• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Pot-0722
POPTR_009G106100

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: Uncharacterized protein
Gene Name: POPTR_009G106100
Ensembl Gene: POPTR_009G106100v3
Ensembl Protein: PNT20675
Organism: Populus trichocarpa
Taxa ID: 3694
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Stress granulePredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblPNT20675PNT20675
EnsemblPNT20674PNT20674
UniProtA0A2K1Z5W9, A0A2K1Z5W9_POPTR
GeneBankCM009298PNT20674.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MGPPSKNART  ISQEAFDELV  KENIEDLGMD  PTEALEDAIQ  TLTLQGVDLS  GIVTCVPGEG  60
61    NVRENPVIKC  LERLEELGFD  NNGSNEMAGL  FDQLAGLFSG  VEGSGNVAIG  VRNGGVELVC  120
121   SICSNIPIGS  EKVLVSALET  LALLIHDVQS  TETFRSSDGP  KMVVDILKDG  SESLDILNSG  180
181   FAVVAAAATS  NEVVKELFME  LKIDELILEA  LNRQSKGNIR  GLYDSIRVLL  TPDDNRVVAS  240
241   QVYGYARRFA  KIGIARALVE  SLRAGLTSPS  LVSASIALKA  VAVNDEICKS  ITESGGIDAI  300
301   LKFIDDSGEQ  GNKIVAKTCC  SLLSKLAGCD  SNKSAIVEKK  GMNKLIQLSA  RFSDDPPVLQ  360
361   EVMSVFTVLC  LRSPDNAARA  MEAGAGDLAI  QVMEKLSTVQ  QLQRNSCLMI  RNLVVRNPEN  420
421   RTTLLSHGIE  KFIRRAKVNH  ETCKDAATDA  LRDLGLDNYN  S  461
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGGCCCAC  CAAGCAAGAA  TGCCCGTACA  ATATCACAAG  AAGCTTTTGA  TGAACTAGTA  60
61    AAAGAGAACA  TAGAAGATCT  AGGTATGGAC  CCCACTGAAG  CCCTTGAAGA  TGCAATCCAG  120
121   ACTCTCACTC  TTCAAGGCGT  TGATCTCTCT  GGGATTGTGA  CTTGCGTACC  GGGAGAGGGT  180
181   AATGTGAGGG  AGAATCCAGT  CATTAAGTGT  TTGGAGAGAT  TGGAGGAATT  GGGATTTGAT  240
241   AATAATGGTT  CGAATGAGAT  GGCTGGGTTG  TTTGATCAGT  TGGCTGGATT  GTTTAGTGGT  300
301   GTTGAAGGAT  CTGGGAATGT  TGCAATTGGG  GTTAGAAATG  GTGGGGTGGA  ATTGGTTTGT  360
361   TCTATTTGTT  CTAACATTCC  TATTGGGTCT  GAGAAAGTTC  TTGTTTCAGC  TTTGGAAACG  420
421   CTGGCATTGT  TGATTCATGA  TGTTCAAAGT  ACCGAAACCT  TTCGGTCTAG  TGATGGACCA  480
481   AAAATGGTGG  TTGATATTTT  AAAAGACGGG  AGTGAAAGTT  TAGACATCCT  GAATAGTGGG  540
541   TTTGCTGTTG  TTGCTGCAGC  GGCAACTAGC  AACGAGGTTG  TGAAAGAGTT  GTTTATGGAA  600
601   TTGAAAATTG  ATGAGCTTAT  TTTGGAAGCA  CTGAATAGAC  AGAGTAAAGG  CAACATCCGA  660
661   GGTCTATATG  ATTCTATACG  TGTTCTCTTG  ACACCTGATG  ATAATCGTGT  TGTGGCATCC  720
721   CAAGTTTATG  GTTATGCACG  GAGATTTGCC  AAAATTGGAA  TTGCAAGAGC  TCTTGTGGAA  780
781   TCACTACGGG  CAGGGCTTAC  CTCACCCAGT  TTAGTCTCAG  CAAGCATCGC  TTTAAAGGCT  840
841   GTTGCTGTTA  ATGATGAAAT  ATGCAAATCC  ATCACTGAAA  GTGGTGGTAT  CGATGCCATT  900
901   CTGAAATTTA  TAGATGACAG  TGGTGAACAA  GGCAACAAAA  TTGTAGCTAA  AACTTGCTGT  960
961   TCTTTGTTAT  CCAAGTTGGC  AGGATGTGAT  TCAAATAAAA  GTGCTATTGT  AGAGAAGAAG  1020
