• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Pes-1622
LIMD1

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Uncharacterized protein
Gene Name: LIMD1
Ensembl Gene: ENSPSIG00000016792.1
Ensembl Protein: ENSPSIP00000018938.1
Organism: Pelodiscus sinensis
Taxa ID: 13735
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Nucleolus, Centrosome/Spindle pole bodyPredicted from orthologs(View)

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MDKYDDLGLE  ASKFIEDLNL  YEASKDGLFR  VDKAAGNNPE  FEETRRVFAT  KMAKIHLQQQ  60
61    QQQQEEELML  AGSGSLNGGA  SFSAQQQLPN  LPVQKLAAGA  SKLHSGENIA  KPPLATASVC  120
121   AAHQLAFPHH  PQAVPEGQRT  KLYQDGKTAG  KEYGCSENLG  DSEVSEGHGL  HREAHMNPSA  180
181   AGSSFPPSLP  HGQHYTEENR  TGISSWGGDA  GFEDETPGGL  QQPRSSSFST  PSTLPAQGFS  240
241   GQSNQFSSNP  ESEVTSHDHP  LRYHDNSSSF  TSSSPTPLPP  SVDYQQETAY  PKSPSHFIVH  300
301   GQNHWLNCPG  SGISPEQNAI  SVASHRSMVS  DAPSSPFKEN  ISSLQHDPGH  QENSSSTKIK  360
361   LPCQTLLPQQ  EQGPSAAELK  LEALTQRLEQ  EMDARPKADY  FGTCVKCSKG  VYGASQACQA  420
421   MGNLYHDGCF  TCGACSRKLR  GKAFYFVNGK  VFCEEDFLYS  GFQQSADRCF  ICGHLIMDMI  480
481   LQALGKSYHP  GCFRCVICNE  CLDGVPFTVD  TENKIYCVRD  YHKVLAPKCA  ACGHPILPNE  540
541   GSDETIRVVS  MDKDYHVECY  RCEDCGMELN  DEDGHRCYPL  DEHLLCHTCH  LKHIEKGTTP  600
601   AAMYQHHY  608
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGATAAAT  ATGATGATCT  AGGCCTGGAG  GCGAGTAAGT  TCATAGAAGA  TCTCAATTTG  60
61    TACGAAGCCT  CCAAGGATGG  GCTCTTTCGG  GTGGACAAAG  CTGCTGGTAA  CAACCCGGAA  120
121   TTTGAGGAAA  CTAGGAGAGT  TTTTGCCACC  AAAATGGCTA  AAATCCATCT  CCAGCAACAA  180
181   CAGCAGCAGC  AAGAAGAAGA  GCTGATGTTG  GCTGGCTCTG  GCTCTCTCAA  TGGTGGGGCC  240
241   AGTTTCAGTG  CCCAGCAGCA  ACTTCCAAAC  CTTCCTGTGC  AAAAACTAGC  TGCAGGAGCC  300
301   AGTAAGTTGC  ATTCAGGAGA  AAATATTGCC  AAACCTCCTC  TGGCCACAGC  ATCAGTGTGT  360
361   GCAGCTCACC  AGCTTGCTTT  TCCACACCAT  CCGCAAGCTG  TTCCTGAGGG  GCAGCGAACA  420
421   AAGTTATACC  AAGATGGCAA  AACAGCTGGC  AAAGAATATG  GCTGTAGTGA  GAATCTGGGG  480
481   GATTCAGAGG  TCTCTGAAGG  ACATGGGCTC  CACAGAGAAG  CCCATATGAA  TCCCAGTGCT  540
541   GCAGGGTCAT  CTTTTCCTCC  GTCTCTTCCC  CATGGGCAGC  ATTATACTGA  GGAGAACCGG  600
601   ACTGGCATCT  CATCTTGGGG  AGGAGATGCT  GGGTTTGAGG  ATGAGACACC  AGGGGGACTT  660
661   CAGCAGCCGA  GATCTTCCTC  CTTCTCAACC  CCATCAACAT  TGCCTGCTCA  AGGGTTTTCA  720
