTACT  3000
3001  GGCTCTGGGA  AGAGGAAAAG  AGCTGTCAAG  CTTGTAGAAG  ATTCTGAAGT  GTTTCAAGAG  3060
3061  GGTACAATTG  GTGAAAGTCC  AAGTGGAGGG  AAACTAAGTA  CTTATAAGGA  GCTTTGCAAC  3120
3121  TTGGCAAACG  AGATGGGGCA  GCCGGACATG  ATTTATAAGT  TCATGGACTT  AGCCAATTAT  3180
3181  CAGGCATCTT  TGAATTCTAA  AAGAGGTGCA  GCCTTTGGAT  TCTCCAAGAT  AGCCAAGCAT  3240
3241  GCCGGGGATG  CTCTGCAGCC  TTACTTGCAT  GCTCTTGTTC  CAAGACTCCT  TCGTTATCAG  3300
3301  TACGATCCTG  ATAAGAATGT  GCTCTTGTTC  CAAGACTCCT  TCGTTATCAG  TACGATCCTG  3360
3361  ATAAGAATGT  GCAGGATGCG  ATGA  3384

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Nia-0547Nicotiana attenuata91.090.01911
LLPS-Orgl-1698Oryza glumaepatula77.643e-75 275
LLPS-Ors-0990Oryza sativa77.55e-99 341
LLPS-Lep-1585Leersia perrieri77.022e-74 272
LLPS-Orr-0211Oryza rufipogon75.06e-75 274
LLPS-Dac-1314Daucus carota73.060.0 948
LLPS-Viv-0025Vitis vinifera72.230.01545
LLPS-Prp-0682Prunus persica70.860.01521
LLPS-Thc-1390Theobroma cacao69.520.01470
LLPS-Hea-1340Helianthus annuus69.140.01528
LLPS-Coc-0542Corchorus capsularis68.90.01477
LLPS-Gor-0241Gossypium raimondii68.840.01477
LLPS-Via-1029Vigna angularis67.40.0 543
LLPS-Glm-0640Glycine max66.910.01441
LLPS-Mae-1432Manihot esculenta66.880.01015
LLPS-Met-0960Medicago truncatula66.490.01434
LLPS-Phv-0430Phaseolus vulgaris66.210.01429
LLPS-Vir-0265Vigna radiata65.990.0 904
LLPS-Pot-1849Populus trichocarpa65.640.01449
LLPS-Cus-1411Cucumis sativus65.480.01411
LLPS-Bro-0344Brassica oleracea64.060.01357
LLPS-Brn-1397Brassica napus63.880.01346
LLPS-Art-0298Arabidopsis thaliana63.730.01368
LLPS-Amt-0746Amborella trichopoda63.090.01328
LLPS-Mua-0325Musa acuminata61.660.0 700
LLPS-Hov-0871Hordeum vulgare60.673e-29 118
LLPS-Ori-0207Oryza indica60.557e-176 572
LLPS-Arl-0355Arabidopsis lyrata60.430.01330
LLPS-Sei-0825Setaria italica59.780.01284
LLPS-Sob-0806Sorghum bicolor59.520.01259
LLPS-Tra-0573Triticum aestivum59.510.01276
LLPS-Org-0436Oryza glaberrima59.140.01295
LLPS-Brd-0534Brachypodium distachyon58.890.01278
LLPS-Orp-0271Oryza punctata58.590.01272
LLPS-Orbr-0600Oryza brachyantha58.450.01261
LLPS-Php-1010Physcomitrella patens57.782e-111 388
LLPS-Zem-0330Zea mays57.230.01238
LLPS-Brr-0550Brassica rapa56.960.01140
LLPS-Orm-0885Oryza meridionalis56.590.0 973
LLPS-Tru-1559Triticum urartu56.230.01205
LLPS-Orni-0243Oryza nivara50.590.0 645
LLPS-Meg-1145Meleagris gallopavo49.077e-39 162
LLPS-Cii-0675Ciona intestinalis47.751e-45 169
LLPS-Cis-1153Ciona savignyi47.621e-43 177
LLPS-Ran-0111Rattus norvegicus46.882e-44 181
LLPS-Sem-0632Selaginella moellendorffii46.430.0 962
LLPS-Orb-1109Oryza barthii45.793e-169 546
LLPS-Cae-1015Caenorhabditis elegans41.945e-39 162
LLPS-Drm-0428Drosophila melanogaster40.01e-41 171
LLPS-Yal-0013Yarrowia lipolytica38.81e-30 135
LLPS-Phn-0535Phaeosphaeria nodorum38.345e-28 127
LLPS-Lem-1207Leptosphaeria maculans38.31e-26 122
LLPS-Gag-0857Gaeumannomyces graminis38.123e-27 124
LLPS-Nec-0962Neurospora crassa37.573e-28 128
LLPS-Chr-0691Chlamydomonas reinhardtii36.954e-49 196
LLPS-Asg-0131Ashbya gossypii36.321e-30 135
LLPS-Fuo-0290Fusarium oxysporum35.275e-29 130
LLPS-Coo-0262Colletotrichum orbiculare34.838e-27 123
LLPS-Sac-0939Saccharomyces cerevisiae34.696e-26 120
LLPS-Asfu-0323Aspergillus fumigatus33.491e-26 122
LLPS-Nef-0840Neosartorya fischeri33.024e-26 121
LLPS-Fus-0434Fusarium solani31.852e-31 138
LLPS-Scj-0777Schizosaccharomyces japonicus31.686e-24 114
LLPS-Blg-0270Blumeria graminis31.651e-28 129
LLPS-Cogr-0483Colletotrichum graminicola31.471e-29 132
LLPS-Ast-0502Aspergillus terreus30.914e-29 130
