• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Pes-2962
RFC1

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: Replication factor C subunit 1
Gene Name: RFC1
Ensembl Gene: ENSPSIG00000008430.1
Ensembl Protein: ENSPSIP00000009485.1
Organism: Pelodiscus sinensis
Taxa ID: 13735
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     QDIRKFFEVV  STGKKHEGET  VKKSEKTKNG  EDTSNRKKKT  KEIKVKSSTN  EDDTKRKQTN  60
61    KKKRIIYDSD  SDEERQSVKK  SKKPSEREPS  SSKPVKVLKK  DPVYVSETDD  EDDFINKKTS  120
121   QKPKENGTSA  SSCPGTAGAR  KEDAKPQAGS  KPLSPVKLTP  TSVFDYFGTS  SVQRSEKKLV  180
181   ASKRKELSHS  RDSLLEDEAI  AKQLQLEEDV  ELERQLHEDE  EFARTLAMLD  ETPKKKKARK  240
241   DPEDKQIIST  TKTSSNTMEK  NKQSKKRITS  NSTEDTKTNN  EKEQAKSENT  RASCSHPETS  300
301   VSKAMELMNK  TLPLKPSSKL  VALKQKEESN  KKGREIPSAA  TKEKITSEKE  EKRTPKKQKI  360
361   SPQKPESFSP  EDSEKKRVNY  QAYRSFLNRE  GPKALGSKDI  PQGAENCLEG  LTFVITGVLE  420
421   SIERDEAKSL  IERYGGKVTG  NVSKKTNYLI  MGRDCGQSKC  DKASTLGTKI  IDEDGLFDLI  480
481   RNMPGKKSKY  ELAAEAEAKK  SKPKWDKTPQ  KVEPEKRKVS  PAKRETDSKK  SNSTPEKGGT  540
541   FRSLKKETTE  TQKSLDFKQQ  AVERKHAPKA  EETCVPDISK  VRAEGLLWVD  KYKPTSLKTV  600
601   IGQQGDQSCA  NKLLRWLQNW  YKNTSEDKHG  KPSKLGGKDD  GTNFKAALLS  GPPGVGKTTT  660
661   AALVCQELGY  SYVELNASDT  RSKNSLKDVV  AESLNNTSIK  DFCSGMSHSV  SMKHVLIMDE  720
721   VDGMAGNEDR  GGIQELIALI  KHTKIPIICM  CNDRNHPKIR  SLVHYCFDLR  FQRPRLEQIK  780
781   GAMMSIAFKE  GLKIPAPAMN  EIILAANQDI  RQVLHNLNMW  CTKNKSLTYD  EAKADANKAK  840
841   KDIKLGPFDV  VRKVFVAGEE  TAHMSLIDKS  DLFFHDYSLA  PLFVQENYVH  VKPIAARGNM  900
901   KKHLMLLSRA  ADSICDGDLV  DRQIRSKQNW  NLLPTQAIYS  SVLPGELMRG  YMSQFPNFPS  960
961   WLGKFSSTGK  HDRIVQELAM  HMSLRTHTSK  RAVNMEYLSY  LRDALVRPLT  SMGTEGVQDA  1020
1021  VTFMDSYCLM  REDVENIMEI  SSWGGKPTPF  SKLDPKVKAA  FTRAYNKEAH  LIPYALHAVK  1080
1081  TSKRQPGLAS  ELNEELNADE  FQSEDEHDSI  ESDAMIKQKK  AKSSKQSKAA  IREEARKGKK  1140
1141  VGSTRQ  1146
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     CAGGATATCA  GAAAATTCTT  TGAGGTTGTA  TCTACTGGCA  AGAAACATGA  AGGTGAGACA  60
61    GTGAAAAAGT  CAGAGAAAAC  CAAAAATGGA  GAAGATACAT  CCAATAGGAA  GAAGAAAACC  120
121   AAGGAAATCA  AGGTGAAGAG  TTCAACTAAT  GAAGATGATA  CCAAACGAAA  GCAGACAAAC  180
181   AAGAAAAAAA  GGATAATCTA  TGATTCAGAT  TCAGATGAAG  AGAGGCAGTC  GGTAAAGAAA  240
