LLPS-Ran-a670
Lrsam1

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: Leucine-rich repeat and sterile alpha motif-containing 1
Gene Name: Lrsam1
Ensembl Gene: ENSRNOG00000022312.6
Ensembl Protein: ENSRNOP00000056931.4
Organism: Rattus norvegicus
Taxa ID: 10116
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Postsynaptic densityPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblENSRNOT00000060186.4ENSRNOP00000056931.4
UniProtD3ZI42, D3ZI42_RAT
GeneBankAABR07051452, AABR07072855
Entrez311866

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MPLFFRKRKP  SEEARKRLEY  QMCLAKEAGA  DDILDISKCE  LSEIPFGAFA  TCKVLQKKVR  60
61    WIRAHHLGAC  FLPTACLIYS  VSSRQVLDLH  DNQLTALPDD  IGQLTALQVL  NVERNQLTHL  120
121   PRSVGNLLQL  QTLNVKDNKL  KELPDTLGEL  RSLRTLDISE  NEIQRLPQML  AHVRTLETLS  180
181   LDALSMVYPP  PEVCGAGTAA  VQQFLCKESG  LDYYPPSQYL  LPVLEQDGAE  NSQDSPDGPT  240
241   RRFSREEAEW  QNRFSDYEKR  KEQKMLEKLE  FERRLDLGQR  EHAELLQQSH  SHKDEILQTV  300
301   KQEQTRLEQG  LSERQRCLDA  ERQQLQEQLK  QSEQSIASRI  QRLLQDNQRQ  KKSSEILKSL  360
361   ENERIRMEQL  MSITQEETEN  LRQREIAAAM  QQMLTESCKS  RLIQMAYESQ  RQSLVQQACS  420
421   SMAEMDKRFQ  QILSWQQMDQ  NKAISQILQE  SVMQKAAFEA  LQVKKDLTHR  QIRSQIRLIE  480
481   TELLQLTQLE  LKRKSLDTET  LQEMVSEQRW  ALSNLLQQLL  KEKKQREEEL  HGILAELEAK  540
541   SETKQENYWL  IQYQRLLNQK  PLSLKLQEEG  MERQLVALLV  ELSAEHYLPL  FAHHRITLDM  600
601   LSRMGPGDLA  KVGVSEAGLQ  HEILRRARDL  LDVARVQPEL  KPPKNEVFGV  SEPPTAPQEL  660
661   PESVRPSAPP  AELDVPTSEC  VVCLEREAQM  VFLTCGHVCC  CQQCCQPLRT  CPLCRQEISQ  720
721   RLRIYHSS  728
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGCCTCTCT  TCTTTCGGAA  GCGGAAACCC  AGTGAGGAAG  CTCGGAAACG  CCTGGAGTAC  60
61    CAGATGTGTC  TGGCAAAAGA  AGCTGGGGCA  GATGACATCC  TTGACATCTC  TAAGTGCGAG  120
121   CTTTCCGAGA  TTCCATTTGG  GGCTTTTGCA  ACGTGCAAAG  TTCTACAGAA  AAAGGTGAGC  180
181   AGAGTCATTG  CTCAGAACTC  ACTTGCTGAA  TTCCCAGCAG  AGGCGAGCAG  ATCTCAAGTT  240
241   CAAGCAGTCA  GAGTTCTGGA  TCTCCATGAC  AACCAGCTGA  CAGCCCTTCC  TGACGATATT  300
301   GGGCAGCTGA  CAGCCCTGCA  GGTATTGAAT  GTAGAAAGGA  ATCAACTGAC  ACACCTCCCA  360
361   CGCTCTGTTG  GGAACCTGCT  GCAGCTCCAG  ACCCTCAACG  TAAAAGACAA  CAAGCTAAAG  420
421   GAGCTTCCGG  ACACCCTGGG  GGAGCTGCGG  AGCCTGCGTA  CCCTCGACAT  CAGTGAAAAT  480
481   GAGATCCAGA  GACTTCCCCA  GATGCTGGCT  CATGTGCGGA  CCCTGGAGAC  GCTGAGCCTC  540
541   GATGCCTTGT  CAATGGTCTA  CCCCCCACCA  GAGGTGTGTG  GCGCTGGCAC  TGCGGCCGTG  600
