• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Pot-0937

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Ensembl Gene: POPTR_005G098500v3
Ensembl Protein: PNT35892
Organism: Populus trichocarpa
Taxa ID: 3694
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblPNT35892PNT35892
EnsemblPNT35890PNT35890
EnsemblPNT35891PNT35891

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MGVELTHQYT  EYRAMEDQEE  VEEGVSITDW  DLVYHVRDAL  LSVKTGDRSS  YHQLVGVLHH  60
61    RDRSAPDKVA  LLLTSLKALS  GAVSYINDVD  HVSLLQSIFG  MSMWNCAPDV  MDALLELIIC  120
121   LAASNGKYVD  LCLDMLVNNF  MPPMESDMLR  HPRGQAKKDQ  VLPRVHTGLE  VIVDLVPLAA  180
181   LKLSTNVVQK  RPMFFRKDFN  MDRLKCRMEI  YLKNMLMLEG  GAIREFVGHS  MLVEVVNMML  240
241   ELDWFSLQVA  IGWDELLRDD  PSKGIFTMEL  EDEEEEAGDD  GQANDGELPS  TLTLRNLGKN  300
301   VTADLLDSLM  IQFLEHLEAC  ADKKRLSEVF  ETLLSSFMAT  ILNTYKSKFS  QFTIFYACAL  360
361   DPENCGVKFA  QTLVDLFIST  CNPPVTRMSA  VAYLSSYLAR  GKFLSAAFVM  NMLKRLVDWC  420
421   LRYCEEQDSD  MNPKAHQVFY  SACQGIMYVL  CFHMKSIMNV  PTLKSQLLLM  PIEPILKHKL  480
481   GPLEVCLPSI  VNEFLKQAKA  AHLFTISKAF  IFEDLLESDL  SRDFGGLERL  DMFFPFDPCL  540
541   LKKCDRGFIR  PNFIYWNHVK  TTYDDDEEDS  SDEDIADDFG  VLNEENFMEE  GMARSFDQDI  600
601   DLDEFDYVMN  KMSITPKNTS  GFHFGGERMP  SKIRPSTSPE  SL  642
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGGTGTTG  AGTTAACCCA  TCAATATACA  GAATATAGAG  CAATGGAGGA  TCAAGAGGAG  60
61    GTGGAGGAAG  GTGTTAGTAT  TACTGATTGG  GATTTAGTTT  ATCATGTTAG  AGATGCCCTT  120
121   TTATCTGTCA  AAACGGGTGA  CAGGAGCAGT  TACCACCAGC  TTGTTGGGGT  TTTGCATCAC  180
181   AGAGATCGTT  CTGCTCCTGA  TAAAGTGGCT  TTGCTTTTGA  CGAGTCTAAA  GGCACTATCT  240
241   GGGGCAGTTT  CTTACATAAA  CGACGTTGAC  CATGTCTCAC  TTCTTCAATC  TATTTTTGGA  300
301   ATGAGCATGT  GGAACTGTGC  GCCTGATGTG  ATGGATGCAT  TGCTTGAACT  TATAATATGC  360
361   TTGGCTGCTT  CAAATGGAAA  ATATGTTGAT  TTATGTCTTG  ATATGCTTGT  AAACAATTTT  420
421   ATGCCACCGA  TGGAATCAGA  TATGCTCCGG  CATCCACGTG  GTCAGGCAAA  AAAGGACCAA  480
481   GTTCTTCCTC  GTGTGCATAC  TGGTCTAGAA  GTTATTGTTG  ATTTGGTGCC  TTTGGCAGCC  540
541   TTGAAATTGT  CTACAAATGT  TGTACAAAAG  AGGCCTATGT  TCTTCAGGAA  GGATTTCAAC  600
601   ATGGATCGTC  TAAAATGTCG  CATGGAGATA  TATTTGAAGA  ATATGCTAAT  GTTGGAGGGT  660
661   GGTGCTATTA  GAGAATTTGT  TGGGCACAGT  ATGCTCGTGG  AAGTGGTGAA  TATGATGCTA  720
721   GAATTGGACT  GGTTTTCCCT  ACAGGTTGCA  ATTGGTTGGG  ATGAATTGTT  AAGGGATGAT  780
781   CCTAGTAAAG  GCATCTTTAC  AATGGAGTTA  GAAGATGAGG  AAGAGGAAGC  TGGTGACGAT  840
841   GGTCAGGCAA  ATGATGGTGA  GCTTCCAAGC  ACGTTAACTC  TCAGGAATTT  AGGTAAAAAT  900
901   GTCACTGCTG  ACTTGCTGGA  TAGCTTGATG  ATACAATTTC  TCGAGCATCT  TGAAGCCTGT  960
961   GCGGACAAGA  AGCGTTTGAG  TGAGGTATTT  GAAACTCTTT  TATCTTCATT  CATGGCAACT  1020
1021  ATTTTGAACA  CGTACAAGTC  AAAGTTTTCT  CAGTTCACGA  TTTTCTATGC  CTGTGCACTT  1080
