LLPS-Ran-a048
Slc4a7

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: Sodium bicarbonate cotransporter 3; Electroneutral sodium bicarbonate cotransporter 1; NBC-like protein; Solute carrier family 4 member 7
Gene Name: Slc4a7, Nbc, Nbc2, Nbc3, Nbcn1
Ensembl Gene: ENSRNOG00000005957.7
Ensembl Protein: ENSRNOP00000063542.3
Organism: Rattus norvegicus
Taxa ID: 10116
LLPS Type: Client


▼ PROPERTY



▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Postsynaptic densityPredicted from orthologs(View)

▼ FUNCTION


Electroneutral sodium- and bicarbonate-dependent cotransporter with a Na(+):HCO3(-) 1:1 stoichiometry. Regulates intracellular pH and may play a role in bicarbonate salvage in secretory epithelia. May also have an associated sodium channel activity.

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MEADGAGEQM  RPLLTRGPDE  EAVVDLGKTS  STVNTKFEKE  ELESHRAVYV  GVHVPFSKES  60
61    RRRHRHRGHK  HHHRRRKDKD  SDKEDGRESP  SYDTPSQRVQ  FILGTEDDDE  EHIPHDLFTE  120
121   MDELCYRDGE  EYEWKETARW  LKFEEDVEDG  GDRWSKPYVA  TLSLHSLFEL  RSCILNGTVM  180
181   LDMRASTLDE  IADMVLDNMI  ASGQLDDSIR  ENVREALLKR  HHHQNEKRFT  SRIPLVRSFA  240
241   DIGKKHSDPH  LLERNGEGLS  ASRHSLRTGL  SASNLSLRGE  SPLSLLLSHL  LPSSRAGTPA  300
301   GSRCTTPVPT  PQNSPPSSPS  LSRLTSRSSQ  QTQPQAPEVL  VSPDRDDIPR  VVIHPPEEDI  360
361   EALKGQEQKN  EENTDFTPGI  LASPQSAPGN  LDSSKSGEVK  GNGSGGSREN  STVDFSKVDM  420
421   NFMRKIPTGA  EASNVLVGEV  DFLERPIIAF  VRLAPAVLLS  GLTEVPVPTR  FLFLLLGPAG  480
481   KAPQYHEIGR  SIATLMTDEI  FHDVAYKAKD  RNDLLSGIDE  FLDQVTVLPP  GEWDPSIRIE  540
541   PPKSVPSQEK  RKIPAFPNGS  APVSADPPKE  ADHHAGPELQ  RTGRLFGGLI  LDIKRKAPFF  600
601   LSDFKDALSL  QCLASILFLY  CACMSPVITF  GGLLGEATEG  RISAIESLFG  ASLTGIAYSL  660
661   FAGQPLTILG  STGPVLVFEK  ILFKFCRDYH  LSYLSLRTSI  GLWTSFLCIV  LVATDASSLV  720
721   CYITRFTEEA  FAALICIIFI  YEALEKLFHL  GEIYAFNMHN  NLDALTSYTC  VCAEPSNPSN  780
781   ETVELWERKN  VTAASISWAN  LTVSECKTFH  GMFVGSACGP  HGPYVPDVLF  WCVVLFFTTF  840
841   FLSSFLKQFK  TKRYFPTKVR  STISDFAVFL  TIVIMVAIDY  LVGIPSPKLH  VPEKFEPTDP  900
901   SRGWIISPLG  DNPWWTLLIA  AVPALLCTIL  IFMDQQITAV  IINRKEHKLK  KGAGYHLDLL  960
