• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Sol-0318

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Ensembl Gene: Solyc01g106220.3
Ensembl Protein: Solyc01g106220.3.1
Organism: Solanum lycopersicum
Taxa ID: 4081
LLPS Type: Others


▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblSolyc01g106220.3.1Solyc01g106220.3.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MFVEGLEDVG  WVKGNFVNGI  MSMETVGSEQ  SREKMKKDKK  KRKAETEGPD  TPSTSHISSN  60
61    PMEKKKQKRA  VDKERRRVET  EKKTEAQQVV  VSSELKSNKS  AVISPTTSGL  PEFHIAVFKD  120
121   LAAADASIRE  AAANSLVAEL  IEVQKAYDIL  ENKEVVEGQL  KLEAEKDDGL  NNCAPSLRYA  180
181   VRRLIRGISS  SRECARQGFA  LGMTVLVGAV  PCIKVDALLK  LIVELLEISS  SMKGQDMKDC  240
241   LLGRLFAYGS  IARSGRLTLE  WTADKNTPYI  KEFVGSLVWL  AKKKLYLQEP  AVSIILELVD  300
301   KLPVEVSLNH  VLEAPGLKEW  FESATEVGNP  DALLLALAIR  EKTGVDNKDF  GKLLPFPYSP  360
361   SRLFSVEHLS  LLSNCLKESH  FCLPRTHSVW  YSLVNILLPE  NVQQDFDPSA  ALNSTRKHKK  420
421   GRKGSSAEED  IEKNLKNFCE  VIIEGSLLPS  SHNCKNLAFN  VLLLLLPKLP  TSCIYNVLSY  480
481   KVVQCLKDIL  SAKDTNLFKA  SQYFLREFSE  WVKHDDVRRV  AVIMALQKHS  NGKFDCFTRS  540
541   KTVKELMAEF  KTESGCMLLI  QNLVDMFLDE  ARASEETSDQ  SQTTDDNSEI  GSLEDKDSVG  600
601   TVGTPDFLKG  WVVESLPNSL  KHLSLDTNAR  FRVQREILKF  LAVQGLFSST  LGTEVTSFEL  660
661   EEKFRWPKSA  ISSALCRMCI  EQLQLLLSNA  QKGEGPQVVP  SGLEANDLGA  YFMRFLTTLR  720
721   NIPSVSLFRS  LGDDDEKAIK  KLQAMESQLS  RQERSLGPGI  AKNKLHSMRY  LLIQLLLQVL  780
781   LRPQEFSEAA  SELVICCTKA  FRSSDLLASS  GDDEAEGDDS  PEFMDVLVDT  MLSLLPQSSA  840
841   PMRTAIEQVF  KCFCEDVTDD  GLHRMLRVIK  KDLKPARHQE  TDSENEDDDD  DDVLDIEEAE  900
901   ESDEAEMDET  AERHAHVDDS  ETVVGVEGVT  SELPVASDDD  SDEGLDDDAM  FRLDTHLAKM  960
961   YNAKKNQAGS  ETAHSQLALF  KLRVLSLLEI  YLHENPEKPK  VVKIFSSLAH  AFVNPHTTEG  1020
1021  NEQLGQRIWG  ILQKKIFKAK  DYPKGEVIEF  PVLKSLLERN  LVLAAKHFKK  KKSASSLSKK  1080
1081  KLSAALNRFK  MINSLAQSSI  FWILKIIDTK  KRPKSELEEV  SCIFREKLEG  YLDSKSTRMK  1140
1141  CEFLKEVFKR  RPRIGYPLFG  FLLEKCASAK  LQFRQIEALE  LVIEMLKSFV  SSNPDDNSHF  1200
1201  AELGSHLAKS  GCLVNVLLKN  MPDKASRRAD  VRKFFGKVIQ  VLTDVELRAL  FLKALEPDCE  1260
1261  AQLKGMFPVL  NQ  1272
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGTTTGTAG  AGGGTTTGGA  AGATGTTGGT  TGGGTTAAGG  GAAATTTTGT  TAATGGAATT  60
61    ATGAGCATGG  AGACGGTTGG  GTCTGAGCAA  TCAAGAGAGA  AAATGAAGAA  AGACAAGAAA  120
121   AAAAGGAAGG  CTGAAACAGA  GGGACCTGAT  ACCCCATCAA  CCTCTCACAT  TTCTAGCAAT  180
181   CCTATGGAGA  AGAAGAAGCA  AAAAAGAGCT  GTAGACAAAG  AGAGGCGCAG  GGTGGAGACC  240
241   GAGAAAAAAA  CCGAAGCCCA  GCAAGTAGTG  GTGTCCTCTG  AATTGAAAAG  TAATAAGAGC  300
