LLPS-Ran-4571
Slf1

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: RCG44470
Gene Name: Slf1, Ankrd32, rCG_44470
Ensembl Gene: ENSRNOG00000040279.3
Ensembl Protein: ENSRNOP00000018457.4
Organism: Rattus norvegicus
Taxa ID: 10116
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Centrosome/Spindle pole bodyPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MEGGATKHVI  QMTGFKMEEK  EALVKLLLKL  DCTFIKSEKY  KNCTHLIAER  LCKSEKFLAA  60
61    CAAGKWVLTK  DYIIHSAKSG  RWLDETTYEW  GYKIEKDSHY  SPQMQSAPKR  WREELKRTGA  120
121   PGAFHRWKVV  LLVRADKRSD  SLVRVLEAGK  ANVILPRSSP  SGITHVIASN  ARISAEREQE  180
181   NFKAPFYPIQ  YLGDFLLEKE  IQNDEDSQIS  SGRTKYNSQE  KSKDFKRDMG  FLEMKGAGEN  240
241   MYRTQNKMGN  HNENVNDKFV  LSEHHKKKFR  DFRKDMKSIK  KTNTFRRRAH  ENQKETKKKD  300
301   KNVQRSYILR  KKNIKEGYCK  TDDAHDTTRS  TLKKRWSYRD  QKEMKNSLLT  DCAKESETKD  360
361   VKANVDLTEV  KNALKRQIHR  DIYRAQAVRY  NCIRVDKQPV  YNVEVKNAEF  PRGILNLIES  420
421   LIEGQFFKEA  IEELSSLQAH  YVPPVCLLHA  LLENVLQDNI  DTFSGRYFHI  LSALLHLHPP  480
481   WKSPAMSRYY  LELFQCPTCM  KGAWPLVEML  VRSCLFNEGF  CHQISENIGS  KVAHLTLLKF  540
541   FFNLLESEVR  HLSQKLCDWS  DSQNLKVAEK  AILHEIFWSG  SETSGLLTKP  VNMLLEWTIY  600
601   SHKEKCKSND  VFKHELSYLL  TGILGTAVDY  WIFLGIQMGR  NVIRHMSEDL  GSYISLSCDD  660
661   FSSKELELFI  CSFSSSWLQM  FVAEAIFKKL  CLQGPTSTCT  EPLSLQKIID  SYLPVLGKMD  720
721   IHGAGKMQMP  KKLCQRPCLE  SQRALLMLNG  AKQKQADGRP  EFLELNHAKC  SSSLKKLKKK  780
781   SEGESSCSKE  NCPSLVTKMN  FHKTNLKGET  ALHRVCIKNQ  VEKLIILLSL  PGIDINVKDN  840
841   AGWTPLHEAC  NYGNTVCVRE  ILQRCPEVDL  LTQVDGVTPL  HDALSNGHVE  IGKLLLQHGG  900
901   PELLQQRNSK  GELPLDYVLS  PKDKEELFAI  TNIDDTVDNF  HAKTQKHFYH  EQLEFGSFLL  960
961   SRMLISFCSI  FDLSSEFILA  FKGLSHLNEL  LMACNTDTEP  TSAHSDWLLD  LYTRNIKTLK  1020
1021  KLPSVLKELP  ENLNVCPGVH  TEALLVTLEM  MCQSITEVS  1059
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGAAGGTG  GTGCCACCAA  ACATGTCATC  CAGATGACAG  GGTTTAAGAT  GGAGGAGAAG  60
61    GAAGCTCTAG  TCAAGTTGCT  TTTAAAGCTA  GATTGCACTT  TTATAAAGAG  TGAGAAATAT  120
121   AAAAACTGTA  CACATCTTAT  AGCTGAACGC  CTGTGCAAGA  GTGAGAAGTT  TTTAGCAGCT  180
181   TGTGCTGCAG  GAAAATGGGT  ATTAACAAAG  GATTACATAA  TTCATAGTGC  CAAAAGTGGC  240
241   AGATGGCTTG  ATGAAACAAC  TTATGAATGG  GGATATAAAA  TTGAAAAAGA  TTCCCATTAT  300
301   TCACCTCAAA  TGCAATCTGC  ACCGAAAAGA  TGGCGTGAAG  AGCTGAAACG  GACTGGTGCT  360
361   CCTGGAGCCT  TCCACAGATG  GAAAGTTGTT  CTCCTTGTTA  GGGCAGATAA  GCGGAGTGAC  420
421   TCTCTTGTAA  GAGTTTTGGA  AGCTGGAAAG  GCAAATGTCA  TTTTACCAAG  AAGTTCTCCT  480
