LLPS-Ran-3996
Ift88

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Intraflagellar transport 88
Gene Name: Ift88
Ensembl Gene: ENSRNOG00000009278.7
Ensembl Protein: ENSRNOP00000067945.1
Organism: Rattus norvegicus
Taxa ID: 10116
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Centrosome/Spindle pole bodyPredicted from orthologs(View)

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MMENVHLAPE  TDEDDLYSGF  NDYNPAYDTE  ELENDTGFQQ  AVRTSHGRRP  PVTAKIPSTA  60
61    VSRPIATGYG  SKTSLTSSMG  RPMTGTIQDG  VARPMTAVRA  AGFSKAALRG  SAFDPLGQSR  120
121   GPAPPLEAKN  EDSPEEKIRQ  LEKKVNELVE  ESCIANSCGD  LKLALEKAKD  AGRKERVLVR  180
181   QREQVTSPEN  INLDLTYSVL  FNLASQYSAN  EMYAEALNTY  QVIVKNKMFS  NAGRLKVNMG  240
241   NIYLKQRNYS  KAIKFYRMAL  DQIPSVHKEM  RIKIMQNIGI  TFIKTGQYSD  AINSFEHIMS  300
301   MAPSLKAGFN  LILSCFAIGD  REKMKKAFQK  LIAVPLEIDE  DDKYISPSDD  PHTNLLIEAI  360
361   KNDHLRQMER  ERKAMAEKYI  MTAAKLIAPV  IEASFAVGYN  WCVEVVKASQ  YVELANDLEI  420
421   NKAITYLRQK  DFNQAVDTLK  MFEKKDSRVK  SAAATNLSFL  YYLENEFAQA  SSYADLAVSS  480
481   DRYNPSALTN  KGNTVFANGD  YEKAAEFYKE  ALRNDSSCTE  ALYNIGLTYK  KLNRLDEALD  540
541   SFLKLHAILR  NSAQVLCQIA  NVYELMEDPN  QAIEWLMQLI  SVVPTDSQAL  SKLGELYDSE  600
601   GDKSQAFQYY  YESYRYFPSN  IEVIEWLGAY  YIDTQFCEKA  IQYFERASLI  QPTQVKWQLM  660
661   VASCFRRSGN  YQKALDTYKE  IHRKFPENVE  CLRFLVRLCT  DIGLKEVQEY  ATKLKRLEKM  720
721   KEMREQRIKS  GRDSGGGSRS  KREGSAGSDS  GQNSSASSKS  ERLSAKLRAL  PGTDEPYESS  780
781   GNKEIDASYV  DPLGPQIERP  KTAARKRIDE  DDFADEELGD  DLLPE  825
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGATGGAAA  ATGTTCATCT  GGCACCAGAA  ACAGATGAGG  ATGATCTTTA  CTCTGGTTTC  60
61    AATGACTACA  ATCCAGCCTA  CGATACTGAG  GAGTTGGAGA  ATGACACGGG  TTTTCAGCAA  120
121   GCAGTGAGAA  CCAGTCATGG  CAGAAGACCT  CCAGTAACTG  CAAAGATACC  AAGCACAGCT  180
181   GTCAGCAGAC  CCATAGCTAC  TGGATATGGG  TCCAAGACAT  CCCTGACATC  ATCAATGGGA  240
241   AGGCCGATGA  CAGGGACTAT  TCAGGATGGA  GTTGCTCGAC  CGATGACGGC  GGTGAGAGCA  300
301   GCTGGCTTTT  CCAAGGCAGC  TTTGCGAGGC  TCTGCATTTG  ACCCCCTTGG  TCAGTCTAGG  360
361   GGCCCTGCTC  CTCCTTTGGA  AGCCAAAAAT  GAAGACAGTC  CAGAAGAAAA  GATTAGACAG  420
421   TTAGAGAAGA  AAGTAAATGA  GTTGGTGGAA  GAAAGCTGTA  TTGCCAACAG  TTGTGGAGAC  480
481   TTAAAACTGG  CCTTAGAGAA  GGCAAAAGAT  GCAGGAAGAA  AAGAGAGAGT  CCTGGTGAGA  540
541   CAACGAGAGC  AAGTCACAAG  TCCAGAAAAT  ATCAACTTGG  ACCTAACCTA  CTCCGTTCTT  600
601   TTCAACTTGG  CAAGTCAGTA  TTCTGCTAAT  GAAATGTATG  CAGAAGCACT  AAACACATAC  660
661   CAAGTTATAG  TGAAAAATAA  GATGTTTAGC  AATGCAGGAA  GACTGAAAGT  GAATATGGGA  720