301   GCGGTGATTT  CTCCCACTAC  TAGTGGATTG  CCTGAGTTCC  ACATTGCTGT  ATTTAAGGAC  360
361   CTTGCAGCTG  CCGATGCTTC  TATTAGAGAA  GCAGCTGCTA  ATTCTTTAGT  TGCTGAGTTG  420
421   ATTGAAGTTC  AGAAGGCTTA  TGATATTCTA  GAGAACAAGG  AAGTGGTTGA  GGGACAGCTC  480
481   AAATTGGAAG  CTGAAAAGGA  TGATGGGTTG  AACAACTGTG  CCCCTTCGTT  GAGATATGCA  540
541   GTTCGGAGGC  TAATTCGGGG  CATTTCTTCA  TCAAGAGAGT  GTGCAAGGCA  AGGGTTTGCA  600
601   TTAGGCATGA  CAGTGTTGGT  TGGTGCTGTT  CCATGCATAA  AAGTGGATGC  CCTGTTGAAG  660
661   CTTATTGTTG  AATTATTGGA  GATCTCTTCT  TCCATGAAGG  GTCAGGACAT  GAAAGATTGC  720
721   CTATTGGGAC  GCTTATTTGC  TTACGGATCT  ATTGCAAGAT  CAGGGAGATT  AACTTTGGAG  780
781   TGGACTGCTG  ATAAGAACAC  TCCTTATATT  AAAGAATTTG  TTGGTTCTCT  TGTCTGGCTG  840
841   GCAAAAAAGA  AGCTCTACTT  ACAAGAGCCT  GCTGTCTCAA  TTATTTTGGA  ATTGGTTGAC  900
901   AAGTTACCTG  TTGAAGTTTC  ATTGAACCAT  GTTCTTGAAG  CTCCTGGGCT  TAAAGAGTGG  960
961   TTTGAAAGTG  CAACGGAAGT  TGGAAATCCT  GATGCTTTGC  TTCTTGCCCT  TGCCATACGT  1020
1021  GAAAAAACTG  GTGTTGATAA  CAAAGATTTT  GGCAAGCTTC  TGCCTTTTCC  TTATAGCCCC  1080
1081  AGCCGGCTTT  TCAGTGTGGA  ACATTTGTCC  TTGCTTTCCA  ATTGCTTGAA  GGAATCCCAC  1140
1141  TTCTGCTTGC  CACGAACTCA  TAGTGTATGG  TATTCCTTGG  TAAATATTCT  TTTACCTGAA  1200
1201  AATGTTCAAC  AAGATTTTGA  TCCCTCAGCA  GCTTTAAATT  CCACAAGGAA  GCACAAAAAA  1260
1261  GGCCGCAAGG  GTAGCTCAGC  TGAAGAAGAT  ATTGAGAAAA  ATCTTAAAAA  CTTTTGTGAA  1320
1321  GTTATCATTG  AAGGATCACT  TCTTCCATCA  TCTCATAATT  GCAAGAATTT  GGCGTTCAAT  1380
1381  GTTTTGCTGC  TTCTCCTTCC  AAAATTGCCC  ACATCGTGCA  TCTACAACGT  CCTGTCTTAC  1440
1441  AAAGTTGTCC  AGTGCTTAAA  GGACATACTT  TCTGCGAAAG  ACACTAATCT  ATTCAAAGCC  1500
1501  AGTCAATACT  TTTTAAGAGA  ATTTTCTGAG  TGGGTCAAGC  ATGATGATGT  TAGAAGAGTG  1560
1561  GCAGTTATTA  TGGCTTTACA  GAAACATAGT  AATGGGAAGT  TTGATTGCTT  CACCAGGTCA  1620
1621  AAAACAGTTA  AAGAGTTGAT  GGCTGAGTTT  AAAACTGAGT  CTGGATGCAT  GCTTCTCATT  1680
1681  CAGAACTTAG  TTGACATGTT  CCTGGATGAA  GCTCGTGCTT  CAGAGGAGAC  TTCAGATCAG  1740
1741  AGTCAAACTA  CAGATGACAA  CTCAGAAATT  GGTTCCTTAG  AAGATAAGGA  TTCTGTTGGA  1800
1801  ACAGTAGGAA  CGCCCGATTT  TTTGAAAGGA  TGGGTTGTAG  AGTCACTTCC  AAATAGCTTG  1860
1861  AAGCATTTAT  CTCTGGATAC  AAATGCAAGG  TTCAGGGTCC  AAAGAGAAAT  TCTAAAATTT  1920
1921  TTGGCAGTGC  AGGGTCTATT  TTCTTCGACA  CTTGGAACTG  AGGTGACATC  TTTTGAATTG  1980
1981  GAAGAAAAAT  TTAGGTGGCC  AAAGTCTGCC  ATTTCAAGTG  CTCTTTGTAG  GATGTGCATT  2040
2041  GAGCAGCTGC  AGTTACTGCT  ATCCAATGCT  CAAAAAGGCG  AAGGACCTCA  AGTTGTGCCT  2100
2101  AGTGGTCTTG  AAGCTAATGA  TCTTGGAGCT  TATTTCATGA  GATTTCTTAC  CACATTGCGA  2160