961   MVAVMLGVCS  IMGLPWFVAA  TVLSISHVNS  LKVESECSAP  GEQPKFLGIR  EQRVTGLMIF  1020
1021  ILMGLSVFMT  SVLKFIPMPV  LYGVFLYMGV  SSLKGIQFFD  RIKLFGMPAK  HQPDLIYLRY  1080
1081  VPLWKVHVFT  VVQLTCLVLL  WVIKASAAAV  VFPMMVLALV  FVRKLMDLCF  TKRELSWLDD  1140
1141  LMPESKKKKE  DDKKKKEKEE  AERMLQGDGD  TVHLPFERGS  LLQIPVKTLK  YSIDPSVVNI  1200
1201  SDEMAKTAQW  KALSMNTENA  KVTRPNMSPE  KPVSVTINFE  DEPSKKYMDA  ETSL  1254
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGAGACCGC  TACTCACGCG  GGGTCCCGAT  GAAGAAGCTG  TTGTGGATCT  TGGCAAAACT  60
61    AGCTCAACCG  TGAACACCAA  GTTTGAAAAA  GAAGAATTAG  AGAGTCATCG  AGCTGTATAT  120
121   GTTGGTGTTC  ATGTACCGTT  TAGTAAAGAG  AGTCGTCGGC  GTCACAGGCA  TCGAGGGCAC  180
181   AAACATCACC  ACCGGAGAAG  AAAAGACAAA  GACTCAGATA  AGGAAGATGG  ACGGGAGTCT  240
241   CCTTCTTATG  ACACGCCATC  GCAGAGGGTG  CAGTTCATCC  TTGGGACTGA  AGACGATGAT  300
301   GAGGAGCACA  TTCCCCACGA  CCTCTTCACG  GAGATGGACG  AGCTCTGCTA  CCGAGACGGG  360
361   GAAGAGTACG  AGTGGAAAGA  GACAGCCAGG  TGGCTGAAGT  TCGAAGAGGA  TGTTGAGGAT  420
421   GGTGGTGACC  GATGGAGTAA  ACCGTATGTG  GCCACTCTGT  CTTTGCACAG  TCTCTTTGAG  480
481   CTGAGGAGTT  GTATCCTAAA  TGGAACAGTC  ATGCTGGATA  TGAGAGCAAG  CACTCTGGAT  540
541   GAAATAGCAG  ATATGGTGTT  AGACAACATG  ATAGCGTCTG  GCCAGCTAGA  TGACTCCATA  600
601   AGGGAGAATG  TTCGAGAAGC  TCTTCTGAAG  AGACATCATC  ATCAAAATGA  GAAAAGGTTT  660
661   ACAAGTCGGA  TTCCCCTCGT  TCGATCCTTT  GCAGATATAG  GCAAGAAACA  TTCTGACCCT  720
721   CACTTGCTTG  AAAGGAATGG  GGAAGGCCTG  TCAGCCTCCC  GCCATTCTTT  GCGAACAGGT  780
781   CTGTCTGCCT  CAAACCTTTC  CTTGAGAGGA  GAATCGCCTT  TATCCCTTCT  TCTCAGTCAT  840
841   CTTCTTCCTT  CTTCAAGAGC  TGGCACCCCT  GCAGGCTCAA  GGTGTACCAC  CCCAGTACCC  900
901   ACCCCCCAGA  ACAGTCCTCC  TTCCAGCCCC  AGCTTAAGTC  GCCTGACCTC  CAGAAGTTCC  960
961   CAACAGACTC  AGCCTCAGGC  CCCAGAAGTA  CTGGTGTCAC  CTGACAGGGA  TGATATTCCC  1020
1021  AGAGTAGTAA  TTCATCCGCC  TGAGGAAGAC  ATAGAAGCAC  TGAAAGGCCA  AGAGCAGAAG  1080
1081  AATGAGGAAA  ATACTGACTT  CACTCCAGGG  ATTTTGGCTT  CTCCACAGTC  TGCTCCTGGA  1140
1141  AACCTGGACA  GTAGTAAAAG  TGGTGAAGTG  AAAGGTAACG  GAAGTGGAGG  AAGCAGAGAA  1200
1201  AATAGTACTG  TTGACTTTAG  CAAGGTTGAC  ATGAATTTCA  TGAGGAAAAT  TCCTACAGGA  1260