241   TCTAAGAAGC  CATCAGAGAG  AGAACCATCC  TCTTCAAAAC  CTGTTAAAGT  TCTTAAGAAG  300
301   GATCCTGTTT  ATGTTTCAGA  AACAGATGAT  GAAGATGACT  TCATTAATAA  GAAGACTTCA  360
361   CAGAAACCCA  AGGAGAATGG  AACATCAGCA  AGCAGCTGTC  CAGGAACAGC  AGGAGCAAGA  420
421   AAGGAGGATG  CTAAGCCACA  GGCCGGAAGT  AAACCTTTAT  CTCCAGTAAA  ATTGACACCA  480
481   ACCTCAGTAT  TCGATTACTT  TGGAACTAGT  AGCGTACAAC  GATCAGAAAA  GAAATTGGTA  540
541   GCAAGCAAAA  GAAAAGAACT  TTCACACAGC  AGAGATTCAT  TGCTAGAAGA  TGAGGCCATT  600
601   GCTAAGCAAC  TGCAGTTAGA  GGAAGATGTA  GAGCTAGAGA  GACAGCTGCA  TGAAGATGAA  660
661   GAATTTGCCA  GAACTCTGGC  CATGTTGGAT  GAAACACCAA  AGAAAAAAAA  GGCTCGAAAA  720
721   GATCCAGAAG  ACAAGCAAAT  CATTTCAACT  ACCAAGACAA  GTTCAAACAC  AATGGAAAAA  780
781   AATAAACAAT  CTAAAAAAAG  GATAACTTCA  AACTCAACAG  AAGACACAAA  GACTAATAAT  840
841   GAAAAGGAAC  AAGCTAAATC  AGAAAACACA  AGAGCATCCT  GTTCACATCC  AGAAACTTCT  900
901   GTCAGTAAAG  CAATGGAGTT  AATGAATAAG  ACCTTGCCTT  TGAAACCTAG  CTCTAAGCTT  960
961   GTGGCTCTGA  AACAGAAAGA  AGAGAGCAAT  AAAAAGGGGA  GAGAGATTCC  TAGTGCAGCG  1020
1021  ACAAAAGAAA  AAATCACTTC  AGAAAAGGAA  GAGAAGAGAA  CGCCAAAGAA  ACAGAAAATT  1080
1081  TCTCCCCAAA  AACCTGAGTC  TTTCAGTCCT  GAGGACTCTG  AAAAGAAACG  CGTCAACTAC  1140
1141  CAGGCATATC  GGAGTTTCCT  TAATCGAGAA  GGTCCAAAAG  CACTTGGTTC  CAAAGACATA  1200
1201  CCACAAGGAG  CTGAAAACTG  CTTGGAAGGC  TTGACATTCG  TAATTACAGG  AGTCCTGGAG  1260
1261  TCTATTGAAC  GAGATGAGGC  AAAGTCTTTA  ATTGAGCGTT  ATGGGGGAAA  AGTAACTGGT  1320
1321  AATGTCAGCA  AGAAGACAAA  CTATCTTATT  ATGGGGCGTG  ACTGTGGCCA  GTCTAAATGT  1380
1381  GACAAGGCAT  CAACATTAGG  GACAAAAATT  ATTGACGAGG  ATGGCCTATT  TGATCTGATT  1440
1441  AGAAATATGC  CAGGCAAAAA  GTCCAAATAT  GAATTAGCAG  CAGAAGCTGA  GGCAAAGAAA  1500
1501  TCAAAGCCAA  AATGGGACAA  GACCCCGCAA  AAAGTTGAGC  CTGAAAAAAG  AAAAGTTAGC  1560
1561  CCAGCTAAGA  GAGAAACTGA  CTCTAAAAAA  AGCAACTCCA  CTCCAGAAAA  AGGAGGCACC  1620
1621  TTCAGATCTC  TAAAAAAAGA  AACTACCGAA  ACACAGAAAA  GTCTGGACTT  CAAGCAGCAA  1680
1681  GCTGTGGAGA  GAAAGCATGC  TCCAAAGGCT  GAAGAGACTT  GTGTTCCTGA  TATAAGCAAA  1740
1741  GTCAGAGCAG  AAGGGTTGCT  ATGGGTTGAT  AAATATAAGC  CCACATCTCT  TAAAACAGTA  1800
1801  ATTGGACAGC  AAGGGGATCA  AAGCTGTGCT  AATAAGTTGT  TACGATGGCT  CCAAAACTGG  1860
1861  TACAAGAATA  CTTCTGAGGA  CAAACATGGA  AAACCCAGTA  AATTGGGAGG  CAAAGATGAT  1920
1921  GGTACTAATT  TTAAAGCAGC  TTTACTGTCC  GGGCCACCAG  GAGTTGGTAA  AACGACTACA  1980