721   GGTCAGTCTA  ATCAATTTAG  CTCAAACCCT  GAGAGTGAGG  TCACCAGTCA  TGACCACCCA  780
781   TTACGGTACC  ATGACAATTC  TAGCTCTTTC  ACTTCTTCAT  CTCCTACTCC  ATTGCCTCCA  840
841   AGTGTAGATT  ATCAGCAAGA  AACGGCTTAC  CCCAAGTCTC  CTAGCCATTT  CATCGTTCAT  900
901   GGACAAAATC  ACTGGCTTAA  TTGTCCTGGC  TCTGGGATAA  GTCCTGAGCA  GAATGCTATC  960
961   AGTGTAGCTT  CACACAGGTC  AATGGTTTCT  GATGCTCCAA  GTTCTCCATT  TAAAGAGAAC  1020
1021  ATAAGCAGTC  TGCAGCATGA  TCCTGGACAC  CAGGAGAATT  CCAGTTCTAC  AAAAATAAAA  1080
1081  TTACCCTGTC  AGACCCTCCT  TCCACAACAG  GAACAAGGGC  CGTCTGCAGC  TGAATTAAAA  1140
1141  TTAGAAGCAC  TTACCCAGCG  TCTGGAGCAA  GAGATGGATG  CTCGTCCTAA  GGCTGACTAC  1200
1201  TTTGGAACAT  GTGTGAAGTG  CAGCAAAGGT  GTGTACGGAG  CAAGCCAGGC  TTGCCAAGCC  1260
1261  ATGGGAAATC  TCTACCACGA  TGGCTGCTTC  ACCTGTGGAG  CATGTAGTCG  AAAACTGAGA  1320
1321  GGAAAAGCCT  TTTATTTTGT  TAATGGAAAG  GTGTTCTGTG  AAGAAGATTT  CCTGTATTCT  1380
1381  GGTTTCCAGC  AGTCAGCTGA  CAGGTGTTTC  ATTTGTGGTC  ATTTGATAAT  GGACATGATC  1440
1441  CTGCAGGCTC  TAGGGAAATC  ATACCATCCA  GGCTGCTTCC  GTTGTGTGAT  CTGTAACGAA  1500
1501  TGTCTGGATG  GAGTGCCATT  CACTGTAGAC  ACTGAGAACA  AAATCTACTG  TGTCAGAGAT  1560
1561  TACCACAAAG  TTTTAGCTCC  AAAATGTGCA  GCATGTGGAC  ATCCCATTTT  GCCAAATGAG  1620
1621  GGGTCCGATG  AAACCATTCG  AGTTGTATCC  ATGGACAAGG  ATTACCATGT  GGAATGTTAT  1680
1681  CGATGTGAGG  ATTGCGGGAT  GGAACTCAAT  GATGAAGATG  GACATCGCTG  TTATCCGCTA  1740
1741  GATGAACATT  TGCTTTGTCA  CACTTGTCAC  CTAAAGCATA  TAGAGAAAGG  CACAACTCCA  1800
1801  GCAGCCATGT  ACCAGCATCA  CTACTAA  1827

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Fia-0928Ficedula albicollis98.258e-27 119
LLPS-Nol-4676Nomascus leucogenys96.431e-25 116
LLPS-Ova-1670Ovis aries96.431e-25 115
LLPS-Meg-0107Meleagris gallopavo95.859e-171 493
LLPS-Cap-3066Cavia porcellus94.642e-25 115
LLPS-Ict-4155Ictidomys tridecemlineatus94.647e-25 113
LLPS-Otg-3498Otolemur garnettii94.643e-25 114
LLPS-Tag-1509Taeniopygia guttata94.161e-179 516
LLPS-Dio-4380Dipodomys ordii87.56e-23 107
LLPS-Asm-2286Astyanax mexicanus85.836e-148 449
LLPS-Mum-1928Mus musculus85.323e-160 482
LLPS-Cas-0444Carlito syrichta85.215e-161 484
LLPS-Sus-0058Sus scrofa85.211e-162 488
LLPS-Myl-1440Myotis lucifugus84.826e-161 483
LLPS-Eqc-0304Equus caballus84.442e-160 482
