• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Php-0753
PHYPA_016064

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: Structural maintenance of chromosomes protein
Gene Name: PHYPA_016064
Ensembl Gene: Pp3c12_10030
Ensembl Protein: Pp3c12_10030V3.1
Organism: Physcomitrella patens
Taxa ID: 3218
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Nucleolus, Centrosome/Spindle pole body, P-bodyPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MPAPVNPGRI  ERLEIENFKS  YKGHQIVGPF  KNFTAIIGPN  GAGKSNLMDA  ISFVLGVRSM  60
61    QLRGAQLKDL  LYAYDDKDRE  QKGRKAFVKL  VFITGSGEEM  EFTRTITSSG  SSEYRINNKT  120
121   VAWDVYNSTM  KTLGILVKAR  NFLVFQGDVE  SIASKNPKEL  TALFEQISGS  EELKKDYEEL  180
181   EVQKARAEET  TVFMYQKRKT  VAAERKQKKE  QKEEAEKHLR  LQGELKELKT  EYCLWQLFNI  240
241   EKDVASTLAQ  LQRERATLQE  LYHEQEQLEA  EIKAKKMDQA  VLIKESLLLD  KKSSKKKMEL  300
301   DKKSPELLKL  KEEITRLSQK  IRNCEKDLEK  KKEDKRKQGS  QIENLQRSLR  DVTQAMNELI  360
361   AQQDREGGER  LHLAESQMLE  YHRIKEEAGT  RTAKLRQEKE  VQDRHLQADV  EALKNLEENL  420
421   RQLTERDQQL  QSQEEQTLSR  LSRCNEAFTK  HDEELRVAQK  ELADMQDRHR  KSRTRSESLR  480
481   AKLDEIDNQL  RELKADKREN  ERDKRIAEAV  ASLKRLFPGV  HGRMTDLCRP  TQKKYNLAVT  540
541   VAMGRYMDAV  VVEDDSTGKE  CIKYLKEHRL  QPQTFIPLQS  VRVKPVHEKL  RALGGSAKLV  600
601   AVLYAVGNTL  VCDQLDEAKR  LAWGSERHKV  VTHDGILLAK  SGTMTGGVSG  GMESRSQKWD  660
661   NQAVEALKRS  KERFENEMAE  LGSARDQSGR  ESEAAGRISG  LERKIHYASS  EKKSIEEKLT  720
721   RLAQERATNR  AHIEEQRPEI  IQLQNAIANK  SREVAELENH  INNIIDRIYK  DFSASVGVAN  780
781   IREYEENQLR  AAQETAERKM  SLTSQISKLR  NQLEYEQRKD  YDGPIRKMSD  TLNALRDELV  840
841   KVENRETQVK  AEMEELSEQI  EKFREDTLDL  RSRADAIEEE  IQDLKKRGSD  DTTSLGNVKR  900
901   QLTAKETHIE  QLNARKQEIV  ESCELDQIKL  PTIGIDSSGP  TQQTPTNVTF  DFSKLSRIHQ  960
961   QDLRPSEKER  MELEFKGKLE  TLSMEIVRTA  PNLKALDQYE  SLREKERWFN  EEFDAARRAG  1020
1021  KEVADKYNAV  KQQRYDKFMD  AFNHISVNIN  AIYKQLTQST  THPLGGTAYL  SLESEDEPYL  1080
1081  HGIKYTAMPP  TKRFRDMEQL  SGGEKTVAAL  ALLFAIHSFR  PSPFFVLDEV  DAALDNLNVA  1140
1141  KVAAYIRAKS  RPEVKDGDGG  KGIGFQSVVI  SLKDTFYDKA  DALIGVYRDQ  SCSKTLTFDL  1200
1201  GKYGGL  1206
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGCCCGCTC  CGGTAAATCC  AGGTAGGATT  GAAAGGCTTG  AAATAGAAAA  TTTCAAGTCT  60
61    TATAAGGGTC  ATCAAATCGT  CGGCCCATTC  AAGAATTTTA  CAGCCATTAT  CGGGCCAAAT  120