1261  GCTGAGGCAT  CCAATGTTTT  GGTAGGAGAG  GTGGATTTCT  TGGAGAGACC  TATCATTGCA  1320
1321  TTTGTGAGAC  TGGCTCCTGC  AGTTCTCCTC  TCAGGGTTGA  CTGAGGTCCC  TGTGCCCACT  1380
1381  AGGTTTTTGT  TTCTGTTACT  GGGCCCAGCA  GGAAAGGCTC  CACAGTACCA  TGAAATTGGC  1440
1441  AGATCCATAG  CAACTCTAAT  GACAGATGAG  ATTTTTCATG  ATGTAGCTTA  TAAAGCAAAA  1500
1501  GATCGAAATG  ACCTCTTATC  TGGAATTGAT  GAATTTTTAG  ATCAAGTAAC  TGTTCTTCCT  1560
1561  CCAGGAGAGT  GGGATCCTTC  CATACGCATA  GAGCCACCAA  AAAGTGTTCC  TTCTCAGGAG  1620
1621  AAAAGGAAGA  TTCCTGCGTT  TCCCAATGGA  TCTGCTCCAG  TGTCTGCTGA  CCCTCCTAAG  1680
1681  GAGGCTGATC  ACCACGCTGG  GCCTGAGCTG  CAGAGGACTG  GACGGCTTTT  TGGTGGTTTG  1740
1741  ATACTTGACA  TCAAAAGGAA  AGCACCTTTT  TTCTTGAGTG  ACTTCAAGGA  TGCATTAAGT  1800
1801  CTGCAGTGCC  TGGCCTCGAT  TCTTTTCCTA  TACTGTGCCT  GTATGTCTCC  TGTAATCACT  1860
1861  TTTGGAGGGC  TGCTTGGAGA  AGCTACAGAA  GGCAGAATAA  GTGCAATAGA  GTCTCTTTTT  1920
1921  GGAGCATCAT  TAACTGGGAT  TGCCTATTCA  TTGTTTGCTG  GGCAACCTCT  AACAATACTG  1980
1981  GGGAGCACGG  GTCCAGTCCT  AGTGTTTGAA  AAAATTTTAT  TTAAATTCTG  TAGAGATTAT  2040
2041  CACCTATCCT  ATCTATCATT  AAGAACCAGT  ATTGGTCTGT  GGACTTCTTT  CTTGTGCATT  2100
2101  GTGTTGGTCG  CAACAGATGC  CAGCAGCCTT  GTTTGTTACA  TTACTCGGTT  CACAGAAGAA  2160
2161  GCTTTCGCCG  CACTCATTTG  TATCATCTTC  ATCTATGAAG  CCTTGGAGAA  ACTCTTTCAC  2220
2221  TTAGGAGAAA  TATATGCATT  TAACATGCAC  AACAACTTGG  ATGCATTGAC  CAGTTACACA  2280
2281  TGTGTATGTG  CTGAGCCATC  TAATCCTAGC  AACGAAACTG  TAGAGCTGTG  GGAGAGGAAG  2340
2341  AACGTGACAG  CAGCCAGTAT  TTCCTGGGCA  AACCTTACCG  TGTCTGAGTG  TAAGACCTTC  2400
2401  CACGGTATGT  TTGTGGGATC  AGCTTGTGGG  CCTCACGGGC  CTTATGTTCC  CGATGTGCTC  2460
2461  TTCTGGTGTG  TCGTCTTGTT  TTTCACAACG  TTCTTTCTGT  CTTCATTCCT  CAAGCAGTTT  2520
2521  AAGACCAAGA  GATATTTTCC  TACTAAGGTG  CGATCAACAA  TCAGTGACTT  TGCTGTATTT  2580
2581  CTCACAATAG  TAATAATGGT  TGCAATTGAC  TACCTTGTAG  GAATTCCATC  TCCTAAACTT  2640
2641  CATGTTCCTG  AAAAGTTTGA  GCCTACTGAT  CCAAGCAGGG  GCTGGATCAT  AAGCCCTTTG  2700
2701  GGAGATAACC  CTTGGTGGAC  CTTACTAATT  GCAGCTGTTC  CAGCTCTCCT  TTGTACCATT  2760
2761  CTCATCTTCA  TGGACCAGCA  GATCACAGCT  GTGATCATCA  ACAGGAAAGA  ACACAAACTG  2820
2821  AAGAAAGGAG  CTGGCTATCA  CCTGGACTTG  CTCATGGTTG  CTGTCATGTT  GGGAGTCTGC  2880