LLPS-Poa-2472Pongo abelii84.054e-158 476
LLPS-Pap-3075Pan paniscus84.054e-158 476
LLPS-Anp-1408Anas platyrhynchos84.038e-175 504
LLPS-Caf-0264Canis familiaris83.915e-162 486
LLPS-Rhb-3972Rhinopithecus bieti83.723e-68 238
LLPS-Hos-4356Homo sapiens83.661e-157 475
LLPS-Pat-4500Pan troglodytes83.661e-157 475
LLPS-Gog-4731Gorilla gorilla83.661e-157 476
LLPS-Scm-3844Scophthalmus maximus82.522e-146 441
LLPS-Orn-4051Oreochromis niloticus81.31e-146 445
LLPS-Xim-2480Xiphophorus maculatus81.33e-143 434
LLPS-Xet-1159Xenopus tropicalis80.74e-21 101
LLPS-Pof-3808Poecilia formosa80.72e-22 105
LLPS-Gaa-3914Gasterosteus aculeatus80.74e-22 104
LLPS-Orl-2970Oryzias latipes80.72e-22 105
LLPS-Leo-0786Lepisosteus oculatus80.72e-22 105
LLPS-Icp-2031Ictalurus punctatus80.73e-22 104
LLPS-Tar-2685Takifugu rubripes80.176e-141 430
LLPS-Scf-1765Scleropages formosus79.22e-132 399
LLPS-Ten-2974Tetraodon nigroviridis77.782e-128 397
LLPS-Mea-1921Mesocricetus auratus76.742e-164 492
LLPS-Bot-2917Bos taurus76.551e-165 496
LLPS-Fud-4130Fukomys damarensis76.322e-117 362
LLPS-Ora-2932Ornithorhynchus anatinus76.114e-169 506
LLPS-Aim-3319Ailuropoda melanoleuca75.745e-162 486
LLPS-Fec-0490Felis catus75.411e-164 493
LLPS-Ere-0287Erinaceus europaeus75.167e-86 271
LLPS-Lac-3625Latimeria chalumnae75.13e-134 416
LLPS-Mup-1709Mustela putorius furo74.437e-160 481
LLPS-Mam-1891Macaca mulatta74.326e-131 406
LLPS-Ran-1743Rattus norvegicus74.294e-164 491
LLPS-Aon-4540Aotus nancymaae74.182e-159 480
LLPS-Orc-2300Oryctolagus cuniculus73.795e-160 481
LLPS-Gaga-3840Gallus gallus73.554e-121 381
LLPS-Man-1138Macaca nemestrina73.534e-158 477
LLPS-Mal-0303Mandrillus leucophaeus73.534e-158 476
LLPS-Paa-3405Papio anubis73.536e-158 476
LLPS-Cea-2564Cercocebus atys73.535e-158 476
LLPS-Chs-0947Chlorocebus sabaeus73.535e-158 476
LLPS-Dar-0648Danio rerio72.023e-117 370
LLPS-Loa-3020Loxodonta africana70.822e-143 439
LLPS-Anc-1951Anolis carolinensis69.610.0 616
LLPS-Caj-1301Callithrix jacchus69.48e-118 364
LLPS-Mod-2145Monodelphis domestica67.866e-125 384
LLPS-Sah-0729Sarcophilus harrisii67.362e-96 300
LLPS-Maf-2901Macaca fascicularis65.523e-106 333
LLPS-Urm-2921Ursus maritimus65.254e-52 181
LLPS-Tut-2057Tursiops truncatus64.395e-97 313
LLPS-Drm-0139Drosophila melanogaster61.62e-103 336
LLPS-Cae-0692Caenorhabditis elegans39.91e-45 175