1981  GCTGCTTTAG  TTTGTCAGGA  ATTGGGGTAC  AGTTATGTGG  AACTGAATGC  CAGTGACACT  2040
2041  CGCAGTAAGA  ACAGTTTGAA  GGATGTGGTT  GCTGAATCTC  TAAATAACAC  CAGCATTAAA  2100
2101  GACTTCTGTT  CTGGAATGTC  CCATTCTGTT  AGTATGAAAC  ATGTATTGAT  CATGGATGAA  2160
2161  GTGGATGGAA  TGGCAGGGAA  TGAAGACAGA  GGAGGGATAC  AGGAGTTAAT  TGCTCTGATC  2220
2221  AAACACACAA  AGATTCCTAT  CATTTGTATG  TGTAATGATC  GGAACCATCC  CAAGATTCGT  2280
2281  TCCCTGGTCC  ATTACTGTTT  TGATCTTCGC  TTTCAGAGAC  CTCGGCTAGA  ACAGATTAAG  2340
2341  GGTGCCATGA  TGTCCATTGC  ATTTAAAGAA  GGGTTAAAGA  TACCCGCTCC  AGCTATGAAT  2400
2401  GAGATAATTT  TGGCAGCAAA  TCAGGATATT  AGGCAGGTTT  TACATAATCT  TAATATGTGG  2460
2461  TGTACAAAAA  ATAAATCATT  GACTTATGAT  GAGGCAAAAG  CTGATGCCAA  CAAAGCCAAA  2520
2521  AAGGATATCA  AACTGGGCCC  CTTTGATGTC  GTCAGGAAGG  TTTTTGTTGC  TGGAGAGGAA  2580
2581  ACTGCTCACA  TGTCTCTTAT  AGACAAATCC  GACTTATTCT  TCCATGATTA  CTCTCTAGCA  2640
2641  CCTCTTTTTG  TCCAGGAAAA  CTATGTACAT  GTAAAACCTA  TTGCTGCTCG  AGGTAACATG  2700
2701  AAAAAACATT  TGATGCTACT  GAGCAGAGCG  GCAGACAGTA  TATGTGATGG  TGACCTAGTT  2760
2761  GATCGGCAGA  TTCGCAGTAA  GCAAAACTGG  AACCTTCTGC  CTACGCAGGC  CATTTATTCG  2820
2821  AGTGTTCTCC  CTGGGGAGCT  GATGAGAGGT  TACATGTCAC  AGTTTCCTAA  CTTTCCAAGC  2880
2881  TGGCTGGGGA  AATTTTCATC  CACAGGCAAA  CATGACCGGA  TTGTTCAAGA  ACTGGCAATG  2940
2941  CACATGAGTC  TCAGAACTCA  CACTAGCAAG  AGAGCCGTAA  ACATGGAGTA  TTTGTCATAC  3000
3001  TTGAGGGATG  CACTTGTTAG  ACCCTTGACA  AGCATGGGAA  CAGAAGGTGT  ACAAGATGCT  3060
3061  GTAACATTCA  TGGACTCTTA  TTGCTTGATG  AGAGAAGATG  TTGAAAATAT  TATGGAAATA  3120
3121  TCCAGCTGGG  GAGGCAAACC  TACTCCCTTT  TCTAAACTGG  ACCCCAAGGT  CAAAGCAGCT  3180
3181  TTTACACGTG  CATATAACAA  GGAGGCACAT  TTGATACCAT  ATGCCCTGCA  TGCAGTAAAG  3240
3241  ACATCTAAAC  GGCAGCCTGG  GTTGGCTTCA  GAACTGAATG  AAGAGTTGAA  TGCTGACGAA  3300
3301  TTTCAGTCTG  AGGATGAGCA  TGATTCTATT  GAAAGTGATG  CAATGATCAA  GCAAAAAAAG  3360
3361  GCCAAGTCTT  CCAAGCAATC  AAAAGCAGCA  ATTAGAGAAG  AAGCAAGAAA  AGGAAAAAAA  3420
3421  GTGGGTAGCA  CTAGGCAA  3438

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Gaga-1527Gallus gallus77.050.01583
LLPS-Anp-2929Anas platyrhynchos77.010.01577
LLPS-Meg-1555Meleagris gallopavo75.80.01564
LLPS-Tag-1880Taeniopygia guttata73.820.01506
LLPS-Fia-0444Ficedula albicollis72.910.01484