601   CAGCAGTTCC  TCTGCAAAGA  GTCAGGCCTG  GACTATTACC  CACCTTCTCA  GTACCTGCTG  660
661   CCAGTCCTGG  AGCAAGATGG  AGCCGAGAAC  TCCCAGGACA  GCCCTGATGG  ACCCACACGC  720
721   AGATTCTCCA  GGGAGGAGGC  TGAATGGCAG  AATCGGTTCT  CCGACTACGA  GAAGCGAAAG  780
781   GAGCAGAAGA  TGCTGGAGAA  GCTGGAGTTC  GAGCGGCGCC  TGGACCTCGG  GCAGCGGGAG  840
841   CATGCTGAGC  TGCTCCAGCA  GAGCCACAGC  CACAAGGACG  AGATCCTGCA  GACGGTCAAG  900
901   CAGGAGCAGA  CACGGCTCGA  GCAGGGCCTG  AGTGAGCGCC  AGCGCTGCCT  GGATGCAGAA  960
961   CGGCAGCAGC  TGCAGGAGCA  GCTCAAGCAG  TCGGAGCAGA  GCATTGCCAG  CCGCATCCAG  1020
1021  AGACTCCTGC  AGGACAATCA  GAGGCAAAAG  AAGAGTTCTG  AGATTCTGAA  ATCACTGGAG  1080
1081  AATGAGAGAA  TACGAATGGA  GCAGCTGATG  TCCATTACCC  AGGAGGAGAC  CGAGAACCTC  1140
1141  AGGCAGCGTG  AGATCGCCGC  CGCCATGCAG  CAGATGCTGA  CCGAGAGCTG  TAAGAGCCGG  1200
1201  CTCATCCAGA  TGGCCTATGA  GTCCCAGAGG  CAGAGCCTGG  TGCAGCAGGC  CTGTTCCAGC  1260
1261  ATGGCTGAAA  TGGACAAGCG  GTTCCAGCAG  ATTCTGTCAT  GGCAGCAGAT  GGACCAGAAC  1320
1321  AAAGCCATCA  GCCAGATCCT  TCAGGAGAGT  GTGATGCAGA  AGGCTGCATT  CGAGGCTCTC  1380
1381  CAGGTAAAGA  AAGACCTCAC  GCATCGGCAG  ATCAGGAGCC  AGATTAGGCT  AATAGAAACT  1440
1441  GAGTTACTGC  AGCTGACACA  GCTGGAGTTA  AAGAGGAAGT  CCCTGGACAC  AGAGACGCTT  1500
1501  CAGGAGATGG  TCTCAGAGCA  GCGCTGGGCG  CTCAGCAACC  TGCTCCAGCA  GCTCCTCAAA  1560
1561  GAGAAGAAGC  AGCGGGAAGA  GGAGCTCCAT  GGCATCCTGG  CGGAATTAGA  GGCCAAGAGT  1620
1621  GAAACGAAGC  AGGAAAATTA  CTGGCTCATC  CAGTACCAAC  GGCTTTTGAA  CCAGAAGCCT  1680
1681  TTGTCCTTGA  AGCTGCAGGA  AGAAGGCATG  GAGCGGCAGC  TGGTGGCCCT  GCTGGTGGAG  1740
1741  CTGTCTGCTG  AGCACTACCT  GCCCCTCTTC  GCCCACCACC  GCATCACACT  GGACATGCTG  1800
1801  AGCCGGATGG  GTCCTGGAGA  TCTGGCTAAG  GTGGGTGTCT  CAGAAGCAGG  CCTGCAACAT  1860
1861  GAAATCCTGC  GAAGAGCCCG  GGACCTGCTG  GATGTGGCCA  GGGTCCAACC  AGAGTTGAAA  1920
1921  CCACCCAAGA  ATGAGGTCTT  TGGTGTCTCT  GAGCCCCCCA  CAGCCCCTCA  GGAGCTTCCT  1980
1981  GAGTCCGTGA  GACCATCTGC  CCCGCCAGCT  GAACTGGACG  TGCCGACCTC  AGAGTGTGTT  2040
2041  GTGTGCCTGG  AACGTGAGGC  CCAGATGGTC  TTCCTCACCT  GCGGCCATGT  CTGCTGCTGC  2100
2101  CAGCAGTGCT  GCCAGCCGCT  GCGCACCTGC  CCACTGTGCC  GCCAGGAGAT  CTCCCAGCGC  2160
2161  CTCCGGATCT  ACCACAGCAG  CTGA  2184

▼ ANNOTATION


Disorder
IUPred2A
Domain
CDDGene3D
Interaction
RAINIIDMIST
Physicochemical
Compute pI/MwAAindex
Localization
COMPARTMENTS

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Hos-a685Homo sapiens0.01215undefined
LLPS-Mum-a679Mus musculus0.01321undefined