121   GGAGCTGGAA  AGTCCAACCT  CATGGATGCC  ATTAGTTTTG  TCCTTGGAGT  TCGCTCCATG  180
181   CAGCTACGAG  GTGCGCAGCT  TAAAGATTTG  CTGTACGCAT  ATGACGATAA  AGACAGGGAA  240
241   CAAAAGGGGA  GGAAAGCTTT  TGTGAAGCTA  GTTTTTATTA  CAGGAAGTGG  GGAGGAAATG  300
301   GAATTTACAA  GAACGATCAC  GAGCAGTGGT  TCCAGCGAAT  ACCGCATCAA  TAACAAAACT  360
361   GTTGCATGGG  ACGTCTACAA  CAGCACGATG  AAGACTCTTG  GAATCCTTGT  GAAGGCCCGA  420
421   AACTTTCTTG  TTTTCCAGGG  AGATGTTGAA  TCTATCGCAT  CCAAGAATCC  TAAGGAGTTG  480
481   ACAGCGCTCT  TTGAGCAGAT  TTCTGGCTCA  GAAGAGTTGA  AGAAGGACTA  TGAAGAGTTG  540
541   GAGGTCCAAA  AGGCACGTGC  AGAAGAGACA  ACAGTCTTTA  TGTATCAGAA  AAGAAAGACT  600
601   GTGGCTGCTG  AGAGAAAGCA  GAAGAAAGAA  CAAAAAGAGG  AAGCTGAAAA  GCACCTTCGA  660
661   CTCCAGGGGG  AGCTGAAAGA  GCTGAAGACT  GAGTACTGCC  TGTGGCAACT  GTTCAACATT  720
721   GAGAAAGATG  TGGCGAGCAC  CTTGGCACAG  CTTCAAAGGG  AGAGAGCAAC  TCTGCAGGAG  780
781   CTCTATCATG  AGCAAGAACA  GCTTGAAGCA  GAAATCAAAG  CTAAGAAGAT  GGATCAGGCA  840
841   GTGCTTATTA  AGGAATCCCT  TTTGCTCGAC  AAGAAAAGTT  CTAAAAAGAA  AATGGAATTA  900
901   GATAAGAAGA  GCCCAGAGCT  ACTCAAGTTA  AAAGAAGAGA  TCACTCGGTT  GTCACAAAAG  960
961   ATCAGGAATT  GTGAAAAAGA  CTTGGAAAAG  AAAAAAGAAG  ACAAGCGAAA  GCAGGGGAGT  1020
1021  CAAATTGAAA  ATCTGCAGCG  TAGCCTACGG  GATGTTACGC  AGGCCATGAA  CGAGCTCATC  1080
1081  GCACAACAAG  ACCGAGAAGG  TGGAGAGCGT  TTGCATCTTG  CGGAGAGCCA  AATGTTAGAG  1140
1141  TACCACCGAA  TCAAGGAGGA  AGCAGGCACA  AGAACCGCGA  AGCTGAGGCA  AGAGAAGGAA  1200
1201  GTCCAAGATC  GGCACCTTCA  AGCTGATGTA  GAAGCTCTAA  AAAATCTCGA  GGAGAACCTC  1260
1261  CGGCAACTAA  CAGAACGAGA  TCAGCAGCTT  CAATCTCAGG  AGGAGCAAAC  GCTGTCTCGC  1320
1321  TTGAGCAGGT  GCAATGAGGC  ATTCACCAAA  CATGATGAGG  AGCTTCGTGT  GGCTCAGAAA  1380
1381  GAACTTGCGG  ACATGCAGGA  CAGACATCGG  AAGTCCAGGA  CTCGCTCTGA  AAGCTTGAGA  1440
1441  GCTAAATTGG  ATGAGATTGA  CAATCAACTT  CGAGAGCTGA  AGGCTGATAA  GAGAGAGAAT  1500
1501  GAGAGAGACA  AGAGGATTGC  AGAGGCCGTT  GCTAGTCTGA  AGCGCTTGTT  TCCTGGTGTA  1560
1561  CATGGGCGCA  TGACGGATCT  TTGCAGGCCC  ACACAGAAAA  AATACAATCT  GGCTGTCACT  1620
1621  GTGGCTATGG  GCAGGTACAT  GGATGCGGTT  GTAGTTGAGG  ATGACAGTAC  TGGAAAGGAG  1680
1681  TGTATCAAGT  ATCTGAAGGA  GCATCGGTTA  CAACCACAAA  CTTTCATTCC  TTTGCAGTCA  1740
1741  GTTAGAGTTA  AGCCTGTCCA  TGAAAAGCTG  CGAGCCCTTG  GTGGGTCGGC  AAAGCTGGTA  1800
1801  GCAGTTCTTT  ACGCAGTCGG  AAATACTTTG  GTATGCGATC  AGCTGGATGA  AGCTAAGAGA  1860