LLPS-Otg-0722Otolemur garnettii70.00.01333
LLPS-Anc-2115Anolis carolinensis69.870.01452
LLPS-Mod-0788Monodelphis domestica69.840.01448
LLPS-Eqc-0383Equus caballus69.750.01441
LLPS-Sus-3252Sus scrofa69.460.01429
LLPS-Pat-1482Pan troglodytes69.460.01431
LLPS-Myl-1264Myotis lucifugus69.420.01431
LLPS-Gog-2532Gorilla gorilla69.40.01431
LLPS-Hos-0051Homo sapiens69.310.01429
LLPS-Pap-0865Pan paniscus69.220.01427
LLPS-Caj-0951Callithrix jacchus69.010.01423
LLPS-Urm-2958Ursus maritimus68.910.01422
LLPS-Fec-1608Felis catus68.890.01414
LLPS-Maf-2540Macaca fascicularis68.860.01414
LLPS-Man-2497Macaca nemestrina68.860.01415
LLPS-Mam-2991Macaca mulatta68.770.01416
LLPS-Aim-3189Ailuropoda melanoleuca68.710.01408
LLPS-Mup-3449Mustela putorius furo68.70.01414
LLPS-Nol-0583Nomascus leucogenys68.690.01388
LLPS-Sah-1505Sarcophilus harrisii68.680.01414
LLPS-Ova-0155Ovis aries68.680.01424
LLPS-Paa-1217Papio anubis68.680.01404
LLPS-Mal-1260Mandrillus leucophaeus68.680.01405
LLPS-Caf-3276Canis familiaris68.670.01415
LLPS-Chs-1420Chlorocebus sabaeus68.550.01221
LLPS-Bot-3767Bos taurus68.330.01395
LLPS-Poa-3774Pongo abelii68.290.01184
LLPS-Cap-2164Cavia porcellus68.260.01371
LLPS-Rhb-1361Rhinopithecus bieti68.120.01394
LLPS-Loa-2126Loxodonta africana68.00.01412
LLPS-Fud-1328Fukomys damarensis67.640.01360
LLPS-Ora-0311Ornithorhynchus anatinus67.640.01355
LLPS-Cas-0208Carlito syrichta67.380.01385
LLPS-Cea-0101Cercocebus atys67.290.01369
LLPS-Aon-3693Aotus nancymaae67.170.01357
LLPS-Ran-2057Rattus norvegicus67.110.01360
LLPS-Dio-1965Dipodomys ordii67.050.01367
LLPS-Ict-3677Ictidomys tridecemlineatus66.90.01384
LLPS-Orc-0824Oryctolagus cuniculus66.490.01354
LLPS-Mum-0294Mus musculus65.820.01358
LLPS-Ten-2037Tetraodon nigroviridis64.830.0 988
LLPS-Lac-0482Latimeria chalumnae63.180.01300
LLPS-Put-1171Puccinia triticina62.076e-1274.7
LLPS-Mea-2540Mesocricetus auratus61.380.01281
LLPS-Leo-2289Lepisosteus oculatus59.10.01132
LLPS-Dar-2783Danio rerio58.670.01115
LLPS-Asm-1267Astyanax mexicanus58.210.01085
LLPS-Scf-1389Scleropages formosus58.170.01121
LLPS-Icp-1555Ictalurus punctatus57.210.01082
LLPS-Beb-1411Beauveria bassiana56.672e-25 118
LLPS-Tar-1497Takifugu rubripes56.620.01059
LLPS-Phv-0015Phaseolus vulgaris56.574e-27 123
LLPS-Trr-0208Trichoderma reesei56.322e-23 112
LLPS-Vir-0286Vigna radiata56.123e-26 120