1021  GGTATGAACA  AGCTAATCCA  ACTCTCAGCC  AGATTTTCTG  ATGACCCCCC  TGTTCTGCAA  1080
1081  GAGGTTATGT  CTGTCTTTAC  GGTGCTCTGT  TTAAGATCTC  CAGACAATGC  AGCCCGTGCC  1140
1141  ATGGAAGCCG  GAGCTGGAGA  CCTTGCCATC  CAAGTCATGG  AGAAGCTTTC  TACTGTGCAA  1200
1201  CAATTACAGA  GGAATTCCTG  TCTAATGATC  CGTAATCTTG  TTGTGAGGAA  CCCGGAGAAC  1260
1261  AGAACTACTC  TTCTTAGTCA  TGGCATCGAG  AAATTTATAA  GAAGGGCAAA  GGTAAACCAC  1320
1321  GAAACATGCA  AGGATGCTGC  CACCGATGCT  CTGAGGGATT  TGGGCCTTGA  TAACTACAAT  1380
1381  TCATAG  1386

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Mae-2585Manihot esculenta77.090.0 712
LLPS-Viv-1327Vitis vinifera72.270.0 653
LLPS-Thc-1623Theobroma cacao71.550.0 663
LLPS-Gor-0266Gossypium raimondii70.320.0 657
LLPS-Prp-1327Prunus persica69.480.0 636
LLPS-Coc-0398Corchorus capsularis69.430.0 595
LLPS-Brn-1581Brassica napus68.350.0 615
LLPS-Cus-1430Cucumis sativus67.960.0 614
LLPS-Brr-2537Brassica rapa67.910.0 610
LLPS-Nia-1118Nicotiana attenuata67.670.0 612
LLPS-Bro-2671Brassica oleracea67.620.0 598
LLPS-Sot-0944Solanum tuberosum66.810.0 598
LLPS-Art-2245Arabidopsis thaliana66.590.0 576
LLPS-Vir-1587Vigna radiata66.561e-140 416
LLPS-Sol-2498Solanum lycopersicum66.090.0 588
LLPS-Dac-0754Daucus carota66.042e-135 400
LLPS-Met-0059Medicago truncatula66.020.0 607
LLPS-Phv-2105Phaseolus vulgaris65.720.0 564
LLPS-Glm-1751Glycine max64.510.0 521
LLPS-Via-2019Vigna angularis63.315e-168 487
LLPS-Mua-0146Musa acuminata62.530.0 562
LLPS-Hea-2182Helianthus annuus61.80.0 552
LLPS-Arl-1344Arabidopsis lyrata60.390.0 531
LLPS-Sob-1202Sorghum bicolor58.820.0 548
LLPS-Sei-1045Setaria italica58.660.0 542
LLPS-Orp-1192Oryza punctata58.570.0 533
LLPS-Orbr-1941Oryza brachyantha58.530.0 542
LLPS-Lep-2286Leersia perrieri58.130.0 528
LLPS-Tra-1033Triticum aestivum57.330.0 522
LLPS-Orr-1254Oryza rufipogon57.020.0 528
LLPS-Orm-1930Oryza meridionalis57.020.0 529
LLPS-Ors-1425Oryza sativa57.020.0 528
LLPS-Orgl-0070Oryza glumaepatula57.020.0 528
LLPS-Ori-1693Oryza indica57.020.0 526
LLPS-Hov-2067Hordeum vulgare56.894e-179 518
LLPS-Org-0191Oryza glaberrima56.80.0 528
LLPS-Orni-0299Oryza nivara56.80.0 524
LLPS-Orb-0846Oryza barthii56.80.0 527
LLPS-Brd-1287Brachypodium distachyon56.435e-177 511
LLPS-Ora-2859Ornithorhynchus anatinus56.254e-0855.5
LLPS-Amt-2281Amborella trichopoda55.355e-173 502
LLPS-Zem-1968Zea mays53.161e-174 506
LLPS-Sem-1050Selaginella moellendorffii40.33e-94 298
LLPS-Cis-0957Ciona savignyi39.331e-0859.7
LLPS-Dio-3469Dipodomys ordii38.891e-0755.1
LLPS-Php-1984Physcomitrella patens36.684e-86 279
LLPS-Chr-0993Chlamydomonas reinhardtii34.169e-28 119
LLPS-Sah-0886Sarcophilus harrisii28.692e-42 162
LLPS-Meg-3157Meleagris gallopavo28.575e-41 157