1861  CTTGCTTGGG  GCAGTGAGCG  GCACAAAGTT  GTTACGCACG  ACGGTATCCT  TCTAGCGAAG  1920
1921  TCGGGCACAA  TGACTGGAGG  TGTTAGTGGA  GGCATGGAAT  CAAGATCCCA  GAAATGGGAT  1980
1981  AACCAAGCAG  TCGAAGCGCT  CAAGAGGAGT  AAGGAACGCT  TTGAGAATGA  GATGGCAGAG  2040
2041  CTTGGATCAG  CTAGGGATCA  GTCAGGGAGG  GAGTCTGAAG  CAGCTGGTAG  GATTAGTGGT  2100
2101  CTGGAAAGAA  AGATTCACTA  TGCCAGTAGT  GAGAAGAAAT  CTATTGAAGA  GAAGCTGACA  2160
2161  AGGCTTGCGC  AAGAGCGTGC  CACTAACAGG  GCTCATATAG  AGGAACAAAG  GCCTGAGATA  2220
2221  ATTCAGCTTC  AGAATGCTAT  AGCCAACAAG  AGCAGAGAGG  TTGCCGAACT  TGAAAATCAC  2280
2281  ATCAACAACA  TTATCGATCG  AATCTACAAA  GATTTCAGTG  CGTCAGTAGG  CGTTGCAAAT  2340
2341  ATACGAGAAT  ATGAAGAAAA  CCAGCTCCGT  GCTGCCCAAG  AGACTGCTGA  GCGAAAAATG  2400
2401  AGTCTTACCA  GTCAGATTTC  AAAACTCAGG  AACCAGTTGG  AGTACGAACA  GAGGAAAGAT  2460
2461  TACGATGGAC  CAATAAGGAA  GATGTCGGAC  ACTTTGAATG  CTTTGCGAGA  TGAGCTCGTG  2520
2521  AAAGTTGAAA  ATAGAGAAAC  GCAAGTCAAA  GCAGAAATGG  AGGAGCTTTC  TGAACAAATT  2580
2581  GAGAAATTCA  GAGAAGATAC  ATTAGACCTC  AGAAGTAGAG  CAGACGCTAT  TGAAGAGGAG  2640
2641  ATTCAGGATC  TGAAAAAGCG  AGGAAGCGAC  GATACCACCA  GTCTTGGAAA  TGTTAAGCGG  2700
2701  CAATTGACAG  CCAAGGAAAC  CCATATTGAG  CAATTGAATG  CGAGGAAACA  AGAAATCGTT  2760
2761  GAGAGCTGTG  AGCTTGATCA  GATCAAGCTA  CCTACAATTG  GCATTGATTC  TTCTGGACCT  2820
2821  ACTCAACAGA  CACCGACAAA  TGTAACTTTT  GATTTTTCCA  AGCTCAGCAG  GATACACCAA  2880
2881  CAGGACTTGA  GACCGTCAGA  GAAAGAAAGG  ATGGAATTAG  AATTTAAGGG  TAAGTTGGAA  2940
2941  ACTCTATCAA  TGGAAATTGT  GAGAACAGCT  CCAAACCTGA  AGGCGTTAGA  TCAATACGAA  3000
3001  AGTCTACGTG  AGAAGGAGAG  ATGGTTCAAT  GAAGAATTTG  ATGCTGCACG  AAGGGCTGGG  3060
3061  AAGGAGGTTG  CAGACAAATA  CAACGCGGTG  AAGCAACAGA  GATATGATAA  GTTCATGGAT  3120
3121  GCGTTCAACC  ACATCTCCGT  AAACATTAAT  GCAATATACA  AACAGCTGAC  TCAAAGCACC  3180
3181  ACTCATCCAT  TGGGTGGAAC  AGCGTACTTG  AGTTTAGAGA  GTGAGGATGA  GCCTTATCTG  3240
3241  CATGGGATTA  AGTACACAGC  CATGCCTCCC  ACTAAGCGTT  TTCGGGATAT  GGAACAACTT  3300
3301  TCCGGAGGAG  AGAAAACTGT  GGCTGCCCTT  GCCCTCCTCT  TCGCTATTCA  CAGCTTCCGG  3360
3361  CCATCCCCCT  TCTTTGTTCT  TGACGAGGTT  GATGCTGCTT  TAGACAATCT  AAATGTAGCC  3420
3421  AAAGTTGCAG  CCTACATACG  TGCCAAATCA  CGTCCAGAGG  TCAAGGACGG  TGATGGCGGG  3480
3481  AAAGGAATAG  GCTTTCAAAG  TGTGGTTATT  TCACTAAAAG  ACACATTCTA  TGATAAAGCC  3540