481   AGTGGTATAA  CCCATGTGAT  TGCCAGTAAT  GCAAGAATCA  GTGCTGAGAG  AGAACAAGAA  540
541   AACTTTAAGG  CTCCGTTTTA  TCCAATTCAG  TATTTAGGGG  ATTTTCTCTT  AGAGAAAGAA  600
601   ATTCAGAATG  ATGAAGATTC  CCAAATCAGT  TCTGGTCGGA  CCAAATATAA  CAGTCAAGAA  660
661   AAAAGCAAAG  ATTTTAAGAG  AGACATGGGA  TTTCTTGAAA  TGAAAGGTGC  TGGAGAAAAC  720
721   ATGTACAGAA  CTCAGAATAA  AATGGGAAAT  CATAATGAAA  ATGTTAATGA  TAAGTTTGTT  780
781   CTGAGTGAAC  ATCACAAAAA  GAAATTCAGA  GACTTCAGAA  AAGATATGAA  ATCTATTAAA  840
841   AAAACAAATA  CATTCAGAAG  ACGTGCACAT  GAGAATCAGA  AAGAAACTAA  GAAAAAAGAT  900
901   AAAAATGTCC  AAAGGAGTTA  CATTTTAAGG  AAAAAGAACA  TAAAAGAAGG  TTATTGCAAA  960
961   ACTGACGATG  CCCATGACAC  AACTAGAAGT  ACATTAAAAA  AGCGCTGGAG  CTACAGAGAC  1020
1021  CAGAAAGAAA  TGAAGAATTC  TCTTCTTACT  GATTGTGCCA  AAGAATCAGA  GACCAAGGAT  1080
1081  GTCAAGGCAA  ATGTGGATCT  CACGGAAGTA  AAAAATGCCT  TAAAGAGGCA  GATACACAGA  1140
1141  GACATATATA  GAGCTCAGGC  AGTCCGATAC  AACTGCATTA  GAGTAGATAA  ACAGCCGGTA  1200
1201  TACAATGTAG  AGGTTAAAAA  TGCAGAGTTC  CCCAGAGGAA  TATTAAATTT  AATTGAAAGC  1260
1261  CTCATAGAGG  GACAGTTCTT  TAAAGAAGCC  ATTGAAGAGC  TTTCCTCTTT  GCAAGCCCAT  1320
1321  TATGTCCCTC  CAGTGTGCCT  TCTACATGCC  CTACTAGAGA  ATGTTCTGCA  GGATAATATA  1380
1381  GATACATTTT  CTGGTCGATA  CTTTCATATA  TTATCAGCTC  TTCTTCATCT  GCATCCTCCT  1440
1441  TGGAAGTCAC  CAGCCATGTC  AAGATACTAC  TTAGAGCTAT  TTCAGTGTCC  AACTTGTATG  1500
1501  AAAGGAGCCT  GGCCTCTCGT  GGAGATGCTC  GTCAGGTCTT  GTCTTTTCAA  TGAAGGTTTC  1560
1561  TGCCATCAAA  TATCAGAAAA  CATTGGTTCT  AAAGTGGCCC  ATCTTACACT  GCTCAAGTTC  1620
1621  TTCTTTAACC  TACTTGAAAG  TGAAGTGCGG  CATTTGAGTC  AAAAGTTATG  TGACTGGTCA  1680
1681  GATTCTCAGA  ATCTAAAAGT  AGCAGAAAAG  GCAATTCTTC  ATGAAATTTT  TTGGTCAGGA  1740
1741  AGTGAAACTT  CAGGACTTTT  GACAAAACCA  GTAAATATGC  TTTTGGAATG  GACTATTTAT  1800
1801  TCTCACAAGG  AAAAATGCAA  GTCTAATGAT  GTCTTCAAAC  ATGAACTATC  TTACTTACTG  1860
1861  ACTGGAATTC  TTGGCACAGC  AGTAGACTAT  TGGATCTTCC  TTGGTATTCA  GATGGGTAGA  1920
1921  AATGTGATCC  GACACATGTC  TGAGGACTTA  GGAAGCTATA  TTTCCCTTTC  CTGTGATGAC  1980
1981  TTTTCTTCAA  AAGAACTAGA  GCTCTTCATT  TGTTCCTTTT  CATCTTCCTG  GCTTCAAATG  2040
2041  TTCGTTGCAG  AAGCAATCTT  TAAAAAGCTG  TGCTTACAGG  GCCCCACTAG  TACGTGCACT  2100
2101  GAGCCACTCT  CTCTTCAGAA  AATAATAGAT  TCCTATTTAC  CAGTTTTGGG  GAAAATGGAC  2160
2161  ATACATGGGG  CTGGAAAGAT  GCAGATGCCA  AAAAAACTCT  GCCAGCGGCC  TTGCCTAGAG  2220
2221  TCTCAAAGAG  CGTTACTAAT  GCTGAACGGT  GCAAAACAGA  AACAAGCAGA  CGGTCGGCCA  2280
2281  GAGTTCCTTG  AGTTAAACCA  TGCTAAATGT  TCCTCATCGT  TGAAAAAGCT  GAAGAAGAAG  2340