1081  GATCCTGAAA  ATTGTGGTGT  GAAATTTGCT  CAAACACTCG  TGGATTTGTT  CATATCTACT  1140
1141  TGCAACCCAC  CGGTTACGAG  GATGAGTGCT  GTGGCTTATC  TTTCTAGCTA  TTTGGCTCGT  1200
1201  GGGAAGTTTC  TATCTGCTGC  CTTCGTCATG  AACATGTTGA  AAAGGCTGGT  GGATTGGTGT  1260
1261  TTGAGATATT  GTGAAGAGCA  GGATAGTGAC  ATGAATCCAA  AAGCACATCA  AGTTTTCTAT  1320
1321  TCTGCATGCC  AGGGAATTAT  GTATGTGCTC  TGCTTTCATA  TGAAATCAAT  AATGAATGTT  1380
1381  CCTACCCTCA  AATCACAGCT  CCTCCTCATG  CCTATAGAGC  CAATATTGAA  GCACAAATTG  1440
1441  GGGCCATTGG  AGGTCTGCTT  GCCATCAATT  GTAAATGAGT  TTCTCAAACA  AGCTAAAGCA  1500
1501  GCACATCTGT  TCACCATCTC  CAAAGCATTC  ATCTTCGAAG  ATTTGCTGGA  ATCAGATCTT  1560
1561  TCTAGGGATT  TTGGTGGGCT  GGAGAGGCTG  GACATGTTCT  TCCCATTTGA  CCCATGTTTG  1620
1621  CTGAAGAAAT  GTGACAGAGG  TTTCATCCGG  CCAAACTTTA  TATACTGGAA  CCATGTCAAA  1680
1681  ACTACCTATG  ATGATGATGA  GGAAGACAGC  AGTGATGAAG  ACATTGCTGA  TGATTTTGGG  1740
1741  GTTCTGAATG  AAGAGAATTT  CATGGAAGAA  GGGATGGCAA  GGAGTTTTGA  TCAAGATATC  1800
1801  GATCTTGATG  AATTTGACTA  CGTCATGAAC  AAGATGTCCA  TCACACCTAA  GAACACGTCA  1860
1861  GGTTTCCACT  TTGGTGGTGA  ACGAATGCCT  TCAAAGATAA  GACCCTCAAC  AAGTCCAGAG  1920
1921  TCCTTGTGA  1929

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Mae-0665Manihot esculenta68.470.0 839
LLPS-Viv-0471Vitis vinifera60.430.0 717
LLPS-Thc-0296Theobroma cacao55.90.0 647
LLPS-Cus-0705Cucumis sativus55.470.0 657
LLPS-Dac-0962Daucus carota55.212e-90 288
LLPS-Gor-2171Gossypium raimondii55.20.0 659
LLPS-Hea-0940Helianthus annuus53.690.0 600
LLPS-Via-0542Vigna angularis53.560.0 598
LLPS-Glm-0352Glycine max53.270.0 631
LLPS-Phv-0819Phaseolus vulgaris52.760.0 603
LLPS-Vir-1323Vigna radiata52.060.0 578
LLPS-Prp-0725Prunus persica51.850.0 560
LLPS-Nia-1230Nicotiana attenuata51.220.0 551
LLPS-Arl-2754Arabidopsis lyrata50.720.0 536
LLPS-Met-0515Medicago truncatula50.310.0 554
LLPS-Sol-0488Solanum lycopersicum49.388e-173 513
LLPS-Art-0583Arabidopsis thaliana49.133e-174 517
LLPS-Coc-0492Corchorus capsularis49.032e-174 515
LLPS-Brr-0853Brassica rapa47.751e-150 455
LLPS-Bro-0734Brassica oleracea47.142e-159 478
LLPS-Brn-0718Brassica napus47.021e-156 471
LLPS-Sei-0095Setaria italica44.877e-109 342
LLPS-Amt-1194Amborella trichopoda44.243e-134 412
LLPS-Mua-0618Musa acuminata43.624e-152 461
LLPS-Org-0412Oryza glaberrima43.294e-152 461
LLPS-Ori-1504Oryza indica43.141e-151 459
LLPS-Ors-1551Oryza sativa43.142e-151 459
LLPS-Tra-1873Triticum aestivum42.951e-137 424
LLPS-Orbr-0062Oryza brachyantha42.91e-147 449
LLPS-Hov-0562Hordeum vulgare42.746e-131 406
LLPS-Brd-1093Brachypodium distachyon42.284e-140 429
LLPS-Tru-0266Triticum urartu41.864e-135 416
LLPS-Lep-1166Leersia perrieri41.651e-133 429
LLPS-Sob-0365Sorghum bicolor41.01e-128 400