2161  AACATTCCTT  CTGTTTCGCT  GTTTAGATCC  TTGGGCGACG  ATGATGAAAA  AGCTATCAAG  2220
2221  AAATTGCAGG  CTATGGAGTC  TCAGCTCTCA  AGACAGGAGA  GAAGCTTGGG  TCCAGGTATT  2280
2281  GCCAAAAATA  AGTTACATTC  CATGAGGTAC  CTTCTGATAC  AATTGTTGCT  TCAAGTCCTA  2340
2341  CTTCGCCCTC  AAGAATTTTC  TGAAGCCGCC  TCTGAATTGG  TTATTTGCTG  TACCAAAGCT  2400
2401  TTTCGATCTT  CTGATCTTCT  TGCTTCCTCT  GGAGATGATG  AAGCAGAGGG  AGATGATAGT  2460
2461  CCTGAATTCA  TGGATGTTCT  AGTGGACACT  ATGCTTTCGT  TGCTGCCACA  ATCATCAGCA  2520
2521  CCGATGCGGA  CAGCTATTGA  GCAGGTTTTC  AAATGTTTTT  GTGAAGATGT  TACGGATGAT  2580
2581  GGGTTACATC  GAATGTTGCG  GGTTATAAAG  AAAGATCTCA  AACCAGCCAG  ACACCAAGAA  2640
2641  ACTGACAGTG  AGAATGAAGA  TGACGATGAT  GACGACGTTC  TTGACATTGA  AGAGGCTGAG  2700
2701  GAATCTGATG  AAGCAGAGAT  GGATGAAACT  GCGGAGAGGC  ATGCACATGT  GGATGACTCA  2760
2761  GAGACAGTAG  TTGGTGTTGA  GGGTGTTACC  TCAGAACTTC  CTGTAGCTTC  TGATGATGAT  2820
2821  TCTGATGAGG  GATTAGATGA  TGATGCAATG  TTCCGCCTGG  ACACACATCT  TGCTAAAATG  2880
2881  TACAACGCTA  AGAAGAACCA  GGCTGGTAGT  GAAACTGCTC  ATTCACAGCT  TGCCCTCTTC  2940
2941  AAACTTCGTG  TCCTCTCGTT  GCTGGAGATT  TACCTACACG  AAAATCCAGA  GAAGCCAAAA  3000
3001  GTAGTGAAAA  TATTCTCAAG  CCTAGCTCAT  GCATTTGTAA  ACCCTCACAC  TACGGAAGGT  3060
3061  AACGAACAAC  TTGGCCAGCG  AATTTGGGGA  ATTTTACAGA  AGAAAATCTT  CAAGGCAAAG  3120
3121  GACTATCCAA  AAGGTGAAGT  CATCGAATTC  CCAGTTCTTA  AGTCTCTCTT  GGAAAGGAAC  3180
3181  TTGGTACTGG  CAGCAAAACA  TTTCAAGAAA  AAGAAATCTG  CCTCTAGTTT  GTCAAAGAAA  3240
3241  AAGCTGTCTG  CTGCCTTGAA  TAGATTCAAA  ATGATCAATT  CTCTTGCCCA  GAGTTCAATA  3300
3301  TTTTGGATTT  TGAAGATTAT  TGATACGAAA  AAACGTCCAA  AATCTGAACT  TGAGGAGGTT  3360
3361  TCTTGTATAT  TCAGAGAAAA  ACTGGAGGGT  TACTTAGATA  GTAAAAGTAC  TCGAATGAAG  3420
3421  TGCGAGTTTC  TAAAAGAAGT  CTTTAAAAGG  CGACCACGGA  TTGGATATCC  TCTATTTGGG  3480
3481  TTCCTTTTGG  AGAAATGTGC  TAGTGCAAAG  CTACAGTTTC  GTCAAATTGA  AGCTCTTGAA  3540
3541  CTGGTCATCG  AGATGTTAAA  ATCGTTTGTT  TCTTCAAACC  CTGATGACAA  CAGCCATTTT  3600
3601  GCCGAGTTAG  GCAGCCATCT  TGCCAAGTCA  GGGTGTCTTG  TTAATGTGTT  GTTGAAAAAT  3660
3661  ATGCCGGATA  AGGCATCACG  ACGAGCTGAT  GTTCGTAAGT  TTTTTGGAAA  AGTGATTCAG  3720
3721  GTCTTAACAG  ATGTTGAACT  GAGGGCCTTG  TTTCTTAAGG  CTCTGGAACC  TGATTGTGAA  3780
3781  GCTCAACTGA  AGGGCATGTT  TCCTGTTTTA  AATCAGTGA  3819

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Sot-0308Solanum tuberosum94.470.02046
LLPS-Nia-1286Nicotiana attenuata79.480.01712
LLPS-Viv-0249Vitis vinifera69.630.01073
LLPS-Dac-0934Daucus carota68.880.0 998
LLPS-Glm-1608Glycine max67.920.01000