721   AATATTTATT  TAAAGCAGAG  GAATTATTCC  AAAGCTATTA  AATTCTACCG  AATGGCCTTA  780
781   GATCAGATCC  CAAGTGTCCA  TAAAGAAATG  AGGATTAAAA  TAATGCAGAA  CATCGGGATC  840
841   ACGTTTATAA  AGACCGGTCA  GTACTCAGAC  GCCATCAACT  CATTCGAGCA  CATCATGAGC  900
901   ATGGCCCCAA  GCCTGAAGGC  AGGCTTCAAC  CTCATTCTCA  GCTGCTTCGC  CATTGGAGAT  960
961   CGAGAGAAAA  TGAAGAAGGC  ATTCCAAAAG  TTAATTGCTG  TTCCGTTGGA  AATTGACGAA  1020
1021  GACGATAAAT  ATATCTCCCC  CAGTGATGAT  CCCCATACTA  ACTTATTGAT  TGAAGCTATA  1080
1081  AAAAATGACC  ATCTTAGGCA  AATGGAACGT  GAAAGGAAAG  CCATGGCAGA  AAAATACATC  1140
1141  ATGACAGCTG  CAAAACTCAT  TGCTCCTGTG  ATCGAAGCCT  CCTTTGCTGT  GGGTTATAAC  1200
1201  TGGTGTGTGG  AAGTAGTGAA  GGCCTCTCAG  TACGTGGAGC  TGGCCAACGA  CCTGGAGATT  1260
1261  AACAAAGCAA  TCACCTACTT  GAGACAGAAG  GACTTCAACC  AGGCTGTAGA  CACATTGAAA  1320
1321  ATGTTTGAGA  AGAAGGACAG  TAGAGTGAAG  AGTGCAGCTG  CGACCAACCT  CTCATTCCTG  1380
1381  TATTATCTGG  AGAACGAATT  TGCCCAAGCC  AGCAGCTATG  CAGATTTAGC  TGTGAGCTCA  1440
1441  GACAGATACA  ACCCATCAGC  TCTCACTAAC  AAGGGGAACA  CAGTGTTTGC  AAATGGTGAC  1500
1501  TACGAGAAGG  CAGCTGAGTT  CTATAAAGAG  GCCCTAAGAA  ACGATTCTTC  TTGTACTGAA  1560
1561  GCACTTTATA  ACATTGGCCT  CACCTACAAG  AAGCTCAACC  GCCTGGACGA  AGCGTTGGAC  1620
1621  TCCTTCCTGA  AACTGCATGC  AATCCTTCGG  AACAGCGCTC  AAGTTCTGTG  CCAGATAGCA  1680
1681  AATGTATACG  AGTTAATGGA  AGATCCCAAT  CAGGCTATTG  AGTGGCTGAT  GCAGTTGATC  1740
1741  AGCGTGGTTC  CAACTGATTC  CCAAGCGCTG  TCTAAACTGG  GAGAGTTGTA  CGATAGTGAG  1800
1801  GGAGACAAGT  CCCAGGCGTT  CCAATATTAC  TATGAGTCAT  ATAGGTATTT  CCCTTCTAAC  1860
1861  ATTGAAGTCA  TCGAATGGCT  TGGAGCTTAT  TACATTGATA  CCCAGTTCTG  CGAGAAAGCC  1920
1921  ATTCAGTACT  TTGAAAGAGC  TTCCCTTATA  CAACCCACAC  AAGTGAAATG  GCAGCTGATG  1980
1981  GTAGCTAGCT  GTTTTAGAAG  AAGTGGTAAC  TACCAAAAGG  CATTAGATAC  TTACAAAGAG  2040
2041  ATTCACAGGA  AATTTCCAGA  GAATGTTGAA  TGTTTGCGTT  TCTTGGTTCG  TCTCTGCACA  2100
2101  GATATTGGAT  TAAAAGAAGT  TCAAGAATAT  GCCACAAAAC  TCAAGAGGTT  GGAAAAAATG  2160
2161  AAAGAAATGC  GGGAACAGCG  CATAAAATCA  GGCAGAGACA  GCGGCGGGGG  CTCTCGCAGC  2220
2221  AAACGAGAGG  GGAGCGCTGG  CAGTGATAGT  GGCCAGAACA  GTAGTGCCAG  TAGTAAAAGT  2280
2281  GAACGACTGA  GTGCCAAGCT  CAGAGCTTTG  CCTGGGACAG  ACGAACCTTA  TGAAAGTAGC  2340
2341  GGGAACAAAG  AAATAGGCAA  ATGCCTCCTA  TGTGGATCCA  CTGGGCCCTC  AGATAGAAAG  2400
2401  ACCAAAAACT  GCAGCCAGAA  AGAGAATCGA  CGAGGACGAT  TTTGCTGA  2448

▼ ANNOTATION

Disorder
D2P2IUPred2A
Interaction
RAINIIDMIST
Physicochemical
Compute pI/MwAAindex
Localization
COMPARTMENTS

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Mum-4679Mus musculus99.390.01618
