• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Orn-3559
DSC1

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: Uncharacterized protein
Gene Name: DSC1
Ensembl Gene: ENSONIG00000009697.1
Ensembl Protein: ENSONIP00000012179.1
Organism: Oreochromis niloticus
Taxa ID: 8128
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
P-bodyPredicted from orthologs(View)

▼ FUNCTION


Component of intercellular desmosome junctions. Involved in the interaction of plaque proteins and intermediate filaments mediating cell-cell adhesion.

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MGRVLIPTIC  LMLILPCVES  CSLPRSLYVI  VPETIPPEYQ  VAKVEAVGCD  VKSTQLTVKD  60
61    PSFTINSNGA  VVALTSVSVA  ERGRTFSVCA  QDNSGPESKM  EVHLVRSTMP  IKHQRGQGFL  120
121   SRSKRRWAPP  NINIVENYVG  PYPKLLERLV  SITSAKYDVY  YTIEGQGVDK  YPTGVLRLDR  180
181   ETGDLFLLKS  VDREAFPEYS  FVVRVWDKIT  NRETDENLPL  KVVVDDVNDN  PPEFVGPLQF  240
241   TVPEHCSAGT  VVGKVNTTDK  DQIGTDHVKI  RYTLLTGTAM  FAIHTQTGVI  TTRTNTLDRE  300
301   SQDIYLVDVK  IQDMDGAPNG  LFATSTATIL  LSDINDNPPT  FMQTSYDVAV  QENECEKLLL  360
361   RIPVQDKDLI  NTPNWISKFV  ISQGNENGNF  RIVTDPRTNE  GLLYVSKPLD  YEKTSSVQLE  420
421   ITAQNQAPLS  GSSASWNSIP  VTVNVTDVDE  GPEFSAPSIR  FNVKENTPNG  TVIGTYTATD  480
481   PETKSSKGIK  YYKVTDPGSW  INVDRDTGEL  RVANTIDRES  PLVRDGFYNI  TVRAVDASSK  540
541   SATGTVVIWV  EDENDNIPTI  PSELTLCQKD  GELGSVVVVA  EDKDQDPFSS  PFTFSLPNKN  600
601   DGTWSVKSLN  DTAATLKQLQ  PLYLGMHTVD  LTVTDLQGSG  KTHTVNLRVC  KCKDGVCLGK  660
661   DRSVSLGPLG  ILTLLLPVAL  LLLLFLLLAF  FCLTKREKLQ  LDDSADTGGI  LLKSNTEAPG  720
721   DEVDASLING  PPFEIDQAVK  GSVKGVMMNP  SWIGNKSGST  IGTLGVHENG  MHGRTDISAA  780
781   NMQDYYTGQY  DMTIDRQSYG  QLVGSGVDFD  YRQHNMDPAL  LYTWETNGRY  LHQKLNQMGT  840
841   EEDGRYADDI  IHAYAFEGRG  SVAGSIGCCS  NNNDNDNLDF  LNTLGPKFKT  LAEVCRKT  898
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     GACCCGAGTT  TTACAATAAA  CAGTAATGGA  GCAGTGGTAG  CTTTAACGTC  TGTCTCAGTG  60
61    GCCGAAAGAG  GACGGACATT  TTCTGTGTGC  GCTCAGGACA  ATAGTGGACC  GGAAAGTAAG  120
121   ATGGAAGTTC  ACCTTGTCCG  CAGTACAATG  CCGATAAAAC  ATCAACGAGG  CCAAGGCTTC  180
181   CTGAGTCGCT  CTAAAAGACG  CTGGGCACCT  CCGAACATCA  ACATAGTGGA  GAATTACGTA  240
241   GGACCCTATC  CAAAACTACT  GGAAAGGCTG  GTGTCAATTA  CCTCAGCCAA  ATATGATGTG  300
301   TACTACACTA  TCGAAGGACA  AGGAGTCGAT  AAGTATCCAA  CTGGAGTGCT  CAGACTGGAC  360
361   AGAGAAACAG  GGGATCTGTT  CTTGCTCAAA  TCAGTGGACC  GTGAGGCGTT  CCCAGAATAT  420
421   AGTTTTGTAG  TGCGTGTTTG  GGACAAGATC  ACAAATCGGG  AGACAGATGA  GAATCTGCCA  480
481   TTGAAAGTGG  TTGTAGATGA  TGTAAATGAC  AATCCACCGG  AGTTTGTAGG  TCCGCTACAG  540
541   TTTACTGTTC  CTGAGCACTG  TAGTGCAGGG  ACTGTGGTGG  GAAAGGTGAA  TACAACCGAC  600