LLPS-Gor-1110Gossypium raimondii67.680.01045
LLPS-Via-1532Vigna angularis67.270.0 966
LLPS-Hea-0456Helianthus annuus66.910.0 999
LLPS-Mae-1512Manihot esculenta66.870.01037
LLPS-Pot-0280Populus trichocarpa66.710.0 989
LLPS-Coc-1535Corchorus capsularis66.510.01040
LLPS-Prp-0874Prunus persica66.350.01030
LLPS-Thc-0407Theobroma cacao66.070.01034
LLPS-Cus-1786Cucumis sativus64.730.01016
LLPS-Phv-0283Phaseolus vulgaris64.180.0 994
LLPS-Met-0578Medicago truncatula63.690.0 988
LLPS-Arl-0823Arabidopsis lyrata61.860.0 890
LLPS-Art-0573Arabidopsis thaliana61.470.0 880
LLPS-Brr-0419Brassica rapa60.790.0 884
LLPS-Vir-2009Vigna radiata60.754e-141 454
LLPS-Brn-0096Brassica napus59.490.0 882
LLPS-Bro-1233Brassica oleracea58.690.0 881
LLPS-Mua-0212Musa acuminata55.690.0 798
LLPS-Brd-1730Brachypodium distachyon51.870.0 707
LLPS-Sob-0073Sorghum bicolor51.540.0 712
LLPS-Tra-2990Triticum aestivum51.240.0 688
LLPS-Zem-0351Zea mays51.170.0 701
LLPS-Hov-1650Hordeum vulgare50.930.0 681
LLPS-Amt-1106Amborella trichopoda50.640.0 741
LLPS-Ors-1611Oryza sativa50.490.0 696
LLPS-Org-1828Oryza glaberrima50.490.0 698
LLPS-Orb-1859Oryza barthii50.240.0 691
LLPS-Orm-1757Oryza meridionalis50.120.0 685
LLPS-Ori-0819Oryza indica50.120.0 686
LLPS-Orgl-1160Oryza glumaepatula50.120.0 686
LLPS-Sei-1432Setaria italica50.060.0 688
LLPS-Orni-1540Oryza nivara50.00.0 689
LLPS-Orbr-0463Oryza brachyantha49.710.0 704
LLPS-Orp-1834Oryza punctata49.690.0 687
LLPS-Tru-0612Triticum urartu48.852e-142 466
LLPS-Orr-1660Oryza rufipogon47.680.0 653
LLPS-Php-1364Physcomitrella patens37.79e-117 403
LLPS-Sem-0027Selaginella moellendorffii33.913e-90 322
LLPS-Miv-0686Microbotryum violaceum30.165e-1068.6
LLPS-Yal-0697Yarrowia lipolytica30.083e-0965.9
LLPS-Scc-0589Schizosaccharomyces cryophilus29.925e-1068.6
LLPS-Cii-0509Ciona intestinalis29.553e-0862.8
LLPS-Sus-2081Sus scrofa29.351e-0657.8
LLPS-Ova-1837Ovis aries28.862e-0760.5
LLPS-Mel-1302Melampsora laricipopulina28.817e-0758.2
LLPS-Bot-0058Bos taurus28.363e-0759.3
LLPS-Pug-0927Puccinia graminis27.464e-0965.9
LLPS-Crn-0581Cryptococcus neoformans27.178e-1997.1
LLPS-Mup-0179Mustela putorius furo26.577e-0655.1
LLPS-Abg-0097Absidia glauca25.592e-22 108
LLPS-Osl-0553Ostreococcus lucimarinus25.031e-30 135
LLPS-Scp-0635Schizosaccharomyces pombe25.02e-1483.2
LLPS-Scj-0195Schizosaccharomyces japonicus24.883e-1275.9
LLPS-Chr-1304Chlamydomonas reinhardtii24.563e-1792.0
LLPS-Asg-0597Ashbya gossypii23.743e-0759.3
LLPS-Aim-2672Ailuropoda melanoleuca22.752e-0760.5
LLPS-Caf-1984Canis familiaris22.675e-1068.6
LLPS-Usm-0821Ustilago maydis22.311e-1277.0