2341  TCAGAAGGAG  AATCGTCATG  TTCGAAGGAG  AATTGCCCCT  CTTTGGTTAC  AAAGATGAAT  2400
2401  TTTCATAAAA  CTAATCTGAA  AGGGGAAACA  GCTCTGCATA  GAGTTTGCAT  AAAAAACCAA  2460
2461  GTGGAGAAAT  TGATTATTCT  TCTCTCTTTA  CCAGGAATAG  ACATCAATGT  TAAAGACAAT  2520
2521  GCTGGCTGGA  CGCCTTTGCA  TGAAGCCTGT  AACTATGGCA  ACACAGTGTG  TGTCCGGGAA  2580
2581  ATTTTGCAAC  GTTGTCCAGA  GGTAGATCTG  CTCACTCAAG  TGGACGGGGT  GACTCCTTTG  2640
2641  CATGATGCAC  TGTCAAACGG  ACATGTAGAA  ATTGGCAAGC  TGCTTCTACA  GCATGGGGGC  2700
2701  CCAGAGCTTT  TACAGCAGAG  GAACTCTAAG  GGGGAGTTGC  CCTTGGATTA  TGTGCTGTCC  2760
2761  CCTAAAGACA  AGGAAGAACT  ATTTGCCATT  ACAAATATAG  ACGATACAGT  GGACAACTTT  2820
2821  CATGCTAAGA  CACAGAAACA  TTTTTATCAC  GAACAACTGG  AATTTGGTTC  ATTTTTACTT  2880
2881  AGTAGGATGT  TGATTAGTTT  TTGTTCAATA  TTTGATTTAT  CCTCAGAATT  CATCCTAGCT  2940
2941  TTCAAAGGGT  TAAGTCATCT  AAATGAGTTG  CTTATGGCAT  GCAATACTGA  TACAGAACCC  3000
3001  ACCAGTGCAC  ATTCTGACTG  GCTACTAGAT  CTTTATACTA  GGAATATAAA  GACATTAAAG  3060
3061  AAGCTCCCAA  GTGTTCTTAA  GGAACTGCCT  GAGAATCTAA  ATGTATGTCC  TGGAGTTCAT  3120
3121  ACTGAGGCCT  TATTGGTGAC  CCTGGAAATG  ATGTGTCAGT  CAATCACAGA  GGTGTCATAA  3180

▼ ANNOTATION

Disorder
D2P2IUPred2A
Interaction
RAINIIDMIST
Physicochemical
Compute pI/MwAAindex
Function
iEKPD
Localization
COMPARTMENTS
Expression
TISSUES

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Mup-1411Mustela putorius furo96.67e-76 276
LLPS-Mum-2323Mus musculus90.080.01906
LLPS-Mea-2634Mesocricetus auratus88.780.01865
LLPS-Loa-4456Loxodonta africana82.940.0 691
LLPS-Orc-3234Oryctolagus cuniculus81.830.01701
LLPS-Eqc-1945Equus caballus81.30.01705
LLPS-Ict-0370Ictidomys tridecemlineatus81.240.01711
LLPS-Man-3180Macaca nemestrina80.90.01712
LLPS-Caf-2284Canis familiaris80.830.01701
LLPS-Fec-0188Felis catus80.830.01684
LLPS-Mal-3328Mandrillus leucophaeus80.810.01712
LLPS-Cea-4300Cercocebus atys80.810.01712
LLPS-Mam-2632Macaca mulatta80.810.01716
LLPS-Maf-2120Macaca fascicularis80.710.01712
LLPS-Sus-3886Sus scrofa80.70.01681
LLPS-Aim-1119Ailuropoda melanoleuca80.470.01689
LLPS-Chs-1151Chlorocebus sabaeus80.430.01702
LLPS-Gog-4259Gorilla gorilla80.240.01693
LLPS-Nol-3987Nomascus leucogenys80.240.01698
LLPS-Otg-0296Otolemur garnettii80.170.01653
LLPS-Pap-1581Pan paniscus80.060.01691
LLPS-Paa-3865Papio anubis79.980.01498
LLPS-Poa-3009Pongo abelii79.980.01687
LLPS-Rhb-4465Rhinopithecus bieti79.960.01681
LLPS-Pat-1695Pan troglodytes79.960.01689
LLPS-Myl-0331Myotis lucifugus79.890.01655