601   AAAGACCAAA  TTGGCACTGA  CCATGTGAAG  ATTAGGTATA  CACTCCTAAC  TGGAACAGCC  660
661   ATGTTTGCCA  TTCATACACA  AACAGGTGTC  ATCACAACAA  GAACCAACAC  CCTAGACAGA  720
721   GAGTCACAAG  ACATATATTT  GGTGGATGTA  AAAATCCAGG  ATATGGATGG  TGCACCAAAT  780
781   GGTCTGTTTG  CTACATCAAC  AGCAACAATT  CTTCTGAGTG  ACATCAATGA  CAACCCACCA  840
841   ACCTTCATGC  AAACATCTTA  TGATGTCGCT  GTGCAAGAGA  ATGAATGTGA  AAAACTTCTA  900
901   CTTCGAATTC  CAGTTCAAGA  TAAAGATTTG  ATAAACACAC  CAAACTGGAT  ATCAAAGTTT  960
961   GTCATTAGTC  AAGGAAATGA  AAATGGAAAT  TTCAGGATTG  TTACCGACCC  CCGAACAAAT  1020
1021  GAAGGGCTTC  TGTATGTCTC  AAAGCCATTA  GATTATGAGA  AGACCAGCAG  TGTACAGCTT  1080
1081  GAGATCACAG  CACAAAATCA  AGCACCACTG  AGTGGCAGCA  GCGCCAGTTG  GAACTCCATC  1140
1141  CCTGTGACGG  TCAATGTGAC  CGATGTCGAT  GAAGGCCCAG  AATTCTCTGC  TCCTTCGATC  1200
1201  CGCTTCAATG  TCAAAGAGAA  CACACCAAAT  GGCACAGTGA  TAGGAACTTA  TACAGCTACG  1260
1261  GATCCTGAGA  CCAAGAGCAG  CAAAGGCATC  AAGTATTACA  AGGTGACAGA  CCCGGGCTCC  1320
1321  TGGATCAATG  TCGACAGAGA  CACGGGAGAG  CTGAGGGTGG  CAAACACAAT  TGACAGAGAG  1380
1381  TCACCGCTTG  TTCGCGATGG  GTTTTACAAC  ATCACAGTGA  GGGCTGTTGA  TGCTAGCTCC  1440
1441  AAGTCAGCAA  CAGGAACAGT  TGTCATTTGG  GTGGAGGATG  AAAACGACAA  CATTCCTACA  1500
1501  ATTCCCAGTG  AGCTCACGTT  GTGTCAGAAG  GATGGAGAGC  TCGGCTCTGT  GGTGGTGGTG  1560
1561  GCTGAAGACA  AAGATCAGGA  TCCCTTTTCG  TCTCCATTCA  CCTTCAGTTT  ACCAAATAAA  1620
1621  AATGATGGCA  CATGGTCTGT  GAAAAGTCTT  AATGACACAG  CAGCTACATT  GAAGCAGCTC  1680
1681  CAACCGCTTT  ATTTGGGGAT  GCACACCGTT  GACCTGACTG  TTACGGATCT  TCAGGGCAGT  1740
1741  GGCAAAACAC  ATACAGTAAA  TCTGAGAGTC  TGCAAGTGCA  AGGATGGCGT  CTGCCTTGGC  1800
1801  AAGGACAGGT  CTGTGTCGCT  CGGACCGCTG  GGAATACTGA  CTCTGCTGTT  GCCTGTGGCT  1860
1861  CTCCTCCTAC  TGCTCTGTGA  GTCTTCCACT  GTAATTATAA  GTATTTTCTG  TCTAACAAAG  1920
1921  AGGGAGAAGT  TGCAACTTGA  CGACTCAGCA  GACACTGGAG  GAATCCTACT  CAAATCCAAC  1980
1981  ACGGAGGCCC  CAGGGGACGA  AGTGATTGGG  AACAAGAGTG  GAAGCACTAT  TGGAACCCTT  2040
2041  GGTGTTCACG  AGAATGGGAT  GCATGGAAGG  ACTGATATTT  CTGCAGCTAA  TATGCAGGAT  2100
2101  TACTATACCG  GCCAGTATGA  CATGACCATA  GATCGTCAAT  CCTATGGTCA  GCTTGTTGGT  2160
2161  AGTGGTGTAG  ACTTTGACTA  CAGACAACAC  AACATGGACC  CAGCTCTTCT  GTATACTTGG  2220
2221  GAAACAAATG  GCCGCTATCT  ACATCAGACA  TATCATTTAT  TTGTTTTTAG  ATACATCCAA  2280
2281  CAAAAATTGA  ACCAAATGGG  AACAGAGGAG  GATGGGCGAT  ACGCAGACGA  TATCATCCAC  2340
2341  GCCTACGCAT  TCGAGGGACG  TGGCTCTGTA  GCTGGCTCTA  TCGGATGCTG  CAGTAATAAT  2400
2401  AATGACAACG  ATAACCTTGA  CTTTCTGAAC  ACACTTGGAC  CAAAGTTCAA  AACTCTTGCA  2460
2461  GAGGTCTGCA  GAAAGACATG  A  2481