LLPS-Mup-4562Mustela putorius furo96.930.01313
LLPS-Aim-4414Ailuropoda melanoleuca96.550.01035
LLPS-Ict-1588Ictidomys tridecemlineatus95.760.01567
LLPS-Urm-3422Ursus maritimus95.520.01566
LLPS-Mod-1477Monodelphis domestica95.340.01461
LLPS-Otg-1071Otolemur garnettii95.030.01562
LLPS-Loa-3135Loxodonta africana94.820.01553
LLPS-Fec-3043Felis catus94.790.01558
LLPS-Caf-2953Canis familiaris94.550.01554
LLPS-Cap-2658Cavia porcellus94.420.01554
LLPS-Fud-2907Fukomys damarensis94.30.01552
LLPS-Orc-2701Oryctolagus cuniculus94.30.01551
LLPS-Ova-3698Ovis aries94.060.01545
LLPS-Dio-4334Dipodomys ordii92.970.01504
LLPS-Bot-1562Bos taurus92.220.01415
LLPS-Myl-1673Myotis lucifugus91.830.01501
LLPS-Mea-3374Mesocricetus auratus91.540.01432
LLPS-Eqc-2936Equus caballus90.940.01466
LLPS-Ora-2687Ornithorhynchus anatinus89.830.01493
LLPS-Cas-0837Carlito syrichta89.560.01469
LLPS-Maf-0624Macaca fascicularis89.210.01471
LLPS-Paa-0431Papio anubis89.090.01469
LLPS-Mam-1962Macaca mulatta89.090.01470
LLPS-Man-2851Macaca nemestrina89.090.01469
LLPS-Mal-0781Mandrillus leucophaeus88.970.01468
LLPS-Cea-2684Cercocebus atys88.850.01462
LLPS-Hos-2100Homo sapiens88.850.01462
LLPS-Pat-0716Pan troglodytes88.730.01461
LLPS-Chs-0335Chlorocebus sabaeus88.480.01355
LLPS-Pap-1853Pan paniscus88.480.01457
LLPS-Sus-1614Sus scrofa88.120.01492
LLPS-Rhb-0460Rhinopithecus bieti88.00.01446
LLPS-Sah-3736Sarcophilus harrisii87.950.0 647
LLPS-Caj-4176Callithrix jacchus87.640.01444
LLPS-Nol-0618Nomascus leucogenys87.640.01447
LLPS-Leo-3724Lepisosteus oculatus87.52e-1379.0
LLPS-Poa-4076Pongo abelii84.860.01302
LLPS-Pes-1789Pelodiscus sinensis84.240.01409
LLPS-Anc-2148Anolis carolinensis83.760.01416
LLPS-Gaga-1161Gallus gallus83.390.01393
LLPS-Meg-0565Meleagris gallopavo83.390.01397
LLPS-Xet-2790Xenopus tropicalis81.960.01331
LLPS-Anp-2707Anas platyrhynchos81.940.01370
LLPS-Gog-0533Gorilla gorilla81.580.01311
LLPS-Lac-0780Latimeria chalumnae81.110.01378
LLPS-Fia-3724Ficedula albicollis79.390.01323
LLPS-Tag-2056Taeniopygia guttata79.20.01307
LLPS-Pof-3940Poecilia formosa76.540.01161
LLPS-Icp-1699Ictalurus punctatus75.420.01270
LLPS-Scf-0943Scleropages formosus75.060.01290
LLPS-Scm-0101Scophthalmus maximus73.980.01274
LLPS-Orn-1363Oreochromis niloticus73.00.01269
LLPS-Orl-1648Oryzias latipes72.530.01125
LLPS-Asm-3810Astyanax mexicanus72.030.01225
LLPS-Dar-3395Danio rerio71.580.01269
LLPS-Xim-1964Xiphophorus maculatus71.560.01209
LLPS-Gaa-1813Gasterosteus aculeatus71.530.01211
LLPS-Aon-0331Aotus nancymaae65.750.0 951
LLPS-Ten-1845Tetraodon nigroviridis64.050.01069
LLPS-Tar-2526Takifugu rubripes62.90.01008