3541  GATGCTTTAA  TTGGTGTTTA  TCGAGATCAA  AGTTGTTCCA  AAACGCTGAC  GTTCGACTTA  3600
3601  GGAAAATACG  GCGGTTTATA  A  3621

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Eqc-2959Equus caballus71.053e-0965.9
LLPS-Sem-1593Selaginella moellendorffii65.460.01436
LLPS-Tru-0373Triticum urartu62.722e-135 426
LLPS-Ors-1539Oryza sativa61.110.0 590
LLPS-Thc-0609Theobroma cacao60.610.01298
LLPS-Sei-1548Setaria italica60.363e-170 523
LLPS-Nia-0684Nicotiana attenuata60.180.01262
LLPS-Prp-0337Prunus persica60.170.0 584
LLPS-Sol-0083Solanum lycopersicum60.10.01242
LLPS-Amt-1298Amborella trichopoda59.966e-166 512
LLPS-Cus-1044Cucumis sativus59.870.0 687
LLPS-Mua-1907Musa acuminata59.850.01310
LLPS-Viv-0587Vitis vinifera59.781e-124 402
LLPS-Mae-0571Manihot esculenta59.450.01280
LLPS-Phv-0787Phaseolus vulgaris59.440.0 796
LLPS-Orr-0830Oryza rufipogon58.970.01237
LLPS-Orni-0022Oryza nivara58.970.01237
LLPS-Tra-2177Triticum aestivum58.90.01244
LLPS-Orgl-0056Oryza glumaepatula58.890.01236
LLPS-Dac-1072Daucus carota58.780.01233
LLPS-Gor-1099Gossypium raimondii58.750.01254
LLPS-Brd-0921Brachypodium distachyon58.720.01253
LLPS-Orbr-0561Oryza brachyantha58.710.01241
LLPS-Hov-0809Hordeum vulgare58.660.01238
LLPS-Sob-1140Sorghum bicolor58.530.01243
LLPS-Zem-0331Zea mays58.470.01218
LLPS-Glm-0789Glycine max58.250.01229
LLPS-Met-0680Medicago truncatula58.180.01215
LLPS-Lep-0643Leersia perrieri58.010.01189
LLPS-Pot-0166Populus trichocarpa57.550.01233
LLPS-Ori-1784Oryza indica57.440.01229
LLPS-Hea-2249Helianthus annuus57.310.01186
LLPS-Bro-2223Brassica oleracea56.880.01204
LLPS-Via-1817Vigna angularis56.730.01162
LLPS-Coc-0839Corchorus capsularis56.530.01205
LLPS-Orp-0196Oryza punctata56.460.01127
LLPS-Vir-0395Vigna radiata56.441e-170 546
LLPS-Brr-1625Brassica rapa56.050.01198
LLPS-Art-2078Arabidopsis thaliana55.640.01202
LLPS-Arl-1079Arabidopsis lyrata55.060.01133
LLPS-Brn-3395Brassica napus54.850.01140
LLPS-Ten-0817Tetraodon nigroviridis53.596e-53 207
LLPS-Scf-0371Scleropages formosus53.592e-52 206
LLPS-Tar-0654Takifugu rubripes53.596e-53 207
LLPS-Chc-0307Chondrus crispus53.311e-61 235
LLPS-Scm-0695Scophthalmus maximus53.167e-52 204
LLPS-Gaa-3294Gasterosteus aculeatus53.165e-52 204
LLPS-Pof-2827Poecilia formosa52.741e-51 203
LLPS-Dar-0197Danio rerio52.746e-52 204
LLPS-Orn-0516Oreochromis niloticus52.742e-51 202
LLPS-Xim-1251Xiphophorus maculatus52.741e-51 203
LLPS-Orl-1252Oryzias latipes52.743e-51 202