LLPS-Osl-0299Ostreococcus lucimarinus30.647e-150 499
LLPS-Fuv-0288Fusarium verticillioides30.492e-30 134
LLPS-Pytr-1136Pyrenophora triticirepentis30.484e-27 124
LLPS-Mao-0221Magnaporthe oryzae29.414e-27 124
LLPS-Trr-1384Trichoderma reesei29.144e-26 120
LLPS-Beb-0778Beauveria bassiana28.784e-32 140
LLPS-Chc-0608Chondrus crispus28.574e-28 127
LLPS-Scc-0288Schizosaccharomyces cryophilus28.572e-20 102
LLPS-Trv-0344Trichoderma virens28.534e-27 124
LLPS-Ved-0211Verticillium dahliae27.997e-23 110
LLPS-Scf-1244Scleropages formosus27.724e-109 381
LLPS-Pyt-0980Pyrenophora teres27.673e-27 124
LLPS-Dio-0014Dipodomys ordii27.667e-46 179
LLPS-Dar-1803Danio rerio27.521e-104 368
LLPS-Orl-0921Oryzias latipes27.51e-97 347
LLPS-Lac-1253Latimeria chalumnae27.431e-116 403
LLPS-Leo-0655Lepisosteus oculatus27.391e-107 377
LLPS-Asm-3052Astyanax mexicanus27.227e-102 359
LLPS-Orn-1491Oreochromis niloticus27.187e-101 357
LLPS-Icp-1847Ictalurus punctatus27.121e-97 347
LLPS-Nol-2959Nomascus leucogenys27.091e-103 365
LLPS-Pof-1371Poecilia formosa27.064e-103 363
LLPS-Rhb-1510Rhinopithecus bieti27.022e-102 362
LLPS-Pap-0439Pan paniscus27.02e-102 362
LLPS-Pat-0539Pan troglodytes27.06e-102 360
LLPS-Gog-0880Gorilla gorilla27.05e-102 361
LLPS-Aon-0403Aotus nancymaae26.971e-101 360
LLPS-Mam-1189Macaca mulatta26.933e-103 364
LLPS-Poa-1558Pongo abelii26.932e-102 361
LLPS-Otg-0193Otolemur garnettii26.931e-102 362
LLPS-Mal-2286Mandrillus leucophaeus26.933e-103 364
LLPS-Cea-0024Cercocebus atys26.932e-103 365
LLPS-Chs-0875Chlorocebus sabaeus26.931e-102 362
LLPS-Maf-0839Macaca fascicularis26.934e-103 364
LLPS-Ova-1516Ovis aries26.96e-102 360
LLPS-Scm-0876Scophthalmus maximus26.895e-106 372
LLPS-Caj-0439Callithrix jacchus26.892e-101 358
LLPS-Gaa-2735Gasterosteus aculeatus26.873e-102 360
LLPS-Hos-1060Homo sapiens26.862e-102 362
LLPS-Paa-2083Papio anubis26.845e-103 364
LLPS-Eqc-1487Equus caballus26.832e-102 361
LLPS-Anc-2255Anolis carolinensis26.819e-104 365
LLPS-Cap-2400Cavia porcellus26.815e-102 360
LLPS-Bot-1626Bos taurus26.812e-99 353
LLPS-Caf-0184Canis familiaris26.759e-103 362
LLPS-Aim-1152Ailuropoda melanoleuca26.751e-102 362
LLPS-Fud-1724Fukomys damarensis26.759e-103 362
LLPS-Ict-0016Ictidomys tridecemlineatus26.736e-103 363
LLPS-Orc-0494Oryctolagus cuniculus26.732e-100 355
LLPS-Fec-0705Felis catus26.683e-102 361
LLPS-Sus-0674Sus scrofa26.684e-102 360
LLPS-Loa-0454Loxodonta africana26.644e-102 360
LLPS-Man-2746Macaca nemestrina26.626e-92 330
LLPS-Mup-2849Mustela putorius furo26.627e-102 360
LLPS-Myl-0975Myotis lucifugus26.573e-101 358
LLPS-Xet-0396Xenopus tropicalis26.489e-100 353
LLPS-Mum-0576Mus musculus26.472e-100 355
LLPS-Gaga-0930Gallus gallus26.284e-100 355
LLPS-Sah-2455Sarcophilus harrisii26.281e-101 359
LLPS-Tag-0416Taeniopygia guttata26.266e-96 342
LLPS-Anp-1603Anas platyrhynchos26.265e-99 351
LLPS-Fia-2667Ficedula albicollis25.939e-94 335
LLPS-Mea-2011Mesocricetus auratus25.861e-85 310
LLPS-Mod-1428Monodelphis domestica25.761e-95 341
LLPS-Scp-0969Schizosaccharomyces pombe25.748e-1687.4
LLPS-Abg-0161Absidia glauca25.524e-104 366
LLPS-Xim-0065Xiphophorus maculatus25.163e-1789.7
LLPS-Ten-0122Tetraodon nigroviridis24.715e-84 306
LLPS-Dos-0393Dothistroma septosporum24.635e-47 188
LLPS-Tum-0336Tuber melanosporum24.452e-50 200
LLPS-Asni-1061Aspergillus niger23.961e-41 172
LLPS-Zyt-0218Zymoseptoria tritici23.793e-46 186
LLPS-Aso-0885Aspergillus oryzae23.758e-45 181
LLPS-Tar-2142Takifugu rubripes23.76e-50 196
LLPS-Asf-0479Aspergillus flavus23.583e-45 183
LLPS-Asn-0091Aspergillus nidulans23.428e-47 188
LLPS-Asc-0152Aspergillus clavatus23.172e-41 171