▼ KEYWORD


ID
Family
Calcium
Cell adhesion
Cell membrane
Complete proteome
Membrane
Reference proteome
Repeat
Signal
Transmembrane
Transmembrane helix

▼ GENE ONTOLOGY


ID
Classification
Description
Cellular Component
Integral component of membrane
Cellular Component
Plasma membrane
Molecular Function
Calcium ion binding
Biological Process
Homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Scm-2666Scophthalmus maximus58.090.0 938
LLPS-Pof-3672Poecilia formosa58.050.0 931
LLPS-Tar-3701Takifugu rubripes55.080.0 883
LLPS-Asm-3457Astyanax mexicanus49.720.0 734
LLPS-Dar-0415Danio rerio48.00.0 731
LLPS-Icp-3822Ictalurus punctatus46.950.0 701
LLPS-Loa-1256Loxodonta africana46.272e-0862.4
LLPS-Mod-3112Monodelphis domestica41.985e-0757.8
LLPS-Meg-1115Meleagris gallopavo38.783e-0758.9
LLPS-Gaga-3864Gallus gallus38.783e-0758.9
LLPS-Cap-1760Cavia porcellus37.583e-115 379
LLPS-Dio-3254Dipodomys ordii37.212e-125 407
LLPS-Poa-2434Pongo abelii36.64e-122 397
LLPS-Fud-4442Fukomys damarensis35.992e-113 376
LLPS-Mup-3340Mustela putorius furo35.83e-120 392
LLPS-Ran-1246Rattus norvegicus35.242e-118 387
LLPS-Tag-1917Taeniopygia guttata35.244e-62 223
LLPS-Cas-0048Carlito syrichta35.223e-44 169
LLPS-Pes-3393Pelodiscus sinensis35.04e-62 224
LLPS-Ict-3575Ictidomys tridecemlineatus34.939e-61 223
LLPS-Ora-2564Ornithorhynchus anatinus34.913e-61 220
LLPS-Myl-2823Myotis lucifugus34.852e-44 169
LLPS-Anp-1007Anas platyrhynchos34.777e-61 220
LLPS-Aim-2961Ailuropoda melanoleuca34.431e-59 215
LLPS-Gaa-3618Gasterosteus aculeatus34.375e-50 187
LLPS-Sah-3949Sarcophilus harrisii34.237e-71 251
LLPS-Mea-2916Mesocricetus auratus34.031e-129 419
LLPS-Urm-3125Ursus maritimus34.028e-135 432
LLPS-Nol-4097Nomascus leucogenys33.955e-138 441
LLPS-Hos-2072Homo sapiens33.912e-137 439
LLPS-Pap-4322Pan paniscus33.912e-137 439
LLPS-Pat-4081Pan troglodytes33.913e-137 439
LLPS-Man-2981Macaca nemestrina33.885e-58 210
LLPS-Gog-2608Gorilla gorilla33.76e-138 441
LLPS-Otg-3825Otolemur garnettii33.673e-110 363
LLPS-Rhb-3360Rhinopithecus bieti33.661e-135 434
LLPS-Fia-2933Ficedula albicollis33.66e-78 274
LLPS-Bot-2259Bos taurus33.595e-126 409
LLPS-Caf-2104Canis familiaris33.554e-130 420
LLPS-Cea-4052Cercocebus atys33.526e-136 435
LLPS-Maf-3701Macaca fascicularis33.521e-135 434
LLPS-Chs-2747Chlorocebus sabaeus33.525e-136 435
LLPS-Fec-2580Felis catus33.483e-132 425
LLPS-Paa-4088Papio anubis33.411e-134 432
LLPS-Mum-4879Mus musculus33.374e-134 430
LLPS-Mal-1989Mandrillus leucophaeus33.372e-136 437
LLPS-Ova-1020Ovis aries33.332e-67 242
LLPS-Sus-2361Sus scrofa33.31e-129 418
LLPS-Mam-1975Macaca mulatta33.32e-134 431
LLPS-Aon-4831Aotus nancymaae33.268e-136 435
LLPS-Orc-2549Oryctolagus cuniculus33.227e-133 427
LLPS-Xet-2003Xenopus tropicalis32.382e-72 258
LLPS-Eqc-2675Equus caballus32.221e-130 421
LLPS-Caj-2107Callithrix jacchus32.181e-125 408
LLPS-Leo-3081Lepisosteus oculatus32.073e-68 246
LLPS-Xim-0963Xiphophorus maculatus31.182e-62 229
LLPS-Scf-0063Scleropages formosus31.131e-60 224
LLPS-Orl-3817Oryzias latipes30.322e-65 238