LLPS-Icp-1963Ictalurus punctatus52.743e-51 202
LLPS-Asm-1214Astyanax mexicanus51.92e-50 199
LLPS-Lac-0664Latimeria chalumnae51.483e-52 205
LLPS-Xet-0807Xenopus tropicalis51.052e-51 202
LLPS-Dio-0186Dipodomys ordii51.052e-51 201
LLPS-Nol-2416Nomascus leucogenys50.439e-50 197
LLPS-Put-0009Puccinia triticina50.01e-39 164
LLPS-Cii-1711Ciona intestinalis50.02e-45 169
LLPS-Gog-2009Gorilla gorilla50.02e-55 214
LLPS-Mam-1775Macaca mulatta49.798e-51 201
LLPS-Cap-2787Cavia porcellus49.799e-51 200
LLPS-Caf-0161Canis familiaris49.798e-51 200
LLPS-Ict-1175Ictidomys tridecemlineatus49.798e-51 200
LLPS-Anc-0614Anolis carolinensis49.795e-51 201
LLPS-Cas-0901Carlito syrichta49.797e-51 201
LLPS-Man-0832Macaca nemestrina49.798e-51 201
LLPS-Fec-0838Felis catus49.798e-51 200
LLPS-Pat-0463Pan troglodytes49.798e-51 201
LLPS-Pap-0106Pan paniscus49.798e-51 201
LLPS-Hos-1789Homo sapiens49.798e-51 201
LLPS-Rhb-1364Rhinopithecus bieti49.798e-51 201
LLPS-Otg-0514Otolemur garnettii49.797e-51 201
LLPS-Bot-4533Bos taurus49.798e-51 200
LLPS-Tut-0173Tursiops truncatus49.798e-51 200
LLPS-Mup-0490Mustela putorius furo49.798e-51 200
LLPS-Aim-1238Ailuropoda melanoleuca49.798e-51 200
LLPS-Ova-0472Ovis aries49.798e-51 200
LLPS-Myl-0326Myotis lucifugus49.798e-51 200
LLPS-Mal-0427Mandrillus leucophaeus49.798e-51 201
LLPS-Paa-1470Papio anubis49.797e-51 201
LLPS-Ran-0243Rattus norvegicus49.798e-51 200
LLPS-Sah-1566Sarcophilus harrisii49.793e-50 199
LLPS-Cea-2930Cercocebus atys49.798e-51 201
LLPS-Aon-2713Aotus nancymaae49.798e-51 201
LLPS-Sus-3152Sus scrofa49.791e-50 200
LLPS-Mea-2027Mesocricetus auratus49.798e-51 200
LLPS-Maf-1949Macaca fascicularis49.798e-51 201
LLPS-Mum-2394Mus musculus49.798e-51 200
LLPS-Caj-2881Callithrix jacchus49.798e-51 201
LLPS-Fud-0092Fukomys damarensis49.798e-51 201
LLPS-Mel-0136Melampsora laricipopulina49.64e-48 192
LLPS-Loa-0324Loxodonta africana49.582e-49 196
LLPS-Usm-0306Ustilago maydis48.613e-55 214
LLPS-Cis-0837Ciona savignyi48.512e-46 187
LLPS-Spr-0552Sporisorium reilianum48.251e-53 209
LLPS-Ora-2143Ornithorhynchus anatinus48.029e-35 146
LLPS-Pug-0520Puccinia graminis46.691e-47 190
LLPS-Scp-1335Schizosaccharomyces pombe46.487e-54 210
LLPS-Chs-2762Chlorocebus sabaeus45.929e-0860.8
LLPS-Poa-1438Pongo abelii45.777e-32 139
LLPS-Phn-0955Phaeosphaeria nodorum45.756e-23 110
LLPS-Leo-2285Lepisosteus oculatus45.411e-36 155