LLPS-Hos-3585Homo sapiens79.870.01688
LLPS-Caj-1068Callithrix jacchus79.680.01692
LLPS-Dio-3529Dipodomys ordii79.450.01672
LLPS-Urm-1109Ursus maritimus79.320.01648
LLPS-Aon-2180Aotus nancymaae78.730.01524
LLPS-Bot-2026Bos taurus78.570.01607
LLPS-Fud-4427Fukomys damarensis77.590.01614
LLPS-Cas-2212Carlito syrichta77.310.01405
LLPS-Ova-3626Ovis aries77.090.01565
LLPS-Cap-4568Cavia porcellus76.610.01578
LLPS-Mod-2378Monodelphis domestica66.395e-86 304
LLPS-Ora-0766Ornithorhynchus anatinus62.342e-79 285
LLPS-Sah-3499Sarcophilus harrisii61.56e-148 455
LLPS-Tag-2655Taeniopygia guttata59.721e-73 248
LLPS-Anc-3140Anolis carolinensis59.573e-71 260
LLPS-Gaga-1419Gallus gallus59.575e-75 272
LLPS-Fia-0931Ficedula albicollis54.883e-69 254
LLPS-Pes-2298Pelodiscus sinensis49.580.0 962
LLPS-Xim-1847Xiphophorus maculatus49.097e-41 160
LLPS-Scm-2278Scophthalmus maximus47.932e-1895.1
LLPS-Xet-1584Xenopus tropicalis47.628e-1996.3
LLPS-Lac-4097Latimeria chalumnae47.412e-1792.4
LLPS-Ten-3355Tetraodon nigroviridis47.111e-1792.8
LLPS-Scf-0353Scleropages formosus47.04e-1584.3
LLPS-Anp-1316Anas platyrhynchos46.833e-1791.3
LLPS-Meg-1590Meleagris gallopavo46.832e-1688.6
LLPS-Orn-0026Oreochromis niloticus46.619e-1686.7
LLPS-Orl-0671Oryzias latipes46.45e-1894.0
LLPS-Dar-0183Danio rerio45.381e-1998.6
LLPS-Tar-1990Takifugu rubripes44.928e-1170.5
LLPS-Pof-1703Poecilia formosa44.833e-1687.8
LLPS-Icp-2511Ictalurus punctatus44.271e-1999.0
LLPS-Drm-1626Drosophila melanogaster42.51e-1380.1
LLPS-Cis-1568Ciona savignyi42.028e-2096.3
LLPS-Leo-3311Lepisosteus oculatus41.552e-1792.0
LLPS-Vir-1565Vigna radiata37.195e-1068.2
LLPS-Hov-1540Hordeum vulgare36.972e-1275.9
LLPS-Mua-0620Musa acuminata36.361e-1070.1
LLPS-Brn-3155Brassica napus35.963e-1172.0
LLPS-Brr-2560Brassica rapa35.964e-1172.0
LLPS-Asm-3700Astyanax mexicanus35.713e-1481.6
LLPS-Gaa-1079Gasterosteus aculeatus35.423e-1172.4
LLPS-Bro-1144Brassica oleracea35.097e-1170.9
LLPS-Tru-0875Triticum urartu35.077e-1274.3
LLPS-Pot-2120Populus trichocarpa34.812e-1069.7
LLPS-Via-2032Vigna angularis34.563e-1069.3
LLPS-Cae-1473Caenorhabditis elegans34.513e-1275.5
LLPS-Cii-1780Ciona intestinalis34.014e-1993.2
LLPS-Hea-1841Helianthus annuus33.594e-1171.6
LLPS-Tut-1622Tursiops truncatus33.142e-1169.7
LLPS-Amt-2264Amborella trichopoda31.143e-1172.4
LLPS-Zem-1951Zea mays30.776e-1171.2
LLPS-Dac-2445Daucus carota30.437e-1480.9
LLPS-Orgl-0848Oryza glumaepatula29.73e-1172.4
LLPS-Orm-0366Oryza meridionalis29.73e-1172.0
LLPS-Orp-1510Oryza punctata29.71e-1173.2
LLPS-Viv-0532Vitis vinifera28.892e-1068.2