LLPS-Orp-0192Oryza punctata40.245e-140 428
LLPS-Zem-0512Zea mays38.217e-121 381
LLPS-Orm-0889Oryza meridionalis38.111e-117 369
LLPS-Php-0627Physcomitrella patens37.467e-100 328
LLPS-Orni-0250Oryza nivara37.041e-116 366
LLPS-Sem-1862Selaginella moellendorffii36.72e-98 321
LLPS-Orb-2197Oryza barthii36.133e-110 349
LLPS-Orr-1365Oryza rufipogon35.981e-109 347
LLPS-Orgl-1166Oryza glumaepatula35.374e-102 328
LLPS-Poa-0899Pongo abelii33.168e-1990.9
LLPS-Chr-0380Chlamydomonas reinhardtii31.853e-40 161
LLPS-Pug-0715Puccinia graminis30.882e-0965.5
LLPS-Fia-1506Ficedula albicollis29.932e-23 109
LLPS-Scp-0919Schizosaccharomyces pombe29.923e-23 108
LLPS-Rhb-2349Rhinopithecus bieti29.749e-24 107
LLPS-Mup-0359Mustela putorius furo29.737e-23 107
LLPS-Pes-0907Pelodiscus sinensis29.721e-1894.0
LLPS-Cea-3451Cercocebus atys29.461e-21 103
LLPS-Tag-2945Taeniopygia guttata29.356e-23 107
LLPS-Scc-0081Schizosaccharomyces cryophilus28.937e-24 110
LLPS-Map-1227Magnaporthe poae28.91e-1688.2
LLPS-Miv-1200Microbotryum violaceum28.791e-1585.1
LLPS-Gag-0560Gaeumannomyces graminis28.621e-1894.4
LLPS-Lac-0043Latimeria chalumnae28.623e-2099.0
LLPS-Aso-1412Aspergillus oryzae28.163e-2099.4
LLPS-Asf-0789Aspergillus flavus28.162e-20 100
LLPS-Mao-1139Magnaporthe oryzae28.093e-1893.2
LLPS-Put-0665Puccinia triticina28.034e-1067.4
LLPS-Pytr-1022Pyrenophora triticirepentis28.015e-1892.4
LLPS-Yal-1057Yarrowia lipolytica27.925e-1995.5
LLPS-Scs-0312Sclerotinia sclerotiorum26.972e-1790.5
LLPS-Usm-0157Ustilago maydis26.93e-0964.7
LLPS-Leo-0186Lepisosteus oculatus26.882e-28 124
LLPS-Orl-1873Oryzias latipes26.783e-28 124
LLPS-Tum-1233Tuber melanosporum26.754e-21 102
LLPS-Drm-0277Drosophila melanogaster26.695e-1685.9
LLPS-Osl-0520Ostreococcus lucimarinus26.316e-35 145
LLPS-Mod-1645Monodelphis domestica26.221e-24 112
LLPS-Beb-0563Beauveria bassiana26.15e-1479.3
LLPS-Asm-0005Astyanax mexicanus26.076e-27 120
LLPS-Icp-2295Ictalurus punctatus25.963e-26 118
LLPS-Otg-0431Otolemur garnettii25.951e-24 113
LLPS-Lem-0482Leptosphaeria maculans25.725e-1789.4
LLPS-Pyt-0057Pyrenophora teres25.713e-1789.7
LLPS-Mel-0598Melampsora laricipopulina25.713e-2098.6
LLPS-Fud-0343Fukomys damarensis25.631e-26 119
LLPS-Sah-0672Sarcophilus harrisii25.558e-23 107
LLPS-Kop-0095Komagataella pastoris25.525e-1582.4
LLPS-Abg-0269Absidia glauca25.522e-21 102
LLPS-Nol-1955Nomascus leucogenys25.55e-26 117
LLPS-Dio-4010Dipodomys ordii25.499e-30 129
LLPS-Chs-2556Chlorocebus sabaeus25.412e-27 122
LLPS-Paa-0188Papio anubis25.322e-26 119
LLPS-Mal-1662Mandrillus leucophaeus25.322e-26 119
LLPS-Man-0070Macaca nemestrina25.321e-26 119
LLPS-Gaga-0166Gallus gallus25.272e-27 121
LLPS-Orc-0388Oryctolagus cuniculus25.232e-25 115
LLPS-Meg-1128Meleagris gallopavo25.221e-26 119
LLPS-Caf-0082Canis familiaris25.097e-25 114