LLPS-Scc-0276Schizosaccharomyces cryophilus45.065e-51 201
LLPS-Yal-0231Yarrowia lipolytica44.942e-42 173
LLPS-Gaga-2526Gallus gallus44.083e-40 167
LLPS-Sac-0208Saccharomyces cerevisiae44.02e-32 141
LLPS-Lem-0356Leptosphaeria maculans43.873e-39 163
LLPS-Pyt-0656Pyrenophora teres43.752e-37 157
LLPS-Miv-0070Microbotryum violaceum43.684e-45 182
LLPS-Kop-0491Komagataella pastoris43.668e-38 159
LLPS-Urm-0314Ursus maritimus43.242e-33 144
LLPS-Pytr-0668Pyrenophora triticirepentis42.242e-36 154
LLPS-Cog-0213Colletotrichum gloeosporioides42.165e-43 176
LLPS-Ved-0062Verticillium dahliae42.057e-41 168
LLPS-Cae-0042Caenorhabditis elegans42.05e-42 172
LLPS-Asg-0075Ashbya gossypii41.428e-43 175
LLPS-Coo-0231Colletotrichum orbiculare41.043e-42 173
LLPS-Osl-0241Ostreococcus lucimarinus40.780.0 782
LLPS-Gag-0005Gaeumannomyces graminis40.32e-41 171
LLPS-Cogr-0922Colletotrichum graminicola40.159e-44 178
LLPS-Map-0737Magnaporthe poae39.937e-42 172
LLPS-Orc-4069Oryctolagus cuniculus38.22e-64 228
LLPS-Gas-0459Galdieria sulphuraria37.831e-30 135
LLPS-Cym-0613Cyanidioschyzon merolae37.43e-36 154
LLPS-Mod-0190Monodelphis domestica35.715e-1481.6
LLPS-Tum-0870Tuber melanosporum35.370.0 644
LLPS-Asn-0083Aspergillus nidulans34.70.0 612
LLPS-Abg-0115Absidia glauca34.610.0 611
LLPS-Nef-1308Neosartorya fischeri34.340.0 614
LLPS-Asc-0411Aspergillus clavatus34.340.0 614
LLPS-Drm-0534Drosophila melanogaster34.070.0 584
LLPS-Asfu-0451Aspergillus fumigatus34.060.0 608
LLPS-Scj-0813Schizosaccharomyces japonicus33.830.0 611
LLPS-Aso-0208Aspergillus oryzae33.620.0 592
LLPS-Fuo-1046Fusarium oxysporum33.230.0 577
LLPS-Scs-0725Sclerotinia sclerotiorum33.20.0 591
LLPS-Fuv-0279Fusarium verticillioides33.070.0 575
LLPS-Ast-0112Aspergillus terreus32.994e-171 546
LLPS-Pes-2697Pelodiscus sinensis32.952e-67 246
LLPS-Anp-0850Anas platyrhynchos32.911e-160 519
LLPS-Beb-1002Beauveria bassiana32.840.0 586
LLPS-Crn-0152Cryptococcus neoformans32.831e-172 551
LLPS-Nec-0852Neurospora crassa32.791e-177 565
LLPS-Asf-0599Aspergillus flavus32.722e-169 543
LLPS-Trv-0096Trichoderma virens32.680.0 591
LLPS-Tag-0999Taeniopygia guttata32.082e-163 526
LLPS-Fia-1495Ficedula albicollis31.975e-156 506
LLPS-Blg-0220Blumeria graminis31.692e-166 535
LLPS-Meg-1907Meleagris gallopavo31.591e-152 498
LLPS-Mao-0665Magnaporthe oryzae30.72e-160 519
LLPS-Dos-0628Dothistroma septosporum29.578e-1894.0