LLPS-Gaga-0637Gallus gallus28.213e-40 155
LLPS-Pof-3694Poecilia formosa28.172e-37 147
LLPS-Tar-0825Takifugu rubripes27.776e-38 149
LLPS-Mod-4320Monodelphis domestica27.683e-40 155
LLPS-Orn-2978Oreochromis niloticus27.672e-37 147
LLPS-Icp-3057Ictalurus punctatus27.672e-35 141
LLPS-Anp-0719Anas platyrhynchos27.644e-38 149
LLPS-Dar-4126Danio rerio27.438e-32 130
LLPS-Xim-2312Xiphophorus maculatus27.334e-35 140
LLPS-Caf-2853Canis familiaris27.166e-41 157
LLPS-Sus-3685Sus scrofa27.02e-42 162
LLPS-Orl-2618Oryzias latipes26.92e-38 150
LLPS-Ova-2054Ovis aries26.885e-35 140
LLPS-Cas-1917Carlito syrichta26.872e-38 150
LLPS-Caj-2766Callithrix jacchus26.812e-40 156
LLPS-Tag-2656Taeniopygia guttata26.671e-1582.4
LLPS-Scm-2552Scophthalmus maximus26.574e-32 131
LLPS-Ten-3132Tetraodon nigroviridis26.512e-35 141
LLPS-Orc-3667Oryctolagus cuniculus26.52e-21 100
LLPS-Ict-1468Ictidomys tridecemlineatus26.462e-35 141
LLPS-Gaa-2197Gasterosteus aculeatus26.362e-35 141
LLPS-Otg-0178Otolemur garnettii26.352e-36 144
LLPS-Mea-3846Mesocricetus auratus26.356e-31 128
LLPS-Eqc-3875Equus caballus26.32e-37 147
LLPS-Asm-1727Astyanax mexicanus26.251e-31 130
LLPS-Pes-3151Pelodiscus sinensis26.163e-38 150
LLPS-Ran-3101Rattus norvegicus26.145e-32 131
LLPS-Mum-4162Mus musculus26.142e-32 132
LLPS-Aon-2320Aotus nancymaae26.128e-39 151
LLPS-Loa-3328Loxodonta africana26.092e-29 123
LLPS-Leo-1424Lepisosteus oculatus26.082e-31 129
LLPS-Cii-1360Ciona intestinalis26.072e-30 127
LLPS-Nol-1539Nomascus leucogenys26.015e-39 152
LLPS-Rhb-1227Rhinopithecus bieti25.941e-37 148
LLPS-Aim-0791Ailuropoda melanoleuca25.893e-37 147
LLPS-Myl-0845Myotis lucifugus25.853e-35 141
LLPS-Fia-1500Ficedula albicollis25.817e-22 101
LLPS-Mal-0866Mandrillus leucophaeus25.732e-36 145
LLPS-Cea-2085Cercocebus atys25.731e-36 145
LLPS-Cap-2873Cavia porcellus25.715e-36 143
LLPS-Scf-0670Scleropages formosus25.669e-33 133
LLPS-Mam-4096Macaca mulatta25.642e-37 148
LLPS-Man-3668Macaca nemestrina25.642e-37 147
LLPS-Paa-4436Papio anubis25.641e-37 148
LLPS-Tut-0663Tursiops truncatus25.591e-37 148
LLPS-Fec-2137Felis catus25.545e-38 149
LLPS-Poa-1372Pongo abelii25.535e-37 146
LLPS-Maf-4811Macaca fascicularis25.536e-37 146
LLPS-Chs-2943Chlorocebus sabaeus25.485e-37 146
LLPS-Drm-2178Drosophila melanogaster25.447e-28 119
LLPS-Pap-3653Pan paniscus25.321e-37 148
LLPS-Pat-2899Pan troglodytes25.321e-37 148
LLPS-Hos-1824Homo sapiens25.329e-38 148
LLPS-Gog-3929Gorilla gorilla25.321e-37 148
LLPS-Lac-0734Latimeria chalumnae25.229e-32 130
LLPS-Bot-4829Bos taurus25.09e-25 110
LLPS-Xet-1853Xenopus tropicalis24.188e-31 127
LLPS-Fud-3889Fukomys damarensis24.149e-22 101
LLPS-Osl-0857Ostreococcus lucimarinus22.046e-1065.5