LLPS-Dar-3396Danio rerio25.093e-25 115
LLPS-Gaa-0033Gasterosteus aculeatus25.048e-31 131
LLPS-Blg-0769Blumeria graminis24.962e-22 106
LLPS-Hos-0342Homo sapiens24.951e-26 119
LLPS-Pat-3919Pan troglodytes24.951e-26 119
LLPS-Fus-0024Fusarium solani24.924e-1479.7
LLPS-Scf-1682Scleropages formosus24.915e-29 126
LLPS-Loa-0729Loxodonta africana24.912e-25 115
LLPS-Cii-0310Ciona intestinalis24.94e-1582.8
LLPS-Urm-0630Ursus maritimus24.874e-27 120
LLPS-Pof-1970Poecilia formosa24.835e-27 120
LLPS-Ora-2279Ornithorhynchus anatinus24.788e-26 116
LLPS-Cap-0511Cavia porcellus24.785e-25 114
LLPS-Eqc-0780Equus caballus24.784e-24 111
LLPS-Anc-3288Anolis carolinensis24.789e-27 119
LLPS-Fec-4089Felis catus24.782e-26 119
LLPS-Maf-2064Macaca fascicularis24.776e-26 117
LLPS-Caj-1499Callithrix jacchus24.776e-27 120
LLPS-Mam-0877Macaca mulatta24.776e-26 117
LLPS-Fuv-1109Fusarium verticillioides24.753e-1377.0
LLPS-Fuo-0320Fusarium oxysporum24.753e-1377.0
LLPS-Mum-3222Mus musculus24.733e-23 108
LLPS-Ved-1172Verticillium dahliae24.626e-22 104
LLPS-Orn-0555Oreochromis niloticus24.61e-26 119
LLPS-Aon-0471Aotus nancymaae24.593e-26 118
LLPS-Aim-1825Ailuropoda melanoleuca24.562e-25 115
LLPS-Xim-1172Xiphophorus maculatus24.556e-32 135
LLPS-Bot-3483Bos taurus24.553e-24 111
LLPS-Anp-1242Anas platyrhynchos24.555e-25 114
LLPS-Asfu-0336Aspergillus fumigatus24.543e-21 102
LLPS-Nef-0583Neosartorya fischeri24.542e-21 103
LLPS-Myl-3739Myotis lucifugus24.516e-24 110
LLPS-Ova-1499Ovis aries24.423e-23 108
LLPS-Ict-1683Ictidomys tridecemlineatus24.427e-24 110
LLPS-Mea-0015Mesocricetus auratus24.415e-22 104
LLPS-Sus-1306Sus scrofa24.414e-23 108
LLPS-Ran-3822Rattus norvegicus24.281e-24 113
LLPS-Coo-1434Colletotrichum orbiculare24.272e-1480.9
LLPS-Asni-0137Aspergillus niger24.241e-21 103
LLPS-Cas-0402Carlito syrichta24.235e-25 114
LLPS-Cogr-0159Colletotrichum graminicola24.233e-1583.6
LLPS-Cog-0024Colletotrichum gloeosporioides24.235e-1479.3
LLPS-Tut-1018Tursiops truncatus24.197e-24 110
LLPS-Nec-1425Neurospora crassa24.161e-1481.6
LLPS-Ast-0548Aspergillus terreus24.031e-20 100
LLPS-Tar-0756Takifugu rubripes23.946e-24 110
LLPS-Scm-0481Scophthalmus maximus23.861e-26 119
LLPS-Ten-0472Tetraodon nigroviridis23.773e-22 105
LLPS-Trr-0187Trichoderma reesei23.775e-1892.4
LLPS-Cae-0609Caenorhabditis elegans23.742e-0655.1
LLPS-Asc-0608Aspergillus clavatus23.697e-22 104
LLPS-Xet-1444Xenopus tropicalis23.532e-26 119
LLPS-Trv-0285Trichoderma virens22.896e-1789.0
LLPS-Phn-0936Phaeosphaeria nodorum22.827e-2098.2
LLPS-Asn-0944Aspergillus nidulans22.72e-1996.7
LLPS-Sac-0517Saccharomyces cerevisiae22.686e-1066.6
LLPS-Scj-0518Schizosaccharomyces japonicus22.512e-22 105
LLPS-Cis-0887Ciona savignyi21.95e-1788.6
LLPS-Asg-0469Ashbya gossypii20.343e-1067.4
LLPS-Spr-0592Sporisorium reilianum20.313e-0861.2