LLPS-Cis-0724Ciona savignyi58.670.0 694
LLPS-Cii-0599Ciona intestinalis55.470.0 920
LLPS-Cae-1493Caenorhabditis elegans48.460.0 687
LLPS-Sem-2191Selaginella moellendorffii45.240.0 562
LLPS-Chr-0184Chlamydomonas reinhardtii42.980.0 546
LLPS-Php-2336Physcomitrella patens40.411e-178 544
LLPS-Drm-1398Drosophila melanogaster32.918e-110 363
LLPS-Ast-0176Aspergillus terreus30.771e-0656.6
LLPS-Sei-0011Setaria italica29.087e-0654.3
LLPS-Osl-0162Ostreococcus lucimarinus28.664e-0757.8
LLPS-Ors-0937Oryza sativa28.111e-0656.2
LLPS-Brn-0228Brassica napus28.086e-0860.8
LLPS-Brr-0573Brassica rapa28.086e-0860.8
LLPS-Thc-1169Theobroma cacao27.872e-0965.5
LLPS-Coc-2042Corchorus capsularis27.872e-1068.9
LLPS-Phv-1756Phaseolus vulgaris27.852e-0655.5
LLPS-Bro-1112Brassica oleracea27.754e-0861.2
LLPS-Brd-2524Brachypodium distachyon27.663e-0655.1
LLPS-Lep-2205Leersia perrieri27.542e-0655.8
LLPS-Pot-1193Populus trichocarpa27.451e-1172.8
LLPS-Gor-0990Gossypium raimondii27.197e-1273.6
LLPS-Viv-0629Vitis vinifera26.761e-1172.8
LLPS-Hov-0657Hordeum vulgare26.731e-0966.6
LLPS-Tra-0923Triticum aestivum26.737e-1067.0
LLPS-Tru-1176Triticum urartu26.739e-1067.0
LLPS-Orni-0237Oryza nivara26.471e-1172.8
LLPS-Orb-1814Oryza barthii26.471e-1172.8
LLPS-Ori-1521Oryza indica26.471e-1172.4
LLPS-Orm-1678Oryza meridionalis26.471e-1173.2
LLPS-Orr-1588Oryza rufipogon26.471e-1172.8
LLPS-Prp-1146Prunus persica26.475e-1170.9
LLPS-Orbr-2175Oryza brachyantha26.473e-1171.6
LLPS-Orp-1507Oryza punctata26.475e-1170.9
LLPS-Asfu-0895Aspergillus fumigatus26.24e-0654.7
LLPS-Nef-0233Neosartorya fischeri26.23e-0655.1
LLPS-Asf-0679Aspergillus flavus26.067e-0757.0
LLPS-Aso-1459Aspergillus oryzae26.068e-0757.0
LLPS-Cus-0454Cucumis sativus25.981e-0863.2
LLPS-Orgl-0847Oryza glumaepatula25.983e-1171.6
LLPS-Mua-0940Musa acuminata25.986e-1170.9
LLPS-Sob-0543Sorghum bicolor25.983e-1171.2
LLPS-Mae-0132Manihot esculenta25.984e-1170.9
LLPS-Dac-0875Daucus carota25.781e-0966.2
LLPS-Arl-0144Arabidopsis lyrata25.492e-1068.9
LLPS-Amt-2117Amborella trichopoda25.496e-0964.3
LLPS-Via-2349Vigna angularis25.221e-0863.2
LLPS-Sol-1067Solanum lycopersicum25.04e-1067.8
LLPS-Hea-0249Helianthus annuus24.661e-0656.6
LLPS-Art-3100Arabidopsis thaliana24.549e-1170.1
LLPS-Nia-0429Nicotiana attenuata24.512e-1068.6
LLPS-Zem-1870Zea mays24.45e-0757.8
LLPS-Org-0954Oryza glaberrima24.389e-0757.0
LLPS-Vir-1797Vigna radiata24.084e-0964.3
LLPS-Glm-0659Glycine max24.081e-0966.2
LLPS-Sot-0821Solanum tuberosum24.021e-0862.8
LLPS-Met-0893Medicago truncatula23.443e-0965.1
LLPS-Tut-0356Tursiops truncatus20.91e-0862.8