2881  TCCATCATGG  GCCTGCCGTG  GTTTGTGGCT  GCAACAGTGT  TGTCTATAAG  TCATGTCAAC  2940
2941  AGCTTAAAAG  TAGAGTCTGA  ATGTTCTGCT  CCAGGGGAAC  AGCCCAAGTT  CCTCGGAATT  3000
3001  CGTGAACAGC  GGGTTACAGG  GCTGATGATT  TTTATCCTGA  TGGGCCTCTC  TGTGTTCATG  3060
3061  ACTTCAGTAT  TAAAGTTTAT  TCCGATGCCA  GTTCTATATG  GTGTTTTCCT  TTATATGGGA  3120
3121  GTTTCTTCTC  TGAAAGGAAT  TCAGTTTTTT  GACCGTATCA  AATTATTTGG  AATGCCTGCC  3180
3181  AAGCACCAGC  CGGACCTGAT  CTACCTCCGC  TATGTCCCTC  TCTGGAAGGT  GCACGTGTTC  3240
3241  ACGGTCGTCC  AGCTGACCTG  CCTGGTTCTG  CTCTGGGTGA  TCAAAGCCTC  TGCTGCTGCA  3300
3301  GTAGTTTTTC  CCATGATGGT  TCTTGCATTA  GTCTTTGTGC  GCAAGCTCAT  GGATCTGTGC  3360
3361  TTCACAAAGA  GAGAACTCAG  TTGGCTTGAT  GACCTCATGC  CAGAAAGTAA  GAAAAAGAAA  3420
3421  GAAGATGACA  AGAAGAAGAA  GGAGAAGGAG  GAAGCTGAGC  GGATGCTTCA  GGGTGACGGG  3480
3481  GATACTGTGC  ACCTCCCATT  CGAAAGGGGG  AGTCTCCTAC  AAATTCCAGT  TAAGACCCTA  3540
3541  AAATATAGTA  TTGACCCTTC  AGTTGTTAAC  ATATCAGATG  AAATGGCCAA  AACTGCCCAG  3600
3601  TGGAAGGCAC  TTTCCATGAA  TACTGAGAAT  GCCAAAGTAA  CCAGACCTAA  CATGAGCCCT  3660
3661  GAAAAGCCTG  TGAGTGTGAC  AATAAATTTC  GAAGATGAAC  CATCAAAAAA  ATACATGGAT  3720
3721  GCTGAAACTT  CATTGTAA  3738

▼ KEYWORD


ID
Family
Alternative splicing
Cell membrane
Cell projection
Complete proteome
Disulfide bond
Glycoprotein
Ion transport
Membrane
Phosphoprotein
Reference proteome
Sodium
Sodium transport
Symport
Transmembrane
Transmembrane helix
Transport

▼ GENE ONTOLOGY


ID
Classification
Description
Cellular Component
Apical plasma membrane
Cellular Component
Basolateral plasma membrane
Cellular Component
Cytoplasmic vesicle
Cellular Component
Integral component of plasma membrane
Cellular Component
Plasma membrane
Cellular Component
Stereocilium
Cellular Component
Synapse
Molecular Function
Inorganic anion exchanger activity
Molecular Function
Sodium:bicarbonate symporter activity
Biological Process
Auditory receptor cell development
Biological Process
Bicarbonate transport
Biological Process
Regulation of intracellular pH

▼ KEGG



▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Mum-a047Mus musculus0.01767undefined