LLPS-Gaa-0726Gasterosteus aculeatus56.120.01064
LLPS-Trv-0613Trichoderma virens56.042e-24 115
LLPS-Chr-1075Chlamydomonas reinhardtii55.562e-21 105
LLPS-Orn-2424Oreochromis niloticus55.550.01110
LLPS-Orl-0663Oryzias latipes54.730.01098
LLPS-Fuv-0020Fusarium verticillioides54.651e-24 114
LLPS-Fuo-0597Fusarium oxysporum54.655e-24 114
LLPS-Pof-0405Poecilia formosa54.330.01075
LLPS-Xim-2096Xiphophorus maculatus53.950.01059
LLPS-Spr-0123Sporisorium reilianum52.754e-20 100
LLPS-Mao-0056Magnaporthe oryzae52.582e-22 108
LLPS-Nec-0393Neurospora crassa52.581e-22 109
LLPS-Cii-1464Ciona intestinalis52.260.0 561
LLPS-Asn-0639Aspergillus nidulans51.691e-20 102
LLPS-Cog-0155Colletotrichum gloeosporioides51.612e-23 111
LLPS-Scj-0747Schizosaccharomyces japonicus50.562e-1998.6
LLPS-Fus-0527Fusarium solani50.522e-23 112
LLPS-Aso-0837Aspergillus oryzae50.01e-20 103
LLPS-Ast-0713Aspergillus terreus50.01e-1999.4
LLPS-Osl-0410Ostreococcus lucimarinus50.02e-27 114
LLPS-Map-0697Magnaporthe poae49.486e-22 107
LLPS-Gag-0438Gaeumannomyces graminis49.481e-21 106
LLPS-Coo-0349Colletotrichum orbiculare49.461e-22 109
LLPS-Cogr-0536Colletotrichum graminicola48.391e-21 106
LLPS-Cis-1389Ciona savignyi48.350.0 652
LLPS-Miv-1089Microbotryum violaceum46.05e-20 100
LLPS-Asni-1040Aspergillus niger45.91e-24 115
LLPS-Scp-0643Schizosaccharomyces pombe45.564e-1894.7
LLPS-Cym-0341Cyanidioschyzon merolae45.126e-1377.8
LLPS-Asc-0306Aspergillus clavatus44.644e-21 104
LLPS-Drm-0834Drosophila melanogaster44.610.0 639
LLPS-Nef-0539Neosartorya fischeri44.143e-21 105
LLPS-Asfu-0596Aspergillus fumigatus44.145e-21 104
LLPS-Phn-0005Phaeosphaeria nodorum43.699e-1480.5
LLPS-Gas-0824Galdieria sulphuraria42.54e-1997.4
LLPS-Yal-1154Yarrowia lipolytica39.774e-100 345
LLPS-Kop-0592Komagataella pastoris39.674e-1997.8
LLPS-Scm-1954Scophthalmus maximus39.521e-71 254
LLPS-Cae-1126Caenorhabditis elegans39.177e-130 424
LLPS-Dos-0197Dothistroma septosporum38.297e-98 330
LLPS-Lem-0942Leptosphaeria maculans38.051e-131 436
LLPS-Pytr-0755Pyrenophora triticirepentis37.825e-104 360
LLPS-Usm-0293Ustilago maydis37.666e-129 424
LLPS-Coc-1821Corchorus capsularis37.343e-114 384
LLPS-Sei-0122Setaria italica37.227e-112 380
LLPS-Hea-1775Helianthus annuus37.091e-124 414
LLPS-Ved-0998Verticillium dahliae36.991e-131 434
LLPS-Sob-0203Sorghum bicolor36.951e-114 387
LLPS-Pug-0654Puccinia graminis36.82e-126 413
LLPS-Tra-0441Triticum aestivum36.711e-122 410
LLPS-Amt-1172Amborella trichopoda36.67e-86 300
LLPS-Brn-0489Brassica napus36.517e-116 389
LLPS-Mae-0191Manihot esculenta36.516e-122 407
LLPS-Brr-0670Brassica rapa36.517e-116 389
LLPS-Bro-0658Brassica oleracea36.512e-115 388
LLPS-Pyt-1598Pyrenophora teres36.495e-126 420
LLPS-Ori-0004Oryza indica36.489e-123 409
LLPS-Ors-0812Oryza sativa36.481e-122 410
LLPS-Org-0853Oryza glaberrima36.482e-122 409
LLPS-Crn-0346Cryptococcus neoformans36.475e-121 404
LLPS-Met-0526Medicago truncatula36.41e-118 399
LLPS-Zem-1857Zea mays36.291e-115 389
LLPS-Brd-1254Brachypodium distachyon36.265e-120 403
LLPS-Hov-0032Hordeum vulgare36.151e-120 407
LLPS-Scs-0345Sclerotinia sclerotiorum36.143e-130 431
LLPS-Arl-0098Arabidopsis lyrata36.122e-106 363
LLPS-Prp-1207Prunus persica36.076e-123 409
LLPS-Tum-0384Tuber melanosporum36.052e-119 400
LLPS-Gor-1589Gossypium raimondii35.927e-103 351
LLPS-Orgl-2128Oryza glumaepatula35.855e-111 380
LLPS-Orbr-0532Oryza brachyantha35.692e-123 412
LLPS-Asg-1148Ashbya gossypii35.641e-123 407
LLPS-Dac-0404Daucus carota35.626e-104 357
LLPS-Lep-1967Leersia perrieri35.567e-105 360
LLPS-Cus-0637Cucumis sativus35.531e-122 408
LLPS-Asf-0559Aspergillus flavus35.514e-131 428
LLPS-Orp-1629Oryza punctata35.422e-111 378
LLPS-Orr-1342Oryza rufipogon35.423e-112 380
LLPS-Orm-0631Oryza meridionalis35.422e-111 380
LLPS-Glm-2899Glycine max35.351e-117 394
LLPS-Art-0127Arabidopsis thaliana35.346e-110 373
LLPS-Mua-1369Musa acuminata35.294e-111 377
LLPS-Via-0506Vigna angularis35.292e-118 396
LLPS-Pot-0924Populus trichocarpa35.294e-106 363
LLPS-Orni-1096Oryza nivara35.284e-111 377
LLPS-Sac-1036Saccharomyces cerevisiae35.237e-115 384
LLPS-Mel-0004Melampsora laricipopulina35.072e-116 390
LLPS-Chc-0696Chondrus crispus35.041e-105 360
LLPS-Blg-0695Blumeria graminis35.07e-123 410
LLPS-Zyt-0588Zymoseptoria tritici34.923e-122 409
LLPS-Sol-0692Solanum lycopersicum34.858e-100 353
LLPS-Viv-0936Vitis vinifera34.592e-70 258
LLPS-Scc-1350Schizosaccharomyces cryophilus34.535e-119 397
LLPS-Php-0001Physcomitrella patens33.642e-106 364
LLPS-Orb-0059Oryza barthii33.524e-96 335
LLPS-Abg-1085Absidia glauca33.433e-103 352
LLPS-Sem-1518Selaginella moellendorffii32.971e-65 235
LLPS-Thc-1206Theobroma cacao25.862e-1585.9
LLPS-Xet-3597Xenopus tropicalis25.598e-1687.0